logo

Genes within 1Mb (chr12:96634546:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 3.18e-02 0.0966 0.0447 0.485 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 7.06e-02 0.101 0.0557 0.485 B L1
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 2.43e-01 0.0697 0.0596 0.485 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 4.37e-01 0.0422 0.0542 0.485 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0394 0.0792 0.485 B L1
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 6.59e-01 0.0164 0.037 0.485 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0116 0.0509 0.485 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0678 0.0549 0.485 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0304 0.0481 0.485 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0557 0.0592 0.485 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 2.43e-01 0.0443 0.0379 0.485 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 8.39e-01 0.0083 0.0408 0.485 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0409 0.0614 0.485 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 7.10e-01 0.0187 0.0503 0.485 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 1.38e-01 -0.099 0.0666 0.485 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 3.24e-01 0.0715 0.0723 0.484 DC L1
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0989 0.0823 0.484 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 9.55e-03 0.174 0.0664 0.484 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 6.65e-01 0.0358 0.0826 0.484 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 5.83e-01 0.0377 0.0687 0.484 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 2.41e-01 -0.103 0.088 0.484 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 4.75e-01 -0.057 0.0796 0.484 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0443 0.0574 0.485 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 4.89e-01 0.0502 0.0724 0.485 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 3.09e-02 0.176 0.0809 0.485 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 8.10e-01 0.0132 0.0549 0.485 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 8.52e-02 -0.089 0.0514 0.485 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0776 0.0794 0.485 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 1.60e-01 0.108 0.0767 0.485 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 2.41e-02 0.0958 0.0422 0.487 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0745 0.0723 0.487 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 2.68e-01 0.0761 0.0685 0.487 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 7.94e-01 0.0149 0.057 0.487 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 9.39e-01 0.00553 0.0722 0.487 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 9.35e-02 0.06 0.0356 0.485 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 843394 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0725 0.0661 0.485 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000533 0.0749 0.485 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0478 0.0584 0.485 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 6.06e-01 -0.028 0.0543 0.485 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0933 0.0825 0.485 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 144975 sc-eQTL 7.87e-01 0.0232 0.0857 0.485 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 6.20e-01 0.041 0.0825 0.474 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 1.86e-01 0.124 0.0929 0.474 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 3.09e-01 0.101 0.0987 0.474 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0205 0.0933 0.474 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 1.25e-01 -0.15 0.0969 0.474 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 9.56e-02 0.117 0.0701 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 7.20e-02 0.123 0.0678 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0735 0.0769 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 9.87e-01 0.00127 0.0768 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 4.57e-01 0.0669 0.0898 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 8.27e-01 0.015 0.0688 0.487 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 9.60e-01 0.00401 0.0794 0.487 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 7.02e-02 0.141 0.0775 0.487 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0102 0.0827 0.487 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 1.34e-01 0.137 0.091 0.487 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 6.43e-01 0.0262 0.0564 0.485 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 2.92e-01 0.0622 0.0589 0.485 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 2.41e-01 0.0819 0.0696 0.485 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 2.35e-01 0.0806 0.0677 0.485 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 8.23e-01 0.0195 0.0871 0.485 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 4.98e-02 0.142 0.0718 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 1.36e-01 0.102 0.0683 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 9.15e-01 0.00863 0.081 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 3.78e-01 0.0709 0.0802 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 2.16e-01 -0.118 0.0952 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 9.48e-01 0.00431 0.0662 0.493 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 4.59e-02 -0.186 0.0925 0.493 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0387 0.0945 0.493 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 8.25e-01 0.0182 0.0822 0.493 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 1.88e-01 -0.125 0.0946 0.493 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 6.65e-01 0.0176 0.0405 0.485 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0333 0.0586 0.485 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 1.52e-01 -0.084 0.0584 0.485 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0151 0.0521 0.485 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 8.67e-02 -0.11 0.0637 0.485 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 4.20e-01 0.0321 0.0396 0.485 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 