logo

Genes within 1Mb (chr12:96660187:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0837 0.0664 0.128 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 7.72e-01 -0.024 0.0828 0.128 B L1
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0775 0.088 0.128 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 5.87e-02 -0.151 0.0794 0.128 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00467 0.117 0.128 B L1
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0249 0.0551 0.128 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0115 0.0757 0.128 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 8.48e-01 0.0157 0.082 0.128 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 5.91e-01 0.0386 0.0716 0.128 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0748 0.0881 0.128 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00486 0.0562 0.128 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0219 0.0604 0.128 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0222 0.0909 0.128 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 6.65e-01 0.0323 0.0744 0.128 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 9.81e-01 0.00238 0.099 0.128 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0106 0.107 0.126 DC L1
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 6.49e-02 0.225 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0904 0.0997 0.126 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 3.58e-01 -0.112 0.122 0.126 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 3.99e-01 0.0859 0.102 0.126 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 2.21e-01 -0.16 0.13 0.126 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 9.49e-01 0.00757 0.118 0.126 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0983 0.0854 0.128 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 8.72e-01 0.0175 0.108 0.128 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 8.41e-01 0.0245 0.122 0.128 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0428 0.0817 0.128 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 5.51e-01 0.046 0.0771 0.128 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 1.06e-01 -0.191 0.118 0.128 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 2.46e-01 0.133 0.114 0.128 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0225 0.0632 0.129 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0704 0.107 0.129 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 3.17e-01 -0.102 0.101 0.129 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 2.74e-01 0.0923 0.0841 0.129 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0553 0.107 0.129 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 6.86e-02 -0.0977 0.0534 0.128 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 869035 sc-eQTL 4.46e-01 0.0758 0.0993 0.128 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 5.02e-01 0.0755 0.112 0.128 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 4.60e-01 0.0648 0.0876 0.128 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 5.20e-01 0.0524 0.0814 0.128 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0727 0.124 0.128 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 170616 sc-eQTL 3.18e-01 0.128 0.128 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 1.40e-01 -0.177 0.12 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 2.51e-01 0.156 0.136 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 9.45e-01 0.00998 0.144 0.13 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 1.97e-01 0.175 0.135 0.13 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 3.93e-01 0.122 0.142 0.13 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0195 0.102 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 3.83e-01 0.0863 0.0986 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 7.25e-01 0.0393 0.111 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 4.68e-01 0.0806 0.111 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 8.30e-01 0.028 0.13 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0514 0.102 0.129 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0469 0.118 0.129 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 1.09e-01 -0.185 0.115 0.129 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0742 0.123 0.129 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 2.49e-01 -0.156 0.135 0.129 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 4.84e-01 0.0585 0.0834 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 8.32e-01 0.0186 0.0875 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0435 0.103 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0821 0.1 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0824 0.129 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 2.48e-01 -0.122 0.105 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0173 0.1 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 3.24e-01 0.116 0.118 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 6.80e-02 -0.213 0.116 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0365 0.139 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 8.63e-01 -0.017 0.0985 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 6.56e-02 0.255 0.138 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0297 0.141 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 4.93e-01 0.0838 0.122 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0271 0.141 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 6.30e-01 -0.029 0.0602 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 6.21e-01 0.0431 0.087 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 5.58e-01 0.051 0.087 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 8.05e-01 0.0191 0.0774 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 8.60e-01 0.0168 0.0953 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0623 0.0588 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 2.83e-01 -0.108 0.0998 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 7.12e-02 0.177 0.0977 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 8.36e-01 0.0168 0.0808 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 7.72e-01 -0.032 0.11 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 1.81e-01 -0.098 0.073 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0316 0.113 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 7.33e-01 -0.036 0.105 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 9.45e-02 0.184 0.109 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 1.22e-01 -0.202 0.13 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 5.83e-01 0.0384 0.0698 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0868 0.126 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00417 0.115 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 7.66e-01 0.0315 0.106 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.77e-01 0.0661 0.118 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 6.62e-01 0.0369 0.0844 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0984 0.101 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 4.45e-01 0.0817 0.107 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0485 0.0962 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0617 0.114 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0169 0.0938 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0869 0.138 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0946 0.116 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 6.48e-01 0.0615 0.134 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 6.40e-01 0.0617 0.132 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 3.30e-01 -0.109 0.112 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 2.36e-01 0.163 0.137 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 1.52e-01 0.193 0.134 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 2.45e-01 0.146 0.125 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0848 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 5.22e-01 -0.049 0.0764 0.128 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 869035 sc-eQTL 8.14e-01 0.0243 0.103 0.128 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0647 0.118 0.128 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 4.50e-01 0.0749 0.099 0.128 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 3.33e-01 0.111 0.115 0.128 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 3.41e-01 0.123 0.129 0.128 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 170616 sc-eQTL 5.02e-01 0.0859 0.128 0.128 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0281 0.0802 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0332 0.119 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 8.18e-01 0.0291 0.126 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 2.22e-01 0.161 0.131 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 1.79e-01 -0.178 0.132 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0813 0.0684 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 3.57e-01 -0.114 0.124 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0138 0.11 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 1.56e-01 0.148 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0828 0.12 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 2.14e-01 -0.134 0.107 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0816 0.141 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 4.79e-01 -0.093 0.131 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0935 0.137 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 4.97e-01 -0.088 0.129 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00143 0.075 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 2.42e-01 0.148 0.126 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 1.87e-01 -0.16 0.121 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 6.30e-01 0.0495 0.103 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 9.58e-01 0.00676 0.127 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 1.64e-01 -0.172 0.123 0.167 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 1.45e-01 0.159 0.108 0.167 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 7.43e-01 0.0461 0.14 0.167 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 4.30e-01 -0.108 0.136 0.167 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 4.04e-01 0.136 0.162 0.167 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0681 0.0843 0.13 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 869035 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0196 0.0948 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 1.48e-01 0.161 0.111 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 7.42e-01 0.0444 0.135 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 6.06e-01 0.0439 0.085 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0761 0.123 0.13 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 170616 sc-eQTL 9.95e-01 0.000681 0.0999 0.13 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 7.70e-01 0.0268 0.0914 0.128 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 2.95e-01 -0.121 0.116 0.128 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 1.97e-01 0.135 0.105 0.128 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 6.82e-01 0.0498 0.121 0.128 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 1.60e-02 -0.325 0.134 0.128 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0419 0.114 0.124 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 4.00e-01 0.1 0.119 0.124 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 5.52e-02 -0.195 0.101 0.124 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 4.64e-01 0.0985 0.134 0.124 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0118 0.113 0.124 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 2.52e-01 -0.157 0.137 0.124 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 4.05e-01 0.0962 0.115 0.124 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 1.22e-01 -0.152 0.0981 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0349 0.108 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 5.12e-01 0.0763 0.116 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 8.41e-01 0.018 0.0896 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 7.98e-01 0.0237 0.0924 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 3.64e-01 -0.116 0.127 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 3.91e-01 0.102 0.119 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 1.37e-01 -0.166 0.111 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 7.13e-01 0.046 0.125 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0207 0.125 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0907 0.102 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 2.31e-01 -0.121 0.1 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0602 0.136 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00144 0.128 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 8.37e-01 0.0232 0.113 0.106 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 869035 sc-eQTL 3.02e-01 0.134 0.129 0.106 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 2.40e-01 0.198 0.168 0.106 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 1.20e-01 -0.243 0.155 0.106 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 6.01e-01 0.0789 0.151 0.106 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.67e-01 0.0954 0.166 0.106 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 170616 sc-eQTL 8.80e-01 0.022 0.146 0.106 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0516 0.125 0.129 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 5.90e-01 -0.068 0.126 0.129 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 5.23e-01 0.0825 0.129 0.129 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 1.40e-01 -0.17 0.115 0.129 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 2.88e-01 0.131 0.123 0.129 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 9.31e-02 -0.214 0.127 0.129 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 6.73e-01 0.0543 0.129 0.129 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0399 0.1 0.129 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 7.03e-01 0.0427 0.112 0.129 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 2.34e-01 0.148 0.124 0.129 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 6.54e-01 -0.048 0.107 0.129 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 1.84e-01 0.145 0.109 0.129 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.19e-01 -0.075 0.116 0.129 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 6.50e-03 0.358 0.13 0.129 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 9.21e-02 -0.23 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 2.03e-01 0.147 0.115 0.119 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 5.68e-01 0.074 0.129 0.119 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0983 0.158 0.119 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 6.13e-01 0.0701 0.138 0.119 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 4.09e-02 -0.31 0.151 0.119 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 4.07e-01 0.109 0.131 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0783 0.0862 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 9.94e-01 0.000685 0.0897 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 3.08e-01 -0.104 0.102 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0319 0.0993 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 8.88e-01 0.0183 0.13 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0285 0.0748 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 6.94e-01 0.0331 0.084 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 9.28e-01 0.00866 0.0956 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 1.08e-01 -0.155 0.0957 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0803 0.127 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 8.07e-02 -0.155 0.0883 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 8.60e-01 0.019 0.108 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 8.56e-01 0.0214 0.118 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0288 0.0854 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0186 0.0824 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0946 0.129 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 5.78e-01 0.0667 0.12 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0497 0.0912 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 663822 sc-eQTL 7.88e-01 0.029 0.108 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 3.48e-01 0.112 0.119 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0803 0.0883 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 3.42e-01 0.0867 0.091 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 4.60e-02 -0.233 0.116 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 634864 sc-eQTL 5.98e-02 0.232 0.123 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 259707 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0529 0.0644 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 616667 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0761 0.112 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 465812 sc-eQTL 1.73e-01 -0.14 0.102 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 801259 sc-eQTL 5.72e-01 0.0497 0.0878 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0632 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 801259 eQTL 0.0377 0.0268 0.0129 0.00112 0.0 0.125
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 eQTL 9.4e-11 -0.221 0.0338 0.0 0.0 0.125

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -247036 1.28e-06 1.03e-06 2.74e-07 1.15e-06 3.95e-07 6.36e-07 1.52e-06 4.11e-07 1.5e-06 6.19e-07 1.84e-06 8.32e-07 2.34e-06 2.92e-07 4.95e-07 9.92e-07 8.82e-07 9.05e-07 7.81e-07 5.17e-07 7.85e-07 1.8e-06 9.91e-07 5.3e-07 2.31e-06 7.37e-07 9.49e-07 9.17e-07 1.62e-06 1.21e-06 7.32e-07 2.89e-07 2.77e-07 6.29e-07 5.34e-07 4.6e-07 7.09e-07 2.79e-07 4.82e-07 2.93e-07 3.4e-07 1.6e-06 1.24e-07 1.06e-07 2.85e-07 1.99e-07 2.46e-07 8.15e-08 2.04e-07