logo

Genes within 1Mb (chr12:96645821:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 3.44e-02 0.0948 0.0445 0.487 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 6.33e-02 0.103 0.0554 0.487 B L1
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 2.53e-01 0.068 0.0593 0.487 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 4.32e-01 0.0425 0.054 0.487 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0384 0.0789 0.487 B L1
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 7.57e-01 0.0114 0.0369 0.487 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0161 0.0507 0.487 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 1.66e-01 -0.076 0.0546 0.487 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0335 0.0479 0.487 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0483 0.059 0.487 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 3.00e-01 0.0393 0.0378 0.487 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 9.04e-01 0.00493 0.0407 0.487 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 4.15e-01 -0.05 0.0611 0.487 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 7.42e-01 0.0166 0.0501 0.487 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0914 0.0664 0.487 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 3.86e-01 0.0626 0.0719 0.486 DC L1
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 2.12e-01 -0.102 0.0817 0.486 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 6.01e-03 0.183 0.0658 0.486 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 6.91e-01 0.0327 0.0821 0.486 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 6.08e-01 0.0351 0.0683 0.486 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 1.87e-01 -0.116 0.0873 0.486 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0452 0.0791 0.486 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0463 0.0573 0.487 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 4.56e-01 0.0539 0.0722 0.487 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 2.46e-02 0.183 0.0806 0.487 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 8.23e-01 0.0123 0.0548 0.487 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 8.36e-02 -0.0892 0.0513 0.487 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 3.71e-01 -0.071 0.0792 0.487 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 1.46e-01 0.112 0.0765 0.487 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 2.17e-02 0.0971 0.042 0.489 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0789 0.072 0.489 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 2.70e-01 0.0756 0.0683 0.489 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 8.21e-01 0.0129 0.0568 0.489 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 9.48e-01 0.00471 0.0719 0.489 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 9.96e-02 0.0586 0.0354 0.487 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 854669 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0713 0.0657 0.487 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0043 0.0745 0.487 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0502 0.058 0.487 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0243 0.054 0.487 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0923 0.082 0.487 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 156250 sc-eQTL 7.74e-01 0.0244 0.0852 0.487 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 4.88e-01 0.0569 0.0819 0.477 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 1.74e-01 0.126 0.0924 0.477 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 4.01e-01 0.0826 0.0982 0.477 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00883 0.0927 0.477 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 1.20e-01 -0.15 0.0963 0.477 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 1.03e-01 0.114 0.0698 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 6.75e-02 0.124 0.0675 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0771 0.0765 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000939 0.0764 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 4.65e-01 0.0654 0.0894 0.485 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 8.83e-01 0.0101 0.0685 0.489 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 8.85e-01 0.0115 0.079 0.489 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 8.05e-02 0.135 0.0771 0.489 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0095 0.0823 0.489 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 1.44e-01 0.133 0.0906 0.489 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 6.17e-01 0.0282 0.0561 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 2.58e-01 0.0665 0.0587 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 2.30e-01 0.0835 0.0693 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 2.39e-01 0.0796 0.0674 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 7.10e-01 0.0323 0.0867 0.487 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 5.04e-02 0.141 0.0714 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 1.25e-01 0.105 0.0679 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 8.16e-01 0.0188 0.0806 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 3.46e-01 0.0754 0.0798 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 1.97e-01 -0.123 0.0947 0.487 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 8.72e-01 0.0106 0.0657 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 5.37e-02 -0.178 0.0918 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0319 0.0938 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 7.81e-01 0.0227 0.0816 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 1.90e-01 -0.123 0.0939 0.495 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 7.77e-01 0.0115 0.0404 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0373 0.0583 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0898 0.0581 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0168 0.0519 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 9.72e-02 -0.106 0.0635 0.487 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 4.62e-01 0.0291 0.0395 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 6.74e-01 0.0283 0.0671 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 5.39e-02 -0.127 0.0654 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0628 0.054 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 2.46e-01 0.0858 0.0738 0.487 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 4.56e-03 0.137 0.0479 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 5.08e-01 0.0499 0.0753 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 6.31e-01 0.0336 0.07 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 1.13e-01 -0.116 0.0729 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0494 0.0869 0.487 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 4.85e-02 0.0934 0.0471 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0418 0.0857 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 7.40e-01 0.0259 0.0781 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00539 0.0718 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 2.11e-01 -0.101 0.0802 0.487 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00197 0.0567 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 3.17e-01 0.0679 0.0677 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0863 0.0716 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 1.13e-01 0.102 0.0642 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0274 0.0769 0.487 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 4.86e-02 0.122 0.0613 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 2.16e-01 0.112 0.0906 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0482 0.0769 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 4.07e-01 0.0736 0.0885 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 1.63e-01 -0.121 0.0864 0.491 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 2.89e-01 0.084 0.0791 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 8.69e-01 -0.016 0.0971 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 5.51e-01 -0.057 0.0954 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 2.58e-01 -0.1 0.0884 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 2.68e-01 -0.107 0.096 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 6.16e-01 0.0259 0.0517 0.487 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 854669 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0472 0.0696 0.487 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 9.47e-01 0.00529 0.0799 0.487 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 5.03e-01 -0.045 0.0669 0.487 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0982 0.0774 0.487 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 6.89e-02 -0.158 0.0865 0.487 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 156250 sc-eQTL 6.57e-01 0.0384 0.0864 0.487 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 2.98e-05 0.222 0.052 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 6.03e-01 0.0418 0.0803 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 7.18e-01 0.0309 