logo

Genes within 1Mb (chr12:96531827:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 1.18e-01 0.0852 0.0542 0.222 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0822 0.0675 0.222 B L1
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 3.66e-01 0.0652 0.0719 0.222 B L1
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 2.50e-02 0.198 0.0878 0.222 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 8.10e-01 0.0157 0.0655 0.222 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 1.06e-01 0.154 0.095 0.222 B L1
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 5.44e-02 0.0852 0.0441 0.222 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 6.93e-01 0.0241 0.061 0.222 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0238 0.0661 0.222 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 1.67e-01 -0.13 0.0939 0.222 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 2.71e-01 0.0636 0.0576 0.222 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0719 0.071 0.222 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 2.76e-02 0.101 0.0453 0.222 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0128 0.0492 0.222 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 9.18e-01 0.00765 0.0741 0.222 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0684 0.0842 0.222 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0613 0.0606 0.222 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 7.95e-01 -0.021 0.0807 0.222 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 1.36e-01 0.129 0.0859 0.225 DC L1
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 5.95e-01 0.0523 0.0982 0.225 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 7.46e-01 -0.026 0.0804 0.225 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 1.21e-01 0.152 0.0978 0.225 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0588 0.0818 0.225 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 5.01e-01 0.0707 0.105 0.225 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 1.99e-01 0.122 0.0945 0.225 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 4.93e-01 0.0469 0.0683 0.222 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 5.19e-01 0.0556 0.0861 0.222 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 1.27e-01 -0.148 0.0967 0.222 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 5.45e-01 0.0395 0.0653 0.222 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00359 0.0616 0.222 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 1.13e-02 0.238 0.0931 0.222 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0939 0.0914 0.222 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0487 0.0513 0.223 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 6.19e-01 0.0435 0.0871 0.223 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 4.29e-01 0.0654 0.0826 0.223 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 8.90e-01 0.00953 0.0686 0.223 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 1.64e-01 0.121 0.0864 0.223 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0305 0.0435 0.222 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 740675 sc-eQTL 4.06e-01 0.0669 0.0804 0.222 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00399 0.0911 0.222 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 8.87e-01 0.0101 0.0711 0.222 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00973 0.066 0.222 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 4.08e-01 0.0832 0.1 0.222 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 42256 sc-eQTL 2.83e-01 -0.112 0.104 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00157 0.0975 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 3.04e-01 -0.113 0.11 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 3.00e-01 -0.121 0.117 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 1.16e-01 -0.141 0.0892 0.23 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 2.79e-01 -0.119 0.11 0.23 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 5.76e-01 0.0645 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 5.67e-01 0.0492 0.0859 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 8.86e-01 -0.012 0.0832 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 7.77e-02 0.165 0.0932 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 8.52e-03 0.289 0.109 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 7.15e-01 0.0341 0.0935 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 8.03e-01 0.0273 0.11 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 7.89e-01 0.0224 0.0833 0.218 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 1.05e-01 0.156 0.0956 0.218 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0859 0.0944 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 5.42e-02 0.199 0.103 0.218 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 5.76e-01 0.0562 0.1 0.218 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 4.97e-02 -0.217 0.11 0.218 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 5.99e-02 0.128 0.0676 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 6.54e-01 -0.032 0.0713 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 4.72e-01 0.0608 0.0843 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 4.78e-01 0.0753 0.106 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0497 0.082 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0414 0.105 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00323 0.0866 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0371 0.082 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 4.67e-01 0.0704 0.0966 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 7.27e-01 0.0365 0.104 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0525 0.0959 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 1.39e-02 0.279 0.113 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 4.62e-01 0.0579 0.0785 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 3.09e-01 0.113 0.111 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0496 0.112 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0834 0.0894 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 6.95e-01 0.0384 0.0976 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 3.42e-02 0.238 0.112 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 6.26e-02 0.0906 0.0484 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 4.95e-01 0.0482 0.0705 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 9.26e-01 0.00656 0.0706 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 1.31e-01 -0.149 0.0984 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 3.38e-01 0.0601 0.0626 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0186 0.0772 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 1.17e-01 0.0747 0.0474 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 5.52e-01 0.0482 0.0808 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 1.08e-01 -0.128 0.0791 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0504 0.11 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 5.42e-01 0.0399 0.0652 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 2.29e-01 -0.107 0.0889 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0177 0.0588 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0356 0.0907 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0117 0.0843 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0516 0.104 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 1.01e-01 0.144 0.0877 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 7.71e-01 0.0305 0.105 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00531 0.0571 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0854 0.103 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 1.05e-01 -0.152 0.0932 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0628 0.104 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0716 0.0861 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 2.88e-01 0.103 0.0965 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 6.88e-02 0.125 0.0686 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0159 0.0828 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 7.07e-01 0.0329 0.0876 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0745 0.0918 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 6.29e-01 -0.038 0.0787 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 9.40e-02 -0.157 0.0931 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0345 0.073 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 1.04e-01 0.174 0.107 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 7.60e-01 0.0278 0.0909 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 5.91e-01 0.053 0.0983 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 6.75e-01 -0.044 0.105 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0301 0.102 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 2.59e-01 0.105 0.0928 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0459 0.114 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0616 0.112 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 6.84e-01 0.0389 0.0954 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0697 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0149 0.113 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 4.93e-01 0.0425 0.0618 0.223 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 740675 sc-eQTL 3.18e-01 0.0833 0.0832 0.223 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 6.88e-01 0.0384 0.0956 0.223 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 5.78e-01 0.0447 0.0802 0.223 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 5.34e-01 0.0579 0.0929 0.223 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0575 0.104 0.223 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 42256 sc-eQTL 8.42e-01 0.0207 0.103 0.223 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 9.82e-02 -0.11 0.0663 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0329 0.0987 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 3.82e-01 0.0916 0.105 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0929 0.109 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 9.98e-01 0.000288 0.111 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0116 0.0554 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 7.38e-01 0.0336 0.1 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 5.52e-01 0.0528 0.0886 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 7.09e-01 0.0315 0.0843 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 3.85e-02 0.2 0.0962 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0385 0.0884 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00515 0.116 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 8.50e-01 0.0204 0.108 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 9.04e-01 0.0136 0.112 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 4.08e-01 0.0878 0.106 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0403 0.0606 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0611 0.102 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 6.18e-01 0.0489 0.0981 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00629 0.0832 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0831 0.103 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 1.39e-01 0.184 0.123 0.207 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 8.94e-01 0.0147 0.11 0.207 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 4.72e-01 0.101 0.141 0.207 PB L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0677 0.13 0.207 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 6.33e-01 0.0658 0.137 0.207 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 9.85e-01 0.00311 0.163 0.207 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000919 0.0676 0.224 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 740675 sc-eQTL 1.30e-01 0.115 0.0755 0.224 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0678 0.0891 0.224 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0282 0.108 0.224 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0221 0.068 0.224 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0639 0.0988 0.224 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 42256 sc-eQTL 6.61e-01 -0.035 0.0799 0.224 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0018 0.0735 0.222 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 6.12e-01 0.0473 0.0931 0.222 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 3.57e-01 0.0778 0.0842 0.222 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 5.06e-01 -0.063 0.0947 0.222 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 1.93e-01 -0.127 0.0973 0.222 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 1.75e-01 -0.148 0.109 0.222 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 6.41e-01 0.0426 0.0913 0.224 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0203 0.0949 0.224 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 3.38e-01 -0.078 0.0812 0.224 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 4.00e-01 0.0905 0.107 0.224 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0473 0.0899 0.224 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 7.38e-01 0.0367 0.11 0.224 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 6.01e-01 0.0483 0.0923 0.224 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 1.63e-01 0.11 0.0786 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 6.38e-01 0.0406 0.0861 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 7.83e-02 -0.163 0.0924 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 2.05e-01 0.0908 0.0714 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 5.71e-01 0.0419 0.0739 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 5.13e-03 0.283 0.1 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0611 0.095 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 2.52e-01 0.102 0.0893 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0509 0.1 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 2.58e-01 -0.114 0.1 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0217 0.0817 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00889 0.0808 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 1.67e-01 0.15 0.109 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0389 0.103 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0684 0.0885 0.233 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 740675 sc-eQTL 9.90e-01 0.00126 0.102 0.233 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 3.15e-01 -0.133 0.132 0.233 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 8.07e-01 -0.03 0.123 0.233 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 9.45e-01 0.00812 0.119 0.233 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 4.37e-01 -0.102 0.131 0.233 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 42256 sc-eQTL 3.73e-01 -0.102 0.114 0.233 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 1.80e-01 0.133 0.099 0.227 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0588 0.1 0.227 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0876 0.103 0.227 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0777 0.0917 0.227 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 8.62e-02 0.168 0.0975 0.227 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 3.40e-01 0.0973 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0507 0.103 0.227 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0423 0.0794 0.231 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 2.02e-01 0.113 0.0883 0.231 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0678 0.0988 0.231 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 7.71e-01 0.0247 0.0849 0.231 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0655 0.0866 0.231 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 8.63e-01 0.0159 0.0921 0.231 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00758 0.105 0.231 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 5.19e-02 0.204 0.104 0.223 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0257 0.0888 0.223 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 2.24e-01 -0.121 0.099 0.223 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 4.82e-01 0.0855 0.121 0.223 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 9.17e-01 0.0111 0.106 0.223 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 4.19e-01 0.0947 0.117 0.223 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0408 0.1 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 4.41e-01 0.0549 0.0711 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 9.27e-01 0.00679 0.0739 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 9.29e-01 0.00754 0.0845 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 1.97e-03 0.322 0.103 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 2.86e-01 0.0873 0.0816 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 1.37e-01 -0.159 0.107 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 1.34e-01 0.0915 0.0608 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0729 0.0684 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 1.86e-01 0.103 0.0778 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 980351 sc-eQTL 4.17e-01 0.0775 0.0954 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 6.30e-01 -0.038 0.0786 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 1.79e-01 0.14 0.104 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 7.85e-02 0.125 0.0708 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 6.71e-01 0.0368 0.0864 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 1.07e-01 -0.153 0.0943 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 6.35e-01 0.0325 0.0685 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00102 0.0661 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 1.24e-02 0.258 0.102 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0966 0.0959 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 6.08e-01 0.0376 0.0733 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 535462 sc-eQTL 4.75e-01 0.062 0.0866 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0799 0.096 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 8.10e-01 0.0171 0.0711 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 4.76e-01 0.0523 0.0733 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 3.00e-01 0.0976 0.0938 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 506504 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0129 0.0996 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 131347 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0108 0.0521 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 488307 sc-eQTL 6.04e-01 0.047 0.0905 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 337452 sc-eQTL 3.65e-01 0.0752 0.0827 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672899 sc-eQTL 5.56e-01 0.0418 0.0708 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 sc-eQTL 2.23e-01 0.108 0.0881 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 eQTL 2.58e-20 0.25 0.0265 0.0 0.0 0.228
ENSG00000188596 CFAP54 42252 eQTL 1e-07 0.122 0.0228 0.0151 0.0141 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -375396 1.2e-06 9.47e-07 2.66e-07 6.94e-07 3.71e-07 5.63e-07 1.6e-06 4.44e-07 1.59e-06 5.9e-07 1.82e-06 8.32e-07 2.02e-06 3.03e-07 5.69e-07 9.92e-07 9.01e-07 7.89e-07 6.08e-07 5.73e-07 7.54e-07 1.81e-06 8.94e-07 5.61e-07 2.1e-06 8.55e-07 9.37e-07 7.03e-07 1.46e-06 1.22e-06 6.29e-07 2.58e-07 2.51e-07 5.5e-07 5.39e-07 5.32e-07 7.26e-07 2.42e-07 4.8e-07 3.13e-07 2.88e-07 1.62e-06 1.1e-07 1.95e-08 2.5e-07 1.12e-07 2.46e-07 5.98e-08 2.57e-07
ENSG00000188596 CFAP54 42252 1.1e-05 1.25e-05 3.05e-06 8.67e-06 3.55e-06 6.65e-06 1.84e-05 3.41e-06 1.41e-05 6.99e-06 1.71e-05 6.86e-06 2.33e-05 5.09e-06 4.5e-06 9.51e-06 8.11e-06 1.25e-05 5.87e-06 4.47e-06 8.39e-06 1.34e-05 1.37e-05 6.86e-06 2.35e-05 5.73e-06 8e-06 5.79e-06 1.62e-05 1.54e-05 8.58e-06 1.62e-06 2.25e-06 7.02e-06 6.46e-06 4.59e-06 3.48e-06 2.76e-06 4.1e-06 3.04e-06 1.83e-06 1.61e-05 2.68e-06 5.07e-07 2.67e-06 2.75e-06 3.4e-06 1.55e-06 1.52e-06