logo

Genes within 1Mb (chr12:96574177:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 1.20e-01 0.0779 0.0499 0.244 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0523 0.0623 0.244 B L1
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 7.52e-01 0.021 0.0664 0.244 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 7.79e-01 0.0169 0.0603 0.244 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 2.34e-01 0.105 0.0878 0.244 B L1
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 4.58e-01 0.0307 0.0413 0.244 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 5.61e-01 0.033 0.0567 0.244 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 7.31e-01 0.0212 0.0615 0.244 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 4.28e-01 0.0426 0.0537 0.244 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 2.88e-02 -0.144 0.0654 0.244 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 5.54e-02 0.0806 0.0418 0.244 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0561 0.0451 0.244 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 6.41e-01 0.0319 0.0682 0.244 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00251 0.0559 0.244 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 7.47e-01 0.024 0.0743 0.244 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 1.24e-01 0.128 0.083 0.241 DC L1
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 7.23e-02 0.17 0.0942 0.241 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0215 0.0777 0.241 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 3.29e-01 0.0929 0.0949 0.241 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0042 0.0792 0.241 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 6.96e-01 0.0398 0.102 0.241 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 1.02e-01 0.15 0.0911 0.241 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0098 0.0634 0.244 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 2.57e-01 0.0904 0.0796 0.244 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0392 0.0901 0.244 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 4.99e-01 -0.041 0.0605 0.244 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 4.82e-01 0.0401 0.057 0.244 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 1.17e-02 0.219 0.0863 0.244 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0713 0.0848 0.244 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0578 0.0482 0.245 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 9.33e-01 0.00692 0.0821 0.245 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0301 0.0779 0.245 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 1.77e-01 0.0872 0.0643 0.245 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 2.40e-01 0.0961 0.0815 0.245 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0422 0.0397 0.244 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 783025 sc-eQTL 1.64e-01 0.103 0.0733 0.244 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 1.51e-01 0.119 0.0829 0.244 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0139 0.065 0.244 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 4.60e-01 0.0446 0.0603 0.244 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 3.52e-01 0.0857 0.0918 0.244 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 84606 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0201 0.0952 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 9.18e-01 0.00948 0.0919 0.245 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 4.23e-01 0.0834 0.104 0.245 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 9.91e-01 0.00119 0.11 0.245 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0286 0.104 0.245 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 5.23e-01 0.0694 0.109 0.245 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 2.75e-01 0.0872 0.0797 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 5.93e-01 0.0414 0.0773 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 4.54e-01 0.0653 0.0871 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 4.93e-01 0.0596 0.0868 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 5.12e-01 0.0667 0.102 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 1.49e-01 0.111 0.0767 0.239 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 3.20e-02 0.19 0.088 0.239 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 1.42e-01 -0.128 0.087 0.239 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 2.90e-01 0.0981 0.0924 0.239 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 3.03e-01 -0.106 0.102 0.239 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 1.23e-01 0.0968 0.0625 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00131 0.0659 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 6.02e-01 0.0407 0.0778 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0533 0.0756 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 9.57e-01 0.00518 0.0971 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0612 0.0799 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0228 0.0758 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 2.20e-01 0.11 0.0891 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 4.17e-01 -0.072 0.0887 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 7.28e-01 0.0367 0.106 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 2.45e-01 0.0866 0.0743 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 1.83e-01 0.14 0.105 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 7.13e-01 0.0392 0.106 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0608 0.0924 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 3.09e-01 0.109 0.107 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 5.59e-01 0.0267 0.0455 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 3.24e-01 0.065 0.0658 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 8.70e-01 0.0108 0.0659 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 4.46e-01 0.0447 0.0585 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0626 0.072 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 4.14e-01 0.036 0.0439 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0179 0.0746 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0478 0.0734 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 3.93e-01 