logo

Genes within 1Mb (chr12:96621449:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 1.07e-01 0.0919 0.0567 0.194 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0568 0.0708 0.194 B L1
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 2.93e-01 0.0793 0.0752 0.194 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 2.67e-01 0.0761 0.0683 0.194 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 1.94e-01 0.13 0.0996 0.194 B L1
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 3.48e-01 0.0444 0.0473 0.194 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 5.85e-01 0.0355 0.065 0.194 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 7.78e-01 0.0199 0.0705 0.194 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 1.92e-01 0.0803 0.0614 0.194 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 2.27e-02 -0.172 0.075 0.194 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 1.49e-01 0.069 0.0476 0.194 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0705 0.0512 0.194 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 6.42e-01 0.036 0.0773 0.194 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0173 0.0634 0.194 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 9.70e-01 0.00318 0.0843 0.194 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 1.33e-01 0.14 0.0929 0.194 DC L1
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 2.52e-01 0.122 0.106 0.194 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 6.34e-01 0.0415 0.087 0.194 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 3.07e-01 0.109 0.106 0.194 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0182 0.0886 0.194 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 5.32e-01 0.0712 0.114 0.194 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 1.88e-01 0.135 0.102 0.194 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 5.44e-01 0.0439 0.0723 0.194 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 1.66e-01 0.126 0.0907 0.194 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0613 0.103 0.194 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00111 0.0691 0.194 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 6.76e-01 0.0273 0.0651 0.194 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 2.54e-03 0.299 0.0979 0.194 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 1.32e-01 -0.146 0.0964 0.194 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0509 0.0536 0.195 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 8.41e-01 0.0183 0.0912 0.195 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 9.31e-01 0.00754 0.0865 0.195 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 2.62e-01 0.0805 0.0715 0.195 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 3.42e-01 0.0863 0.0906 0.195 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00682 0.0455 0.194 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 830297 sc-eQTL 2.86e-01 0.0898 0.084 0.194 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 6.81e-01 0.0391 0.0951 0.194 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 7.88e-01 -0.02 0.0743 0.194 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 7.77e-01 0.0196 0.069 0.194 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 6.87e-01 0.0423 0.105 0.194 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 131878 sc-eQTL 1.04e-01 -0.177 0.108 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 6.54e-01 0.0458 0.102 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0255 0.115 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00469 0.122 0.196 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0769 0.115 0.196 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 4.18e-01 0.0976 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 3.05e-01 0.0928 0.0903 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0266 0.0876 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 3.88e-01 0.0854 0.0987 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 2.73e-01 0.108 0.0982 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 3.32e-01 0.112 0.115 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 1.40e-01 0.13 0.0878 0.19 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 6.08e-03 0.277 0.1 0.19 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0651 0.1 0.19 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 4.68e-01 0.0771 0.106 0.19 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 1.95e-01 -0.152 0.117 0.19 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 2.34e-01 0.084 0.0704 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00856 0.0739 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 1.07e-01 0.141 0.0869 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0503 0.085 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00149 0.109 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0572 0.0903 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00859 0.0857 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 2.89e-01 0.107 0.101 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0195 0.1 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 1.41e-01 0.175 0.119 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 2.00e-01 0.105 0.0819 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000902 0.116 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 8.42e-01 0.0235 0.117 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0166 0.102 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 9.79e-02 0.195 0.117 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 3.86e-01 0.0451 0.0519 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 3.69e-01 0.0675 0.0751 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 7.86e-01 0.0205 0.0752 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 2.75e-01 0.0729 0.0666 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 2.11e-01 -0.103 0.082 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 3.77e-01 0.0443 0.05 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 6.55e-01 -0.038 0.085 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 2.17e-01 -0.103 0.0834 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 5.48e-02 0.131 0.068 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 1.25e-01 -0.144 0.0933 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00769 0.0619 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0994 0.0953 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00352 0.0888 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 6.40e-01 0.0435 0.0929 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0652 0.11 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 9.94e-01 0.000466 0.0602 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 2.52e-01 -0.125 0.108 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 2.76e-02 -0.217 0.0979 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 9.16e-01 0.00966 0.091 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 4.59e-01 0.0757 0.102 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 7.17e-02 0.13 0.0717 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0771 0.0864 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 1.74e-01 0.124 0.0912 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0515 0.0822 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0887 0.0978 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00897 0.0772 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 6.60e-01 0.05 0.113 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 1.02e-01 0.157 0.0954 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0605 0.111 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 5.64e-01 0.0626 0.108 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 2.78e-02 0.215 0.097 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 7.70e-01 0.0352 0.12 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0827 0.118 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0461 0.11 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00607 0.119 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 8.67e-01 0.0109 0.0651 0.195 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 830297 sc-eQTL 1.69e-01 0.121 0.0873 0.195 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 9.33e-01 0.00852 0.101 0.195 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 5.95e-01 0.0449 0.0843 0.195 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 4.45e-01 0.0748 0.0977 0.195 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 4.44e-01 -0.084 0.11 0.195 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 131878 sc-eQTL 9.50e-01 0.00683 0.109 0.195 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 1.51e-01 -0.101 0.0699 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 1.63e-01 -0.145 0.103 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 9.89e-01 0.00154 0.11 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0756 0.115 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 8.55e-01 0.0213 0.116 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0599 0.058 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 5.31e-01 0.0658 0.105 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 8.45e-01 0.0183 0.093 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 1.95e-01 0.115 0.0882 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 6.68e-02 0.186 0.101 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 2.42e-01 -0.108 0.0919 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 5.74e-01 0.0681 0.121 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 3.19e-01 -0.112 0.112 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 6.79e-01 0.0485 0.117 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 5.13e-02 0.215 0.11 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00337 0.0637 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 3.21e-01 -0.107 0.107 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 9.83e-01 0.00219 0.103 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 8.91e-01 0.0119 0.0873 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 2.77e-01 -0.117 0.108 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 1.20e-01 0.195 0.125 0.181 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0433 0.111 0.181 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0537 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 5.66e-01 0.08 0.139 0.181 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0159 0.165 0.181 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 5.82e-01 0.0393 0.0712 0.196 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 830297 sc-eQTL 3.03e-01 0.0824 0.0798 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0452 0.094 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0691 0.114 0.196 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 6.67e-01 0.0309 0.0717 0.196 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0812 0.104 0.196 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 131878 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0316 0.0843 0.196 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0498 0.0776 0.194 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 4.64e-01 0.0721 0.0982 0.194 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 6.33e-01 0.0426 0.089 0.194 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0614 0.103 0.194 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 1.15e-02 -0.289 0.113 0.194 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 5.28e-01 0.0617 0.0974 0.19 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 5.07e-01 0.0673 0.101 0.19 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0471 0.0868 0.19 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 6.40e-01 0.0537 0.115 0.19 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0193 0.096 0.19 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 4.83e-01 0.082 0.117 0.19 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 5.08e-01 0.0654 0.0985 0.19 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 7.11e-02 0.15 0.0828 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 2.63e-01 0.102 0.0908 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0676 0.0983 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 4.54e-01 0.0568 0.0757 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 5.80e-01 0.0433 0.0781 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 1.68e-03 0.335 0.105 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 2.35e-01 -0.119 0.1 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 2.86e-01 0.101 0.0943 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 8.09e-01 0.0257 0.106 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0446 0.106 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0563 0.0862 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 9.64e-01 0.00381 0.0853 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 3.40e-01 0.11 0.115 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 2.33e-01 -0.129 0.108 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0094 0.0946 0.197 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 830297 sc-eQTL 3.87e-01 0.094 0.108 0.197 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 7.03e-01 -0.054 0.141 0.197 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0664 0.131 0.197 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 9.42e-01 0.0092 0.126 0.197 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 6.83e-01 -0.057 0.14 0.197 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 131878 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0745 0.122 0.197 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 4.37e-01 0.0829 0.106 0.193 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 2.65e-01 -0.12 0.107 0.193 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0967 0.11 0.193 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0193 0.0984 0.193 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 2.98e-03 0.309 0.103 0.193 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 7.16e-02 0.196 0.108 0.193 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0242 0.11 0.193 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0918 0.0843 0.197 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 2.06e-01 0.119 0.094 0.197 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 8.85e-01 0.0152 0.105 0.197 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00491 0.0903 0.197 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0876 0.0921 0.197 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 3.77e-01 0.0866 0.0978 0.197 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 7.66e-01 0.0333 0.112 0.197 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 1.13e-01 0.178 0.112 0.189 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00872 0.095 0.189 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0734 0.106 0.189 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 1.31e-01 0.196 0.129 0.189 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 7.61e-01 0.0346 0.114 0.189 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 2.84e-01 0.134 0.125 0.189 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0762 0.107 0.189 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 7.44e-02 0.132 0.0737 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 5.50e-01 0.0462 0.0771 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0156 0.0881 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 8.97e-02 0.145 0.0849 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0513 0.112 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 5.51e-01 0.038 0.0637 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0567 0.0714 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 2.62e-02 0.18 0.0805 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0226 0.082 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 3.35e-01 0.105 0.108 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 4.14e-02 0.154 0.0749 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 1.72e-01 0.125 0.0912 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0836 0.1 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0145 0.0727 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 9.32e-01 0.00595 0.0701 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 1.42e-02 0.268 0.108 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 7.39e-02 -0.182 0.101 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0222 0.0779 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 625084 sc-eQTL 4.40e-01 0.0711 0.092 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0205 0.102 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 5.70e-01 0.043 0.0755 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 2.06e-01 0.0986 0.0776 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 5.51e-02 0.191 0.0991 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 596126 sc-eQTL 8.40e-01 0.0214 0.106 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 220969 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0257 0.0543 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 577929 sc-eQTL 5.17e-01 0.0612 0.0944 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 427074 sc-eQTL 8.45e-01 0.017 0.0865 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 762521 sc-eQTL 1.76e-01 0.1 0.0737 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 sc-eQTL 3.02e-01 0.0952 0.092 0.194 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 762521 eQTL 0.0464 -0.0221 0.0111 0.0 0.0 0.191
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 eQTL 4.17e-19 0.26 0.0285 0.0 0.0 0.191
ENSG00000188596 CFAP54 131874 eQTL 3.1e-06 0.115 0.0245 0.0 0.0 0.191

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -285774 1.27e-06 9.28e-07 2.97e-07 1.22e-06 5.79e-07 6.46e-07 1.52e-06 4.02e-07 1.38e-06 3.83e-07 1.86e-06 5.7e-07 2.25e-06 5.86e-07 5.58e-07 8.35e-07 1.12e-06 1.18e-06 5.4e-07 4.95e-07 6.57e-07 1.96e-06 1.05e-06 4.66e-07 2.21e-06 9.86e-07 9.97e-07 6.88e-07 1.62e-06 1.84e-06 8.83e-07 7.49e-08 5.58e-08 4.83e-07 5.31e-07 8.66e-07 6.37e-07 1.41e-07 1.55e-07 2.77e-08 3.46e-08 2.84e-06 4.36e-08 1.32e-07 1.93e-07 7.7e-08 9.83e-08 3.09e-09 6.03e-08
ENSG00000188596 CFAP54 131874 6.57e-06 9.31e-06 1.61e-06 5.08e-06 2.85e-06 5.06e-06 1.09e-05 2.18e-06 8.69e-06 5.49e-06 1.31e-05 4.89e-06 1.23e-05 3.59e-06 2.62e-06 6.63e-06 5.38e-06 6.63e-06 3.29e-06 2.77e-06 6.79e-06 1.11e-05 7.47e-06 2.36e-06 1.25e-05 4.65e-06 6.59e-06 4.49e-06 1.14e-05 1.07e-05 6.69e-06 8.07e-07 4.86e-07 2.78e-06 3.3e-06 2.68e-06 1.71e-06 1.08e-06 1.57e-06 8.21e-07 7.83e-07 1.16e-05 9.02e-07 5.03e-07 7.68e-07 1.07e-06 1.05e-06 7.35e-07 5.22e-07