logo

Genes within 1Mb (chr12:96577640:G:GT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 1.56e-01 -0.113 0.0794 0.088 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 6.97e-01 0.0386 0.099 0.088 B L1
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 2.15e-01 -0.131 0.105 0.088 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0115 0.0958 0.088 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 4.20e-01 -0.113 0.14 0.088 B L1
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 3.48e-01 0.0621 0.066 0.088 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 2.18e-01 -0.112 0.0905 0.088 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 2.90e-01 0.104 0.0982 0.088 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 9.36e-01 0.00687 0.086 0.088 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0597 0.106 0.088 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0235 0.0679 0.088 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 1.63e-01 0.102 0.0725 0.088 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00241 0.11 0.088 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 8.04e-01 0.0223 0.0899 0.088 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0112 0.119 0.088 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 4.22e-01 0.0992 0.123 0.088 DC L1
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 3.63e-01 -0.128 0.14 0.088 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0156 0.115 0.088 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.95e-01 -0.182 0.14 0.088 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 5.11e-01 0.0769 0.117 0.088 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 3.14e-01 0.151 0.15 0.088 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0341 0.136 0.088 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 3.76e-01 0.0897 0.101 0.088 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 5.64e-01 0.0736 0.127 0.088 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 4.61e-01 0.106 0.144 0.088 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.01e-01 -0.012 0.0967 0.088 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.93e-01 0.0626 0.091 0.088 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 2.80e-01 -0.151 0.14 0.088 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 1.08e-01 0.217 0.135 0.088 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 7.99e-02 0.134 0.0759 0.088 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0576 0.13 0.088 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00338 0.123 0.088 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 1.64e-01 0.142 0.102 0.088 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0763 0.129 0.088 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 4.55e-01 0.0468 0.0625 0.088 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 786488 sc-eQTL 3.75e-01 0.103 0.116 0.088 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 1.77e-02 -0.309 0.129 0.088 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.70e-01 0.14 0.102 0.088 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.36e-02 0.191 0.094 0.088 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 3.50e-01 0.135 0.144 0.088 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 88069 sc-eQTL 5.98e-02 -0.281 0.148 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 4.80e-01 0.0999 0.141 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0259 0.16 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.68e-01 -0.233 0.168 0.092 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.37e-01 0.124 0.159 0.092 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 9.91e-02 0.275 0.166 0.092 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 2.71e-01 -0.135 0.122 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 6.08e-01 -0.061 0.119 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0152 0.134 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0247 0.133 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 7.66e-01 0.0465 0.156 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0394 0.118 0.088 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0944 0.136 0.088 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 3.15e-01 -0.134 0.134 0.088 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 3.51e-01 0.132 0.142 0.088 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 5.70e-01 0.0893 0.157 0.088 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0601 0.0992 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 4.26e-01 0.0829 0.104 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.18e-01 -0.192 0.122 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 8.71e-01 0.0194 0.12 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 5.14e-02 -0.298 0.152 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 9.44e-01 0.00881 0.124 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0538 0.118 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 4.04e-01 -0.116 0.139 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 6.60e-01 0.0607 0.138 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 4.84e-01 0.115 0.164 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 2.46e-01 -0.135 0.116 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 6.47e-02 -0.302 0.163 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 2.55e-01 0.189 0.166 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.31e-01 0.114 0.144 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 5.25e-01 0.106 0.167 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 2.75e-01 0.0789 0.0721 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 8.40e-02 -0.18 0.104 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 2.60e-01 0.118 0.104 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 6.92e-01 0.0369 0.0929 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 3.30e-01 -0.112 0.114 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0339 0.0705 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 9.52e-02 -0.199 0.119 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 3.08e-01 0.12 0.118 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 2.99e-01 -0.1 0.0964 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0683 0.132 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0465 0.086 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 7.17e-02 0.239 0.132 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0642 0.123 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0432 0.129 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 3.22e-01 -0.152 0.153 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0258 0.0838 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 6.21e-01 0.075 0.151 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 4.51e-01 -0.104 0.138 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.64e-01 0.0927 0.127 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 2.82e-01 -0.153 0.142 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 7.37e-01 0.0337 0.1 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 3.55e-01 0.111 0.12 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.77e-01 0.00372 0.127 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 8.55e-02 0.196 0.113 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 7.12e-01 0.0503 0.136 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0504 0.109 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 2.27e-01 -0.194 0.16 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00699 0.136 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 1.57e-01 -0.221 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 1.85e-01 0.203 0.153 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 6.10e-02 -0.246 0.131 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0547 0.161 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0985 0.159 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.72e-01 0.106 0.147 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 9.37e-01 0.0127 0.16 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0766 0.0895 0.089 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 786488 sc-eQTL 6.75e-01 0.0508 0.121 0.089 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 2.41e-01 -0.162 0.138 0.089 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 2.24e-01 0.141 0.116 0.089 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 8.91e-03 0.35 0.132 0.089 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0236 0.151 0.089 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 88069 sc-eQTL 3.33e-01 -0.145 0.149 0.089 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0819 0.0941 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 7.72e-01 0.0404 0.139 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0119 0.148 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 7.45e-02 0.275 0.154 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0154 0.156 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 1.82e-01 0.109 0.0814 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000305 0.148 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 5.51e-01 0.0781 0.131 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 5.94e-02 0.234 0.123 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 9.25e-01 0.0135 0.143 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 5.05e-02 0.249 0.127 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 1.42e-01 -0.246 0.167 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.19e-01 0.0158 0.155 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 2.25e-01 0.197 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 1.38e-01 -0.227 0.152 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 4.10e-01 0.0735 0.089 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 8.75e-01 0.0237 0.151 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00833 0.144 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 1.30e-01 0.185 0.122 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 3.71e-01 -0.135 0.151 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0842 0.167 0.081 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 4.04e-01 -0.123 0.147 0.081 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.64e-01 -0.262 0.187 0.081 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 9.98e-01 0.00044 0.184 0.081 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 8.22e-01 0.0493 0.219 0.081 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0604 0.0996 0.089 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 786488 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0819 0.112 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 1.26e-01 -0.201 0.131 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.26e-01 0.243 0.158 0.089 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0289 0.1 0.089 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 6.28e-01 0.0707 0.146 0.089 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 88069 sc-eQTL 3.53e-02 -0.247 0.117 0.089 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 3.81e-01 0.0949 0.108 0.088 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 1.30e-01 -0.208 0.136 0.088 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.65e-01 0.172 0.124 0.088 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.48e-01 0.109 0.144 0.088 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 2.40e-02 0.361 0.159 0.088 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 9.59e-02 0.232 0.138 0.085 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 4.44e-01 -0.111 0.145 0.085 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0342 0.124 0.085 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.12e-01 -0.26 0.163 0.085 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.32e-01 0.108 0.137 0.085 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 2.07e-01 -0.211 0.166 0.085 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 3.26e-01 0.138 0.141 0.085 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 1.92e-01 0.152 0.116 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 1.61e-01 0.178 0.127 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 8.12e-01 0.0327 0.137 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.74e-01 0.00347 0.106 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.64e-01 0.0799 0.109 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 1.97e-01 -0.194 0.15 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 3.46e-01 0.132 0.14 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 5.29e-01 0.0831 0.132 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 2.99e-01 -0.154 0.148 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 6.01e-01 0.0774 0.148 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 5.44e-01 -0.073 0.12 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 8.30e-01 0.0256 0.119 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 6.23e-01 -0.079 0.161 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 4.54e-02 0.301 0.15 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 5.44e-01 0.0811 0.134 0.085 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 786488 sc-eQTL 6.11e-01 0.0781 0.153 0.085 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0108 0.2 0.085 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 7.40e-01 0.0615 0.185 0.085 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 4.69e-01 -0.13 0.178 0.085 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 1.74e-01 0.268 0.196 0.085 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 88069 sc-eQTL 4.73e-01 0.124 0.173 0.085 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 2.89e-01 -0.159 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 3.96e-02 0.31 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 9.91e-01 0.00184 0.155 0.091 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 4.38e-01 0.107 0.138 0.091 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 2.18e-01 -0.182 0.147 0.091 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0756 0.153 0.091 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 5.25e-01 -0.098 0.154 0.091 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 5.76e-02 0.225 0.118 0.088 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 4.28e-01 -0.106 0.133 0.088 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0179 0.148 0.088 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0561 0.127 0.088 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 2.55e-02 0.289 0.128 0.088 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 2.23e-01 -0.168 0.138 0.088 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 3.67e-01 0.142 0.157 0.088 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 9.39e-01 0.0132 0.172 0.076 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 8.60e-01 0.0257 0.145 0.076 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 4.69e-01 -0.118 0.162 0.076 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.99e-01 -0.256 0.198 0.076 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 6.05e-01 -0.09 0.174 0.076 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 1.24e-01 0.294 0.19 0.076 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0191 0.164 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0991 0.103 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0542 0.107 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 3.59e-01 -0.112 0.122 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 7.59e-01 0.0365 0.119 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 3.31e-01 0.152 0.156 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 5.80e-01 -0.049 0.0884 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 3.85e-01 0.0864 0.0992 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 1.23e-01 -0.174 0.112 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 9.10e-01 0.0129 0.114 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 2.86e-01 -0.161 0.15 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 1.59e-01 0.148 0.105 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 7.90e-01 0.0342 0.128 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 7.60e-01 0.0429 0.14 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0246 0.101 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 6.75e-01 0.041 0.0978 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 4.23e-01 -0.123 0.153 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 1.51e-01 0.204 0.141 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 3.77e-01 0.0977 0.11 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 581275 sc-eQTL 4.92e-01 0.09 0.131 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 9.55e-01 0.00817 0.145 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0281 0.107 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 7.37e-01 0.0372 0.111 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0962 0.142 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 552317 sc-eQTL 7.76e-01 0.0428 0.15 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 177160 sc-eQTL 3.01e-02 0.167 0.0763 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 534120 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0458 0.134 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 383265 sc-eQTL 9.35e-01 0.0101 0.123 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 718712 sc-eQTL 1.08e-01 0.169 0.104 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0548 0.131 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111144 LTA4H 534120 pQTL 0.0444 -0.0579 0.0288 0.0 0.0 0.0918
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 eQTL 3.59e-07 -0.198 0.0387 0.0 0.0 0.0893

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -329583 1.91e-06 1.08e-06 6.52e-07 1.96e-06 5.1e-07 7.84e-07 1.87e-06 2.74e-07 1.86e-06 7.04e-07 1.96e-06 1.41e-06 3.31e-06 5.06e-07 4.89e-07 1.2e-06 8.85e-07 1.34e-06 1.48e-06 4.52e-07 7.49e-07 2.26e-06 2.32e-06 6.89e-07 2.62e-06 4.33e-07 9.35e-07 8.37e-07 1.72e-06 3.09e-06 7.64e-07 8.37e-08 1.08e-07 7.27e-07 6.88e-07 7.46e-07 5.1e-07 2.78e-07 2.44e-07 2.57e-07 4.49e-08 2.39e-06 4.37e-07 6.46e-08 1.01e-07 3.19e-07 1.26e-07 3.21e-08 4.66e-08