0.0515 0.0601 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 1.82e-01 -0.11 0.0819 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00737 0.0544 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 1.40e-01 -0.124 0.0836 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0133 0.0781 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 8.12e-02 0.142 0.0812 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 6.95e-01 -0.038 0.0969 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 5.43e-01 0.0322 0.0528 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 1.26e-01 -0.146 0.095 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 1.11e-02 -0.219 0.0856 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 2.60e-01 0.0901 0.0797 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 8.50e-01 0.017 0.0896 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 1.15e-01 0.0997 0.0631 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 1.61e-01 -0.106 0.0756 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 1.18e-01 0.125 0.0799 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0949 0.072 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0651 0.0859 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 8.85e-01 -0.01 0.069 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 9.73e-01 0.00349 0.101 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 3.41e-01 0.0817 0.0857 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0223 0.0989 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 1.55e-01 0.137 0.0963 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 6.23e-02 0.16 0.0852 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 4.54e-01 0.0788 0.105 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0314 0.103 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0175 0.0962 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0387 0.104 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0137 0.0581 0.242 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 783025 sc-eQTL 1.14e-01 0.123 0.0778 0.242 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 2.56e-01 0.102 0.0894 0.242 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 6.45e-01 0.0347 0.0752 0.242 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 1.92e-01 0.114 0.0869 0.242 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 6.86e-01 0.0396 0.0979 0.242 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 84606 sc-eQTL 2.29e-01 0.117 0.0967 0.242 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0991 0.062 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 3.04e-01 -0.095 0.0921 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0343 0.098 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 9.39e-01 0.00788 0.103 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 5.47e-01 0.0624 0.103 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 9.49e-02 -0.0866 0.0516 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 8.39e-01 0.0191 0.0938 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0155 0.0831 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 6.61e-02 0.145 0.0784 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 2.11e-01 0.114 0.0907 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 2.13e-01 -0.102 0.0815 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 3.58e-01 0.0988 0.107 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0622 0.0995 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0484 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 9.04e-02 0.166 0.0975 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0407 0.0562 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0423 0.0951 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0469 0.0911 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0067 0.0772 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0522 0.0954 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 5.95e-01 0.0589 0.11 0.241 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 3.12e-01 0.0985 0.097 0.241 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0382 0.125 0.241 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 3.13e-01 0.123 0.121 0.241 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 9.61e-01 0.00708 0.145 0.241 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0141 0.0621 0.246 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 783025 sc-eQTL 3.81e-01 0.0611 0.0696 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 3.28e-01 0.0801 0.0818 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0422 0.0991 0.246 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 2.01e-01 0.0798 0.0623 0.246 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0379 0.0908 0.246 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 84606 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0196 0.0734 0.246 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0141 0.0689 0.244 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 6.25e-01 0.0427 0.0873 0.244 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 1.66e-01 0.109 0.0788 0.244 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 1.51e-01 -0.131 0.0912 0.244 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 9.22e-04 -0.335 0.0996 0.244 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 7.64e-01 0.0268 0.0891 0.234 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 1.20e-01 0.144 0.092 0.234 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 1.29e-01 -0.12 0.0789 0.234 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 2.26e-01 0.127 0.104 0.234 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0419 0.0877 0.234 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 5.80e-01 0.0593 0.107 0.234 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 4.53e-01 0.0677 0.09 0.234 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 5.27e-01 0.0465 0.0733 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 5.52e-01 0.0476 0.0799 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0391 0.0864 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 8.88e-01 0.00936 0.0666 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 2.74e-01 0.0751 0.0685 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 9.05e-03 0.245 0.0931 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 5.04e-01 -0.059 0.0882 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 8.18e-01 0.0191 0.0828 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 6.08e-01 0.0478 0.0929 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0309 0.0928 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0564 0.0755 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0488 0.0747 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 1.87e-01 0.133 0.1 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0676 0.0949 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0622 0.0839 0.245 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 783025 sc-eQTL 3.41e-01 0.0919 0.0961 0.245 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 4.85e-01 0.0879 0.126 0.245 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 1.29e-01 -0.176 0.115 0.245 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 8.95e-01 0.0148 0.112 0.245 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0237 0.124 0.245 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 84606 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0363 0.109 0.245 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 2.07e-01 0.118 0.0931 0.247 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0507 0.0945 0.247 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0431 0.0969 0.247 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0418 0.0863 0.247 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 8.32e-04 0.305 0.0898 0.247 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 2.70e-01 0.106 0.0957 0.247 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 9.92e-01 0.00097 0.0965 0.247 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0715 0.0746 0.249 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 3.48e-01 0.0784 0.0833 0.249 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 5.00e-01 0.0628 0.0929 0.249 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0459 0.0798 0.249 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 6.16e-01 0.041 0.0816 0.249 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 4.01e-01 0.0728 0.0865 0.249 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 4.04e-01 0.0826 0.0987 0.249 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 1.07e-01 0.162 0.1 0.234 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0502 0.0852 0.234 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0567 0.0954 0.234 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 2.33e-01 0.139 0.116 0.234 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 5.08e-01 0.0675 0.102 0.234 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 9.41e-01 0.00835 0.112 0.234 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0281 0.0964 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 1.00e-01 0.107 0.065 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 3.25e-01 0.0669 0.0678 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0533 0.0776 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 1.72e-01 0.103 0.0749 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 6.78e-01 -0.041 0.0987 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 4.18e-01 0.0456 0.0562 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0349 0.0631 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 1.01e-01 0.118 0.0715 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0411 0.0724 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 5.97e-01 0.0507 0.0958 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 5.05e-01 0.0441 0.066 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 2.34e-01 0.0953 0.0798 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0556 0.0878 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0415 0.0634 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 8.53e-01 0.0114 0.0613 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 2.13e-02 0.22 0.0949 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0947 0.0888 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00844 0.0685 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 577812 sc-eQTL 6.42e-01 0.0377 0.0809 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 7.99e-01 0.0229 0.0898 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00582 0.0664 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 3.25e-02 0.146 0.0678 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 1.88e-01 0.116 0.0875 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 548854 sc-eQTL 3.60e-01 0.0852 0.0928 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 173697 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0517 0.0485 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 530657 sc-eQTL 6.04e-01 0.0439 0.0846 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 379802 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0295 0.0775 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 715249 sc-eQTL 1.88e-01 0.0871 0.066 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 sc-eQTL 2.54e-01 0.0942 0.0824 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 eQTL 3.28e-10 0.176 0.0277 0.0 0.0 0.238
ENSG00000188596 CFAP54 84602 eQTL 2.04e-07 0.122 0.0232 0.00758 0.00793 0.238

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -333046 1.11e-06 8.16e-07 1.58e-07 4.06e-07 1.14e-07 2.95e-07 6.23e-07 2.28e-07 7.11e-07 3.22e-07 1.07e-06 5.01e-07 1.03e-06 1.57e-07 3.16e-07 3.96e-07 5.92e-07 4.52e-07 3.3e-07 2.73e-07 2.26e-07 5.49e-07 4.66e-07 3.09e-07 1.25e-06 2.37e-07 4.37e-07 3.95e-07 5.9e-07 8.56e-07 4.08e-07 4.34e-08 6.78e-08 2.1e-07 3.34e-07 2.76e-07 2.46e-07 1.21e-07 8.45e-08 1.84e-08 1.3e-07 9.14e-07 5.09e-08 3.38e-08 1.69e-07 2.68e-08 1.19e-07 3.21e-08 5.84e-08
ENSG00000188596 CFAP54 84602 4.85e-06 5.32e-06 6.54e-07 3.52e-06 1.7e-06 1.52e-06 7.26e-06 1.17e-06 4.66e-06 3.09e-06 7.51e-06 3.18e-06 9.39e-06 1.7e-06 9.99e-07 3.9e-06 2.72e-06 3.78e-06 1.65e-06 1.7e-06 2.66e-06 5.66e-06 4.79e-06 2.01e-06 8.71e-06 2.34e-06 2.65e-06 1.8e-06 5.6e-06 6.66e-06 2.89e-06 4.82e-07 8.41e-07 2.34e-06 2.05e-06 1.71e-06 1.27e-06 6.18e-07 1.35e-06 8.05e-07 8.61e-07 8.06e-06 6.81e-07 1.32e-07 6.91e-07 1.1e-06 1.16e-06 6.8e-07 5.78e-07