logo

Genes within 1Mb (chr12:96658880:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 1.93e-04 -0.243 0.0642 0.13 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0833 0.0822 0.13 B L1
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 2.08e-01 -0.11 0.0874 0.13 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 2.04e-01 -0.101 0.0794 0.13 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 7.22e-01 0.0414 0.116 0.13 B L1
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 9.67e-02 -0.0901 0.054 0.13 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 8.83e-01 0.011 0.0747 0.13 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 5.49e-01 0.0485 0.0808 0.13 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0733 0.0705 0.13 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 8.81e-06 0.379 0.0831 0.13 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 3.45e-02 -0.117 0.0548 0.13 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.35e-01 0.0887 0.0591 0.13 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 2.16e-01 0.111 0.0891 0.13 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0298 0.0733 0.13 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 9.01e-02 0.165 0.0967 0.13 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 9.63e-03 -0.27 0.103 0.133 DC L1
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 5.59e-01 -0.07 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.63e-02 -0.234 0.0964 0.133 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 6.70e-01 0.0511 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 1.61e-01 -0.14 0.0992 0.133 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 1.11e-01 0.203 0.127 0.133 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 2.14e-01 -0.143 0.115 0.133 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 2.61e-01 0.0945 0.0838 0.13 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 3.77e-02 -0.219 0.105 0.13 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 9.13e-02 -0.201 0.119 0.13 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 5.85e-01 0.0439 0.0802 0.13 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 2.96e-01 0.0791 0.0755 0.13 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0935 0.116 0.13 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 1.28e-01 -0.171 0.112 0.13 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 1.71e-02 -0.149 0.0619 0.127 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.40e-01 0.157 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 9.01e-01 0.0125 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 3.30e-02 -0.178 0.0828 0.127 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0805 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0238 0.053 0.13 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 867728 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0521 0.0979 0.13 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 6.41e-01 0.0516 0.111 0.13 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 4.00e-01 0.0728 0.0863 0.13 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0704 0.0802 0.13 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 9.31e-01 0.0106 0.122 0.13 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 169309 sc-eQTL 9.65e-02 0.21 0.126 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0771 0.122 0.135 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 5.41e-02 -0.266 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 5.58e-01 -0.086 0.146 0.135 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 1.72e-01 -0.189 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 9.69e-01 0.00563 0.145 0.135 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 3.36e-04 -0.358 0.0982 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 9.55e-03 -0.252 0.0965 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 8.93e-01 0.0149 0.111 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 2.10e-01 -0.138 0.11 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 2.64e-01 -0.144 0.129 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 5.34e-02 -0.189 0.0975 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 3.74e-02 -0.235 0.112 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 8.47e-01 0.0216 0.112 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0337 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0396 0.131 0.131 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 3.88e-03 -0.232 0.0795 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 2.37e-01 -0.1 0.0847 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 1.19e-02 -0.251 0.0989 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 1.57e-01 -0.138 0.0972 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 2.90e-01 0.133 0.125 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 8.26e-01 -0.023 0.104 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0887 0.0986 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0749 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00838 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 5.00e-01 0.0929 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 2.22e-01 -0.118 0.0965 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.47e-02 0.331 0.135 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 9.76e-01 0.00417 0.138 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 2.69e-01 -0.133 0.12 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0962 0.139 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 8.83e-02 -0.102 0.0593 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 8.54e-01 0.016 0.0864 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 6.49e-01 0.0393 0.0863 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0893 0.0765 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 2.01e-04 0.346 0.0915 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0638 0.0582 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 2.04e-01 0.126 0.0987 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 1.12e-01 0.155 0.0969 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 9.33e-01 0.00678 0.0799 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 5.15e-01 0.0711 0.109 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0971 0.071 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0892 0.11 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 9.65e-01 0.00454 0.102 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 8.97e-01 0.0138 0.107 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 5.52e-03 0.35 0.125 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 5.17e-03 -0.19 0.0673 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 7.35e-02 0.221 0.123 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 1.29e-02 0.279 0.111 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0996 0.103 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 5.33e-01 0.0725 0.116 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 9.95e-02 -0.138 0.0835 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.64e-01 0.14 0.1 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 3.98e-01 0.0902 0.106 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 1.20e-01 -0.149 0.0952 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 5.52e-02 0.218 0.113 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 5.85e-02 -0.171 0.0901 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0177 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0576 0.113 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0864 0.13 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 6.44e-01 0.059 0.128 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 1.54e-01 -0.159 0.111 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 4.73e-01 -0.098 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 4.40e-01 0.104 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.124 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 9.88e-02 0.223 0.135 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 4.81e-01 0.0538 0.0762 0.13 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 867728 sc-eQTL 3.10e-01 -0.104 0.103 0.13 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 3.93e-01 0.101 0.118 0.13 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0109 0.0989 0.13 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0806 0.114 0.13 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 2.46e-01 0.149 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 169309 sc-eQTL 9.87e-01 0.00203 0.127 0.13 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 3.89e-02 -0.163 0.0786 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 7.77e-01 0.0333 