logo

Genes within 1Mb (chr12:96535422:A:AT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 3.09e-02 -0.132 0.0609 0.167 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 5.32e-01 0.0478 0.0764 0.167 B L1
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 1.83e-01 -0.108 0.0811 0.167 B L1
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 9.95e-01 0.000579 0.1 0.167 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0173 0.0739 0.167 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.83e-01 -0.116 0.108 0.167 B L1
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 8.94e-01 0.00674 0.0503 0.167 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0895 0.0688 0.167 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 7.90e-01 0.02 0.0748 0.167 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0168 0.107 0.167 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0473 0.0653 0.167 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00691 0.0806 0.167 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 8.64e-01 0.0088 0.0513 0.167 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 6.84e-01 0.0224 0.0551 0.167 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 7.82e-01 0.023 0.0829 0.167 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0583 0.0942 0.167 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 3.18e-01 0.0679 0.0678 0.167 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00651 0.0903 0.167 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 6.41e-01 0.0441 0.0944 0.171 DC L1
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 7.92e-01 0.0284 0.108 0.171 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0587 0.0879 0.171 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 9.29e-02 -0.181 0.107 0.171 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 2.00e-01 0.115 0.0892 0.171 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 8.33e-01 0.0243 0.115 0.171 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 9.45e-01 0.00718 0.104 0.171 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 4.94e-01 -0.053 0.0773 0.167 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 4.72e-01 0.0701 0.0973 0.167 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 1.62e-01 0.154 0.11 0.167 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0567 0.0738 0.167 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 3.69e-01 0.0626 0.0696 0.167 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 9.78e-02 -0.177 0.106 0.167 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 2.45e-01 0.12 0.103 0.167 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 3.48e-01 0.0545 0.0579 0.167 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 2.57e-01 -0.112 0.0982 0.167 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 1.37e-01 -0.139 0.0929 0.167 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 8.47e-01 -0.015 0.0775 0.167 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.44e-01 -0.114 0.0977 0.167 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0328 0.0486 0.167 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 744270 sc-eQTL 9.23e-02 0.151 0.0893 0.167 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 8.24e-01 0.0227 0.102 0.167 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 2.29e-01 0.0954 0.0791 0.167 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 4.50e-01 0.0558 0.0736 0.167 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 5.43e-01 0.0684 0.112 0.167 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 45851 sc-eQTL 8.42e-01 0.0232 0.116 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0538 0.105 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0944 0.119 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 9.06e-01 -0.015 0.126 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0369 0.0968 0.176 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 6.53e-01 0.0536 0.119 0.176 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 8.14e-01 0.0294 0.124 0.176 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0525 0.0941 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 5.63e-01 0.0528 0.0911 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 9.01e-01 0.0129 0.103 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0533 0.121 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 9.10e-01 0.0116 0.102 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 3.16e-01 -0.12 0.12 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00992 0.0904 0.168 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 2.04e-01 -0.133 0.104 0.168 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 6.44e-02 -0.189 0.102 0.168 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0962 0.112 0.168 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 5.59e-02 0.207 0.108 0.168 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 6.57e-01 0.0535 0.12 0.168 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 1.67e-01 -0.105 0.0758 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 1.40e-01 0.117 0.0793 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 2.72e-01 -0.103 0.0939 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 6.12e-01 0.0602 0.118 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 9.77e-01 0.00262 0.0916 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 1.04e-01 -0.191 0.117 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 3.98e-02 -0.199 0.0964 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 6.65e-01 -0.04 0.0922 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 2.37e-01 -0.128 0.108 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 9.78e-01 0.00326 0.117 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0971 0.108 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0261 0.128 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0783 0.0877 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 5.19e-01 -0.08 0.124 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 1.38e-01 0.186 0.125 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 7.09e-01 0.0374 0.1 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0257 0.109 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.87e-01 -0.134 0.126 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 9.62e-01 0.00262 0.0551 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0974 0.0795 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 5.27e-01 0.0505 0.0797 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 7.09e-01 0.0417 0.112 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 8.96e-01 0.0093 0.0709 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 8.84e-01 0.0128 0.0873 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00437 0.0536 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 1.05e-01 -0.147 0.0904 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 4.05e-01 0.0746 0.0894 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 2.88e-01 -0.131 0.123 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 2.73e-02 -0.161 0.0726 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0575 0.1 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 4.77e-02 -0.131 0.0655 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 5.16e-01 0.0664 0.102 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0545 0.0948 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0211 0.117 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 7.49e-01 0.0318 0.0994 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 8.92e-01 -0.016 0.118 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0261 0.0634 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0719 0.114 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0223 0.104 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 8.01e-01 0.0293 0.116 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 3.03e-01 0.0987 0.0956 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 3.55e-02 -0.225 0.106 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 4.86e-01 0.0534 0.0765 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0242 0.0917 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0532 0.097 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0199 0.102 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 5.37e-02 0.168 0.0865 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.60e-01 0.117 0.104 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0547 0.084 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 5.51e-02 -0.236 0.122 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 9.27e-01 0.00954 0.105 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0462 0.113 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 2.10e-01 -0.151 0.12 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.32e-01 0.141 0.118 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 2.73e-01 -0.112 0.102 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 2.81e-01 0.135 0.125 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 7.38e-01 0.0412 0.123 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 9.84e-01 0.0021 0.105 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0277 0.114 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 4.61e-01 0.0915 0.124 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0257 0.069 0.169 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 744270 sc-eQTL 2.07e-01 0.117 0.0926 0.169 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00884 0.107 0.169 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 1.92e-01 0.117 0.0891 0.169 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 6.61e-02 0.19 0.103 0.169 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 4.34e-01 0.0911 0.116 0.169 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 45851 sc-eQTL 9.86e-01 0.00203 0.115 0.169 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0815 0.0722 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 8.98e-01 0.0137 0.107 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 9.16e-01 0.0121 0.114 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 1.31e-01 0.179 0.118 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 7.41e-01 0.0397 0.12 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 7.35e-01 0.0212 0.0624 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 3.53e-01 -0.105 0.113 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 5.15e-01 -0.065 0.0998 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 2.75e-01 0.104 0.0948 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.22e-01 -0.134 0.109 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 1.00e-01 0.162 0.0983 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 5.64e-01 0.0749 0.13 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 9.32e-01 0.0102 0.12 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 1.54e-01 -0.179 0.125 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 1.70e-01 -0.163 0.118 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 1.21e-01 0.106 0.0679 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0286 0.115 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 1.36e-01 -0.165 0.11 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 6.66e-01 0.0404 0.0936 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 3.73e-01 -0.103 0.116 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 7.52e-02 -0.209 0.116 0.181 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 7.66e-01 -0.031 0.104 0.181 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 1.32e-01 -0.2 0.132 0.181 PB L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 2.86e-01 -0.132 0.123 0.181 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 7.16e-01 0.0475 0.13 0.181 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.78e-01 0.168 0.154 0.181 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00476 0.0782 0.167 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 744270 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0298 0.0877 0.167 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0887 0.103 0.167 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 8.61e-01 0.0219 0.125 0.167 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 8.99e-01 -0.01 0.0787 0.167 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0173 0.114 0.167 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 45851 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0559 0.0924 0.167 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 4.47e-01 0.0627 0.0823 0.167 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 7.08e-02 -0.188 0.104 0.167 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 2.66e-01 0.105 0.0943 0.167 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 2.98e-01 -0.11 0.106 0.167 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00406 0.109 0.167 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 5.27e-01 0.0773 0.122 0.167 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 9.06e-01 0.0123 0.104 0.168 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 7.06e-01 -0.041 0.109 0.168 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0687 0.0929 0.168 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 8.65e-01 -0.021 0.123 0.168 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00653 0.103 0.168 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.01e-01 -0.16 0.125 0.168 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 4.30e-01 0.0835 0.105 0.168 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0307 0.0891 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 1.95e-01 0.126 0.0968 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 2.35e-01 0.125 0.105 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0147 0.0809 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 8.49e-01 0.0159 0.0835 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 9.13e-02 -0.194 0.114 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 2.65e-01 0.119 0.107 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 6.84e-01 -0.041 0.101 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 8.73e-01 -0.018 0.113 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 2.18e-01 0.139 0.112 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0583 0.0918 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0288 0.0908 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0516 0.123 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 8.22e-01 0.026 0.115 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0474 0.099 0.167 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 744270 sc-eQTL 5.67e-01 0.0651 0.114 0.167 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 1.23e-01 0.228 0.147 0.167 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0885 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 2.46e-01 -0.153 0.132 0.167 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 3.35e-01 0.141 0.146 0.167 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 45851 sc-eQTL 6.68e-01 0.055 0.128 0.167 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00795 0.117 0.171 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 3.33e-02 0.251 0.117 0.171 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 6.16e-01 0.061 0.121 0.171 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00028 0.108 0.171 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0095 0.116 0.171 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0871 0.12 0.171 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 3.09e-01 -0.123 0.121 0.171 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 2.64e-01 0.101 0.0902 0.172 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 7.62e-01 0.0306 0.101 0.172 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 4.16e-01 0.0916 0.112 0.172 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 2.74e-01 -0.106 0.0964 0.172 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 3.80e-02 0.204 0.0977 0.172 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 6.70e-02 -0.192 0.104 0.172 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 4.37e-02 0.24 0.118 0.172 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 8.21e-01 0.0276 0.122 0.161 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 7.86e-01 0.028 0.103 0.161 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 2.16e-01 -0.142 0.114 0.161 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 2.30e-01 -0.169 0.14 0.161 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0158 0.123 0.161 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 8.80e-01 0.0205 0.135 0.161 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 7.58e-01 0.0358 0.116 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0564 0.0788 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00258 0.082 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0881 0.0935 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 2.24e-01 -0.142 0.116 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 3.76e-01 0.0804 0.0906 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0345 0.119 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 7.66e-02 -0.121 0.0679 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 1.52e-01 0.11 0.0765 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 2.15e-01 -0.108 0.0871 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 983946 sc-eQTL 4.33e-01 0.0838 0.107 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0381 0.088 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.30e-01 -0.14 0.116 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0425 0.0805 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 6.01e-01 0.051 0.0975 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 3.22e-01 0.106 0.107 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0298 0.0773 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 7.24e-01 0.0264 0.0746 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 3.25e-01 -0.115 0.117 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 4.76e-01 0.0773 0.108 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 4.51e-01 0.064 0.0847 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 539057 sc-eQTL 2.35e-01 0.119 0.0999 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.111 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0455 0.0822 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 4.53e-01 0.0637 0.0847 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 1.06e-01 -0.176 0.108 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 510099 sc-eQTL 3.95e-01 0.098 0.115 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 134942 sc-eQTL 1.79e-01 0.0788 0.0585 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 491902 sc-eQTL 2.34e-01 -0.121 0.102 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 341047 sc-eQTL 9.49e-02 -0.156 0.0928 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 676494 sc-eQTL 9.35e-01 0.00652 0.08 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 sc-eQTL 2.13e-01 -0.124 0.0994 0.166 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 134942 eQTL 2.42e-02 -0.0336 0.0149 0.00104 0.0 0.16
ENSG00000136014 USP44 983946 eQTL 0.0447 -0.0736 0.0366 0.0 0.0 0.16
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 eQTL 3.49e-09 -0.176 0.0296 0.0 0.0 0.16

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139343 \N 676494 2.56e-07 1.16e-07 3.34e-08 1.66e-07 1.03e-07 8.95e-08 1.36e-07 5.29e-08 1.32e-07 3.99e-08 1.59e-07 7.4e-08 1.2e-07 6.1e-08 4.48e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.33e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.09e-07 9.43e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.09e-08 1.06e-07 4.23e-08 3.84e-08 8.48e-08 8.39e-08 3.96e-08 2.6e-08 1.42e-07 4.33e-08 0.0 1.15e-07 1.86e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08
ENSG00000139350 NEDD1 -371801 2.66e-07 1.06e-07 3.59e-08 1.7e-07 1.02e-07 9.13e-08 1.42e-07 5.24e-08 1.41e-07 4.23e-08 1.63e-07 7.49e-08 1.27e-07 6.07e-08 4.77e-08 7.76e-08 5.12e-08 1.07e-07 5.22e-08 2.85e-08 1.06e-07 1.31e-07 1.3e-07 5.01e-08 1.31e-07 1.09e-07 1.13e-07 8.49e-08 1.03e-07 1.11e-07 9.75e-08 3.41e-08 2.75e-08 8.02e-08 9.69e-08 4.12e-08 5.09e-08 9.2e-08 8.44e-08 3.74e-08 3.71e-08 1.39e-07 4.12e-08 0.0 1.15e-07 1.83e-08 1.5e-07 4.82e-09 4.72e-08