logo

Genes within 1Mb (chr12:96710830:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 9.71e-02 -0.139 0.0835 0.068 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0594 0.104 0.068 B L1
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 1.32e-01 -0.167 0.111 0.068 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 1.87e-01 -0.133 0.101 0.068 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 2.49e-01 -0.17 0.147 0.068 B L1
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 4.10e-01 0.0575 0.0697 0.068 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 8.02e-02 -0.167 0.0952 0.068 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0476 0.104 0.068 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 6.05e-01 -0.047 0.0907 0.068 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00353 0.112 0.068 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0202 0.072 0.068 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 4.03e-01 0.0647 0.0772 0.068 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 8.51e-01 0.022 0.116 0.068 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00207 0.0954 0.068 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0847 0.127 0.068 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 2.94e-01 0.14 0.134 0.068 DC L1
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0329 0.152 0.068 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 9.28e-01 0.0113 0.125 0.068 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 3.27e-01 -0.15 0.152 0.068 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 5.76e-01 0.0711 0.127 0.068 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 9.50e-01 0.0102 0.163 0.068 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 6.40e-01 0.0688 0.147 0.068 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 3.70e-01 0.0968 0.108 0.068 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 7.42e-01 0.0448 0.136 0.068 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 9.89e-01 0.00219 0.153 0.068 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 7.71e-01 0.03 0.103 0.068 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0123 0.0972 0.068 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 5.62e-01 0.0866 0.149 0.068 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 6.49e-01 0.0659 0.145 0.068 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 3.85e-01 0.0704 0.0809 0.067 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 4.58e-01 -0.102 0.137 0.067 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0458 0.13 0.067 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0368 0.108 0.067 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 4.59e-01 -0.101 0.137 0.067 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 6.48e-01 0.0306 0.0671 0.068 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 919678 sc-eQTL 3.20e-01 0.123 0.124 0.068 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 1.55e-01 -0.199 0.14 0.068 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0397 0.109 0.068 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 3.50e-01 0.095 0.102 0.068 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 1.18e-01 0.242 0.154 0.068 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 221259 sc-eQTL 7.52e-02 -0.285 0.159 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 6.34e-01 -0.074 0.155 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 1.47e-01 -0.255 0.175 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 2.67e-01 -0.207 0.186 0.064 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0735 0.175 0.064 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 3.02e-01 0.189 0.183 0.064 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 2.30e-01 -0.157 0.131 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 2.05e-01 -0.161 0.127 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0559 0.143 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 3.92e-01 -0.122 0.142 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 1.69e-01 -0.23 0.166 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0524 0.128 0.069 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 2.85e-01 -0.158 0.147 0.069 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0427 0.145 0.069 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 6.89e-01 0.0615 0.154 0.069 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 6.58e-01 0.0752 0.17 0.069 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0986 0.107 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 9.08e-01 0.0129 0.112 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0475 0.133 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0489 0.129 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0976 0.165 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 9.61e-01 0.0066 0.134 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0646 0.127 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 6.72e-02 -0.273 0.149 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0124 0.149 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 9.17e-01 0.0184 0.177 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 5.27e-01 -0.077 0.122 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 4.39e-03 -0.484 0.168 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 3.11e-01 0.176 0.173 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0695 0.151 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 4.80e-01 0.123 0.174 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 6.03e-01 0.0399 0.0766 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 1.73e-02 -0.262 0.109 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 9.93e-01 0.000925 0.111 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0341 0.0984 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0577 0.121 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 7.18e-01 -0.027 0.0747 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 2.54e-01 -0.145 0.126 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 7.26e-01 0.0438 0.125 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 2.79e-01 -0.111 0.102 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0285 0.14 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0313 0.0925 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 1.80e-01 0.191 0.142 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 