logo

Genes within 1Mb (chr12:96657399:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 1.93e-04 -0.243 0.0642 0.13 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0833 0.0822 0.13 B L1
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 2.08e-01 -0.11 0.0874 0.13 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 2.04e-01 -0.101 0.0794 0.13 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 7.22e-01 0.0414 0.116 0.13 B L1
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 9.67e-02 -0.0901 0.054 0.13 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 8.83e-01 0.011 0.0747 0.13 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 5.49e-01 0.0485 0.0808 0.13 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0733 0.0705 0.13 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 8.81e-06 0.379 0.0831 0.13 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 3.45e-02 -0.117 0.0548 0.13 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.35e-01 0.0887 0.0591 0.13 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 2.16e-01 0.111 0.0891 0.13 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0298 0.0733 0.13 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 9.01e-02 0.165 0.0967 0.13 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 9.63e-03 -0.27 0.103 0.133 DC L1
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 5.59e-01 -0.07 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.63e-02 -0.234 0.0964 0.133 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 6.70e-01 0.0511 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 1.61e-01 -0.14 0.0992 0.133 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 1.11e-01 0.203 0.127 0.133 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 2.14e-01 -0.143 0.115 0.133 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 2.61e-01 0.0945 0.0838 0.13 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 3.77e-02 -0.219 0.105 0.13 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 9.13e-02 -0.201 0.119 0.13 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 5.85e-01 0.0439 0.0802 0.13 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 2.96e-01 0.0791 0.0755 0.13 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0935 0.116 0.13 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 1.28e-01 -0.171 0.112 0.13 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 1.71e-02 -0.149 0.0619 0.127 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.40e-01 0.157 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 9.01e-01 0.0125 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 3.30e-02 -0.178 0.0828 0.127 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0805 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0238 0.053 0.13 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 866247 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0521 0.0979 0.13 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 6.41e-01 0.0516 0.111 0.13 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 4.00e-01 0.0728 0.0863 0.13 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0704 0.0802 0.13 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 9.31e-01 0.0106 0.122 0.13 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 167828 sc-eQTL 9.65e-02 0.21 0.126 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0771 0.122 0.135 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 5.41e-02 -0.266 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 5.58e-01 -0.086 0.146 0.135 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 1.72e-01 -0.189 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 9.69e-01 0.00563 0.145 0.135 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 3.36e-04 -0.358 0.0982 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 9.55e-03 -0.252 0.0965 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 8.93e-01 0.0149 0.111 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 2.10e-01 -0.138 0.11 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 2.64e-01 -0.144 0.129 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 5.34e-02 -0.189 0.0975 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 3.74e-02 -0.235 0.112 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 8.47e-01 0.0216 0.112 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0337 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0396 0.131 0.131 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 3.88e-03 -0.232 0.0795 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 2.37e-01 -0.1 0.0847 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 1.19e-02 -0.251 0.0989 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 1.57e-01 -0.138 0.0972 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 2.90e-01 0.133 0.125 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 8.26e-01 -0.023 0.104 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0887 0.0986 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0749 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00838 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 5.00e-01 0.0929 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 2.22e-01 -0.118 0.0965 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.47e-02 0.331 0.135 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 9.76e-01 0.00417 0.138 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 2.69e-01 -0.133 0.12 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0962 0.139 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 8.83e-02 -0.102 0.0593 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 8.54e-01 0.016 0.0864 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 6.49e-01 0.0393 0.0863 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0893 0.0765 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 2.01e-04 0.346 0.0915 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0638 0.0582 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 2.04e-01 0.126 0.0987 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 1.12e-01 0.155 0.0969 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 9.33e-01 0.00678 0.0799 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 5.15e-01 0.0711 0.109 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0971 0.071 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0892 0.11 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 9.65e-01 0.00454 0.102 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 8.97e-01 0.0138 0.107 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 5.52e-03 0.35 0.125 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 5.17e-03 -0.19 0.0673 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 7.35e-02 0.221 0.123 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 1.29e-02 0.279 0.111 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0996 0.103 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 5.33e-01 0.0725 0.116 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 9.95e-02 -0.138 0.0835 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.64e-01 0.14 0.1 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 3.98e-01 0.0902 0.106 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 1.20e-01 -0.149 0.0952 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 5.52e-02 0.218 0.113 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 5.85e-02 -0.171 0.0901 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0177 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0576 0.113 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0864 0.13 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 6.44e-01 0.059 0.128 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 1.54e-01 -0.159 0.111 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 4.73e-01 -0.098 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 4.40e-01 0.104 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.124 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 9.88e-02 0.223 0.135 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 4.81e-01 0.0538 0.0762 0.13 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 866247 sc-eQTL 3.10e-01 -0.104 0.103 0.13 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 3.93e-01 0.101 0.118 0.13 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0109 0.0989 0.13 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0806 0.114 0.13 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 2.46e-01 0.149 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 167828 sc-eQTL 9.87e-01 0.00203 0.127 0.13 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 3.89e-02 -0.163 0.0786 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 7.77e-01 0.0333 