logo

Genes within 1Mb (chr12:96672130:GA:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 3.19e-02 0.0934 0.0432 0.53 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.27e-01 0.0827 0.054 0.53 B L1
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 2.32e-01 0.0691 0.0576 0.53 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 3.41e-01 0.05 0.0524 0.53 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0314 0.0766 0.53 B L1
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 8.12e-01 -0.00853 0.0359 0.53 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 8.71e-01 0.00802 0.0493 0.53 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0206 0.0534 0.53 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0281 0.0467 0.53 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0743 0.0573 0.53 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0383 0.0371 0.53 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0164 0.0399 0.53 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0793 0.0599 0.53 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 7.32e-01 0.0169 0.0492 0.53 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 5.52e-01 -0.039 0.0654 0.53 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0536 0.0693 0.527 DC L1
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0455 0.0789 0.527 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 2.64e-02 0.143 0.0638 0.527 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 7.07e-01 0.0297 0.0791 0.527 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 8.01e-01 0.0166 0.0658 0.527 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 1.93e-01 -0.11 0.0841 0.527 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 1.16e-01 -0.12 0.0758 0.527 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0454 0.0559 0.53 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 7.78e-01 0.0198 0.0705 0.53 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 6.83e-02 0.145 0.079 0.53 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0259 0.0534 0.53 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0585 0.0502 0.53 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 4.33e-02 -0.156 0.0766 0.53 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 3.44e-02 0.158 0.0742 0.53 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 1.40e-01 0.061 0.0412 0.532 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0495 0.0703 0.532 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 5.94e-01 0.0356 0.0667 0.532 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 5.21e-01 0.0356 0.0553 0.532 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 5.06e-01 0.0466 0.07 0.532 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 3.97e-01 0.0295 0.0348 0.53 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 880978 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0764 0.0642 0.53 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.29e-01 -0.11 0.0724 0.53 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0361 0.0567 0.53 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 8.92e-01 0.0072 0.0528 0.53 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 2.01e-01 -0.103 0.0801 0.53 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 182559 sc-eQTL 5.91e-01 0.0448 0.0832 0.53 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 8.55e-01 0.015 0.082 0.52 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 5.96e-01 0.0492 0.0928 0.52 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 6.46e-01 0.0453 0.0983 0.52 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 6.72e-01 0.0393 0.0927 0.52 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 1.99e-01 -0.124 0.0966 0.52 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 1.43e-01 0.1 0.0682 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 2.36e-01 0.0786 0.0662 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0693 0.0747 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 2.03e-01 0.0948 0.0743 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 4.36e-01 0.068 0.0872 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0152 0.067 0.532 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 8.44e-01 0.0153 0.0774 0.532 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 3.30e-01 0.0742 0.0759 0.532 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0618 0.0805 0.532 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 2.74e-01 0.0975 0.089 0.532 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 2.17e-01 0.0676 0.0546 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 4.86e-01 0.0401 0.0573 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 2.85e-01 0.0725 0.0677 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 2.71e-01 0.0727 0.0658 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0365 0.0846 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 2.02e-01 0.0895 0.0699 0.53 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.77e-01 0.0897 0.0662 0.53 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 5.37e-01 0.0484 0.0783 0.53 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 6.73e-01 0.0329 0.0778 0.53 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0294 0.0925 0.53 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 9.76e-01 0.00201 0.0659 0.534 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0317 0.0929 0.534 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0387 0.094 0.534 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 3.07e-01 0.0834 0.0815 0.534 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0785 0.0943 0.534 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 6.35e-01 0.0188 0.0396 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 7.64e-01 0.0172 0.0572 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0121 0.0573 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0349 0.0508 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 9.01e-02 -0.106 0.0622 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0186 0.0385 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00852 0.0654 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0393 0.0643 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0158 0.0528 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 6.02e-01 0.0376 0.0721 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 2.98e-01 0.0501 0.048 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 4.50e-01 0.0562 0.0742 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 2.63e-01 0.0773 0.0689 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0931 0.072 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 8.42e-02 -0.148 0.0852 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 8.29e-01 0.0101 0.0467 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0472 0.0843 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 2.94e-01 0.0807 0.0766 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0161 0.0706 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00495 0.0792 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0675 0.0551 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 5.71e-01 0.0376 0.0662 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 6.21e-02 -0.13 0.0695 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 1.06e-01 0.102 0.0627 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0339 0.075 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 9.15e-02 0.105 0.0617 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.21e-01 0.141 0.0907 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0771 0.0771 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 6.62e-01 0.039 0.089 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0586 0.0871 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0322 0.0754 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 8.98e-01 0.0119 0.0923 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0049 0.0908 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 9.26e-01 0.00789 0.0844 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0855 0.0914 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 8.39e-01 0.0102 0.0502 0.53 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 880978 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0663 0.0675 0.53 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0759 0.0774 0.53 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0432 0.065 0.53 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0216 0.0754 0.53 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0984 0.0844 0.53 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 182559 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0315 0.0839 0.53 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 2.40e-03 0.159 0.0518 0.536 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 6.67e-01 0.0338 0.0783 0.536 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 7.69e-01 0.0245 0.0831 0.536 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 4.53e-02 0.173 0.0861 0.536 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0144 0.0877 0.536 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 3.55e-02 0.0931 0.044 0.534 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0352 0.0803 0.534 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0136 0.0711 0.534 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0941 0.0673 0.534 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0101 0.0779 0.534 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0306 0.0696 0.537 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0883 0.0911 0.537 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 7.93e-02 0.148 0.0841 0.537 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 3.03e-02 0.19 0.0872 0.537 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0172 0.0835 0.537 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 7.44e-01 0.0159 0.0487 0.534 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0231 0.0824 0.534 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0045 0.0789 0.534 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 1.16e-01 0.105 0.0664 0.534 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 1.28e-01 0.125 0.0822 0.534 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0806 0.0997 0.526 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0665 0.088 0.526 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 6.25e-03 0.305 0.109 0.526 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 5.94e-01 0.0589 0.11 0.526 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0285 0.131 0.526 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0145 0.0543 0.526 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 880978 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0551 0.0608 0.526 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0121 0.0717 0.526 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0607 0.0866 0.526 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00128 0.0547 0.526 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 8.57e-01 0.0143 0.0794 0.526 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 182559 sc-eQTL 4.96e-01 0.0437 0.0642 0.526 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0952 0.0594 0.53 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0768 0.0755 0.53 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0566 0.0685 0.53 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 6.24e-01 0.039 0.0794 0.53 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 6.09e-01 0.0454 0.0886 0.53 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00729 0.0761 0.529 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0704 0.0789 0.529 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.59e-03 0.211 0.066 0.529 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 7.90e-01 0.0239 0.0895 0.529 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00104 0.0749 0.529 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 2.73e-01 -0.1 0.091 0.529 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0319 0.0769 0.529 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 7.02e-02 -0.117 0.0641 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 6.41e-01 0.0329 0.0705 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 3.99e-02 0.156 0.0754 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0735 0.0585 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0494 0.0604 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 5.95e-03 -0.228 0.0819 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 2.95e-02 0.169 0.0769 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0222 0.0733 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 5.21e-01 0.0528 0.0822 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.45e-01 0.12 0.0818 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 7.44e-01 0.0219 0.067 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 5.68e-01 0.0379 0.0662 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0824 0.0892 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 2.49e-02 0.188 0.0831 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 7.32e-01 0.0253 0.0739 0.527 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 880978 sc-eQTL 9.03e-01 0.0104 0.0848 0.527 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.10e-01 -0.176 0.11 0.527 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 5.05e-01 0.0684 0.102 0.527 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 2.14e-02 0.226 0.097 0.527 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00151 0.109 0.527 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 182559 sc-eQTL 8.01e-01 0.0242 0.0956 0.527 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0804 0.082 0.527 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 6.68e-01 0.0356 0.0831 0.527 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.24e-01 0.131 0.0847 0.527 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0317 0.0759 0.527 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0752 0.081 0.527 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 1.29e-01 -0.128 0.0839 0.527 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 1.43e-01 0.124 0.0844 0.527 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00571 0.0665 0.516 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00929 0.0742 0.516 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 6.99e-01 0.032 0.0827 0.516 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00557 0.071 0.516 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 3.18e-02 -0.155 0.0717 0.516 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 6.21e-01 0.0381 0.077 0.516 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 6.86e-01 0.0356 0.0879 0.516 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0796 0.0864 0.52 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 8.46e-01 0.0142 0.0731 0.52 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 3.59e-02 0.171 0.0807 0.52 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 5.03e-01 0.0672 0.1 0.52 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 4.96e-01 0.0595 0.0872 0.52 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0238 0.0964 0.52 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 8.97e-01 0.0107 0.0827 0.52 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 3.63e-01 0.0522 0.0572 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.87e-01 0.0784 0.0593 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00451 0.068 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 6.28e-01 0.0319 0.0659 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 5.45e-01 0.0524 0.0864 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 6.74e-02 0.09 0.049 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 1.48e-01 0.08 0.0551 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 4.62e-01 0.0464 0.063 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 5.36e-01 0.0393 0.0635 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0502 0.084 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 8.26e-02 -0.101 0.0579 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 8.01e-01 0.0179 0.0707 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 4.02e-02 0.159 0.0768 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0327 0.056 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 6.57e-01 -0.024 0.0541 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 2.38e-02 -0.191 0.0838 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 1.27e-02 0.195 0.0774 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0416 0.0603 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 675765 sc-eQTL 8.87e-01 0.0102 0.0714 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 2.38e-01 0.0934 0.0789 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0322 0.0585 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 3.70e-02 -0.126 0.0598 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0624 0.0774 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 646807 sc-eQTL 8.84e-01 0.0119 0.082 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 271650 sc-eQTL 2.39e-01 0.0492 0.0417 0.534 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 628610 sc-eQTL 2.54e-01 -0.083 0.0725 0.534 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 477755 sc-eQTL 6.47e-01 0.0305 0.0666 0.534 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 813202 sc-eQTL 8.14e-01 0.0134 0.057 0.534 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 sc-eQTL 4.86e-01 0.0496 0.071 0.534 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 eQTL 0.000999 -0.0764 0.0232 0.0 0.0 0.463
ENSG00000188596 CFAP54 182555 eQTL 0.00088 -0.0645 0.0193 0.0 0.0 0.463

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -235093 3.68e-06 1.53e-06 7.87e-07 1.7e-06 3.55e-07 7.73e-07 2.46e-06 2.25e-07 1.68e-06 6.07e-07 2.02e-06 8.93e-07 4.58e-06 4.19e-07 5.69e-07 9.92e-07 8.26e-07 1.35e-06 1.38e-06 1.13e-06 8.63e-07 2.91e-06 3.09e-06 8.52e-07 2.61e-06 7.54e-07 9.35e-07 1.05e-06 3.55e-06 1.31e-06 1.07e-06 6.7e-08 3.16e-07 1.31e-06 8.57e-07 6.12e-07 8.3e-07 3.86e-07 4.82e-07 2.05e-07 3.45e-07 4.93e-06 5.95e-07 7.3e-08 1.92e-07 3.52e-07 2.69e-07 3.05e-08 1.97e-07
ENSG00000188596 CFAP54 182555 4.89e-06 3.49e-06 9.65e-07 2.43e-06 5.29e-07 1.53e-06 5.25e-06 3.56e-07 3.03e-06 8.25e-07 2.6e-06 1.34e-06 7.12e-06 1.36e-06 5.7e-07 1.54e-06 1.1e-06 2.11e-06 1.44e-06 9.89e-07 2.06e-06 4.56e-06 4.63e-06 1.64e-06 4.77e-06 1.33e-06 1.18e-06 1.56e-06 4.73e-06 2.37e-06 2.01e-06 9.48e-08 5.97e-07 1.54e-06 1.75e-06 9.33e-07 8.96e-07 4.93e-07 7.83e-07 3.46e-07 2.08e-07 8.5e-06 4.19e-07 1.06e-07 3.55e-07 1.13e-06 7.09e-07 8.31e-08 2.05e-07