logo

Genes within 1Mb (chr12:96594065:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 1.26e-03 -0.16 0.0489 0.265 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0469 0.0622 0.265 B L1
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 1.12e-02 -0.167 0.0653 0.265 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 5.09e-02 -0.117 0.0597 0.265 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 7.59e-01 -0.027 0.0879 0.265 B L1
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0192 0.0409 0.265 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0367 0.0562 0.265 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 1.85e-01 0.0807 0.0607 0.265 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0516 0.0531 0.265 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 3.72e-02 0.136 0.0649 0.265 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0589 0.0419 0.265 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 8.59e-02 0.0774 0.0449 0.265 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 6.02e-01 0.0355 0.068 0.265 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 7.20e-01 -0.02 0.0557 0.265 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 1.41e-01 0.109 0.0737 0.265 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0741 0.0785 0.266 DC L1
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0183 0.0895 0.266 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 4.72e-03 -0.205 0.0718 0.266 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0181 0.0897 0.266 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0548 0.0745 0.266 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 1.19e-01 0.149 0.0952 0.266 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0647 0.0863 0.266 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 7.98e-01 0.0161 0.063 0.265 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 9.42e-02 -0.133 0.0788 0.265 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0867 0.0894 0.265 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0141 0.0602 0.265 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 2.02e-01 0.0723 0.0565 0.265 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 1.63e-01 -0.121 0.0867 0.265 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 9.16e-01 0.00897 0.0844 0.265 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0313 0.047 0.262 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 3.21e-01 0.0793 0.0796 0.262 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0367 0.0757 0.262 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0349 0.0627 0.262 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0497 0.0794 0.262 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0323 0.04 0.265 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 802913 sc-eQTL 7.42e-01 0.0244 0.074 0.265 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 4.89e-01 -0.058 0.0836 0.265 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.21e-02 0.117 0.0648 0.265 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 5.62e-01 0.0352 0.0606 0.265 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 3.31e-01 0.0898 0.0922 0.265 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 104494 sc-eQTL 2.97e-01 0.0998 0.0955 0.265 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0414 0.0891 0.273 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.35e-01 -0.12 0.101 0.273 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 2.04e-01 -0.136 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 8.34e-01 0.0212 0.101 0.273 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 2.48e-01 0.122 0.105 0.273 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 3.60e-03 -0.223 0.0756 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 1.44e-01 -0.109 0.0743 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00847 0.0842 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 1.21e-01 -0.13 0.0834 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 2.05e-01 -0.125 0.0979 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0806 0.0745 0.267 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.88e-02 -0.188 0.0853 0.267 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.64e-02 -0.15 0.0842 0.267 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 7.48e-01 0.0289 0.0899 0.267 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 7.61e-01 0.0303 0.0994 0.267 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 9.21e-02 -0.104 0.0614 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0178 0.0647 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.00e-04 -0.256 0.0745 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0873 0.0742 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0457 0.0954 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0237 0.0791 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 3.24e-01 -0.074 0.0748 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0888 0.0882 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0551 0.0877 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 9.93e-01 0.000981 0.104 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 9.26e-02 -0.122 0.072 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 1.00e-01 0.168 0.102 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 5.92e-01 0.0555 0.104 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0663 0.0899 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0417 0.104 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0196 0.0448 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0693 0.0646 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 2.42e-01 0.0758 0.0646 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0523 0.0575 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 6.04e-02 0.133 0.0703 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0364 0.0436 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 7.62e-01 0.0224 0.074 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 2.14e-02 0.167 0.0719 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0617 0.0596 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00434 0.0816 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0817 0.0533 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 7.50e-01 0.0264 0.0827 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0122 0.0769 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 2.29e-01 0.0968 0.0802 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 5.14e-01 0.0623 0.0954 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 6.87e-02 -0.0957 0.0523 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.84e-01 0.102 0.0949 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 3.09e-01 0.0882 0.0864 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 6.23e-01 0.0392 0.0796 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 8.40e-01 0.018 0.0893 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0677 0.0621 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 4.69e-01 0.0541 0.0745 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.50e-01 0.0252 0.0789 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0543 0.0709 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 1.96e-01 0.109 0.0841 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 1.12e-01 -0.109 0.068 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0672 0.101 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0957 0.085 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 2.17e-01 -0.121 0.0978 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 8.82e-02 0.163 0.0954 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 2.95e-02 -0.182 0.0828 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0636 0.103 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 8.89e-01 0.014 0.101 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 1.01e-01 0.153 0.0931 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 2.56e-01 0.116 0.101 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0317 0.0567 0.264 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 802913 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0196 0.0765 0.264 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 6.30e-01 0.0422 0.0876 0.264 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 2.85e-01 0.0786 0.0734 0.264 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 1.01e-01 0.139 0.0847 0.264 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 1.17e-01 0.15 0.0952 0.264 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 104494 sc-eQTL 6.21e-01 0.047 0.0948 0.264 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 2.23e-02 -0.134 0.0583 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.98e-01 0.0908 0.0871 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0514 0.0926 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0629 0.0968 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 9.02e-01 -0.012 0.0978 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0443 0.0507 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 6.55e-01 0.0411 0.0917 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0273 0.0812 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 1.57e-01 0.109 0.0769 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0874 0.0888 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 3.21e-01 0.0809 0.0814 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 6.56e-01 0.0477 0.107 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 5.38e-01 0.0612 0.0991 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 7.85e-02 -0.181 0.103 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 1.42e-01 -0.144 0.0973 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0442 0.0556 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.01e-01 0.12 0.0937 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 6.85e-01 0.0366 0.09 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0575 0.0762 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0347 0.0943 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0642 0.101 0.274 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 3.69e-01 0.0804 0.0891 0.274 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 5.89e-02 -0.215 0.113 0.274 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0117 0.112 0.274 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 3.06e-01 0.136 0.132 0.274 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 7.74e-01 -0.018 0.0628 0.267 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 802913 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0221 0.0705 0.267 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 9.53e-01 0.00491 0.0829 0.267 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 6.89e-02 0.182 0.0995 0.267 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 7.08e-01 0.0237 0.0632 0.267 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 6.54e-01 0.0413 0.0918 0.267 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 104494 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0425 0.0742 0.267 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 1.91e-01 0.0885 0.0674 0.265 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 5.22e-01 -0.055 0.0857 0.265 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 6.90e-01 0.031 0.0777 0.265 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0484 0.0899 0.265 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 1.30e-01 0.152 0.0999 0.265 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0787 0.0836 0.268 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 6.22e-01 0.043 0.087 0.268 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.08e-02 -0.172 0.0736 0.268 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.35e-01 0.0334 0.0985 0.268 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0182 0.0825 0.268 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 8.31e-01 0.0215 0.1 0.268 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0593 0.0846 0.268 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 8.55e-01 0.0133 0.0729 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 5.89e-01 -0.043 0.0795 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 1.62e-01 -0.12 0.0855 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.67e-01 0.0196 0.0662 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 3.05e-01 0.0701 0.0681 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0567 0.094 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0729 0.0876 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0123 0.0831 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 4.28e-02 -0.188 0.0924 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0789 0.093 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0416 0.0758 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0124 0.075 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0426 0.101 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 4.11e-01 0.0784 0.0951 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0169 0.0799 0.258 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 802913 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0421 0.0916 0.258 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.64e-01 0.133 0.119 0.258 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.30e-01 0.0382 0.111 0.258 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 7.34e-02 -0.19 0.106 0.258 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 4.39e-01 0.0913 0.118 0.258 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 104494 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0147 0.103 0.258 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 7.76e-01 0.0269 0.0946 0.271 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 6.78e-01 0.0398 0.0956 0.271 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0168 0.0981 0.271 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0254 0.0874 0.271 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 1.68e-01 -0.128 0.093 0.271 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 2.28e-01 -0.117 0.0967 0.271 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 1.44e-01 -0.143 0.0971 0.271 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 2.16e-01 0.0944 0.0761 0.271 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0675 0.0852 0.271 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0105 0.0951 0.271 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0463 0.0816 0.271 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 2.77e-04 0.299 0.0807 0.271 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 1.04e-01 -0.144 0.088 0.271 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 6.83e-01 0.0413 0.101 0.271 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0202 0.1 0.26 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 9.13e-01 0.00921 0.0844 0.26 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 1.33e-02 -0.232 0.0927 0.26 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 3.26e-02 -0.246 0.114 0.26 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 1.12e-01 -0.16 0.1 0.26 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 6.22e-01 0.055 0.111 0.26 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 3.94e-01 0.0814 0.0952 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 1.43e-03 -0.204 0.063 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 5.58e-02 -0.128 0.0665 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 3.89e-01 -0.066 0.0765 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 1.03e-01 -0.121 0.0738 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 9.40e-01 0.00738 0.0974 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 7.08e-02 -0.0997 0.0549 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0333 0.0621 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 3.83e-03 -0.203 0.0694 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0542 0.0712 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0393 0.0943 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00612 0.0658 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 1.10e-01 -0.127 0.0792 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0951 0.0873 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00994 0.0632 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 3.54e-01 0.0565 0.0609 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0506 0.0956 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 8.14e-01 0.0208 0.0886 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 2.90e-01 0.0734 0.0692 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 597700 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0384 0.082 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0351 0.0909 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0517 0.0672 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 1.87e-01 0.0916 0.0691 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 6.54e-02 -0.164 0.0883 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 568742 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0112 0.0942 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 193585 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0295 0.0476 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 550545 sc-eQTL 2.76e-01 0.0902 0.0826 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 399690 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0238 0.0758 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 735137 sc-eQTL 8.05e-01 -0.016 0.0648 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0606 0.0807 0.261 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 eQTL 3.93e-11 -0.168 0.0251 0.0 0.0 0.263

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -313158 1.34e-06 9.44e-07 3.2e-07 5.65e-07 3.2e-07 4.63e-07 1.13e-06 3.43e-07 1.2e-06 3.83e-07 1.35e-06 5.83e-07 1.75e-06 2.54e-07 4.77e-07 7.78e-07 8.4e-07 5.45e-07 5.54e-07 6.72e-07 4.43e-07 1.2e-06 7.78e-07 6.02e-07 1.97e-06 3.75e-07 7.12e-07 7.74e-07 1.07e-06 1.08e-06 5.45e-07 1.72e-07 2.14e-07 5.46e-07 4.91e-07 4.32e-07 4.26e-07 1.57e-07 2.92e-07 2.42e-07 2.67e-07 1.41e-06 7.66e-08 2.63e-08 1.74e-07 1.11e-07 2.41e-07 8.73e-08 9.42e-08