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 7.78e-01 0.0352 0.125 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 1.44e-04 -0.488 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 3.84e-01 -0.115 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 6.10e-02 -0.128 0.0677 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0397 0.109 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0653 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 3.29e-01 -0.117 0.119 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 9.02e-01 0.013 0.106 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 3.16e-01 0.139 0.139 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 8.04e-01 0.032 0.129 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 3.61e-02 -0.28 0.133 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0802 0.127 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 1.69e-01 -0.101 0.0732 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.32e-01 0.187 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 2.47e-01 0.138 0.119 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 1.46e-01 -0.146 0.1 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0509 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 2.84e-01 0.139 0.129 0.133 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.114 0.133 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 3.87e-01 -0.127 0.146 0.133 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 3.71e-01 -0.128 0.143 0.133 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 3.65e-01 0.154 0.169 0.133 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 3.07e-01 0.0844 0.0823 0.13 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 866247 sc-eQTL 6.26e-01 0.0451 0.0926 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0448 0.109 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 2.00e-01 0.169 0.131 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 9.83e-01 0.00178 0.0831 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 8.77e-01 0.0188 0.121 0.13 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 167828 sc-eQTL 3.10e-01 0.099 0.0974 0.13 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 3.71e-01 0.08 0.0893 0.13 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 3.62e-01 0.103 0.113 0.13 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 5.15e-02 -0.199 0.102 0.13 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0234 0.119 0.13 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 4.89e-02 0.261 0.132 0.13 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 1.38e-02 -0.273 0.11 0.141 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0149 0.116 0.141 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.46e-01 -0.144 0.0988 0.141 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 5.68e-01 0.075 0.131 0.141 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0812 0.11 0.141 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 1.56e-01 0.19 0.133 0.141 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 2.74e-02 -0.248 0.111 0.141 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 2.31e-01 0.115 0.0959 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 2.74e-01 -0.115 0.105 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 6.38e-02 -0.21 0.112 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 5.35e-01 0.0542 0.0873 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 6.99e-01 0.0348 0.0901 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 8.51e-01 0.0234 0.124 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 5.21e-02 -0.224 0.115 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 5.75e-01 0.0613 0.109 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 1.71e-01 -0.168 0.122 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 2.71e-01 -0.135 0.122 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 7.23e-01 0.0355 0.0999 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 4.15e-01 0.0806 0.0986 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0721 0.133 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 3.73e-01 -0.112 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0121 0.109 0.13 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 866247 sc-eQTL 2.25e-01 -0.152 0.125 0.13 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 3.72e-01 0.146 0.163 0.13 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 1.64e-01 0.21 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 2.75e-02 -0.32 0.144 0.13 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 9.16e-01 -0.017 0.161 0.13 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 167828 sc-eQTL 3.90e-01 -0.122 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 3.65e-01 0.114 0.126 0.131 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 1.67e-01 -0.177 0.127 0.131 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0919 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00371 0.117 0.131 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 8.96e-02 -0.211 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 8.80e-01 0.0196 0.13 0.131 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 2.24e-01 -0.159 0.13 0.131 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0255 0.0985 0.133 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0596 0.11 0.133 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0289 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 7.50e-01 0.0336 0.105 0.133 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.133 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 2.67e-01 -0.127 0.114 0.133 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0817 0.13 0.133 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 2.99e-01 -0.135 0.13 0.138 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 5.92e-01 0.059 0.11 0.138 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.30e-02 -0.303 0.121 0.138 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 6.44e-02 -0.278 0.149 0.138 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 1.08e-01 -0.21 0.13 0.138 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 4.36e-01 0.113 0.145 0.138 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 8.76e-01 0.0195 0.124 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 5.44e-05 -0.339 0.0822 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.35e-02 -0.218 0.0875 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 4.58e-01 0.0753 0.101 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 4.23e-02 -0.199 0.0973 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0405 0.129 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 7.61e-03 -0.193 0.0716 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.08e-01 -0.131 0.0813 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 2.35e-02 -0.21 0.092 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0432 0.0937 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 3.95e-01 0.106 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 3.92e-01 0.0745 0.0868 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 9.77e-02 -0.174 0.105 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.64e-01 -0.161 0.115 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 6.74e-01 0.0351 0.0835 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 2.19e-01 0.099 0.0803 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0364 0.126 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 2.40e-01 -0.137 0.117 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 5.18e-01 0.0597 0.0923 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 661034 sc-eQTL 1.71e-01 -0.149 0.109 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 3.56e-01 -0.112 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 9.41e-01 0.00663 0.0896 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 8.66e-01 0.0156 0.0924 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 3.92e-01 -0.102 0.118 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 632076 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0959 0.125 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 256919 sc-eQTL 2.47e-02 -0.142 0.0628 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 613879 sc-eQTL 1.10e-01 0.176 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 463024 sc-eQTL 8.28e-01 0.022 0.101 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 798471 sc-eQTL 1.58e-01 -0.122 0.0862 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -249824 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0937 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 256919 eQTL 4.09e-03 0.0476 0.0166 0.00245 0.0012 0.134

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina