logo

Genes within 1Mb (chr12:96542887:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 6.65e-02 -0.14 0.0757 0.096 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 9.25e-01 0.00889 0.0948 0.096 B L1
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 2.73e-01 -0.111 0.101 0.096 B L1
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 5.05e-01 0.0831 0.124 0.096 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 5.14e-01 0.0599 0.0916 0.096 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 1.04e-01 -0.217 0.133 0.096 B L1
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 6.81e-01 -0.026 0.0633 0.096 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0984 0.0867 0.096 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.92e-01 0.000887 0.0942 0.096 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0316 0.134 0.096 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0602 0.0822 0.096 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 4.24e-01 0.081 0.101 0.096 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0311 0.0644 0.096 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 8.98e-01 0.00885 0.0692 0.096 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 4.28e-01 0.0826 0.104 0.096 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0987 0.118 0.096 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 7.03e-01 0.0326 0.0853 0.096 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 8.70e-01 0.0186 0.113 0.096 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 8.31e-01 0.0248 0.116 0.099 DC L1
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 1.81e-01 -0.177 0.131 0.099 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.82e-01 -0.116 0.108 0.099 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 5.21e-02 -0.256 0.131 0.099 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 3.65e-01 0.0996 0.11 0.099 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 5.06e-01 0.0938 0.141 0.099 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 7.17e-01 0.0463 0.127 0.099 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 7.83e-01 0.0265 0.0961 0.096 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0577 0.121 0.096 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 4.45e-01 -0.105 0.137 0.096 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0253 0.0918 0.096 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 6.18e-01 0.0433 0.0865 0.096 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0765 0.133 0.096 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 4.17e-01 -0.105 0.129 0.096 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 2.48e-01 0.0833 0.0718 0.097 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.13e-01 -0.152 0.122 0.097 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 1.35e-01 -0.173 0.115 0.097 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 8.83e-02 -0.164 0.0956 0.097 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0827 0.122 0.097 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 9.09e-01 0.00704 0.0612 0.096 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 751735 sc-eQTL 1.71e-01 0.155 0.113 0.096 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0483 0.128 0.096 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 7.45e-01 0.0325 0.0998 0.096 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 5.47e-01 0.0558 0.0927 0.096 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 3.49e-01 0.132 0.141 0.096 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 53316 sc-eQTL 3.75e-01 -0.13 0.146 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 3.80e-01 -0.115 0.131 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.34e-01 -0.177 0.148 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0076 0.158 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0106 0.121 0.105 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 4.29e-01 0.118 0.148 0.105 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0245 0.155 0.105 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 2.77e-01 -0.127 0.117 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0676 0.113 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0554 0.128 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 7.82e-01 0.0417 0.151 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 3.76e-01 -0.113 0.127 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 6.38e-02 -0.276 0.148 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 8.80e-01 0.017 0.113 0.097 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.47e-01 -0.151 0.13 0.097 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 1.14e-01 -0.202 0.127 0.097 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00527 0.141 0.097 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 2.36e-01 0.161 0.135 0.097 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 8.35e-01 0.0313 0.15 0.097 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 2.14e-01 -0.117 0.094 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 7.03e-01 0.0377 0.0988 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0103 0.117 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 4.91e-01 0.101 0.147 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 2.47e-01 0.132 0.113 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 3.99e-01 -0.123 0.146 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 9.20e-02 -0.199 0.118 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.66e-01 -0.125 0.112 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 3.18e-02 -0.283 0.131 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 7.55e-01 0.0446 0.143 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 7.67e-01 0.0391 0.131 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 4.73e-01 -0.112 0.156 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0619 0.108 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 3.48e-02 -0.319 0.15 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 2.79e-01 0.166 0.153 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0109 0.123 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 3.41e-01 -0.127 0.133 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0318 0.154 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0154 0.0696 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 7.24e-02 -0.18 0.0999 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 6.24e-01 0.0495 0.101 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 5.88e-01 0.0764 0.141 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 8.51e-01 0.0169 0.0895 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 5.98e-01 0.0581 0.11 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0675 0.0674 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 1.69e-01 -0.157 0.114 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.06e-01 0.0133 0.113 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 4.33e-01 -0.122 0.156 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 5.88e-02 -0.174 0.0917 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0664 0.126 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 8.32e-02 -0.143 0.0819 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 1.81e-01 0.17 0.127 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00716 0.118 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 7.13e-01 0.0535 0.146 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0561 0.124 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 1.58e-01 0.207 0.146 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 9.39e-01 0.00607 0.0786 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00832 0.142 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 7.22e-01 0.0461 0.129 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0159 0.144 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 4.49e-01 0.0899 0.119 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 7.60e-02 -0.236 0.132 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 6.93e-01 0.0381 0.0962 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0634 0.115 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 2.88e-01 -0.13 0.122 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 2.65e-01 -0.143 0.128 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 1.21e-01 0.17 0.109 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 1.51e-01 0.187 0.13 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 2.50e-01 -0.121 0.105 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 5.16e-03 -0.427 0.151 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.58e-02 0.217 0.13 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 4.55e-01 0.106 0.141 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0807 0.15 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 7.22e-01 0.0524 0.147 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 6.46e-02 -0.234 0.126 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 4.15e-01 0.127 0.155 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 6.43e-01 0.0708 0.153 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0328 0.13 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 3.66e-01 -0.129 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 4.91e-01 0.106 0.154 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00794 0.085 0.097 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 751735 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.114 0.097 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.86e-01 -0.14 0.131 0.097 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 3.94e-01 0.0939 0.11 0.097 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 5.63e-01 0.0739 0.128 0.097 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 1.54e-01 0.204 0.143 0.097 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 53316 sc-eQTL 1.11e-01 -0.226 0.141 0.097 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 1.48e-01 -0.132 0.0906 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0594 0.135 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0107 0.143 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 5.81e-01 0.0827 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 3.21e-01 0.15 0.15 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 3.41e-01 0.074 0.0776 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0303 0.14 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 7.24e-01 -0.044 0.124 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0214 0.118 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0354 0.136 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 1.28e-01 0.185 0.121 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0893 0.159 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 6.56e-01 -0.066 0.148 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 3.41e-01 -0.147 0.154 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 2.42e-01 -0.17 0.145 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 1.82e-02 0.2 0.0839 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0897 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0954 0.137 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0879 0.116 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 5.41e-01 -0.088 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0963 0.153 0.104 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 1.05e-01 -0.218 0.134 0.104 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 3.46e-02 -0.363 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 9.00e-01 0.0201 0.16 0.104 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 9.97e-01 0.000673 0.169 0.104 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 2.00e-01 0.257 0.199 0.104 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 9.83e-01 0.00206 0.0944 0.096 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 751735 sc-eQTL 2.28e-01 -0.128 0.106 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 6.59e-02 -0.229 0.124 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0588 0.151 0.096 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0265 0.0951 0.096 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 6.40e-01 0.0647 0.138 0.096 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 53316 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0471 0.112 0.096 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 8.63e-01 0.0176 0.102 0.096 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 4.31e-01 -0.102 0.129 0.096 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00156 0.117 0.096 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 4.42e-01 -0.101 0.131 0.096 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 9.97e-01 0.000517 0.136 0.096 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 1.37e-01 0.225 0.15 0.096 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 6.75e-01 0.0543 0.129 0.098 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 1.93e-01 -0.174 0.134 0.098 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0976 0.115 0.098 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 1.46e-01 -0.22 0.151 0.098 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 6.54e-01 0.057 0.127 0.098 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 4.73e-01 -0.111 0.155 0.098 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 4.29e-01 0.103 0.13 0.098 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 5.66e-01 0.0631 0.11 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 8.06e-01 0.0295 0.12 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 3.00e-01 -0.134 0.129 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0253 0.0997 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00394 0.103 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 3.12e-01 -0.143 0.141 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0742 0.132 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 9.80e-01 0.00304 0.124 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 2.44e-01 -0.162 0.139 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 6.46e-01 -0.064 0.139 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0219 0.113 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 7.90e-01 0.0298 0.112 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 6.11e-01 0.077 0.151 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 3.87e-01 -0.123 0.142 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0863 0.122 0.097 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 751735 sc-eQTL 4.33e-01 0.11 0.14 0.097 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 3.08e-01 0.186 0.182 0.097 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 2.82e-01 -0.182 0.168 0.097 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 1.01e-02 -0.415 0.159 0.097 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 2.90e-01 -0.19 0.179 0.097 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 53316 sc-eQTL 7.59e-01 0.0485 0.158 0.097 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00332 0.143 0.098 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 1.46e-01 0.211 0.144 0.098 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.29e-01 -0.179 0.148 0.098 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 3.33e-01 0.128 0.132 0.098 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 4.18e-01 -0.115 0.141 0.098 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0294 0.147 0.098 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 2.02e-01 -0.189 0.147 0.098 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 9.11e-02 0.185 0.109 0.102 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 9.93e-01 0.00115 0.123 0.102 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 1.98e-01 -0.176 0.136 0.102 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.36e-01 0.00938 0.117 0.102 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 2.82e-01 0.129 0.12 0.102 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 1.43e-01 -0.186 0.127 0.102 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 6.48e-01 0.0663 0.145 0.102 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 6.74e-01 0.0647 0.153 0.096 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 2.65e-01 -0.144 0.129 0.096 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.72e-01 -0.159 0.144 0.096 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 2.32e-01 -0.212 0.176 0.096 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 2.40e-01 -0.182 0.154 0.096 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 7.28e-01 0.0594 0.171 0.096 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 6.01e-01 0.0767 0.146 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0951 0.0978 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 3.03e-01 -0.105 0.102 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 2.26e-01 -0.141 0.116 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0605 0.145 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 7.69e-01 0.0331 0.113 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 2.01e-01 -0.189 0.147 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 1.28e-01 -0.128 0.0836 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 8.09e-01 0.0229 0.0944 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 2.24e-01 -0.131 0.107 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 991411 sc-eQTL 3.92e-01 0.112 0.131 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 4.52e-01 0.0815 0.108 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 3.22e-01 -0.142 0.143 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 5.81e-01 0.0549 0.0993 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0707 0.12 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 2.82e-01 -0.142 0.132 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00569 0.0955 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 8.33e-01 0.0195 0.0921 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0278 0.144 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 2.75e-01 -0.146 0.133 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 2.71e-01 0.113 0.102 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 546522 sc-eQTL 4.69e-01 0.0877 0.121 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 3.18e-01 -0.134 0.134 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 6.81e-01 0.0409 0.0993 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0427 0.102 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0957 0.131 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 517564 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0234 0.139 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 142407 sc-eQTL 6.57e-02 0.134 0.0725 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 499367 sc-eQTL 3.35e-01 -0.123 0.127 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 348512 sc-eQTL 1.85e-01 -0.154 0.116 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 683959 sc-eQTL 1.89e-01 -0.131 0.0991 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0746 0.124 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000084110 HAL 546522 eQTL 0.0173 -0.0523 0.0219 0.0 0.0 0.0957
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 eQTL 0.000677 -0.129 0.0379 0.0 0.0 0.0957

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -364336 1.29e-06 8.78e-07 1.87e-07 3.25e-07 1.38e-07 3.18e-07 7.22e-07 2.88e-07 8.7e-07 2.67e-07 1.13e-06 5.5e-07 1.28e-06 2.14e-07 3.86e-07 4.79e-07 6.98e-07 5.2e-07 3.51e-07 3.06e-07 2.57e-07 6.2e-07 5.67e-07 3.56e-07 1.54e-06 2.54e-07 5.04e-07 4.59e-07 7.07e-07 8.5e-07 4.61e-07 4.34e-08 9.89e-08 3.03e-07 3.18e-07 2.42e-07 2.59e-07 1.21e-07 7.63e-08 1.83e-08 1.67e-07 9.5e-07 6.37e-08 1.27e-08 1.85e-07 4.53e-08 1.82e-07 5.93e-08 5.62e-08