logo

Genes within 1Mb (chr12:96605094:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 2.70e-04 -0.238 0.0642 0.13 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.83e-01 -0.109 0.0819 0.13 B L1
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 8.22e-02 -0.152 0.087 0.13 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 9.71e-02 -0.132 0.079 0.13 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 9.90e-01 0.00151 0.116 0.13 B L1
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0735 0.0541 0.13 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 8.49e-01 0.0142 0.0746 0.13 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 6.37e-01 0.0381 0.0808 0.13 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0784 0.0705 0.13 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 3.96e-05 0.351 0.0836 0.13 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 4.98e-02 -0.108 0.0547 0.13 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.64e-01 0.0825 0.059 0.13 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 5.64e-01 0.0515 0.0892 0.13 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0659 0.073 0.13 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 1.41e-01 0.143 0.0967 0.13 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.31e-02 -0.262 0.105 0.133 DC L1
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 5.98e-01 -0.064 0.121 0.133 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.72e-02 -0.235 0.0977 0.133 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 4.46e-01 0.0924 0.121 0.133 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 1.15e-01 -0.159 0.1 0.133 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 4.82e-02 0.255 0.128 0.133 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 1.49e-01 -0.169 0.116 0.133 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 5.35e-01 0.0524 0.0843 0.13 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 1.89e-02 -0.248 0.105 0.13 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 6.85e-02 -0.218 0.119 0.13 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 6.44e-01 0.0372 0.0805 0.13 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 5.49e-01 0.0456 0.0759 0.13 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0981 0.116 0.13 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 2.39e-01 -0.133 0.113 0.13 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 2.81e-02 -0.138 0.0622 0.127 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 5.80e-02 0.202 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0319 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 1.49e-02 -0.203 0.0828 0.127 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 3.33e-01 -0.103 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0258 0.0531 0.13 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 813942 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0756 0.0982 0.13 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0136 0.111 0.13 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 4.84e-01 0.0608 0.0866 0.13 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0928 0.0803 0.13 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 6.14e-01 0.0619 0.123 0.13 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 115523 sc-eQTL 8.07e-02 0.221 0.126 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 3.51e-01 -0.111 0.119 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.53e-02 -0.326 0.133 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 4.04e-01 -0.12 0.143 0.138 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0607 0.135 0.138 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0338 0.141 0.138 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 3.97e-04 -0.355 0.0986 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.08e-02 -0.249 0.0969 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 9.08e-01 0.0128 0.111 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 6.93e-02 -0.2 0.11 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 8.15e-02 -0.225 0.129 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 2.89e-02 -0.215 0.0976 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 2.77e-02 -0.25 0.113 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0532 0.112 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0567 0.119 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0961 0.131 0.131 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 3.13e-03 -0.239 0.0798 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.46e-01 -0.124 0.0849 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 9.05e-03 -0.261 0.0992 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 1.80e-01 -0.132 0.0977 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 3.81e-01 0.11 0.126 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 9.45e-01 0.00722 0.104 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 2.72e-01 -0.109 0.0987 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 2.81e-01 -0.126 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0277 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 4.02e-01 0.115 0.138 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 2.98e-01 -0.102 0.0976 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 6.14e-03 0.375 0.135 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0146 0.14 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 2.79e-01 -0.132 0.121 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0699 0.14 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0839 0.0595 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 9.13e-01 0.00943 0.0865 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 8.69e-01 0.0143 0.0865 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 1.49e-01 -0.111 0.0765 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 3.48e-04 0.334 0.0918 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0516 0.0581 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.50e-01 0.142 0.0983 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 1.15e-01 0.153 0.0966 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 8.95e-01 0.0106 0.0797 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 7.06e-01 0.0412 0.109 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.48e-01 -0.103 0.0712 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0627 0.11 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 7.08e-01 0.0385 0.103 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 8.74e-01 0.0171 0.108 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 2.90e-02 0.277 0.126 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 2.31e-03 -0.208 0.0673 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 5.29e-02 0.24 0.123 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 3.21e-02 0.241 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0998 0.104 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 2.09e-01 0.146 0.116 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.42e-01 -0.124 0.0839 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 2.45e-01 0.117 0.101 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 8.56e-01 0.0194 0.107 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 5.93e-02 -0.181 0.0953 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 2.49e-01 0.132 0.114 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 9.14e-02 -0.154 0.0907 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 7.61e-01 0.0409 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 4.99e-01 -0.077 0.114 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0939 0.131 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0276 0.128 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.74e-01 -0.151 0.11 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0971 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 4.81e-01 0.0941 0.133 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 2.29e-01 0.149 0.124 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 8.29e-02 0.233 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 5.37e-01 0.0474 0.0767 0.13 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 813942 sc-eQTL 3.32e-01 -0.1 0.103 0.13 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 5.16e-01 0.0771 0.118 0.13 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0431 0.0995 0.13 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0952 0.115 0.13 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 8.98e-02 0.219 0.129 0.13 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 115523 sc-eQTL 8.44e-01 0.0253 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.88e-02 -0.187 0.079 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 2.62e-01 0.133 0.118 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 7.09e-01 0.0469 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 1.14e-03 -0.423 0.128 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 3.30e-01 -0.129 0.132 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0989 0.0685 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.92e-01 0.162 0.124 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0641 0.11 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0748 0.105 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 2.82e-01 -0.13 0.12 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 8.98e-01 0.0138 0.108 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 4.10e-01 0.116 0.141 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 8.09e-01 0.0317 0.131 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 7.09e-02 -0.246 0.135 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 3.21e-01 -0.128 0.129 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0847 0.0737 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 2.09e-01 0.157 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 4.99e-01 0.081 0.12 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 8.25e-02 -0.176 0.101 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0716 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 3.40e-01 0.126 0.131 0.133 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 8.16e-01 0.0271 0.116 0.133 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 2.03e-01 -0.19 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 3.53e-01 -0.135 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 1.76e-01 0.233 0.171 0.133 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 2.55e-01 0.0939 0.0822 0.13 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 813942 sc-eQTL 6.56e-01 0.0414 0.0926 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0666 0.109 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 2.71e-01 0.145 0.131 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 9.36e-01 0.00665 0.0831 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0114 0.121 0.13 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 115523 sc-eQTL 2.22e-01 0.119 0.0972 0.13 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 5.59e-01 0.0528 0.0901 0.13 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 3.76e-01 0.101 0.114 0.13 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 8.05e-02 -0.181 0.103 0.13 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0123 0.12 0.13 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 1.02e-01 0.218 0.133 0.13 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.47e-02 -0.273 0.111 0.141 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00912 0.117 0.141 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.15e-01 -0.158 0.0995 0.141 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 3.45e-01 0.125 0.132 0.141 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0609 0.111 0.141 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 1.12e-01 0.214 0.134 0.141 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 2.24e-02 -0.258 0.112 0.141 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 5.54e-01 0.0573 0.0967 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 2.16e-01 -0.13 0.105 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 4.02e-02 -0.233 0.113 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 6.30e-01 0.0424 0.0878 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 8.68e-01 0.0151 0.0906 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 8.76e-01 0.0194 0.125 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 8.19e-02 -0.202 0.116 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 6.70e-01 0.0468 0.11 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 8.46e-02 -0.212 0.122 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 2.13e-01 -0.153 0.123 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 7.60e-01 0.0307 0.1 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 6.55e-01 0.0444 0.0991 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0512 0.134 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0505 0.126 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0388 0.109 0.127 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 813942 sc-eQTL 1.37e-01 -0.186 0.125 0.127 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 6.08e-01 0.084 0.163 0.127 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 2.93e-01 0.159 0.151 0.127 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 4.11e-02 -0.297 0.144 0.127 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0577 0.161 0.127 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 115523 sc-eQTL 2.22e-01 -0.173 0.141 0.127 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 5.65e-01 0.0733 0.127 0.131 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 1.10e-01 -0.205 0.128 0.131 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0679 0.132 0.131 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0513 0.118 0.131 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 1.02e-01 -0.205 0.125 0.131 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0414 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 2.77e-01 -0.143 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 9.28e-01 0.009 0.0999 0.133 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 7.07e-01 -0.042 0.111 0.133 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0444 0.124 0.133 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 6.87e-01 0.043 0.107 0.133 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 3.82e-01 0.0953 0.109 0.133 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 1.95e-01 -0.15 0.115 0.133 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0745 0.132 0.133 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0785 0.136 0.138 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 8.17e-01 0.0265 0.115 0.138 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 9.73e-03 -0.328 0.125 0.138 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 4.21e-02 -0.317 0.155 0.138 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 1.29e-02 -0.337 0.134 0.138 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 2.84e-01 0.162 0.15 0.138 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 9.33e-01 -0.011 0.13 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 2.88e-05 -0.351 0.082 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 6.86e-03 -0.238 0.0873 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 8.79e-01 0.0155 0.101 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 2.30e-02 -0.222 0.0972 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 1.94e-01 -0.167 0.128 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 1.28e-02 -0.181 0.072 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 6.92e-02 -0.149 0.0814 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 1.47e-02 -0.227 0.0921 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0443 0.094 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 3.96e-01 0.106 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 6.88e-01 0.0351 0.0872 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 4.43e-02 -0.212 0.105 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 1.19e-01 -0.181 0.115 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 7.32e-01 0.0287 0.0838 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 4.08e-01 0.067 0.0807 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0328 0.127 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 3.82e-01 -0.103 0.117 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 5.82e-01 0.0515 0.0934 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 608729 sc-eQTL 2.07e-01 -0.139 0.11 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 3.88e-01 -0.106 0.122 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0128 0.0906 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 9.79e-01 0.00245 0.0935 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 2.27e-01 -0.145 0.119 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 579771 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0769 0.127 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 204614 sc-eQTL 6.30e-02 -0.118 0.0634 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 561574 sc-eQTL 5.88e-02 0.209 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 410719 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00859 0.102 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 746166 sc-eQTL 9.56e-02 -0.145 0.0865 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 sc-eQTL 2.74e-01 -0.119 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 204614 eQTL 4.36e-03 0.0492 0.0172 0.00247 0.00116 0.126
ENSG00000139350 NEDD1 -302129 eQTL 0.0388 -0.0722 0.0349 0.0 0.0 0.126

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina