logo

Genes within 1Mb (chr12:96541488:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 3.01e-02 -0.133 0.0608 0.169 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 5.31e-01 0.0479 0.0763 0.169 B L1
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 1.81e-01 -0.109 0.081 0.169 B L1
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0147 0.1 0.169 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0128 0.0739 0.169 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 2.19e-01 -0.132 0.107 0.169 B L1
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 8.83e-01 0.00743 0.0502 0.169 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0941 0.0687 0.169 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 9.06e-01 0.00885 0.0747 0.169 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0202 0.107 0.169 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0503 0.0652 0.169 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0119 0.0804 0.169 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 8.97e-01 0.0066 0.0512 0.169 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 5.70e-01 0.0313 0.0549 0.169 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 8.54e-01 0.0153 0.0828 0.169 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 4.76e-01 -0.067 0.094 0.169 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 3.27e-01 0.0665 0.0676 0.169 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 1.00e+00 -6.71e-06 0.0901 0.169 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 6.17e-01 0.0473 0.0943 0.173 DC L1
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 5.73e-01 0.0606 0.107 0.173 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0475 0.0878 0.173 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 1.23e-01 -0.166 0.107 0.173 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 1.61e-01 0.125 0.089 0.173 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 8.59e-01 0.0205 0.115 0.173 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 8.14e-01 0.0244 0.104 0.173 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0519 0.077 0.169 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 4.06e-01 0.0808 0.097 0.169 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 1.10e-01 0.175 0.109 0.169 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0718 0.0735 0.169 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 3.30e-01 0.0676 0.0693 0.169 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 1.04e-01 -0.173 0.106 0.169 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 2.30e-01 0.124 0.103 0.169 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 2.93e-01 0.0608 0.0577 0.17 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 2.72e-01 -0.108 0.0979 0.17 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 1.19e-01 -0.145 0.0926 0.17 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00402 0.0772 0.17 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 2.46e-01 -0.113 0.0974 0.17 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0353 0.0485 0.169 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 750336 sc-eQTL 1.30e-01 0.136 0.0892 0.169 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 7.52e-01 0.0321 0.101 0.169 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 2.18e-01 0.0974 0.0789 0.169 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 4.32e-01 0.0579 0.0734 0.169 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 4.71e-01 0.0808 0.112 0.169 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 51917 sc-eQTL 7.52e-01 0.0367 0.116 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0413 0.105 0.179 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0759 0.119 0.179 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 8.15e-01 0.0296 0.126 0.179 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0444 0.0967 0.179 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 6.59e-01 0.0526 0.119 0.179 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 7.64e-01 0.0373 0.124 0.179 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0589 0.0938 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 6.35e-01 0.0433 0.0909 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 9.01e-01 0.0127 0.103 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0439 0.121 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 9.08e-01 0.0118 0.102 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 2.56e-01 -0.136 0.119 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0115 0.09 0.17 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 2.42e-01 -0.121 0.104 0.17 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 6.15e-02 -0.19 0.101 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 3.49e-01 -0.105 0.112 0.17 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 5.19e-02 0.21 0.107 0.17 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 6.57e-01 0.0532 0.12 0.17 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0982 0.0758 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 1.21e-01 0.123 0.0792 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 2.44e-01 -0.11 0.0938 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 7.31e-01 0.0408 0.118 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 8.95e-01 0.0121 0.0916 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 1.16e-01 -0.184 0.117 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 3.75e-02 -0.202 0.0963 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0211 0.0922 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 2.08e-01 -0.137 0.108 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0214 0.117 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0917 0.108 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0518 0.128 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0938 0.0874 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0596 0.123 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 1.52e-01 0.179 0.124 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 7.69e-01 0.0293 0.0998 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0385 0.109 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 2.82e-01 -0.135 0.125 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 9.99e-01 -6.94e-05 0.055 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 1.89e-01 -0.104 0.0793 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 5.93e-01 0.0425 0.0796 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 7.66e-01 0.0333 0.112 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 8.71e-01 0.0115 0.0707 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 9.60e-01 0.0044 0.0871 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 9.71e-01 0.00192 0.0535 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 6.29e-02 -0.168 0.09 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 4.75e-01 0.0638 0.0892 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 3.47e-01 -0.116 0.123 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 2.53e-02 -0.163 0.0724 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0692 0.1 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 5.23e-02 -0.128 0.0653 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 4.27e-01 0.081 0.102 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0676 0.0945 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0116 0.116 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 8.78e-01 0.0152 0.099 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0233 0.117 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0308 0.0631 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0674 0.114 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0405 0.104 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 7.47e-01 0.0374 0.116 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 3.33e-01 0.0923 0.0952 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 4.38e-02 -0.215 0.106 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 4.92e-01 0.0525 0.0763 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0115 0.0915 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 6.13e-01 -0.049 0.0967 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0322 0.102 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 4.81e-02 0.171 0.0862 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 2.28e-01 0.125 0.103 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0714 0.0836 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 6.03e-02 -0.231 0.122 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00452 0.104 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0547 0.113 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 1.75e-01 -0.163 0.12 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 3.44e-01 0.111 0.117 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 2.93e-01 -0.107 0.102 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 2.69e-01 0.138 0.124 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 8.03e-01 0.0305 0.123 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 9.20e-01 0.0105 0.104 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0435 0.114 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 4.82e-01 0.0871 0.123 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0276 0.0688 0.171 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 750336 sc-eQTL 2.58e-01 0.105 0.0925 0.171 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 9.91e-01 0.00118 0.106 0.171 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 1.77e-01 0.12 0.0889 0.171 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 6.96e-02 0.187 0.103 0.171 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 4.11e-01 0.0955 0.116 0.171 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 51917 sc-eQTL 9.22e-01 0.0113 0.115 0.171 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0619 0.072 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 9.97e-01 0.000462 0.107 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 9.95e-01 0.000746 0.113 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 1.78e-01 0.159 0.118 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 6.86e-01 0.0485 0.119 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 6.59e-01 0.0275 0.0623 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0984 0.112 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0722 0.0995 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 2.01e-01 0.121 0.0944 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 2.46e-01 -0.127 0.109 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 1.13e-01 0.156 0.0978 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 7.56e-01 0.0401 0.129 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 9.70e-01 0.00454 0.12 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 2.02e-01 -0.159 0.124 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 1.30e-01 -0.178 0.117 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 1.02e-01 0.111 0.0677 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0173 0.115 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 1.31e-01 -0.166 0.11 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 6.78e-01 0.0388 0.0933 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 3.46e-01 -0.109 0.115 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 8.49e-02 -0.203 0.117 0.185 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0321 0.104 0.185 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 9.51e-02 -0.222 0.132 0.185 PB L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 2.37e-01 -0.146 0.123 0.185 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 7.39e-01 0.0435 0.13 0.185 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 3.50e-01 0.145 0.154 0.185 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 9.40e-01 0.00582 0.0779 0.17 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 750336 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00382 0.0874 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 3.24e-01 -0.101 0.103 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 9.15e-01 0.0133 0.124 0.17 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00131 0.0784 0.17 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00454 0.114 0.17 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 51917 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0619 0.092 0.17 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 4.55e-01 0.0614 0.082 0.169 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 4.97e-02 -0.203 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 2.51e-01 0.108 0.094 0.169 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 3.07e-01 -0.108 0.106 0.169 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 9.20e-01 -0.011 0.109 0.169 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 3.80e-01 0.107 0.122 0.169 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 9.11e-01 0.0117 0.105 0.171 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000152 0.109 0.171 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0458 0.0932 0.171 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 9.86e-01 0.00221 0.123 0.171 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0129 0.103 0.171 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 1.75e-01 -0.17 0.125 0.171 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 2.86e-01 0.113 0.106 0.171 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0376 0.0888 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 1.55e-01 0.138 0.0964 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 1.66e-01 0.145 0.104 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0287 0.0806 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 8.23e-01 0.0187 0.0832 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 8.33e-02 -0.198 0.114 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 2.49e-01 0.123 0.107 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0222 0.1 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00951 0.112 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 1.36e-01 0.167 0.112 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0693 0.0914 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0313 0.0904 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0545 0.122 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 7.98e-01 0.0294 0.115 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0789 0.0983 0.17 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 750336 sc-eQTL 4.43e-01 0.0869 0.113 0.17 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 1.20e-01 0.229 0.146 0.17 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0911 0.136 0.17 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 2.76e-01 -0.143 0.131 0.17 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 4.07e-01 0.121 0.145 0.17 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 51917 sc-eQTL 4.78e-01 0.0904 0.127 0.17 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00677 0.117 0.173 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 2.83e-02 0.258 0.117 0.173 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 4.71e-01 0.0874 0.121 0.173 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 9.95e-01 0.00067 0.108 0.173 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00215 0.115 0.173 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0609 0.12 0.173 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 3.53e-01 -0.112 0.12 0.173 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 2.90e-01 0.0954 0.0898 0.174 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 9.34e-01 0.00835 0.101 0.174 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 3.19e-01 0.112 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0806 0.0961 0.174 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 4.44e-02 0.197 0.0973 0.174 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 7.18e-02 -0.188 0.104 0.174 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 4.17e-02 0.242 0.118 0.174 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 8.21e-01 0.0276 0.122 0.161 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 7.86e-01 0.028 0.103 0.161 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 2.16e-01 -0.142 0.114 0.161 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 2.30e-01 -0.169 0.14 0.161 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0158 0.123 0.161 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 8.80e-01 0.0205 0.135 0.161 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 7.58e-01 0.0358 0.116 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0591 0.0786 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00502 0.0817 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0842 0.0932 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 2.12e-01 -0.145 0.116 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 3.57e-01 0.0834 0.0903 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0469 0.119 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 8.61e-02 -0.117 0.0679 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 1.20e-01 0.119 0.0763 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 1.82e-01 -0.117 0.087 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 990012 sc-eQTL 6.11e-01 0.0544 0.107 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0288 0.088 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 2.09e-01 -0.146 0.116 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0389 0.0803 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 5.23e-01 0.0621 0.0972 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 2.27e-01 0.129 0.106 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0452 0.0771 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 6.83e-01 0.0305 0.0744 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 3.10e-01 -0.119 0.116 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 4.61e-01 0.0797 0.108 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 4.76e-01 0.0602 0.0844 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 545123 sc-eQTL 2.53e-01 0.114 0.0996 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 2.19e-01 0.136 0.11 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0385 0.0819 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 3.87e-01 0.0732 0.0844 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 1.53e-01 -0.155 0.108 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 516165 sc-eQTL 3.45e-01 0.108 0.115 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 141008 sc-eQTL 1.45e-01 0.0852 0.0583 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 497968 sc-eQTL 2.65e-01 -0.113 0.102 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 347113 sc-eQTL 8.72e-02 -0.159 0.0925 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 682560 sc-eQTL 7.91e-01 0.0212 0.0797 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 sc-eQTL 2.12e-01 -0.124 0.0991 0.168 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 141008 eQTL 2.61e-02 -0.033 0.0148 0.0 0.0 0.16
ENSG00000136014 USP44 990012 eQTL 0.0369 -0.0762 0.0365 0.0 0.0 0.16
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 eQTL 4.34e-09 -0.175 0.0295 0.0 0.0 0.16

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139343 \N 682560 3.1e-07 1.7e-07 6.45e-08 2.24e-07 1.06e-07 7.75e-08 2.4e-07 5.84e-08 1.89e-07 1.11e-07 1.83e-07 1.59e-07 2.45e-07 8.44e-08 6.53e-08 9.35e-08 5.27e-08 2.04e-07 7.27e-08 7.05e-08 1.33e-07 1.81e-07 1.69e-07 4.37e-08 2.37e-07 1.51e-07 1.25e-07 1.46e-07 1.37e-07 1.38e-07 1.26e-07 5.32e-08 4.34e-08 9.72e-08 5.41e-08 3.94e-08 6.04e-08 7.1e-08 5.84e-08 7.04e-08 4.07e-08 1.62e-07 3.02e-08 1.07e-08 4.36e-08 9.86e-09 7.66e-08 0.0 4.83e-08
ENSG00000139350 NEDD1 -365735 1.29e-06 8.9e-07 2.7e-07 3.04e-07 2.28e-07 3.22e-07 7.96e-07 2.84e-07 1.03e-06 3.24e-07 1.1e-06 5.62e-07 1.43e-06 2.29e-07 4.43e-07 5.7e-07 7.79e-07 5.2e-07 3.66e-07 4.65e-07 3.24e-07 7.58e-07 6.1e-07 4.62e-07 1.59e-06 2.44e-07 5.83e-07 5.65e-07 8e-07 9.25e-07 4.61e-07 7.24e-08 1.76e-07 3.51e-07 3.35e-07 3.47e-07 3.26e-07 1.54e-07 1.33e-07 4.2e-08 2.82e-07 1.15e-06 6.17e-08 1.28e-08 1.64e-07 7.43e-08 1.91e-07 8.89e-08 6.58e-08