0.0852 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 1.29e-01 0.135 0.0886 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 7.11e-01 0.0333 0.0899 0.493 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 2.49e-02 0.102 0.045 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0908 0.0821 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 6.31e-01 0.0351 0.0729 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0999 0.0691 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0612 0.0798 0.491 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 2.65e-01 0.0811 0.0726 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0314 0.0954 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 1.45e-01 0.129 0.088 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 1.39e-01 0.136 0.0917 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0288 0.0873 0.493 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 2.59e-01 0.0568 0.0502 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0744 0.0849 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0118 0.0814 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 5.74e-01 0.0388 0.0689 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 1.42e-01 0.125 0.0849 0.491 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0899 0.0985 0.463 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0217 0.0872 0.463 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 6.57e-02 0.205 0.11 0.463 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 2.99e-01 0.113 0.109 0.463 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 9.46e-02 -0.216 0.128 0.463 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0259 0.056 0.483 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 854669 sc-eQTL 7.86e-01 0.0171 0.0629 0.483 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 4.74e-01 0.053 0.0739 0.483 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0655 0.0894 0.483 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0211 0.0564 0.483 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 4.77e-01 0.0583 0.0819 0.483 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 156250 sc-eQTL 8.96e-01 0.00867 0.0663 0.483 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00644 0.0614 0.487 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 9.22e-01 0.0076 0.0778 0.487 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0375 0.0704 0.487 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 5.00e-01 0.0551 0.0815 0.487 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 3.22e-01 0.0902 0.0909 0.487 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 2.69e-01 0.0845 0.0762 0.485 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0596 0.0794 0.485 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 4.01e-03 0.194 0.0666 0.485 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0392 0.0899 0.485 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 9.04e-01 0.00913 0.0753 0.485 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0569 0.0916 0.485 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0177 0.0773 0.485 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0891 0.0658 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0014 0.0721 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 1.22e-02 0.194 0.0767 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 4.95e-01 -0.041 0.0599 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0815 0.0617 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 6.98e-02 -0.154 0.0846 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 5.59e-02 0.152 0.0789 0.487 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0652 0.0748 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 3.53e-02 0.176 0.0833 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 7.58e-02 0.149 0.0834 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 3.30e-01 0.0667 0.0683 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 7.74e-01 0.0195 0.0677 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0568 0.0913 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 1.81e-01 0.115 0.0856 0.487 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 7.19e-01 0.0267 0.074 0.506 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 854669 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0126 0.0849 0.506 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 3.76e-01 -0.098 0.11 0.506 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 1.59e-01 0.144 0.102 0.506 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 3.06e-02 0.212 0.0973 0.506 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 7.30e-01 0.0378 0.109 0.506 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 156250 sc-eQTL 6.07e-01 0.0493 0.0956 0.506 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0823 0.084 0.484 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 1.30e-01 0.129 0.0847 0.484 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 1.12e-01 0.139 0.0868 0.484 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 8.09e-01 0.0188 0.0778 0.484 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 1.14e-01 -0.131 0.0827 0.484 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0188 0.0864 0.484 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 1.12e-01 0.138 0.0864 0.484 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 9.24e-01 0.00656 0.0683 0.477 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 7.83e-01 -0.021 0.0763 0.477 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 6.85e-01 0.0345 0.085 0.477 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 9.04e-01 0.00883 0.073 0.477 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 7.94e-02 -0.13 0.074 0.477 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 5.33e-01 0.0494 0.0791 0.477 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 1.26e-01 -0.138 0.0898 0.477 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 7.74e-01 0.0255 0.0883 0.494 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0491 0.0745 0.494 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 7.42e-03 0.221 0.0816 0.494 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 3.02e-01 0.105 0.102 0.494 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 2.51e-01 0.102 0.0888 0.494 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0549 0.0983 0.494 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 8.75e-01 0.0133 0.0843 0.494 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 8.64e-02 0.101 0.0586 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 6.48e-02 0.113 0.0608 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 5.37e-01 0.0432 0.0699 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 8.75e-01 0.0107 0.0678 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 3.93e-01 0.0761 0.0888 0.487 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 9.76e-02 0.0834 0.0501 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 8.38e-02 0.0977 0.0563 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 4.89e-01 0.0446 0.0644 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 3.75e-01 0.0577 0.0648 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0331 0.0859 0.487 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0938 0.0593 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 4.85e-01 0.0505 0.0721 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 1.22e-02 0.197 0.0781 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 6.65e-01 0.0248 0.0572 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 3.75e-01 -0.049 0.0551 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 1.48e-01 -0.125 0.0862 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 4.93e-02 0.157 0.0795 0.487 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 5.38e-01 -0.038 0.0615 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 649456 sc-eQTL 9.18e-01 0.00748 0.0727 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 2.79e-01 0.0873 0.0804 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0198 0.0597 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 5.24e-02 -0.119 0.061 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 8.13e-01 0.0187 0.0789 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 620498 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0592 0.0834 0.489 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 245341 sc-eQTL 8.77e-02 0.0731 0.0426 0.491 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 602301 sc-eQTL 1.22e-01 -0.115 0.0742 0.491 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 451446 sc-eQTL 3.60e-01 0.0626 0.0682 0.491 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 786893 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0163 0.0584 0.491 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -261402 sc-eQTL 9.30e-01 0.00642 0.0729 0.491 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 245341 eQTL 2.40e-02 -0.0261 0.0115 0.00123 0.0 0.491
ENSG00000188596 CFAP54 156246 eQTL 0.0103 -0.05 0.0194 0.0 0.0 0.491

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina