logo

Genes within 1Mb (chr12:96531040:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 1.17e-01 -0.116 0.0735 0.098 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 8.45e-01 0.018 0.0919 0.098 B L1
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 2.40e-01 -0.115 0.0975 0.098 B L1
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 4.98e-01 0.0818 0.12 0.098 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 5.78e-01 0.0495 0.0888 0.098 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 1.27e-01 -0.198 0.129 0.098 B L1
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0198 0.0614 0.098 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 2.30e-01 -0.101 0.084 0.098 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 9.67e-01 0.00376 0.0913 0.098 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0163 0.13 0.098 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0628 0.0797 0.098 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 4.42e-01 0.0756 0.0982 0.098 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0204 0.0625 0.098 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 8.50e-01 0.0127 0.0671 0.098 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 3.68e-01 0.0909 0.101 0.098 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 5.20e-01 -0.074 0.115 0.098 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 8.71e-01 0.0134 0.0828 0.098 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 9.32e-01 0.00939 0.11 0.098 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 8.85e-01 0.0163 0.112 0.101 DC L1
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 1.67e-01 -0.176 0.127 0.101 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 3.19e-01 -0.104 0.104 0.101 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 4.42e-02 -0.256 0.127 0.101 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 4.17e-01 0.0864 0.106 0.101 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 4.11e-01 0.112 0.136 0.101 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 7.14e-01 0.0452 0.123 0.101 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 7.54e-01 0.0292 0.0931 0.098 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0538 0.117 0.098 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0796 0.132 0.098 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0232 0.0889 0.098 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 7.62e-01 0.0254 0.0838 0.098 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0757 0.129 0.098 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0944 0.125 0.098 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 1.44e-01 0.102 0.0694 0.099 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 1.88e-01 -0.156 0.118 0.099 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 1.84e-01 -0.149 0.112 0.099 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 9.25e-02 -0.156 0.0925 0.099 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0815 0.118 0.099 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 8.99e-01 0.00751 0.0592 0.098 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 739888 sc-eQTL 1.66e-01 0.151 0.109 0.098 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0619 0.124 0.098 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 6.70e-01 0.0412 0.0965 0.098 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 6.38e-01 0.0423 0.0897 0.098 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 2.98e-01 0.142 0.136 0.098 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 41469 sc-eQTL 4.04e-01 -0.118 0.141 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 3.80e-01 -0.115 0.131 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 2.34e-01 -0.177 0.148 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0076 0.158 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0106 0.121 0.105 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 4.29e-01 0.118 0.148 0.105 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0245 0.155 0.105 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 3.31e-01 -0.11 0.113 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0412 0.11 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0479 0.124 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 6.79e-01 0.0604 0.146 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 3.32e-01 -0.12 0.123 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 8.39e-02 -0.249 0.143 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 8.73e-01 0.0174 0.109 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 2.75e-01 -0.138 0.126 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 9.97e-02 -0.204 0.123 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 9.71e-01 -0.005 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 2.19e-01 0.162 0.131 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 9.50e-01 0.00906 0.145 0.099 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0876 0.0913 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 6.51e-01 0.0434 0.0958 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 8.12e-01 -0.027 0.113 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 5.99e-01 0.075 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 2.51e-01 0.126 0.11 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 4.33e-01 -0.111 0.141 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 1.03e-01 -0.187 0.114 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 3.16e-01 -0.109 0.109 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 3.27e-02 -0.273 0.127 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 6.87e-01 0.056 0.139 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 8.73e-01 0.0204 0.127 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 5.27e-01 -0.096 0.151 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0661 0.104 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 2.62e-02 -0.325 0.145 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 3.26e-01 0.146 0.148 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0264 0.119 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 4.39e-01 -0.1 0.129 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0408 0.149 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00695 0.0674 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 7.17e-02 -0.175 0.0967 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 6.64e-01 0.0423 0.0975 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 5.09e-01 0.0902 0.137 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 8.95e-01 0.0115 0.0866 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 5.47e-01 0.0643 0.107 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0597 0.0654 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 1.24e-01 -0.171 0.111 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 8.13e-01 0.026 0.109 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 5.02e-01 -0.102 0.151 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 3.95e-02 -0.184 0.0889 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0616 0.123 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 6.76e-02 -0.146 0.0793 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 1.81e-01 0.165 0.123 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0246 0.115 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 7.56e-01 0.0439 0.141 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0666 0.12 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 1.77e-01 0.192 0.142 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 8.49e-01 0.0145 0.0762 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0326 0.138 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 7.17e-01 0.0454 0.125 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0207 0.14 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 4.86e-01 0.0803 0.115 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 5.65e-02 -0.246 0.128 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 6.31e-01 0.0449 0.0933 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 6.42e-01 -0.052 0.112 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 3.54e-01 -0.11 0.118 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 3.44e-01 -0.118 0.124 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 1.61e-01 0.149 0.106 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 1.91e-01 0.165 0.126 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 2.36e-01 -0.12 0.101 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 4.40e-03 -0.42 0.146 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 7.00e-02 0.228 0.125 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 6.41e-01 0.0638 0.136 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0946 0.145 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 6.70e-01 0.0606 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 7.09e-02 -0.221 0.122 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 5.07e-01 0.0998 0.15 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 6.73e-01 0.0624 0.148 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0103 0.126 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 3.91e-01 -0.118 0.137 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 4.13e-01 0.122 0.149 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00704 0.0824 0.1 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 739888 sc-eQTL 1.08e-01 0.178 0.11 0.1 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 2.55e-01 -0.145 0.127 0.1 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 3.48e-01 0.1 0.107 0.1 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 6.17e-01 0.0619 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 1.66e-01 0.192 0.138 0.1 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 41469 sc-eQTL 1.21e-01 -0.213 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 2.11e-01 -0.11 0.0877 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0534 0.13 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0423 0.138 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 5.66e-01 0.0831 0.144 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 2.74e-01 0.159 0.145 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 2.38e-01 0.0886 0.0749 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 7.02e-01 -0.052 0.136 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00798 0.12 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0551 0.114 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 7.33e-01 -0.045 0.132 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 8.48e-02 0.203 0.117 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 4.74e-01 -0.111 0.155 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0301 0.144 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0871 0.15 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 1.76e-01 -0.191 0.141 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 1.01e-02 0.21 0.081 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0854 0.139 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0842 0.133 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0641 0.113 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0684 0.139 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0963 0.153 0.104 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 1.05e-01 -0.218 0.134 0.104 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 3.46e-02 -0.363 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 9.00e-01 0.0201 0.16 0.104 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 9.97e-01 0.000673 0.169 0.104 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 2.00e-01 0.257 0.199 0.104 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00495 0.0912 0.098 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 739888 sc-eQTL 1.91e-01 -0.134 0.102 0.098 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 9.42e-02 -0.201 0.12 0.098 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0708 0.146 0.098 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00588 0.0918 0.098 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 6.32e-01 0.064 0.133 0.098 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 41469 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0478 0.108 0.098 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 8.27e-01 0.0216 0.099 0.098 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 3.09e-01 -0.128 0.125 0.098 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 8.78e-01 0.0174 0.114 0.098 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0953 0.127 0.098 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0298 0.132 0.098 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 2.34e-01 0.174 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 6.66e-01 0.0538 0.124 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 1.72e-01 -0.176 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0947 0.111 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 1.16e-01 -0.23 0.145 0.1 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 7.39e-01 0.0408 0.122 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0942 0.149 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 5.04e-01 0.0841 0.126 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 5.93e-01 0.0568 0.106 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 7.77e-01 0.0328 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 3.90e-01 -0.108 0.125 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0106 0.0965 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0306 0.0995 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 2.71e-01 -0.151 0.137 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0689 0.128 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0125 0.12 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 2.03e-01 -0.171 0.134 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0604 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0184 0.11 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 8.72e-01 0.0175 0.108 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 5.04e-01 0.098 0.146 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 4.52e-01 -0.104 0.138 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0771 0.117 0.1 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 739888 sc-eQTL 6.65e-01 0.0582 0.134 0.1 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 4.04e-01 0.146 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 3.20e-01 -0.161 0.161 0.1 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 7.58e-03 -0.412 0.152 0.1 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 3.74e-01 -0.153 0.172 0.1 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 41469 sc-eQTL 7.43e-01 0.0496 0.151 0.1 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00348 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 9.85e-02 0.23 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 2.74e-01 -0.157 0.143 0.1 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 2.69e-01 0.141 0.127 0.1 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 3.82e-01 -0.119 0.136 0.1 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0209 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 1.82e-01 -0.19 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 5.25e-02 0.205 0.105 0.104 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 9.52e-01 0.0072 0.119 0.104 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 2.47e-01 -0.153 0.132 0.104 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00215 0.113 0.104 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 2.82e-01 0.125 0.116 0.104 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 1.20e-01 -0.191 0.122 0.104 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 7.30e-01 0.0485 0.14 0.104 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 7.83e-01 0.0402 0.146 0.099 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 2.52e-01 -0.141 0.123 0.099 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 3.34e-01 -0.133 0.137 0.099 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 2.14e-01 -0.209 0.168 0.099 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 2.67e-01 -0.163 0.147 0.099 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 6.08e-01 0.0834 0.162 0.099 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 5.53e-01 0.0828 0.139 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0747 0.0948 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 3.89e-01 -0.085 0.0984 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 2.14e-01 -0.14 0.112 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0457 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 8.05e-01 0.0269 0.109 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 2.10e-01 -0.179 0.143 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 2.05e-01 -0.103 0.0813 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 7.49e-01 0.0294 0.0916 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 1.83e-01 -0.139 0.104 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 979564 sc-eQTL 4.27e-01 0.101 0.127 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 5.06e-01 0.0698 0.105 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 3.76e-01 -0.123 0.139 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 6.47e-01 0.0441 0.0961 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0695 0.116 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 3.46e-01 -0.12 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 9.81e-01 0.00215 0.0924 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 9.87e-01 0.00148 0.0891 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0244 0.14 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 2.99e-01 -0.134 0.129 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 1.74e-01 0.135 0.0986 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 534675 sc-eQTL 4.06e-01 0.0974 0.117 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 3.79e-01 -0.114 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 7.00e-01 0.037 0.096 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0442 0.099 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 3.94e-01 -0.108 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 505717 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0397 0.134 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 130560 sc-eQTL 3.47e-02 0.149 0.0699 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 487520 sc-eQTL 2.72e-01 -0.135 0.122 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 336665 sc-eQTL 2.88e-01 -0.119 0.112 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 672112 sc-eQTL 1.72e-01 -0.131 0.0958 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0758 0.12 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000084110 HAL 534675 eQTL 0.0172 -0.0523 0.0219 0.0 0.0 0.0957
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 eQTL 0.000677 -0.129 0.0379 0.0 0.0 0.0957

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -376183 1.04e-06 6.42e-07 1.31e-07 3.81e-07 1.05e-07 2.01e-07 5.8e-07 1.37e-07 5.02e-07 2.62e-07 8.08e-07 4.55e-07 8.6e-07 1.52e-07 2.48e-07 2.89e-07 3.69e-07 4.07e-07 2.51e-07 1.8e-07 2.09e-07 3.92e-07 3.87e-07 1.8e-07 7.94e-07 2.54e-07 3.16e-07 3.18e-07 4.22e-07 6.47e-07 3.49e-07 4.06e-08 5.63e-08 1.49e-07 3.08e-07 1.71e-07 1.02e-07 1.09e-07 5.93e-08 2.65e-08 1.22e-07 6.8e-07 4.18e-08 1.93e-08 1.91e-07 1.44e-08 1.03e-07 2.44e-08 6.15e-08