logo

Genes within 1Mb (chr12:96592102:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 1.11e-01 0.0908 0.0568 0.19 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 5.08e-01 -0.047 0.0709 0.19 B L1
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 2.33e-01 0.0901 0.0753 0.19 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 2.51e-01 0.0787 0.0684 0.19 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 1.70e-01 0.137 0.0997 0.19 B L1
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 3.12e-01 0.0479 0.0473 0.19 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 4.54e-01 0.0488 0.0651 0.19 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 6.62e-01 0.0309 0.0705 0.19 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 1.77e-01 0.0832 0.0614 0.19 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 2.94e-02 -0.165 0.0751 0.19 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 1.11e-01 0.0764 0.0477 0.19 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0539 0.0514 0.19 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 6.23e-01 0.0382 0.0776 0.19 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00661 0.0636 0.19 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0178 0.0845 0.19 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 2.83e-01 0.101 0.0934 0.189 DC L1
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 3.19e-01 0.106 0.106 0.189 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 6.52e-01 0.0394 0.0872 0.189 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 1.89e-01 0.14 0.106 0.189 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0011 0.0888 0.189 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 3.54e-01 0.106 0.114 0.189 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 2.22e-01 0.126 0.103 0.189 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 6.09e-01 0.0371 0.0725 0.19 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 2.13e-01 0.114 0.091 0.19 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0719 0.103 0.19 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0166 0.0693 0.19 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 6.87e-01 0.0264 0.0653 0.19 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 3.03e-03 0.294 0.0982 0.19 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 1.47e-01 -0.141 0.0967 0.19 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0396 0.0538 0.191 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 7.25e-01 0.0322 0.0914 0.191 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00955 0.0867 0.191 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 1.44e-01 0.105 0.0715 0.191 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 3.48e-01 0.0854 0.0908 0.191 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0078 0.0458 0.19 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 800950 sc-eQTL 3.47e-01 0.0796 0.0844 0.19 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 7.03e-01 0.0365 0.0956 0.19 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0144 0.0746 0.19 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 5.07e-01 0.046 0.0693 0.19 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 5.91e-01 0.0568 0.106 0.19 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 102531 sc-eQTL 1.35e-01 -0.163 0.109 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 6.90e-01 0.041 0.102 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0243 0.116 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0151 0.123 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0663 0.116 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 4.09e-01 0.1 0.121 0.191 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 3.41e-01 0.0865 0.0906 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0123 0.0879 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 4.35e-01 0.0774 0.099 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 3.50e-01 0.0923 0.0985 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 3.27e-01 0.113 0.115 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 1.83e-01 0.118 0.0881 0.185 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 2.37e-03 0.307 0.0999 0.185 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0369 0.1 0.185 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 4.25e-01 0.0849 0.106 0.185 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 1.42e-01 -0.173 0.117 0.185 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 2.11e-01 0.0885 0.0706 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 9.91e-01 0.000853 0.0742 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 1.39e-01 0.13 0.0872 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 5.82e-01 -0.047 0.0853 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 9.30e-01 0.00958 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 4.41e-01 -0.07 0.0906 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0041 0.086 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 2.04e-01 0.129 0.101 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0102 0.101 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 1.42e-01 0.175 0.119 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 2.01e-01 0.105 0.0822 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 6.93e-01 0.046 0.116 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 9.55e-01 0.00673 0.118 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0189 0.102 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 8.92e-02 0.201 0.118 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 3.39e-01 0.0499 0.052 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 2.80e-01 0.0814 0.0752 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 7.26e-01 0.0265 0.0754 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 2.25e-01 0.0812 0.0667 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0963 0.0822 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 2.89e-01 0.0533 0.0501 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0456 0.0852 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 3.11e-01 -0.085 0.0837 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 8.50e-02 0.118 0.0683 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 9.26e-02 -0.158 0.0934 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 9.99e-01 0.000117 0.0621 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0762 0.0957 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00911 0.0891 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 6.57e-01 0.0414 0.0932 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0594 0.111 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 9.74e-01 0.00197 0.0604 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 3.11e-01 -0.111 0.109 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 2.77e-02 -0.218 0.0982 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 7.91e-01 0.0243 0.0913 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 4.73e-01 0.0736 0.102 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 5.54e-02 0.138 0.0718 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 4.83e-01 -0.061 0.0867 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 1.95e-01 0.119 0.0915 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0464 0.0825 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 2.67e-01 -0.109 0.098 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000603 0.0775 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 6.81e-01 0.0468 0.114 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 8.54e-02 0.165 0.0957 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0568 0.111 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 4.56e-01 0.0811 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 5.33e-02 0.189 0.0972 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 6.84e-01 0.0489 0.12 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0595 0.118 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0446 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0363 0.119 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 8.50e-01 0.0124 0.0654 0.19 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 800950 sc-eQTL 2.54e-01 0.101 0.0878 0.19 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 9.23e-01 0.00974 0.101 0.19 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 5.68e-01 0.0485 0.0847 0.19 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 3.46e-01 0.0926 0.098 0.19 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0695 0.11 0.19 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 102531 sc-eQTL 8.87e-01 0.0155 0.109 0.19 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 1.02e-01 -0.115 0.0699 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 1.82e-01 -0.139 0.104 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 8.80e-01 0.0166 0.11 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0628 0.115 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 9.08e-01 0.0134 0.117 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 4.51e-01 -0.044 0.0582 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 4.45e-01 0.0805 0.105 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0163 0.0932 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 1.60e-01 0.125 0.0883 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 9.71e-02 0.169 0.102 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 1.93e-01 -0.12 0.092 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 4.51e-01 0.0914 0.121 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 2.83e-01 -0.121 0.112 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 4.91e-01 0.0807 0.117 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 2.24e-02 0.252 0.109 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 8.67e-01 0.0107 0.0638 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0982 0.108 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 9.65e-01 0.00459 0.103 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 6.90e-01 0.0349 0.0875 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 3.20e-01 -0.108 0.108 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 1.20e-01 0.195 0.125 0.181 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0433 0.111 0.181 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0537 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 5.66e-01 0.08 0.139 0.181 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0159 0.165 0.181 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 5.11e-01 0.0472 0.0716 0.191 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 800950 sc-eQTL 2.20e-01 0.0986 0.0801 0.191 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0325 0.0946 0.191 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0283 0.114 0.191 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 6.06e-01 0.0372 0.0721 0.191 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0779 0.105 0.191 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 102531 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0229 0.0847 0.191 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0641 0.0777 0.19 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 4.08e-01 0.0816 0.0984 0.19 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 4.40e-01 0.0689 0.0892 0.19 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0911 0.103 0.19 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 2.09e-02 -0.265 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 7.05e-01 0.0372 0.0981 0.185 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 4.67e-01 0.0743 0.102 0.185 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0487 0.0874 0.185 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 4.77e-01 0.0821 0.115 0.185 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0101 0.0966 0.185 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 4.51e-01 0.0888 0.118 0.185 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 6.65e-01 0.0431 0.0992 0.185 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 8.04e-02 0.146 0.083 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 3.08e-01 0.0929 0.091 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0757 0.0983 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 4.85e-01 0.053 0.0758 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 5.39e-01 0.0482 0.0782 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 2.64e-03 0.321 0.106 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 