logo

Genes within 1Mb (chr12:96654210:G:GT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 3.44e-01 0.0782 0.0825 0.925 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 9.04e-01 0.0124 0.103 0.925 B L1
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 3.37e-01 0.105 0.109 0.925 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0236 0.0993 0.925 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 1.46e-01 0.211 0.144 0.925 B L1
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0753 0.069 0.925 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 1.67e-01 0.131 0.0946 0.925 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 2.88e-01 -0.109 0.103 0.925 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0373 0.09 0.925 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 8.07e-01 0.0271 0.111 0.925 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 5.67e-01 0.0402 0.0702 0.925 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0677 0.0753 0.925 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 6.98e-01 0.0441 0.113 0.925 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0217 0.093 0.925 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 7.35e-01 0.042 0.124 0.925 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 2.54e-01 -0.146 0.128 0.926 DC L1
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 4.56e-01 0.109 0.145 0.926 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 5.61e-01 0.0693 0.119 0.926 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 1.14e-01 0.23 0.145 0.926 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0703 0.121 0.926 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0978 0.156 0.926 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0133 0.141 0.926 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0777 0.105 0.925 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 8.74e-01 0.0211 0.133 0.925 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 9.65e-01 0.00667 0.15 0.925 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 7.12e-01 0.0372 0.101 0.925 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0491 0.0948 0.925 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 6.86e-01 0.0589 0.146 0.925 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 2.64e-01 -0.157 0.141 0.925 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 1.30e-01 -0.119 0.0779 0.925 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 6.55e-01 0.0594 0.133 0.925 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 6.90e-01 0.0504 0.126 0.925 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0402 0.105 0.925 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0215 0.132 0.925 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0444 0.0649 0.925 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 863058 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0109 0.12 0.925 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 5.98e-02 0.255 0.135 0.925 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 8.29e-01 -0.023 0.106 0.925 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 1.19e-01 -0.153 0.098 0.925 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 3.48e-01 -0.141 0.15 0.925 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 164639 sc-eQTL 1.58e-02 0.373 0.153 0.925 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 4.84e-01 -0.104 0.148 0.923 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 6.09e-01 0.0856 0.167 0.923 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 3.70e-01 0.159 0.177 0.923 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 3.88e-01 -0.144 0.167 0.923 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 2.57e-01 -0.198 0.174 0.923 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 3.80e-01 0.111 0.126 0.925 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 4.12e-01 0.101 0.122 0.925 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0184 0.138 0.925 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 7.58e-01 0.0424 0.138 0.925 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 8.48e-01 0.0309 0.161 0.925 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0654 0.123 0.925 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 3.13e-01 0.143 0.141 0.925 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 4.19e-01 0.113 0.139 0.925 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 4.90e-01 -0.102 0.147 0.925 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0567 0.163 0.925 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 8.61e-01 0.018 0.103 0.925 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00978 0.107 0.925 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 2.64e-01 0.142 0.127 0.925 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 3.89e-01 -0.106 0.123 0.925 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 3.43e-02 0.334 0.157 0.925 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 6.74e-01 0.0542 0.128 0.925 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 4.02e-01 0.102 0.122 0.925 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 2.45e-01 0.167 0.143 0.925 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0661 0.142 0.925 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0607 0.169 0.925 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 5.23e-01 0.0767 0.12 0.923 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 2.62e-02 0.374 0.167 0.923 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 3.22e-01 -0.169 0.171 0.923 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0462 0.149 0.923 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 3.33e-01 -0.167 0.172 0.923 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0753 0.0752 0.925 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 1.01e-01 0.179 0.108 0.925 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 2.41e-01 -0.128 0.109 0.925 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0822 0.0967 0.925 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 3.73e-01 0.106 0.119 0.925 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 9.63e-01 0.00346 0.0736 0.925 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 8.33e-02 0.216 0.124 0.925 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 3.74e-01 -0.109 0.123 0.925 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 2.34e-01 0.12 0.1 0.925 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 8.46e-01 0.0267 0.138 0.925 