2.52e-02 -0.296 0.131 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0745 0.139 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 6.94e-01 -0.065 0.165 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 3.81e-01 0.0779 0.0888 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 7.67e-01 0.0476 0.161 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 4.08e-01 -0.121 0.146 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 7.11e-01 0.0498 0.134 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 2.37e-01 -0.178 0.15 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 2.27e-01 0.13 0.107 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 6.85e-01 0.0524 0.129 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0125 0.137 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 7.56e-01 0.0383 0.123 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 4.09e-01 0.121 0.146 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 1.87e-01 -0.157 0.118 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 2.62e-02 -0.387 0.173 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 7.40e-01 0.0491 0.148 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 1.21e-01 -0.264 0.169 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0201 0.167 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 2.24e-01 -0.173 0.142 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0814 0.174 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0269 0.172 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 9.57e-01 0.00858 0.159 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 2.72e-01 0.19 0.173 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 3.26e-01 -0.094 0.0955 0.069 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 919678 sc-eQTL 3.83e-01 0.113 0.129 0.069 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 3.94e-01 -0.126 0.148 0.069 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0148 0.124 0.069 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 8.00e-01 0.0365 0.144 0.069 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 5.00e-01 0.109 0.161 0.069 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 221259 sc-eQTL 4.59e-01 -0.118 0.16 0.069 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 3.21e-01 -0.101 0.102 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0907 0.151 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0387 0.161 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 7.96e-01 0.0436 0.168 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 1.68e-01 0.233 0.169 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 8.71e-01 0.0141 0.0871 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 3.21e-01 -0.156 0.157 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 6.00e-01 0.0731 0.139 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 3.74e-01 0.118 0.132 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0467 0.153 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 2.45e-01 0.158 0.136 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 1.37e-01 -0.265 0.178 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 1.72e-01 -0.226 0.165 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 8.52e-01 0.0322 0.173 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 4.17e-01 -0.133 0.163 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 1.18e-01 0.152 0.0969 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 7.64e-01 0.0495 0.165 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 9.65e-01 0.00694 0.158 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 3.37e-01 -0.128 0.133 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 6.59e-01 -0.073 0.165 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 9.82e-01 0.00398 0.176 0.063 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0629 0.156 0.063 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 1.56e-03 -0.618 0.191 0.063 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 1.79e-01 -0.261 0.193 0.063 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0177 0.231 0.063 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00971 0.106 0.07 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 919678 sc-eQTL 9.59e-01 0.00617 0.119 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 1.53e-01 -0.2 0.139 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 9.06e-01 0.02 0.169 0.07 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0119 0.107 0.07 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 1.57e-01 0.219 0.154 0.07 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 221259 sc-eQTL 1.19e-01 -0.195 0.125 0.07 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 2.12e-01 0.144 0.115 0.068 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0508 0.146 0.068 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 5.35e-02 0.255 0.131 0.068 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 8.83e-01 0.0225 0.153 0.068 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 5.04e-02 0.334 0.17 0.068 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 3.94e-01 0.131 0.153 0.063 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0624 0.16 0.063 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0167 0.137 0.063 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 9.24e-02 -0.303 0.179 0.063 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 4.91e-01 0.104 0.151 0.063 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 6.33e-01 -0.088 0.184 0.063 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 1.86e-01 0.205 0.155 0.063 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 4.56e-01 0.0924 0.124 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 2.41e-01 0.158 0.135 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 7.69e-01 -0.043 0.146 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 6.76e-01 0.0471 0.113 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0366 0.116 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 7.05e-01 0.0606 0.16 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 7.65e-01 0.0447 0.149 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 9.77e-01 0.00401 0.141 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 3.30e-01 -0.154 0.158 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 8.27e-01 0.0346 0.158 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0511 0.129 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0801 0.127 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 3.07e-01 0.176 0.172 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 8.51e-01 0.0304 0.162 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 8.57e-01 0.0251 0.139 0.07 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 919678 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0145 0.16 0.07 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0932 0.209 0.07 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 7.24e-01 0.0683 0.193 0.07 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 8.24e-02 -0.323 0.184 0.07 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 9.44e-02 0.343 0.204 0.07 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 221259 sc-eQTL 7.22e-01 0.0643 0.18 0.07 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0534 0.163 0.069 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 3.06e-01 0.169 0.164 0.069 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 3.09e-01 -0.172 0.168 0.069 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 1.01e-01 0.246 0.149 0.069 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 1.78e-01 -0.216 0.16 0.069 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0527 0.167 0.069 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 3.99e-01 -0.142 0.168 0.069 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 6.84e-02 0.229 0.125 0.07 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 1.97e-01 -0.181 0.14 0.07 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0531 0.157 0.07 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0452 0.135 0.07 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 1.21e-01 0.213 0.137 0.07 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 3.56e-01 -0.135 0.146 0.07 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0831 0.166 0.07 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 6.54e-01 0.0828 0.184 0.062 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 7.66e-01 0.0463 0.156 0.062 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 8.10e-01 0.0419 0.174 0.062 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 6.06e-01 -0.11 0.213 0.062 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 4.21e-01 -0.15 0.185 0.062 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 9.59e-01 0.0104 0.205 0.062 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 7.64e-01 -0.053 0.176 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0915 0.11 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 6.75e-02 -0.209 0.114 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0901 0.131 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0292 0.127 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0232 0.167 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 5.49e-01 -0.057 0.0948 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 8.43e-01 0.0211 0.107 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 1.77e-01 -0.164 0.121 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0837 0.122 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0588 0.162 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 3.32e-01 0.109 0.112 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 6.42e-01 0.0632 0.136 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0122 0.149 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 8.18e-01 0.0248 0.108 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0549 0.104 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 3.46e-01 0.154 0.163 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 6.69e-01 0.0646 0.151 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 3.06e-01 0.12 0.117 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 714465 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0383 0.139 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0627 0.154 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 6.13e-01 0.0577 0.114 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 9.36e-01 0.00937 0.117 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 9.42e-01 -0.011 0.151 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 685507 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0685 0.159 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 310350 sc-eQTL 2.32e-01 0.098 0.0817 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 667310 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0988 0.142 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 516455 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0522 0.13 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 851902 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00831 0.112 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 sc-eQTL 4.30e-01 -0.11 0.139 0.067 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 eQTL 7.35e-05 -0.178 0.0448 0.0 0.0 0.0672
ENSG00000258177 AC008149.1 486857 eQTL 0.0443 -0.145 0.0721 0.0 0.0 0.0672

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139344 \N 767499 3.02e-07 1.53e-07 6.41e-08 2.15e-07 1.1e-07 8.37e-08 2.1e-07 5.82e-08 1.71e-07 9.35e-08 1.61e-07 1.31e-07 2.05e-07 8e-08 5.97e-08 9.01e-08 4.45e-08 1.8e-07 7.16e-08 5.87e-08 1.18e-07 1.56e-07 1.58e-07 3.58e-08 2.09e-07 1.39e-07 1.22e-07 1.26e-07 1.32e-07 1.05e-07 1.14e-07 4.61e-08 3.65e-08 9.81e-08 4.41e-08 2.74e-08 4.41e-08 7.63e-08 6.39e-08 6.07e-08 4.58e-08 1.52e-07 4.76e-08 1.09e-08 3.87e-08 6.68e-09 7.92e-08 2.13e-09 4.98e-08
ENSG00000139350 NEDD1 -196393 2.28e-06 2.34e-06 3.47e-07 1.74e-06 6.88e-07 8.21e-07 1.83e-06 7.94e-07 1.88e-06 1.03e-06 2.48e-06 1.34e-06 3.5e-06 1.42e-06 9.01e-07 1.77e-06 1.17e-06 2.3e-06 1.15e-06 1.39e-06 1.32e-06 3.03e-06 2.33e-06 1.05e-06 3.48e-06 1.13e-06 1.39e-06 1.79e-06 2.17e-06 1.82e-06 1.67e-06 4.14e-07 5.97e-07 1.25e-06 1.29e-06 9.75e-07 8.44e-07 4.46e-07 1.18e-06 3.45e-07 2.8e-07 3.22e-06 4.58e-07 1.89e-07 3.5e-07 3.67e-07 8.19e-07 2.28e-07 1.58e-07
ENSG00000258177 AC008149.1 486857 8.21e-07 5.18e-07 1.31e-07 3.57e-07 1.09e-07 2.09e-07 5.28e-07 1.48e-07 4.61e-07 2.57e-07 6.88e-07 3.84e-07 7.19e-07 1.41e-07 2.57e-07 2.55e-07 3.24e-07 3.95e-07 2.25e-07 1.69e-07 2.17e-07 3.8e-07 3.45e-07 1.71e-07 7.71e-07 2.6e-07 3.04e-07 2.74e-07 3.88e-07 5.28e-07 2.83e-07 6.37e-08 5.55e-08 1.54e-07 3.35e-07 1.21e-07 1.08e-07 1.06e-07 6.01e-08 2.17e-08 1.01e-07 4.68e-07 2.47e-08 2e-08 1.45e-07 1.48e-08 1.17e-07 2.35e-08 6.15e-08