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 7.78e-01 0.0352 0.125 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 1.44e-04 -0.488 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 3.84e-01 -0.115 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 6.10e-02 -0.128 0.0677 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0397 0.109 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0653 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 3.29e-01 -0.117 0.119 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 9.02e-01 0.013 0.106 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 3.16e-01 0.139 0.139 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 8.04e-01 0.032 0.129 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 3.61e-02 -0.28 0.133 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0802 0.127 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 1.69e-01 -0.101 0.0732 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.32e-01 0.187 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 2.47e-01 0.138 0.119 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 1.46e-01 -0.146 0.1 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0509 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 2.84e-01 0.139 0.129 0.133 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.114 0.133 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 3.87e-01 -0.127 0.146 0.133 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 3.71e-01 -0.128 0.143 0.133 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 3.65e-01 0.154 0.169 0.133 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 3.07e-01 0.0844 0.0823 0.13 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 867728 sc-eQTL 6.26e-01 0.0451 0.0926 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0448 0.109 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 2.00e-01 0.169 0.131 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 9.83e-01 0.00178 0.0831 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 8.77e-01 0.0188 0.121 0.13 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 169309 sc-eQTL 3.10e-01 0.099 0.0974 0.13 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 3.71e-01 0.08 0.0893 0.13 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 3.62e-01 0.103 0.113 0.13 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 5.15e-02 -0.199 0.102 0.13 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0234 0.119 0.13 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 4.89e-02 0.261 0.132 0.13 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 1.38e-02 -0.273 0.11 0.141 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0149 0.116 0.141 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.46e-01 -0.144 0.0988 0.141 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 5.68e-01 0.075 0.131 0.141 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0812 0.11 0.141 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 1.56e-01 0.19 0.133 0.141 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 2.74e-02 -0.248 0.111 0.141 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 2.31e-01 0.115 0.0959 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 2.74e-01 -0.115 0.105 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 6.38e-02 -0.21 0.112 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 5.35e-01 0.0542 0.0873 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 6.99e-01 0.0348 0.0901 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 8.51e-01 0.0234 0.124 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 5.21e-02 -0.224 0.115 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 5.75e-01 0.0613 0.109 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 1.71e-01 -0.168 0.122 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 2.71e-01 -0.135 0.122 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 7.23e-01 0.0355 0.0999 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 4.15e-01 0.0806 0.0986 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0721 0.133 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 3.73e-01 -0.112 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0121 0.109 0.13 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 867728 sc-eQTL 2.25e-01 -0.152 0.125 0.13 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 3.72e-01 0.146 0.163 0.13 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 1.64e-01 0.21 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 2.75e-02 -0.32 0.144 0.13 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 9.16e-01 -0.017 0.161 0.13 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 169309 sc-eQTL 3.90e-01 -0.122 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 3.65e-01 0.114 0.126 0.131 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 1.67e-01 -0.177 0.127 0.131 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0919 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00371 0.117 0.131 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 8.96e-02 -0.211 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 8.80e-01 0.0196 0.13 0.131 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 2.24e-01 -0.159 0.13 0.131 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0255 0.0985 0.133 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0596 0.11 0.133 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0289 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 7.50e-01 0.0336 0.105 0.133 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.133 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 2.67e-01 -0.127 0.114 0.133 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0817 0.13 0.133 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 2.99e-01 -0.135 0.13 0.138 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 5.92e-01 0.059 0.11 0.138 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.30e-02 -0.303 0.121 0.138 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 6.44e-02 -0.278 0.149 0.138 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 1.08e-01 -0.21 0.13 0.138 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 4.36e-01 0.113 0.145 0.138 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 8.76e-01 0.0195 0.124 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 5.44e-05 -0.339 0.0822 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.35e-02 -0.218 0.0875 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 4.58e-01 0.0753 0.101 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 4.23e-02 -0.199 0.0973 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0405 0.129 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 7.61e-03 -0.193 0.0716 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.08e-01 -0.131 0.0813 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 2.35e-02 -0.21 0.092 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0432 0.0937 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 3.95e-01 0.106 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 3.92e-01 0.0745 0.0868 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 9.77e-02 -0.174 0.105 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.64e-01 -0.161 0.115 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 6.74e-01 0.0351 0.0835 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 2.19e-01 0.099 0.0803 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0364 0.126 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 2.40e-01 -0.137 0.117 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 5.18e-01 0.0597 0.0923 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 662515 sc-eQTL 1.71e-01 -0.149 0.109 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 3.56e-01 -0.112 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 9.41e-01 0.00663 0.0896 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 8.66e-01 0.0156 0.0924 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 3.92e-01 -0.102 0.118 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 633557 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0959 0.125 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 258400 sc-eQTL 2.47e-02 -0.142 0.0628 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 615360 sc-eQTL 1.10e-01 0.176 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 464505 sc-eQTL 8.28e-01 0.022 0.101 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 799952 sc-eQTL 1.58e-01 -0.122 0.0862 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -248343 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0937 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 258400 eQTL 3.49e-03 0.0483 0.0165 0.00268 0.00137 0.134

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina