logo

Genes within 1Mb (chr12:96595566:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 3.23e-04 -0.175 0.0479 0.276 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0406 0.0612 0.276 B L1
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 9.84e-03 -0.167 0.0642 0.276 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 5.54e-02 -0.113 0.0588 0.276 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0338 0.0865 0.276 B L1
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0318 0.0403 0.276 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0262 0.0554 0.276 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 2.06e-01 0.076 0.0598 0.276 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0654 0.0523 0.276 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 9.30e-03 0.167 0.0636 0.276 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0661 0.0411 0.276 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 1.00e-01 0.0728 0.0441 0.276 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 7.64e-01 0.0201 0.0668 0.276 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 6.74e-01 -0.023 0.0547 0.276 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 1.33e-01 0.109 0.0724 0.276 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 1.74e-01 -0.106 0.0774 0.277 DC L1
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0129 0.0885 0.277 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 1.29e-02 -0.179 0.0713 0.277 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0436 0.0886 0.277 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0566 0.0737 0.277 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 5.74e-02 0.179 0.0938 0.277 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0508 0.0854 0.277 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 6.24e-01 0.0304 0.0619 0.276 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 1.37e-01 -0.116 0.0776 0.276 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 4.89e-01 -0.061 0.088 0.276 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0157 0.0591 0.276 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 1.55e-01 0.0793 0.0555 0.276 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 1.27e-01 -0.131 0.0852 0.276 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 7.60e-01 0.0254 0.083 0.276 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0466 0.046 0.273 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 2.01e-01 0.1 0.0779 0.273 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0457 0.0742 0.273 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0366 0.0615 0.273 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0736 0.0778 0.273 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0372 0.0393 0.276 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 804414 sc-eQTL 6.32e-01 0.0349 0.0728 0.276 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 5.68e-01 -0.047 0.0822 0.276 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 1.07e-01 0.103 0.0638 0.276 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 5.20e-01 0.0384 0.0596 0.276 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 2.00e-01 0.116 0.0905 0.276 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 105995 sc-eQTL 2.02e-01 0.12 0.0938 0.276 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 6.07e-01 -0.045 0.0873 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 2.79e-01 -0.107 0.0986 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 1.53e-01 -0.15 0.104 0.286 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 8.78e-01 0.0152 0.0988 0.286 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 3.60e-01 0.0945 0.103 0.286 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 1.89e-03 -0.234 0.0742 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 1.43e-01 -0.108 0.0732 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0155 0.0829 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 9.94e-02 -0.136 0.0821 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 2.42e-01 -0.113 0.0965 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 1.17e-01 -0.115 0.0731 0.278 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 2.05e-02 -0.196 0.0838 0.278 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 8.04e-02 -0.146 0.0828 0.278 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 6.42e-01 0.0411 0.0884 0.278 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 9.48e-01 0.00638 0.0978 0.278 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 4.66e-02 -0.121 0.0602 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0204 0.0636 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 3.23e-04 -0.267 0.073 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0785 0.073 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0412 0.0938 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0226 0.078 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 2.73e-01 -0.081 0.0737 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0763 0.087 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 5.33e-01 -0.054 0.0865 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 9.39e-01 0.00794 0.103 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 7.99e-02 -0.126 0.0713 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 7.68e-02 0.179 0.101 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 4.93e-01 0.0703 0.102 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0783 0.089 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0463 0.103 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0318 0.0443 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0503 0.0641 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 2.59e-01 0.0724 0.064 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0698 0.0568 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 2.00e-02 0.163 0.0693 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0484 0.043 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 7.81e-01 0.0204 0.0731 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 1.87e-02 0.168 0.071 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0665 0.0588 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 9.29e-01 0.00722 0.0806 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 9.14e-02 -0.089 0.0525 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 8.94e-01 0.0109 0.0816 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0175 0.0758 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 3.52e-01 0.0739 0.0792 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 2.21e-01 0.115 0.0938 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 4.55e-02 -0.103 0.0514 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 2.25e-01 0.114 0.0934 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 3.90e-01 0.0734 0.0852 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 6.98e-01 0.0305 0.0784 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00517 0.088 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0772 0.0615 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 5.01e-01 0.0497 0.0739 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 7.31e-01 0.0269 0.0782 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0798 0.0701 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 1.70e-01 0.115 0.0834 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 5.80e-02 -0.128 0.0673 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0844 0.0996 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 2.56e-01 -0.096 0.0843 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 1.46e-01 -0.141 0.0968 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 9.22e-02 0.16 0.0946 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 2.54e-02 -0.183 0.0814 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0485 0.101 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 7.84e-01 0.0272 0.0992 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 1.59e-01 0.13 0.0917 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 2.23e-01 0.122 0.0997 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0404 0.0562 0.275 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 804414 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0196 0.0759 0.275 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 5.93e-01 0.0465 0.0869 0.275 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 5.58e-01 0.0427 0.0729 0.275 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 1.65e-01 0.117 0.0842 0.275 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 5.72e-02 0.18 0.0941 0.275 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 105995 sc-eQTL 6.60e-01 0.0415 0.0941 0.275 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 1.32e-02 -0.143 0.0572 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 3.07e-01 0.0878 0.0857 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0357 0.0911 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0871 0.0952 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0345 0.0962 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0569 0.0496 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 5.02e-01 0.0604 0.0898 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0341 0.0796 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 2.15e-01 0.0938 0.0755 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0991 0.087 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 3.41e-01 0.0757 0.0793 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 5.48e-01 0.0627 0.104 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 6.32e-01 0.0463 0.0967 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 8.75e-02 -0.172 0.1 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 1.50e-01 -0.137 0.0949 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0609 0.0544 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 1.12e-01 0.146 0.0917 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 8.35e-01 0.0184 0.0883 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0366 0.0748 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0754 0.0924 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0262 0.0983 0.285 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 4.63e-01 0.0636 0.0865 0.285 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 9.80e-02 -0.183 0.11 0.285 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0455 0.108 0.285 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 2.67e-01 0.143 0.128 0.285 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00749 0.0616 0.278 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 804414 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0172 0.0692 0.278 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0102 0.0813 0.278 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 6.75e-02 0.179 0.0976 0.278 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 5.52e-01 0.0369 0.062 0.278 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 6.70e-01 0.0384 0.0901 0.278 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 105995 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0239 0.0729 0.278 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 2.73e-01 0.073 0.0665 0.276 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0349 0.0844 0.276 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00135 0.0765 0.276 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0249 0.0886 0.276 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 1.19e-01 0.154 0.0983 0.276 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 2.26e-01 -0.101 0.0827 0.28 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 7.77e-01 0.0244 0.0863 0.28 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 4.25e-02 -0.149 0.0731 0.28 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 8.17e-01 0.0226 0.0976 0.28 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0285 0.0817 0.28 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 6.34e-01 0.0474 0.0995 0.28 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0529 0.0839 0.28 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 6.74e-01 0.0302 0.0717 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0384 0.0782 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0914 0.0843 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00299 0.0651 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 2.90e-01 0.071 0.067 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0853 0.0923 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0457 0.0863 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 8.99e-01 0.0103 0.0817 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 8.86e-02 -0.156 0.091 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0498 0.0915 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0159 0.0746 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00296 0.0737 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0497 0.0995 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 4.17e-01 0.076 0.0935 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0245 0.0791 0.27 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 804414 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0497 0.0907 0.27 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 1.74e-01 0.161 0.118 0.27 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 9.12e-01 0.0121 0.11 0.27 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 5.11e-02 -0.205 0.104 0.27 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 4.16e-01 0.095 0.116 0.27 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 105995 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0162 0.102 0.27 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 5.79e-01 0.0516 0.0928 0.282 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 5.82e-01 0.0517 0.0939 0.282 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 9.97e-01 0.000361 0.0964 0.282 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 9.35e-01 0.00706 0.0858 0.282 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 1.88e-01 -0.121 0.0914 0.282 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0752 0.0952 0.282 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 2.55e-01 -0.109 0.0956 0.282 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 2.52e-01 0.0858 0.0746 0.283 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0769 0.0834 0.283 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 7.83e-01 0.0257 0.0932 0.283 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0244 0.08 0.283 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 3.65e-04 0.287 0.0791 0.283 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 1.24e-01 -0.133 0.0863 0.283 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 4.79e-01 0.0701 0.0989 0.283 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0423 0.0991 0.271 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 6.36e-01 0.0397 0.0837 0.271 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 2.13e-02 -0.214 0.0922 0.271 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 1.61e-02 -0.274 0.113 0.271 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 1.04e-01 -0.162 0.0992 0.271 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 4.73e-01 0.0792 0.11 0.271 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 6.05e-01 0.049 0.0946 0.271 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 3.82e-04 -0.223 0.0616 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 6.39e-02 -0.122 0.0654 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0733 0.0752 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 1.06e-01 -0.118 0.0726 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00156 0.0958 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 3.63e-02 -0.114 0.0539 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0356 0.0611 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 3.14e-03 -0.204 0.0682 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 4.76e-01 -0.05 0.07 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0381 0.0927 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 8.50e-01 0.0122 0.0647 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 1.62e-01 -0.11 0.078 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0683 0.0859 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0165 0.0621 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 2.98e-01 0.0624 0.0598 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0719 0.0939 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 7.16e-01 0.0317 0.0871 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 2.25e-01 0.0827 0.0679 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 599201 sc-eQTL 5.52e-01 -0.048 0.0805 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0157 0.0893 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0298 0.0661 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 1.93e-01 0.0888 0.0679 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 1.19e-01 -0.136 0.0869 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 570243 sc-eQTL 7.88e-01 0.0249 0.0925 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 195086 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0437 0.0466 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 552046 sc-eQTL 1.68e-01 0.112 0.0808 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 401191 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0336 0.0742 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 736638 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0131 0.0635 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0821 0.079 0.272 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 eQTL 4.25e-11 -0.166 0.0248 0.0 0.0 0.273

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -311657 1.26e-06 9.52e-07 3.21e-07 7.35e-07 3.57e-07 4.77e-07 1.28e-06 3.49e-07 1.28e-06 4.32e-07 1.48e-06 6.2e-07 1.96e-06 2.76e-07 5.08e-07 8.02e-07 8.25e-07 6.1e-07 7.76e-07 6.76e-07 5.8e-07 1.27e-06 9.26e-07 6.23e-07 2.06e-06 4.28e-07 7.97e-07 7.14e-07 1.29e-06 1.22e-06 5.91e-07 1.88e-07 2.13e-07 5.6e-07 4.66e-07 4.59e-07 5.17e-07 2.31e-07 3.43e-07 2.5e-07 2.67e-07 1.59e-06 5.07e-08 6.48e-08 2.16e-07 1.22e-07 2.35e-07 5.39e-08 1.35e-07