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 3.59e-01 0.0816 0.0887 0.925 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 1.17e-01 -0.215 0.136 0.925 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 3.03e-01 0.131 0.127 0.925 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 7.98e-01 0.0341 0.134 0.925 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 9.36e-01 0.0128 0.158 0.925 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 6.58e-01 0.0381 0.0861 0.925 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0798 0.156 0.925 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 4.32e-01 0.111 0.141 0.925 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0665 0.13 0.925 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 3.87e-01 0.126 0.146 0.925 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0441 0.104 0.925 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0289 0.124 0.925 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 7.42e-01 0.0433 0.132 0.925 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 1.26e-01 -0.181 0.118 0.925 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 9.28e-01 0.0127 0.141 0.925 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 3.13e-01 0.114 0.113 0.924 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 5.19e-02 0.322 0.165 0.924 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 9.32e-01 0.012 0.141 0.924 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 2.68e-01 0.179 0.162 0.924 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 3.37e-01 -0.153 0.158 0.924 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 7.18e-02 0.245 0.135 0.92 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 4.50e-01 0.126 0.167 0.92 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 2.79e-01 0.178 0.164 0.92 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0803 0.153 0.92 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 8.76e-01 -0.026 0.166 0.92 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 5.11e-01 0.0612 0.0928 0.924 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 863058 sc-eQTL 8.75e-01 0.0198 0.125 0.924 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 3.90e-01 0.123 0.143 0.924 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0358 0.12 0.924 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 1.01e-02 -0.357 0.137 0.924 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0532 0.157 0.924 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 164639 sc-eQTL 1.24e-01 0.239 0.154 0.924 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 1.88e-01 0.129 0.0977 0.924 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0507 0.145 0.924 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 9.09e-01 0.0176 0.154 0.924 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 1.63e-01 -0.225 0.16 0.924 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 3.70e-01 -0.146 0.162 0.924 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 2.18e-01 -0.104 0.0839 0.925 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0375 0.152 0.925 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00486 0.135 0.925 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 3.35e-01 -0.124 0.128 0.925 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 4.31e-01 -0.116 0.147 0.925 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 6.54e-02 -0.245 0.132 0.929 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 1.09e-01 0.279 0.173 0.929 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 8.83e-01 0.0238 0.162 0.929 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 6.40e-01 -0.079 0.169 0.929 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 2.12e-01 0.199 0.159 0.929 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0453 0.092 0.925 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 9.46e-01 0.0105 0.156 0.925 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00297 0.149 0.925 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 3.24e-01 -0.125 0.126 0.925 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 5.72e-01 0.0881 0.156 0.925 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 6.74e-01 0.0716 0.17 0.926 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 3.70e-01 0.135 0.15 0.926 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 1.57e-01 0.271 0.191 0.926 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 9.95e-01 0.0012 0.188 0.926 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 6.40e-01 -0.105 0.223 0.926 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 4.56e-01 0.0773 0.103 0.924 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 863058 sc-eQTL 1.38e-01 0.172 0.116 0.924 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 7.92e-02 0.239 0.136 0.924 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 3.00e-01 -0.171 0.165 0.924 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 3.99e-01 0.0881 0.104 0.924 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0535 0.151 0.924 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 164639 sc-eQTL 6.12e-02 0.229 0.121 0.924 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0739 0.112 0.925 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 1.20e-01 0.22 0.141 0.925 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 1.74e-01 -0.174 0.128 0.925 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0457 0.149 0.925 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 1.86e-02 -0.388 0.164 0.925 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 3.11e-02 -0.314 0.144 0.929 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 5.72e-01 0.0861 0.152 0.929 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 4.47e-01 0.0991 0.13 0.929 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 9.00e-02 0.291 0.171 0.929 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 3.28e-01 -0.141 0.144 0.929 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 2.70e-01 0.193 0.175 0.929 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 2.88e-01 -0.157 0.147 0.929 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 3.36e-01 -0.117 0.121 0.925 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 4.36e-01 -0.103 0.132 0.925 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 5.74e-01 0.0805 0.143 0.925 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 7.06e-01 0.0416 0.11 0.925 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0608 0.114 0.925 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 