6.91e-01 0.0268 0.0673 0.485 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 8.30e-02 -0.115 0.0658 0.485 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0593 0.0542 0.485 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 2.97e-01 0.0774 0.0741 0.485 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 4.80e-03 0.137 0.0481 0.485 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 4.19e-01 0.0612 0.0756 0.485 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 5.49e-01 0.0422 0.0703 0.485 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 1.18e-01 -0.115 0.0732 0.485 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0589 0.0873 0.485 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 4.56e-02 0.0951 0.0473 0.485 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0582 0.0861 0.485 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 7.23e-01 0.0278 0.0785 0.485 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0235 0.0721 0.485 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0868 0.0807 0.485 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 9.50e-01 0.00357 0.057 0.485 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 2.79e-01 0.0739 0.068 0.485 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0778 0.072 0.485 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 9.47e-02 0.108 0.0645 0.485 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0347 0.0772 0.485 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 3.22e-02 0.133 0.0615 0.488 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 2.45e-01 0.106 0.0911 0.488 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0519 0.0773 0.488 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 3.97e-01 0.0755 0.089 0.488 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 1.34e-01 -0.131 0.0868 0.488 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 3.15e-01 0.0801 0.0795 0.479 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0236 0.0976 0.479 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0414 0.0959 0.479 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 2.20e-01 -0.109 0.0889 0.479 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 2.94e-01 -0.102 0.0966 0.479 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 6.43e-01 0.0241 0.0519 0.485 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 843394 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0465 0.07 0.485 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 8.77e-01 0.0124 0.0803 0.485 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0385 0.0673 0.485 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0975 0.0778 0.485 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 5.87e-02 -0.165 0.0869 0.485 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 144975 sc-eQTL 7.00e-01 0.0335 0.0868 0.485 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 4.11e-05 0.219 0.0523 0.491 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 6.18e-01 0.0403 0.0806 0.491 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 7.01e-01 0.033 0.0856 0.491 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 1.20e-01 0.139 0.089 0.491 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 7.18e-01 0.0327 0.0903 0.491 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 1.93e-02 0.106 0.0451 0.489 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0787 0.0825 0.489 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 6.61e-01 0.0321 0.0731 0.489 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0985 0.0693 0.489 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0547 0.0801 0.489 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 3.19e-01 0.0727 0.0728 0.491 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0413 0.0957 0.491 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 1.43e-01 0.13 0.0883 0.491 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 1.68e-01 0.127 0.0921 0.491 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 7.67e-01 -0.026 0.0876 0.491 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 2.75e-01 0.0551 0.0504 0.489 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0727 0.0852 0.489 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00785 0.0817 0.489 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 5.55e-01 0.0409 0.0692 0.489 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 1.60e-01 0.12 0.0852 0.489 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 5.99e-01 -0.053 0.1 0.459 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0343 0.0886 0.459 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 6.96e-02 0.205 0.112 0.459 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 4.83e-01 0.0778 0.111 0.459 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 1.75e-01 -0.178 0.131 0.459 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 7.50e-01 -0.018 0.0563 0.48 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 843394 sc-eQTL 7.64e-01 0.019 0.0633 0.48 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 5.11e-01 0.0489 0.0743 0.48 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0708 0.0899 0.48 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0297 0.0567 0.48 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 4.51e-01 0.0622 0.0823 0.48 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 144975 sc-eQTL 8.20e-01 0.0152 0.0667 0.48 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00392 0.0617 0.485 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 9.34e-01 0.00649 0.0781 0.485 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0285 0.0708 0.485 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 5.13e-01 0.0536 0.0819 0.485 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 3.77e-01 0.0808 0.0913 0.485 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 2.12e-01 0.0961 0.0766 0.483 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0567 0.0799 0.483 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 5.63e-03 0.188 0.0671 0.483 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0388 0.0904 0.483 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 9.25e-01 0.00715 0.0757 0.483 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0455 0.0922 0.483 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00583 0.0778 0.483 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0841 0.0661 0.485 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000593 0.0724 0.485 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 1.46e-02 0.19 0.0771 0.485 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0421 0.0602 0.485 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0811 0.0619 0.485 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 5.58e-02 -0.163 0.0849 0.485 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 5.89e-02 0.15 0.0792 0.485 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0608 0.0752 0.485 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 5.90e-02 0.159 0.0838 0.485 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 7.65e-02 0.149 0.0838 0.485 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 3.26e-01 0.0675 0.0686 0.485 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 7.18e-01 0.0246 0.068 0.485 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0624 0.0916 0.485 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 1.71e-01 0.118 0.086 0.485 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 7.67e-01 0.0221 0.0745 0.503 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 843394 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00867 0.0855 0.503 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0956 0.111 0.503 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 1.90e-01 0.135 0.103 0.503 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 5.30e-02 0.192 0.0983 0.503 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 5.53e-01 0.0654 0.11 0.503 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 144975 sc-eQTL 5.43e-01 0.0587 0.0963 0.503 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0758 0.0845 0.482 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 1.54e-01 0.122 0.0851 0.482 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 1.16e-01 0.138 0.0872 0.482 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 8.04e-01 0.0194 0.0782 0.482 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 1.20e-01 -0.13 0.0831 0.482 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0162 0.0868 0.482 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 1.37e-01 0.13 0.0869 0.482 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 9.79e-01 0.00182 0.0686 0.475 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0207 0.0766 0.475 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 7.44e-01 0.0279 0.0854 0.475 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 8.97e-01 0.00955 0.0733 0.475 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 7.45e-02 -0.133 0.0743 0.475 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 5.55e-01 0.047 0.0795 0.475 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 1.22e-01 -0.14 0.0902 0.475 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 7.13e-01 0.0327 0.0888 0.492 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0504 0.0749 0.492 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 1.47e-02 0.203 0.0824 0.492 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 2.94e-01 0.108 0.102 0.492 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 2.04e-01 0.114 0.0892 0.492 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0469 0.0988 0.492 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0163 0.0848 0.492 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 8.13e-02 0.103 0.0588 0.485 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 7.40e-02 0.11 0.0611 0.485 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 4.59e-01 0.0521 0.0702 0.485 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 8.78e-01 0.0105 0.0681 0.485 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 3.83e-01 0.0779 0.0892 0.485 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 1.08e-01 0.0812 0.0503 0.485 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 9.95e-02 0.0935 0.0565 0.485 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 5.59e-01 0.0378 0.0647 0.485 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 3.96e-01 0.0554 0.0651 0.485 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0411 0.0862 0.485 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0886 0.0596 0.485 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 5.56e-01 0.0427 0.0724 0.485 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 1.42e-02 0.194 0.0785 0.485 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 6.87e-01 0.0232 0.0575 0.485 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0459 0.0554 0.485 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 1.22e-01 -0.134 0.0865 0.485 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 4.90e-02 0.158 0.0799 0.485 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0394 0.0617 0.487 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 638181 sc-eQTL 9.16e-01 0.00773 0.073 0.487 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 3.11e-01 0.082 0.0807 0.487 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0197 0.0599 0.487 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 5.20e-02 -0.12 0.0612 0.487 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 8.29e-01 0.0172 0.0792 0.487 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 609223 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0633 0.0837 0.487 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 234066 sc-eQTL 9.04e-02 0.0728 0.0428 0.489 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 591026 sc-eQTL 1.50e-01 -0.108 0.0745 0.489 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 440171 sc-eQTL 3.57e-01 0.0632 0.0684 0.489 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 775618 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0148 0.0586 0.489 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -272677 sc-eQTL 9.14e-01 0.0079 0.0731 0.489 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 234066 eQTL 2.79e-02 -0.0254 0.0116 0.00113 0.0 0.49
ENSG00000188596 CFAP54 144971 eQTL 0.0104 -0.05 0.0195 0.0 0.0 0.49

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina