logo

Genes within 1Mb (chr12:96661524:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 4.84e-03 -0.124 0.0434 0.534 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0779 0.0547 0.534 B L1
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0717 0.0583 0.534 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0759 0.0529 0.534 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 5.84e-01 0.0425 0.0776 0.534 B L1
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0115 0.0368 0.534 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 8.46e-01 0.0098 0.0505 0.534 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 3.72e-01 0.0489 0.0546 0.534 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 3.20e-01 0.0476 0.0477 0.534 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 4.32e-01 0.0463 0.0588 0.534 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0235 0.0377 0.534 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 6.48e-01 0.0185 0.0405 0.534 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 1.92e-01 0.0795 0.0607 0.534 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 9.96e-01 0.000259 0.0499 0.534 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 4.55e-01 0.0496 0.0663 0.534 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00377 0.0706 0.536 DC L1
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 1.13e-01 0.127 0.0798 0.536 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 4.53e-02 -0.131 0.065 0.536 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0356 0.0804 0.536 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0104 0.0669 0.536 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 2.40e-01 0.101 0.0856 0.536 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 6.16e-01 0.0389 0.0775 0.536 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 6.23e-01 0.028 0.0569 0.534 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00615 0.0717 0.534 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0918 0.0807 0.534 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 6.58e-01 0.0241 0.0543 0.534 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 1.10e-01 0.0817 0.0509 0.534 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.07e-01 0.0804 0.0785 0.534 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 4.02e-01 -0.064 0.0761 0.534 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 4.80e-02 -0.0832 0.0418 0.532 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 6.68e-01 0.0308 0.0716 0.532 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0414 0.0679 0.532 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 9.38e-01 0.00439 0.0563 0.532 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0646 0.0712 0.532 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0329 0.0351 0.534 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 870372 sc-eQTL 1.08e-01 0.104 0.0646 0.534 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 6.09e-01 0.0376 0.0735 0.534 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 1.79e-01 0.0771 0.0571 0.534 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 4.46e-01 0.0406 0.0532 0.534 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 5.31e-01 0.0508 0.0811 0.534 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 171953 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0424 0.084 0.534 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0458 0.0824 0.543 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0335 0.0934 0.543 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0831 0.0987 0.543 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00443 0.0932 0.543 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.97e-02 0.2 0.0964 0.543 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 6.15e-02 -0.128 0.0681 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0805 0.0662 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 3.35e-01 0.0722 0.0748 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 9.31e-01 0.00649 0.0746 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 5.60e-01 -0.051 0.0874 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0206 0.0676 0.532 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 9.26e-01 0.00725 0.078 0.532 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0567 0.0766 0.532 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 9.33e-01 0.00688 0.0813 0.532 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 7.67e-02 -0.159 0.0893 0.532 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0795 0.055 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0443 0.0578 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0907 0.0682 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0817 0.0664 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 9.26e-01 0.00799 0.0854 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 1.14e-01 -0.111 0.0699 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 2.13e-01 -0.083 0.0664 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 8.55e-01 0.0144 0.0786 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0766 0.0778 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.31e-01 0.0902 0.0925 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0176 0.0645 0.527 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 1.86e-01 0.12 0.0907 0.527 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 2.97e-01 0.0962 0.0919 0.527 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 9.17e-01 0.00837 0.0801 0.527 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 2.46e-01 0.107 0.0923 0.527 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0282 0.0402 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 6.96e-01 0.0228 0.0582 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 4.14e-01 0.0476 0.0582 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 3.94e-01 0.0442 0.0517 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 1.17e-01 0.0997 0.0634 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 4.93e-01 -0.027 0.0394 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0174 0.0669 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 8.38e-02 0.113 0.0653 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 2.60e-01 0.0607 0.0538 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0756 0.0735 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 2.59e-02 -0.108 0.0482 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0436 0.0753 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0671 0.0699 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 1.74e-01 0.0996 0.073 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 7.35e-01 0.0294 0.0869 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0478 0.0468 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 6.13e-01 0.0428 0.0846 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 5.78e-01 -0.043 0.0771 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0114 0.0709 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.44e-01 0.0753 0.0793 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 7.40e-01 0.0187 0.0562 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0155 0.0673 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 2.17e-02 0.163 0.0704 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0811 0.0638 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 8.39e-01 0.0156 0.0763 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 7.76e-02 -0.109 0.0614 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 1.94e-01 -0.118 0.0905 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 6.89e-01 0.0308 0.077 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0771 0.0885 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 4.18e-01 0.0703 0.0867 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0762 0.0777 0.539 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 7.48e-01 0.0307 0.0953 0.539 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 3.38e-01 0.0898 0.0935 0.539 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 2.84e-01 0.0933 0.0869 0.539 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.87e-01 0.0819 0.0944 0.539 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 8.44e-01 -0.00997 0.0507 0.535 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 870372 sc-eQTL 2.59e-01 0.0772 0.0682 0.535 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 9.23e-01 0.00754 0.0783 0.535 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 1.21e-01 0.102 0.0654 0.535 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 4.28e-01 0.0604 0.0761 0.535 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 4.45e-01 0.0654 0.0854 0.535 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 171953 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0107 0.0848 0.535 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 6.11e-04 -0.181 0.0519 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0689 0.0789 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 8.31e-01 -0.018 0.0839 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 