4.01e-01 0.131 0.156 0.925 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0947 0.146 0.925 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0653 0.137 0.925 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 7.06e-02 0.277 0.152 0.925 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 9.62e-01 0.00727 0.153 0.925 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 7.68e-01 0.0368 0.125 0.925 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0239 0.123 0.925 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0338 0.167 0.925 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 1.69e-01 -0.215 0.156 0.925 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0939 0.139 0.93 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 863058 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0301 0.16 0.93 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 8.77e-01 0.0324 0.208 0.93 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 2.83e-01 0.207 0.192 0.93 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 2.40e-01 0.218 0.185 0.93 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 4.09e-01 -0.17 0.205 0.93 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 164639 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0905 0.18 0.93 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 5.81e-01 0.0863 0.156 0.922 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 5.95e-02 -0.297 0.157 0.922 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 5.62e-01 0.0941 0.162 0.922 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0956 0.144 0.922 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 2.23e-01 0.188 0.154 0.922 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 5.44e-01 0.0973 0.16 0.922 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 3.89e-01 0.139 0.161 0.922 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 3.12e-02 -0.265 0.122 0.925 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 3.58e-01 0.127 0.138 0.925 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 2.71e-01 0.169 0.153 0.925 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 8.13e-01 0.0312 0.132 0.925 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 8.05e-02 -0.235 0.134 0.925 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 6.86e-01 0.0579 0.143 0.925 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0621 0.163 0.925 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0447 0.176 0.932 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 8.28e-01 0.0324 0.149 0.932 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 5.23e-01 0.106 0.166 0.932 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 1.19e-01 0.317 0.202 0.932 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 8.52e-01 0.0331 0.178 0.932 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 2.82e-01 -0.211 0.195 0.932 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 8.29e-01 0.0364 0.168 0.932 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 5.98e-01 0.0562 0.107 0.925 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 3.04e-01 0.114 0.11 0.925 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 5.19e-01 0.0816 0.126 0.925 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0334 0.123 0.925 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0426 0.161 0.925 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 6.51e-01 0.0413 0.0913 0.925 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0277 0.102 0.925 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 1.67e-01 0.161 0.116 0.925 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0678 0.117 0.925 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 1.27e-01 0.237 0.155 0.925 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 2.32e-01 -0.131 0.109 0.925 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 6.35e-01 0.0631 0.133 0.925 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 6.02e-01 0.0762 0.146 0.925 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 6.35e-01 0.0502 0.105 0.925 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0265 0.102 0.925 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 8.57e-01 0.0289 0.16 0.925 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 3.85e-01 -0.128 0.148 0.925 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 1.67e-01 -0.16 0.115 0.925 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 657845 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0723 0.137 0.925 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 3.47e-01 0.143 0.151 0.925 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 8.70e-01 0.0184 0.112 0.925 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 9.16e-01 0.0122 0.116 0.925 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 9.17e-01 0.0155 0.148 0.925 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 628887 sc-eQTL 9.73e-01 0.0054 0.157 0.925 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 253730 sc-eQTL 3.84e-02 -0.163 0.0784 0.925 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 610690 sc-eQTL 7.20e-01 0.0495 0.138 0.925 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 459835 sc-eQTL 7.71e-01 0.0367 0.126 0.925 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 795282 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0757 0.108 0.925 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0176 0.134 0.925 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 eQTL 2.48e-06 0.203 0.0427 0.0 0.0 0.0731

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000059758 \N 253730 1.24e-06 8.69e-07 2.51e-07 3.4e-07 1.13e-07 3.3e-07 1.15e-06 5.48e-08 9.42e-07 2.62e-07 7.32e-07 1.96e-07 1.47e-06 2.19e-07 6.27e-08 2.45e-07 2.98e-07 3.95e-07 2.51e-07 6.16e-08 2.29e-07 5.36e-07 8.27e-07 1.25e-07 2.09e-06 2.36e-07 2.71e-07 1.88e-07 5.7e-07 9.08e-07 1.76e-07 3.76e-08 3.89e-08 2.74e-07 4.15e-07 5.04e-08 5.35e-08 7.25e-08 6.56e-08 3.82e-08 4.57e-08 1.09e-06 3.99e-08 1.18e-08 4.92e-08 1.84e-08 9.96e-08 3.89e-09 5.09e-08
ENSG00000139350 NEDD1 -253013 1.24e-06 8.69e-07 2.51e-07 3.43e-07 1.13e-07 3.54e-07 1.18e-06 5.48e-08 9.42e-07 2.72e-07 7.32e-07 1.96e-07 1.47e-06 2.29e-07 6.27e-08 2.45e-07 3.13e-07 3.95e-07 2.6e-07 6.29e-08 2.29e-07 5.49e-07 8.26e-07 1.27e-07 2.11e-06 2.46e-07 2.72e-07 1.95e-07 5.7e-07 9.11e-07 1.76e-07 3.76e-08 3.89e-08 2.77e-07 4.28e-07 5.14e-08 4.62e-08 7.25e-08 6.55e-08 3.82e-08 4.57e-08 1.12e-06 3.99e-08 1.16e-08 4.92e-08 1.86e-08 9.29e-08 3.89e-09 5.09e-08