2.37e-01 -0.119 0.1 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 2.68e-01 0.105 0.0944 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 7.11e-01 0.0394 0.106 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0499 0.106 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0867 0.0862 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 9.85e-01 0.00162 0.0854 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 2.22e-01 0.141 0.115 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 2.76e-01 -0.118 0.108 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0312 0.095 0.191 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 800950 sc-eQTL 4.80e-01 0.0771 0.109 0.191 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0659 0.142 0.191 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0653 0.132 0.191 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 8.77e-01 0.0197 0.127 0.191 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0721 0.14 0.191 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 102531 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0789 0.123 0.191 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 5.22e-01 0.0684 0.107 0.191 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 2.73e-01 -0.118 0.107 0.191 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 3.11e-01 -0.112 0.11 0.191 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0241 0.0985 0.191 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 1.95e-03 0.323 0.103 0.191 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 9.19e-02 0.184 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0343 0.11 0.191 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 1.60e-01 -0.119 0.0845 0.192 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 2.89e-01 0.1 0.0946 0.192 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 8.15e-01 0.0248 0.106 0.192 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0106 0.0908 0.192 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0904 0.0925 0.192 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 4.51e-01 0.0743 0.0983 0.192 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 5.74e-01 0.0632 0.112 0.192 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 1.62e-01 0.158 0.113 0.184 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0509 0.0958 0.184 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0686 0.107 0.184 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 9.47e-02 0.219 0.13 0.184 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 5.72e-01 0.0647 0.114 0.184 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 1.58e-01 0.178 0.126 0.184 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 3.86e-01 -0.094 0.108 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 9.16e-02 0.125 0.074 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 3.83e-01 0.0676 0.0772 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00474 0.0884 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 1.11e-01 0.136 0.0852 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0596 0.112 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 4.94e-01 0.0437 0.0637 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0464 0.0716 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 2.06e-02 0.188 0.0805 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0113 0.0821 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 3.21e-01 0.108 0.108 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 5.45e-02 0.145 0.0749 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 1.79e-01 0.123 0.0912 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0896 0.1 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0323 0.0726 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 8.30e-01 0.0151 0.0701 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 1.26e-02 0.273 0.108 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 9.82e-02 -0.168 0.101 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0474 0.0782 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 595737 sc-eQTL 6.29e-01 0.0448 0.0924 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0193 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 6.82e-01 0.0311 0.0758 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 2.20e-01 0.096 0.078 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 6.70e-02 0.183 0.0995 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 566779 sc-eQTL 6.59e-01 0.0469 0.106 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 191622 sc-eQTL 8.68e-01 -0.00903 0.0545 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 548582 sc-eQTL 4.20e-01 0.0764 0.0946 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 397727 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00604 0.0867 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 733174 sc-eQTL 9.15e-02 0.125 0.0737 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 sc-eQTL 2.98e-01 0.0963 0.0923 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 733174 eQTL 0.0477 -0.0221 0.0112 0.0 0.0 0.188
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 eQTL 2.02e-19 0.264 0.0287 0.0 0.0 0.188
ENSG00000188596 CFAP54 102527 eQTL 9.2e-07 0.122 0.0247 0.00211 0.00189 0.188

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -315121 1.26e-06 9.09e-07 2.81e-07 3.4e-07 2.48e-07 3.69e-07 7.99e-07 3.22e-07 1.09e-06 3.8e-07 1.16e-06 5.7e-07 1.49e-06 2.33e-07 4.55e-07 6e-07 7.96e-07 5.65e-07 4.49e-07 4.65e-07 3.5e-07 9.14e-07 6.26e-07 5.25e-07 1.59e-06 2.89e-07 6.38e-07 5.29e-07 8.81e-07 1.01e-06 4.59e-07 1.29e-07 1.82e-07 3.78e-07 3.42e-07 3.94e-07 3.64e-07 1.4e-07 1.33e-07 4.17e-08 1.99e-07 1.09e-06 5.29e-08 1.92e-08 1.81e-07 7.77e-08 1.88e-07 8.31e-08 9.59e-08
ENSG00000188596 CFAP54 102527 4.58e-06 5.09e-06 6.07e-07 2.95e-06 1.67e-06 1.72e-06 5.01e-06 1.19e-06 5e-06 2.69e-06 5.69e-06 3.18e-06 7.42e-06 2.15e-06 1.27e-06 3.85e-06 1.88e-06 3.82e-06 1.45e-06 1.37e-06 2.71e-06 4.96e-06 4.56e-06 1.71e-06 6.72e-06 2.19e-06 2.35e-06 1.62e-06 4.47e-06 4.67e-06 2.85e-06 4.51e-07 7.54e-07 1.81e-06 2.04e-06 1.11e-06 1.08e-06 4.7e-07 8.54e-07 5.77e-07 7.37e-07 5.76e-06 4.37e-07 1.46e-07 7.17e-07 1.16e-06 1.14e-06 6.74e-07 5.13e-07