1.24e-01 -0.135 0.0873 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0773 0.0884 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 1.61e-02 -0.108 0.0446 0.53 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 8.94e-01 0.0109 0.0817 0.53 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 6.49e-01 0.033 0.0723 0.53 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 5.42e-02 0.132 0.0682 0.53 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 9.29e-01 0.00711 0.0792 0.53 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0669 0.0712 0.53 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00212 0.0936 0.53 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 5.55e-02 -0.166 0.086 0.53 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 1.94e-01 -0.117 0.0901 0.53 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00912 0.0856 0.53 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0249 0.0497 0.53 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 3.87e-01 0.0727 0.0839 0.53 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0139 0.0805 0.53 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0454 0.0681 0.53 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 1.07e-01 -0.136 0.0838 0.53 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 6.26e-01 0.0493 0.101 0.556 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 6.15e-01 0.045 0.0891 0.556 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 1.04e-02 -0.289 0.111 0.556 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 1.27e-01 -0.17 0.11 0.556 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 9.50e-02 0.22 0.131 0.556 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 4.13e-01 0.045 0.0548 0.539 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 870372 sc-eQTL 4.29e-01 0.0488 0.0616 0.539 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0148 0.0725 0.539 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 3.93e-01 0.0749 0.0876 0.539 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 6.28e-01 0.0268 0.0553 0.539 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0148 0.0803 0.539 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 171953 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0294 0.0649 0.539 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 4.28e-01 0.0485 0.0611 0.534 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 8.96e-01 0.0102 0.0775 0.534 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 2.90e-01 0.0742 0.07 0.534 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0302 0.0813 0.534 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0721 0.0906 0.534 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0404 0.0754 0.537 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 2.47e-01 0.0908 0.0781 0.537 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 6.30e-03 -0.182 0.0659 0.537 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 9.21e-01 0.00885 0.0887 0.537 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0189 0.0743 0.537 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 6.88e-01 0.0364 0.0905 0.537 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 8.31e-01 0.0164 0.0763 0.537 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 1.53e-01 0.0936 0.0652 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 9.67e-01 0.003 0.0715 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0991 0.0769 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 6.63e-02 0.109 0.059 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 3.29e-01 0.06 0.0612 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.03e-02 0.182 0.0836 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 1.80e-01 -0.106 0.0786 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 8.79e-01 0.0113 0.0742 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0719 0.0832 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0699 0.0831 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 2.95e-01 -0.071 0.0676 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0314 0.067 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 7.85e-01 0.0247 0.0904 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 1.61e-01 -0.119 0.0847 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 9.26e-01 0.00675 0.0722 0.518 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 870372 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00111 0.0828 0.518 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 2.54e-01 0.123 0.107 0.518 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0512 0.0998 0.518 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 1.17e-01 -0.151 0.0956 0.518 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 5.67e-01 0.0611 0.106 0.518 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 171953 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00331 0.0933 0.518 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 7.69e-01 0.0245 0.0833 0.538 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 2.21e-01 -0.103 0.0839 0.538 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 2.44e-01 -0.101 0.0861 0.538 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0137 0.077 0.538 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 2.23e-01 0.1 0.082 0.538 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 5.44e-01 0.052 0.0854 0.538 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 1.74e-01 -0.117 0.0856 0.538 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00382 0.067 0.545 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 8.31e-01 0.016 0.0748 0.545 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 4.80e-01 0.059 0.0833 0.545 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0282 0.0716 0.545 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 3.66e-02 0.152 0.0724 0.545 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0802 0.0775 0.545 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 7.82e-02 0.156 0.088 0.545 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0289 0.0861 0.528 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 3.62e-01 0.0663 0.0725 0.528 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 2.96e-02 -0.176 0.0802 0.528 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0333 0.0996 0.528 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0534 0.0868 0.528 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 5.32e-01 0.06 0.0958 0.528 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0184 0.0822 0.528 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 9.77e-02 -0.0959 0.0577 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0779 0.06 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00512 0.0689 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0281 0.0667 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0311 0.0875 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 2.46e-02 -0.111 0.049 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0698 0.0554 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0443 0.0633 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0771 0.0636 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 5.02e-01 0.0567 0.0843 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 1.73e-01 0.0805 0.0588 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 9.96e-01 0.000344 0.0715 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 1.71e-01 -0.107 0.0782 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 6.32e-01 0.0272 0.0567 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 5.15e-01 0.0357 0.0547 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 1.18e-01 0.134 0.0854 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 1.35e-01 -0.119 0.0791 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 7.63e-01 0.0184 0.0611 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 665159 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00915 0.0722 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0193 0.0801 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 9.17e-01 0.00619 0.0592 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 2.65e-02 0.135 0.0604 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0214 0.0783 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 636201 sc-eQTL 3.21e-01 0.0822 0.0827 0.532 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 261044 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0696 0.0423 0.53 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 618004 sc-eQTL 4.08e-01 0.0613 0.0739 0.53 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 467149 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0428 0.0677 0.53 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 802596 sc-eQTL 5.95e-01 0.0309 0.0579 0.53 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -245699 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0616 0.0722 0.53 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000188596 CFAP54 171949 eQTL 0.0059 0.0528 0.0191 0.0 0.0 0.466

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina