logo

Genes within 1Mb (chr12:96647683:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 3.44e-02 0.0948 0.0445 0.487 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 6.33e-02 0.103 0.0554 0.487 B L1
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 2.53e-01 0.068 0.0593 0.487 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 4.32e-01 0.0425 0.054 0.487 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0384 0.0789 0.487 B L1
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 7.57e-01 0.0114 0.0369 0.487 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0161 0.0507 0.487 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 1.66e-01 -0.076 0.0546 0.487 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0335 0.0479 0.487 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0483 0.059 0.487 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 3.00e-01 0.0393 0.0378 0.487 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 9.04e-01 0.00493 0.0407 0.487 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 4.15e-01 -0.05 0.0611 0.487 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 7.42e-01 0.0166 0.0501 0.487 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0914 0.0664 0.487 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 3.86e-01 0.0626 0.0719 0.486 DC L1
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 2.12e-01 -0.102 0.0817 0.486 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 6.01e-03 0.183 0.0658 0.486 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 6.91e-01 0.0327 0.0821 0.486 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 6.08e-01 0.0351 0.0683 0.486 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 1.87e-01 -0.116 0.0873 0.486 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0452 0.0791 0.486 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0463 0.0573 0.487 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 4.56e-01 0.0539 0.0722 0.487 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 2.46e-02 0.183 0.0806 0.487 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 8.23e-01 0.0123 0.0548 0.487 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 8.36e-02 -0.0892 0.0513 0.487 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 3.71e-01 -0.071 0.0792 0.487 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 1.46e-01 0.112 0.0765 0.487 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 2.17e-02 0.0971 0.042 0.489 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0789 0.072 0.489 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 2.70e-01 0.0756 0.0683 0.489 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 8.21e-01 0.0129 0.0568 0.489 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 9.48e-01 0.00471 0.0719 0.489 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 9.96e-02 0.0586 0.0354 0.487 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 856531 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0713 0.0657 0.487 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0043 0.0745 0.487 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0502 0.058 0.487 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0243 0.054 0.487 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0923 0.082 0.487 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 158112 sc-eQTL 7.74e-01 0.0244 0.0852 0.487 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 4.88e-01 0.0569 0.0819 0.477 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 1.74e-01 0.126 0.0924 0.477 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 4.01e-01 0.0826 0.0982 0.477 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00883 0.0927 0.477 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 1.20e-01 -0.15 0.0963 0.477 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 1.03e-01 0.114 0.0698 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 6.75e-02 0.124 0.0675 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0771 0.0765 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000939 0.0764 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 4.65e-01 0.0654 0.0894 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 8.83e-01 0.0101 0.0685 0.489 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 8.85e-01 0.0115 0.079 0.489 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 8.05e-02 0.135 0.0771 0.489 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0095 0.0823 0.489 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 1.44e-01 0.133 0.0906 0.489 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 6.17e-01 0.0282 0.0561 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 2.58e-01 0.0665 0.0587 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 2.30e-01 0.0835 0.0693 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 2.39e-01 0.0796 0.0674 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 7.10e-01 0.0323 0.0867 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 5.04e-02 0.141 0.0714 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 1.25e-01 0.105 0.0679 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 8.16e-01 0.0188 0.0806 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 3.46e-01 0.0754 0.0798 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 1.97e-01 -0.123 0.0947 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 8.72e-01 0.0106 0.0657 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 5.37e-02 -0.178 0.0918 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0319 0.0938 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 7.81e-01 0.0227 0.0816 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 1.90e-01 -0.123 0.0939 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 7.77e-01 0.0115 0.0404 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0373 0.0583 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0898 0.0581 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0168 0.0519 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 9.72e-02 -0.106 0.0635 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 4.62e-01 0.0291 0.0395 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 6.74e-01 0.0283 0.0671 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 5.39e-02 -0.127 0.0654 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0628 0.054 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 2.46e-01 0.0858 0.0738 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 4.56e-03 0.137 0.0479 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 5.08e-01 0.0499 0.0753 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 6.31e-01 0.0336 0.07 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 1.13e-01 -0.116 0.0729 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0494 0.0869 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 4.85e-02 0.0934 0.0471 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0418 0.0857 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 7.40e-01 0.0259 0.0781 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00539 0.0718 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 2.11e-01 -0.101 0.0802 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00197 0.0567 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 3.17e-01 0.0679 0.0677 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0863 0.0716 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 1.13e-01 0.102 0.0642 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0274 0.0769 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 4.86e-02 0.122 0.0613 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 2.16e-01 0.112 0.0906 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0482 0.0769 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 4.07e-01 0.0736 0.0885 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 1.63e-01 -0.121 0.0864 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 2.89e-01 0.084 0.0791 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 8.69e-01 -0.016 0.0971 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 5.51e-01 -0.057 0.0954 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 2.58e-01 -0.1 0.0884 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 2.68e-01 -0.107 0.096 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 6.16e-01 0.0259 0.0517 0.487 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 856531 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0472 0.0696 0.487 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 9.47e-01 0.00529 0.0799 0.487 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 5.03e-01 -0.045 0.0669 0.487 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0982 0.0774 0.487 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 6.89e-02 -0.158 0.0865 0.487 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 158112 sc-eQTL 6.57e-01 0.0384 0.0864 0.487 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 2.98e-05 0.222 0.052 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 6.03e-01 0.0418 0.0803 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 7.18e-01 0.0309 0.0852 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 1.29e-01 0.135 0.0886 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 7.11e-01 0.0333 0.0899 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 2.49e-02 0.102 0.045 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0908 0.0821 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 6.31e-01 0.0351 0.0729 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0999 0.0691 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0612 0.0798 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 2.65e-01 0.0811 0.0726 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0314 0.0954 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 1.45e-01 0.129 0.088 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 1.39e-01 0.136 0.0917 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0288 0.0873 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 2.59e-01 0.0568 0.0502 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0744 0.0849 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0118 0.0814 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 5.74e-01 0.0388 0.0689 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 1.42e-01 0.125 0.0849 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0899 0.0985 0.463 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0217 0.0872 0.463 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 6.57e-02 0.205 0.11 0.463 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 2.99e-01 0.113 0.109 0.463 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 9.46e-02 -0.216 0.128 0.463 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0259 0.056 0.483 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 856531 sc-eQTL 7.86e-01 0.0171 0.0629 0.483 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 4.74e-01 0.053 0.0739 0.483 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0655 0.0894 0.483 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0211 0.0564 0.483 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 4.77e-01 0.0583 0.0819 0.483 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 158112 sc-eQTL 8.96e-01 0.00867 0.0663 0.483 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00644 0.0614 0.487 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 9.22e-01 0.0076 0.0778 0.487 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0375 0.0704 0.487 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 5.00e-01 0.0551 0.0815 0.487 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 3.22e-01 0.0902 0.0909 0.487 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 2.69e-01 0.0845 0.0762 0.485 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0596 0.0794 0.485 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 4.01e-03 0.194 0.0666 0.485 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0392 0.0899 0.485 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 9.04e-01 0.00913 0.0753 0.485 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0569 0.0916 0.485 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0177 0.0773 0.485 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0891 0.0658 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0014 0.0721 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 1.22e-02 0.194 0.0767 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 4.95e-01 -0.041 0.0599 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0815 0.0617 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 6.98e-02 -0.154 0.0846 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 5.59e-02 0.152 0.0789 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0652 0.0748 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 3.53e-02 0.176 0.0833 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 7.58e-02 0.149 0.0834 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 3.30e-01 0.0667 0.0683 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 7.74e-01 0.0195 0.0677 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0568 0.0913 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 1.81e-01 0.115 0.0856 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 7.19e-01 0.0267 0.074 0.506 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 856531 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0126 0.0849 0.506 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 3.76e-01 -0.098 0.11 0.506 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 1.59e-01 0.144 0.102 0.506 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 3.06e-02 0.212 0.0973 0.506 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 7.30e-01 0.0378 0.109 0.506 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 158112 sc-eQTL 6.07e-01 0.0493 0.0956 0.506 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0823 0.084 0.484 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 1.30e-01 0.129 0.0847 0.484 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 1.12e-01 0.139 0.0868 0.484 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 8.09e-01 0.0188 0.0778 0.484 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 1.14e-01 -0.131 0.0827 0.484 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0188 0.0864 0.484 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 1.12e-01 0.138 0.0864 0.484 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 9.24e-01 0.00656 0.0683 0.477 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 7.83e-01 -0.021 0.0763 0.477 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 6.85e-01 0.0345 0.085 0.477 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 9.04e-01 0.00883 0.073 0.477 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 7.94e-02 -0.13 0.074 0.477 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 5.33e-01 0.0494 0.0791 0.477 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 1.26e-01 -0.138 0.0898 0.477 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 7.74e-01 0.0255 0.0883 0.494 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0491 0.0745 0.494 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 7.42e-03 0.221 0.0816 0.494 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 3.02e-01 0.105 0.102 0.494 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 2.51e-01 0.102 0.0888 0.494 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0549 0.0983 0.494 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 8.75e-01 0.0133 0.0843 0.494 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 8.64e-02 0.101 0.0586 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 6.48e-02 0.113 0.0608 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 5.37e-01 0.0432 0.0699 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 8.75e-01 0.0107 0.0678 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 3.93e-01 0.0761 0.0888 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 9.76e-02 0.0834 0.0501 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 8.38e-02 0.0977 0.0563 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 4.89e-01 0.0446 0.0644 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 3.75e-01 0.0577 0.0648 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0331 0.0859 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0938 0.0593 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 4.85e-01 0.0505 0.0721 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 1.22e-02 0.197 0.0781 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 6.65e-01 0.0248 0.0572 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 3.75e-01 -0.049 0.0551 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 1.48e-01 -0.125 0.0862 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 4.93e-02 0.157 0.0795 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 5.38e-01 -0.038 0.0615 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 651318 sc-eQTL 9.18e-01 0.00748 0.0727 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 2.79e-01 0.0873 0.0804 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0198 0.0597 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 5.24e-02 -0.119 0.061 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 8.13e-01 0.0187 0.0789 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 622360 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0592 0.0834 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 247203 sc-eQTL 8.77e-02 0.0731 0.0426 0.491 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 604163 sc-eQTL 1.22e-01 -0.115 0.0742 0.491 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 453308 sc-eQTL 3.60e-01 0.0626 0.0682 0.491 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 788755 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0163 0.0584 0.491 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -259540 sc-eQTL 9.30e-01 0.00642 0.0729 0.491 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 247203 eQTL 2.18e-02 -0.0265 0.0116 0.0013 0.0 0.49
ENSG00000188596 CFAP54 158108 eQTL 0.0103 -0.0501 0.0195 0.0 0.0 0.49

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina