logo

Genes within 1Mb (chr12:96651319:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 1.93e-04 -0.243 0.0642 0.13 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0833 0.0822 0.13 B L1
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 2.08e-01 -0.11 0.0874 0.13 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 2.04e-01 -0.101 0.0794 0.13 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 7.22e-01 0.0414 0.116 0.13 B L1
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 9.67e-02 -0.0901 0.054 0.13 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 8.83e-01 0.011 0.0747 0.13 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 5.49e-01 0.0485 0.0808 0.13 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0733 0.0705 0.13 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 8.81e-06 0.379 0.0831 0.13 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 3.45e-02 -0.117 0.0548 0.13 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.35e-01 0.0887 0.0591 0.13 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 2.16e-01 0.111 0.0891 0.13 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0298 0.0733 0.13 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 9.01e-02 0.165 0.0967 0.13 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 9.63e-03 -0.27 0.103 0.133 DC L1
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 5.59e-01 -0.07 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.63e-02 -0.234 0.0964 0.133 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 6.70e-01 0.0511 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 1.61e-01 -0.14 0.0992 0.133 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 1.11e-01 0.203 0.127 0.133 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 2.14e-01 -0.143 0.115 0.133 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 2.61e-01 0.0945 0.0838 0.13 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 3.77e-02 -0.219 0.105 0.13 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 9.13e-02 -0.201 0.119 0.13 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 5.85e-01 0.0439 0.0802 0.13 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 2.96e-01 0.0791 0.0755 0.13 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0935 0.116 0.13 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 1.28e-01 -0.171 0.112 0.13 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 1.71e-02 -0.149 0.0619 0.127 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.40e-01 0.157 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 9.01e-01 0.0125 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 3.30e-02 -0.178 0.0828 0.127 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0805 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0238 0.053 0.13 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 860167 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0521 0.0979 0.13 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 6.41e-01 0.0516 0.111 0.13 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 4.00e-01 0.0728 0.0863 0.13 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0704 0.0802 0.13 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 9.31e-01 0.0106 0.122 0.13 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 161748 sc-eQTL 9.65e-02 0.21 0.126 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0771 0.122 0.135 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 5.41e-02 -0.266 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 5.58e-01 -0.086 0.146 0.135 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 1.72e-01 -0.189 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 9.69e-01 0.00563 0.145 0.135 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 3.36e-04 -0.358 0.0982 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 9.55e-03 -0.252 0.0965 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 8.93e-01 0.0149 0.111 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 2.10e-01 -0.138 0.11 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 2.64e-01 -0.144 0.129 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 5.34e-02 -0.189 0.0975 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 3.74e-02 -0.235 0.112 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 8.47e-01 0.0216 0.112 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0337 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0396 0.131 0.131 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 3.88e-03 -0.232 0.0795 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 2.37e-01 -0.1 0.0847 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 1.19e-02 -0.251 0.0989 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 1.57e-01 -0.138 0.0972 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 2.90e-01 0.133 0.125 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 8.26e-01 -0.023 0.104 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0887 0.0986 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0749 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00838 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 5.00e-01 0.0929 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 2.22e-01 -0.118 0.0965 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.47e-02 0.331 0.135 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 9.76e-01 0.00417 0.138 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 2.69e-01 -0.133 0.12 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0962 0.139 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 8.83e-02 -0.102 0.0593 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 8.54e-01 0.016 0.0864 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 6.49e-01 0.0393 0.0863 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0893 0.0765 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 2.01e-04 0.346 0.0915 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0638 0.0582 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 2.04e-01 0.126 0.0987 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 1.12e-01 0.155 0.0969 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 9.33e-01 0.00678 0.0799 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 5.15e-01 0.0711 0.109 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0971 0.071 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0892 0.11 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 9.65e-01 0.00454 0.102 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 8.97e-01 0.0138 0.107 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 5.52e-03 0.35 0.125 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 5.17e-03 -0.19 0.0673 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 7.35e-02 0.221 0.123 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 1.29e-02 0.279 0.111 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0996 0.103 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 5.33e-01 0.0725 0.116 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 9.95e-02 -0.138 0.0835 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.64e-01 0.14 0.1 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 3.98e-01 0.0902 0.106 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 1.20e-01 -0.149 0.0952 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 5.52e-02 0.218 0.113 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 5.85e-02 -0.171 0.0901 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0177 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0576 0.113 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0864 0.13 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 6.44e-01 0.059 0.128 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 1.54e-01 -0.159 0.111 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 4.73e-01 -0.098 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 4.40e-01 0.104 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.124 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 9.88e-02 0.223 0.135 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 4.81e-01 0.0538 0.0762 0.13 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 860167 sc-eQTL 3.10e-01 -0.104 0.103 0.13 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 3.93e-01 0.101 0.118 0.13 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0109 0.0989 0.13 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0806 0.114 0.13 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 2.46e-01 0.149 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 161748 sc-eQTL 9.87e-01 0.00203 0.127 0.13 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 3.89e-02 -0.163 0.0786 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 7.77e-01 0.0333 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 7.78e-01 0.0352 0.125 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 1.44e-04 -0.488 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 3.84e-01 -0.115 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 6.10e-02 -0.128 0.0677 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0397 0.109 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0653 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 3.29e-01 -0.117 0.119 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 9.02e-01 0.013 0.106 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 3.16e-01 0.139 0.139 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 8.04e-01 0.032 0.129 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 3.61e-02 -0.28 0.133 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0802 0.127 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 1.69e-01 -0.101 0.0732 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.32e-01 0.187 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 2.47e-01 0.138 0.119 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 1.46e-01 -0.146 0.1 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0509 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 2.84e-01 0.139 0.129 0.133 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.114 0.133 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 3.87e-01 -0.127 0.146 0.133 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 3.71e-01 -0.128 0.143 0.133 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 3.65e-01 0.154 0.169 0.133 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 3.07e-01 0.0844 0.0823 0.13 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 860167 sc-eQTL 6.26e-01 0.0451 0.0926 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0448 0.109 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 2.00e-01 0.169 0.131 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 9.83e-01 0.00178 0.0831 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 8.77e-01 0.0188 0.121 0.13 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 161748 sc-eQTL 3.10e-01 0.099 0.0974 0.13 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 3.71e-01 0.08 0.0893 0.13 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 3.62e-01 0.103 0.113 0.13 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 5.15e-02 -0.199 0.102 0.13 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0234 0.119 0.13 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 4.89e-02 0.261 0.132 0.13 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 1.38e-02 -0.273 0.11 0.141 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0149 0.116 0.141 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.46e-01 -0.144 0.0988 0.141 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 5.68e-01 0.075 0.131 0.141 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0812 0.11 0.141 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 1.56e-01 0.19 0.133 0.141 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 2.74e-02 -0.248 0.111 0.141 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 2.31e-01 0.115 0.0959 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 2.74e-01 -0.115 0.105 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 6.38e-02 -0.21 0.112 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 5.35e-01 0.0542 0.0873 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 6.99e-01 0.0348 0.0901 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 8.51e-01 0.0234 0.124 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 5.21e-02 -0.224 0.115 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 5.75e-01 0.0613 0.109 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 1.71e-01 -0.168 0.122 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 2.71e-01 -0.135 0.122 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 7.23e-01 0.0355 0.0999 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 4.15e-01 0.0806 0.0986 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0721 0.133 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 3.73e-01 -0.112 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0121 0.109 0.13 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 860167 sc-eQTL 2.25e-01 -0.152 0.125 0.13 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 3.72e-01 0.146 0.163 0.13 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 1.64e-01 0.21 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 2.75e-02 -0.32 0.144 0.13 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 9.16e-01 -0.017 0.161 0.13 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 161748 sc-eQTL 3.90e-01 -0.122 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 3.65e-01 0.114 0.126 0.131 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 1.67e-01 -0.177 0.127 0.131 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0919 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00371 0.117 0.131 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 8.96e-02 -0.211 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 8.80e-01 0.0196 0.13 0.131 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 2.24e-01 -0.159 0.13 0.131 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0255 0.0985 0.133 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0596 0.11 0.133 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0289 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 7.50e-01 0.0336 0.105 0.133 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.133 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 2.67e-01 -0.127 0.114 0.133 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0817 0.13 0.133 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 2.99e-01 -0.135 0.13 0.138 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 5.92e-01 0.059 0.11 0.138 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.30e-02 -0.303 0.121 0.138 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 6.44e-02 -0.278 0.149 0.138 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 1.08e-01 -0.21 0.13 0.138 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 4.36e-01 0.113 0.145 0.138 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 8.76e-01 0.0195 0.124 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 5.44e-05 -0.339 0.0822 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.35e-02 -0.218 0.0875 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 4.58e-01 0.0753 0.101 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 4.23e-02 -0.199 0.0973 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0405 0.129 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 7.61e-03 -0.193 0.0716 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.08e-01 -0.131 0.0813 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 2.35e-02 -0.21 0.092 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0432 0.0937 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 3.95e-01 0.106 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 3.92e-01 0.0745 0.0868 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 9.77e-02 -0.174 0.105 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.64e-01 -0.161 0.115 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 6.74e-01 0.0351 0.0835 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 2.19e-01 0.099 0.0803 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0364 0.126 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 2.40e-01 -0.137 0.117 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 5.18e-01 0.0597 0.0923 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 654954 sc-eQTL 1.71e-01 -0.149 0.109 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 3.56e-01 -0.112 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 9.41e-01 0.00663 0.0896 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 8.66e-01 0.0156 0.0924 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 3.92e-01 -0.102 0.118 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 625996 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0959 0.125 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 250839 sc-eQTL 2.47e-02 -0.142 0.0628 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 607799 sc-eQTL 1.10e-01 0.176 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 456944 sc-eQTL 8.28e-01 0.022 0.101 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 792391 sc-eQTL 1.58e-01 -0.122 0.0862 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -255904 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0937 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 250839 eQTL 4.17e-03 0.0475 0.0165 0.00243 0.00118 0.135

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina