logo

Genes within 1Mb (chr12:96525935:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 3.45e-02 -0.181 0.0853 0.077 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0122 0.107 0.077 B L1
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 2.32e-01 -0.136 0.114 0.077 B L1
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 7.02e-01 0.0538 0.14 0.077 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 6.64e-01 0.045 0.103 0.077 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 1.45e-01 -0.22 0.15 0.077 B L1
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0606 0.0705 0.077 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0661 0.0969 0.077 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 8.41e-01 0.0212 0.105 0.077 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0534 0.15 0.077 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0464 0.0918 0.077 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 7.35e-01 0.0383 0.113 0.077 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 1.27e-01 -0.111 0.0722 0.077 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 7.14e-01 0.0285 0.0779 0.077 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 6.04e-01 0.0608 0.117 0.077 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 3.91e-01 -0.114 0.133 0.077 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 4.88e-01 0.0667 0.096 0.077 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 7.45e-01 0.0416 0.128 0.077 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0334 0.13 0.079 DC L1
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0999 0.148 0.079 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 1.37e-01 -0.18 0.12 0.079 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 6.52e-02 -0.272 0.147 0.079 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 4.16e-01 0.1 0.123 0.079 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 7.18e-01 0.0571 0.158 0.079 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0284 0.143 0.079 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 9.76e-01 0.00325 0.107 0.077 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 4.16e-01 -0.109 0.134 0.077 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0975 0.151 0.077 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0835 0.102 0.077 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 2.69e-01 0.106 0.0957 0.077 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0546 0.147 0.077 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 9.51e-01 0.00881 0.143 0.077 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 6.95e-01 0.0317 0.0805 0.077 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.83e-01 -0.147 0.136 0.077 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 1.02e-01 -0.211 0.129 0.077 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 1.34e-01 -0.161 0.107 0.077 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0631 0.136 0.077 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 7.55e-01 0.0214 0.0684 0.077 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 734783 sc-eQTL 2.99e-01 0.131 0.126 0.077 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 4.27e-01 -0.114 0.143 0.077 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 1.00e+00 5.37e-05 0.112 0.077 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 3.69e-01 0.0933 0.104 0.077 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 3.14e-01 0.159 0.158 0.077 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 36364 sc-eQTL 3.41e-01 -0.156 0.163 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0716 0.149 0.084 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 3.46e-01 -0.159 0.168 0.084 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0719 0.178 0.084 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0193 0.137 0.084 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 4.45e-01 0.128 0.168 0.084 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 7.81e-01 0.049 0.176 0.084 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 8.07e-02 -0.229 0.13 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.09e-01 -0.16 0.127 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0842 0.143 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 8.18e-01 0.0389 0.169 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 4.51e-01 -0.108 0.143 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 3.61e-02 -0.349 0.166 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0252 0.127 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 1.61e-01 -0.205 0.146 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 1.94e-01 -0.187 0.143 0.078 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 9.34e-01 0.013 0.158 0.078 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 8.34e-01 0.032 0.152 0.078 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 8.42e-01 0.0336 0.169 0.078 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 2.77e-01 -0.115 0.106 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 7.41e-01 0.0367 0.111 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0757 0.131 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 6.90e-01 0.0658 0.165 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 9.94e-02 0.21 0.127 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0798 0.163 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 2.44e-01 -0.156 0.133 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 3.46e-01 -0.119 0.126 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 8.35e-02 -0.257 0.148 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0146 0.161 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 7.03e-01 0.0566 0.148 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0714 0.176 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0086 0.122 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 6.03e-02 -0.321 0.17 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 1.18e-01 0.271 0.173 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0671 0.139 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 1.37e-01 -0.224 0.15 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 4.85e-01 0.122 0.174 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0403 0.0777 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 1.62e-01 -0.157 0.112 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 7.07e-01 0.0423 0.112 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 6.17e-01 0.0789 0.158 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 7.06e-01 0.0377 0.0999 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0134 0.123 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 1.07e-01 -0.121 0.0749 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.64e-01 -0.143 0.127 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 9.75e-01 0.0039 0.126 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 5.85e-01 -0.095 0.174 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 1.71e-01 -0.141 0.103 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 2.59e-01 -0.159 0.14 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 5.20e-02 -0.179 0.0915 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.58e-01 0.161 0.142 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 8.86e-01 0.019 0.132 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 8.72e-01 0.0262 0.163 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0434 0.139 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 1.16e-01 0.258 0.163 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0169 0.0882 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 8.39e-01 0.0324 0.159 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 7.13e-01 0.0534 0.145 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0974 0.161 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 7.58e-01 0.0412 0.133 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 3.76e-01 -0.132 0.149 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0305 0.107 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0397 0.129 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 1.22e-01 -0.21 0.135 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 3.45e-01 -0.135 0.143 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 1.49e-01 0.176 0.122 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 8.78e-02 0.248 0.145 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 1.26e-01 -0.182 0.118 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.62e-02 -0.388 0.173 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 7.34e-02 0.265 0.147 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 2.11e-01 0.201 0.16 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 5.53e-01 -0.101 0.171 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 9.35e-01 0.0137 0.167 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 7.77e-03 -0.375 0.139 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.69e-01 0.192 0.173 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0825 0.171 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0367 0.145 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 4.68e-01 -0.115 0.158 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 6.68e-01 0.074 0.172 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 7.71e-01 0.0278 0.0952 0.078 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 734783 sc-eQTL 1.80e-01 0.172 0.128 0.078 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.84e-01 -0.158 0.147 0.078 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 3.95e-01 0.105 0.123 0.078 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 6.49e-01 0.0652 0.143 0.078 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 1.42e-01 0.236 0.16 0.078 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 36364 sc-eQTL 5.59e-02 -0.303 0.158 0.078 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 1.21e-01 -0.158 0.102 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 4.70e-01 -0.11 0.151 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 4.65e-01 -0.118 0.161 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0144 0.168 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 2.93e-01 0.178 0.169 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 4.11e-01 0.072 0.0874 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 9.81e-01 0.00386 0.158 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0356 0.14 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0168 0.133 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 9.81e-01 0.00357 0.154 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 8.48e-01 0.0262 0.137 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.10e-01 -0.225 0.179 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 8.67e-01 -0.028 0.166 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 3.95e-01 -0.147 0.173 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 5.06e-01 -0.109 0.164 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 2.58e-01 0.108 0.0952 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 6.03e-01 -0.084 0.161 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 4.70e-01 -0.112 0.154 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00708 0.131 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 3.62e-01 -0.147 0.161 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 8.94e-01 0.0212 0.159 0.089 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 3.93e-02 -0.287 0.137 0.089 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 1.78e-02 -0.421 0.175 0.089 PB L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 8.33e-01 0.0351 0.166 0.089 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 5.64e-01 -0.101 0.175 0.089 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 7.00e-02 0.375 0.205 0.089 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 3.35e-01 0.102 0.106 0.076 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 734783 sc-eQTL 9.64e-02 -0.197 0.118 0.076 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 1.41e-01 -0.206 0.139 0.076 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0401 0.169 0.076 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 9.20e-01 0.0107 0.107 0.076 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 1.99e-01 0.199 0.154 0.076 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 36364 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0304 0.125 0.076 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00647 0.113 0.077 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 4.04e-01 -0.12 0.143 0.077 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 8.88e-01 0.0184 0.13 0.077 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 3.92e-01 -0.125 0.146 0.077 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 7.39e-01 0.0502 0.151 0.077 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 3.98e-02 0.344 0.166 0.077 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 8.80e-01 0.022 0.146 0.078 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 4.64e-01 -0.111 0.151 0.078 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 3.72e-01 -0.116 0.129 0.078 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 2.69e-01 -0.189 0.171 0.078 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 3.73e-01 0.128 0.143 0.078 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 3.66e-01 -0.158 0.174 0.078 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 4.04e-01 0.123 0.147 0.078 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 6.30e-01 0.0588 0.122 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 6.78e-01 0.0554 0.133 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 3.22e-01 -0.142 0.144 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0496 0.111 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 5.46e-01 0.0691 0.114 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 2.73e-01 -0.173 0.157 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0448 0.147 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00116 0.138 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 7.66e-02 -0.274 0.154 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0341 0.155 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 3.94e-01 -0.108 0.126 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 6.21e-01 0.0617 0.125 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 3.10e-01 0.171 0.168 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 8.96e-01 0.0207 0.158 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 4.52e-01 -0.107 0.142 0.073 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 734783 sc-eQTL 1.96e-01 0.21 0.162 0.073 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 3.19e-01 0.212 0.211 0.073 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 2.13e-01 -0.244 0.195 0.073 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 2.80e-02 -0.414 0.186 0.073 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 2.50e-01 -0.24 0.208 0.073 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 36364 sc-eQTL 8.12e-01 0.0436 0.183 0.073 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0629 0.16 0.08 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 4.82e-01 0.114 0.161 0.08 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.40e-01 -0.195 0.165 0.08 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 1.55e-01 0.21 0.147 0.08 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0565 0.158 0.08 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 4.71e-01 -0.118 0.164 0.08 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 4.47e-01 -0.126 0.165 0.08 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 1.04e-01 0.2 0.123 0.081 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0709 0.138 0.081 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 2.83e-01 -0.165 0.153 0.081 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 6.44e-01 -0.061 0.132 0.081 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 4.21e-01 0.109 0.135 0.081 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 1.77e-01 -0.193 0.143 0.081 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 3.11e-01 0.165 0.163 0.081 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 9.30e-01 -0.015 0.17 0.073 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0573 0.143 0.073 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 1.58e-01 -0.226 0.159 0.073 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 2.42e-01 -0.23 0.196 0.073 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 2.10e-01 -0.214 0.17 0.073 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0128 0.189 0.073 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00778 0.162 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 8.65e-02 -0.188 0.109 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 1.34e-01 -0.171 0.114 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 1.95e-01 -0.169 0.13 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0384 0.163 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0309 0.127 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 1.68e-01 -0.229 0.165 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 1.40e-01 -0.139 0.0937 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 8.50e-01 0.02 0.106 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 1.77e-01 -0.162 0.12 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 974459 sc-eQTL 7.62e-01 0.0446 0.147 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 3.07e-01 0.124 0.121 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 5.15e-01 -0.104 0.16 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 6.89e-01 0.0442 0.11 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 4.10e-01 -0.11 0.133 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 3.64e-01 -0.133 0.146 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0778 0.106 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 5.29e-01 0.0644 0.102 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 9.71e-01 0.00589 0.16 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0365 0.148 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 6.11e-01 0.0583 0.114 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 529570 sc-eQTL 9.60e-01 0.00685 0.135 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 4.21e-01 -0.121 0.15 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 8.59e-01 0.0197 0.111 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0237 0.115 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 4.31e-01 -0.116 0.147 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 500612 sc-eQTL 7.32e-01 0.0534 0.155 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 125455 sc-eQTL 2.83e-01 0.0881 0.0817 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 482415 sc-eQTL 4.73e-01 -0.102 0.142 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 331560 sc-eQTL 2.29e-01 -0.157 0.13 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 667007 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0923 0.111 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0635 0.139 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 eQTL 4.9e-05 -0.173 0.0424 0.0 0.0 0.077

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -381288 1.25e-06 9.48e-07 2.41e-07 3.77e-07 1.18e-07 3.36e-07 8.73e-07 2.66e-07 9.02e-07 3.05e-07 1.22e-06 5.73e-07 1.47e-06 2.09e-07 4.01e-07 4.53e-07 6.67e-07 5.33e-07 3.3e-07 4.32e-07 2.43e-07 6.91e-07 5.87e-07 3.62e-07 1.72e-06 2.4e-07 5.49e-07 4.29e-07 7.07e-07 9.25e-07 4.53e-07 3.77e-08 1.21e-07 2.33e-07 3.42e-07 3.32e-07 1.84e-07 1.21e-07 8.72e-08 9.61e-09 1.35e-07 1.23e-06 5.65e-08 1.25e-08 1.7e-07 4.48e-08 1.21e-07 5.66e-08 5.84e-08
ENSG00000257715 \N 500612 8.7e-07 5.67e-07 1.05e-07 3.58e-07 1.07e-07 1.71e-07 5.13e-07 9.07e-08 3.62e-07 1.78e-07 5.58e-07 3.36e-07 6.77e-07 1.1e-07 1.51e-07 1.76e-07 1.69e-07 3.67e-07 1.5e-07 1.41e-07 1.65e-07 3.1e-07 3.03e-07 1.25e-07 6.59e-07 2.32e-07 2.22e-07 1.95e-07 2.78e-07 3.93e-07 2.55e-07 7.03e-08 5.58e-08 1.19e-07 2.85e-07 7.98e-08 8.07e-08 6.56e-08 5.98e-08 5.54e-08 4.27e-08 4.42e-07 2.84e-08 1.84e-08 1.27e-07 1.78e-08 9.34e-08 3.04e-09 5.43e-08