logo

Genes within 1Mb (chr12:96511881:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 1.13e-01 0.0747 0.0469 0.536 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 4.41e-01 0.0452 0.0586 0.536 B L1
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 5.95e-01 0.0332 0.0624 0.536 B L1
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 2.27e-03 -0.233 0.0753 0.536 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 5.69e-01 0.0324 0.0567 0.536 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0895 0.0826 0.536 B L1
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0233 0.0379 0.536 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 8.79e-01 0.00795 0.0521 0.536 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0392 0.0564 0.536 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 8.96e-02 0.136 0.08 0.536 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00465 0.0494 0.536 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0211 0.0608 0.536 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0135 0.0389 0.536 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0259 0.0418 0.536 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0521 0.0628 0.536 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 1.78e-01 0.0963 0.0712 0.536 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 4.92e-01 0.0354 0.0515 0.536 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0419 0.0685 0.536 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 7.28e-01 -0.026 0.0746 0.527 DC L1
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0563 0.0848 0.527 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 7.28e-02 0.124 0.0689 0.527 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0313 0.085 0.527 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 9.06e-01 0.00833 0.0707 0.527 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0973 0.0905 0.527 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0431 0.0819 0.527 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 7.08e-01 -0.022 0.0586 0.536 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0207 0.0739 0.536 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 5.33e-01 0.0521 0.0834 0.536 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0039 0.056 0.536 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0657 0.0526 0.536 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00525 0.0811 0.536 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 5.55e-01 0.0465 0.0786 0.536 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 1.26e-01 0.0672 0.0437 0.536 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00977 0.0746 0.536 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 3.40e-01 0.0676 0.0706 0.536 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 5.09e-01 0.0388 0.0586 0.536 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 8.39e-01 0.0151 0.0743 0.536 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 6.01e-02 0.0699 0.037 0.536 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 720729 sc-eQTL 5.41e-02 -0.132 0.0683 0.536 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0496 0.0778 0.536 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0722 0.0606 0.536 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0098 0.0565 0.536 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 1.89e-01 -0.113 0.0857 0.536 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 22310 sc-eQTL 6.69e-01 0.0381 0.0891 0.536 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 4.15e-01 0.0706 0.0863 0.526 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 5.01e-02 0.191 0.0969 0.526 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 2.46e-01 0.12 0.103 0.526 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 1.18e-01 0.124 0.0791 0.526 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 5.15e-01 0.0637 0.0977 0.526 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 3.01e-01 -0.106 0.102 0.526 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 8.60e-02 0.124 0.0717 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 3.39e-01 0.0669 0.0698 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 1.20e-01 -0.122 0.0784 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 1.58e-02 -0.223 0.0917 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 5.25e-01 -0.05 0.0785 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0916 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 8.57e-01 0.0127 0.0707 0.539 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 5.92e-01 0.0437 0.0816 0.539 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 8.58e-02 0.138 0.0797 0.539 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 1.50e-01 -0.127 0.0876 0.539 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 1.45e-01 -0.124 0.0846 0.539 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 2.46e-01 0.109 0.0938 0.539 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 5.22e-01 0.0373 0.0581 0.536 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0155 0.0609 0.536 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 1.74e-01 0.0978 0.0717 0.536 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 6.57e-03 -0.244 0.089 0.536 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 7.39e-02 0.125 0.0696 0.536 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 5.20e-01 0.0579 0.0898 0.536 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 8.65e-02 0.128 0.0743 0.536 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 4.97e-01 0.0482 0.0709 0.536 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 6.70e-01 0.0357 0.0836 0.536 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0375 0.0903 0.536 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 1.72e-01 0.113 0.0827 0.536 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 2.42e-02 -0.222 0.0976 0.536 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 4.22e-01 0.0548 0.068 0.539 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 1.53e-01 -0.137 0.0956 0.539 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0574 0.0972 0.539 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 8.83e-01 0.0114 0.0776 0.539 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 9.37e-01 0.00667 0.0846 0.539 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0684 0.0977 0.539 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0335 0.0415 0.536 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0092 0.0601 0.536 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0735 0.0599 0.536 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 1.08e-01 0.135 0.0838 0.536 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0165 0.0534 0.536 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 3.62e-01 -0.06 0.0657 0.536 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00545 0.0408 0.536 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00025 0.0692 0.536 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0221 0.0681 0.536 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 2.63e-01 0.105 0.0938 0.536 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 5.52e-01 0.0333 0.0558 0.536 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 2.24e-01 0.0927 0.076 0.536 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 1.40e-02 0.122 0.0493 0.536 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 8.39e-01 0.0157 0.0772 0.536 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 8.20e-01 0.0164 0.0718 0.536 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 4.60e-01 0.0652 0.0882 0.536 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0988 0.0749 0.536 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0403 0.0891 0.536 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 6.85e-02 0.0886 0.0484 0.536 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 4.41e-01 0.0678 0.0879 0.536 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 5.05e-01 0.0535 0.0801 0.536 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 6.58e-01 0.0395 0.0893 0.536 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0185 0.0737 0.536 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0184 0.0826 0.536 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0619 0.0583 0.536 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0194 0.07 0.536 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0255 0.074 0.536 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 2.80e-01 0.0841 0.0776 0.536 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 8.97e-01 0.00861 0.0666 0.536 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0327 0.0792 0.536 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 1.93e-01 0.0828 0.0634 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00749 0.0935 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0124 0.0792 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 5.92e-01 -0.046 0.0857 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 1.52e-01 0.13 0.0907 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0989 0.089 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 4.47e-01 0.0613 0.0805 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0528 0.0986 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0404 0.097 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 9.78e-01 0.00231 0.0826 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 8.92e-01 0.0123 0.0902 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0722 0.0977 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0109 0.0533 0.535 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 720729 sc-eQTL 1.52e-01 -0.103 0.0715 0.535 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0874 0.0822 0.535 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0831 0.0689 0.535 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 7.09e-02 -0.144 0.0795 0.535 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0695 0.0898 0.535 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 22310 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000782 0.0892 0.535 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 1.30e-03 0.179 0.0548 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0186 0.0832 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0424 0.0882 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 2.56e-01 0.105 0.092 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 3.41e-01 0.0887 0.0929 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 2.65e-01 0.0535 0.0478 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 6.74e-01 0.0365 0.0866 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 4.21e-01 0.0618 0.0766 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 9.45e-02 -0.122 0.0725 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0252 0.084 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0326 0.0763 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0778 0.0999 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0401 0.0928 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 8.08e-02 0.168 0.096 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 4.38e-01 0.0711 0.0914 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 7.09e-01 0.0197 0.0526 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0267 0.0889 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 7.99e-01 0.0217 0.0851 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 4.38e-01 0.056 0.072 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 3.43e-01 0.0845 0.0889 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 8.57e-01 0.0179 0.0991 0.537 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 9.74e-01 0.00286 0.0874 0.537 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 2.10e-01 0.14 0.111 0.537 PB L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 2.98e-01 0.108 0.103 0.537 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0972 0.109 0.537 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 1.97e-01 -0.167 0.129 0.537 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 8.66e-01 0.00985 0.0584 0.533 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 720729 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0693 0.0655 0.533 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 2.08e-01 0.0971 0.0769 0.533 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0623 0.0933 0.533 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0118 0.0589 0.533 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 5.30e-01 0.0537 0.0854 0.533 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 22310 sc-eQTL 4.66e-01 0.0505 0.0691 0.533 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0246 0.0634 0.536 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 5.26e-01 0.051 0.0802 0.536 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0438 0.0727 0.536 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 2.00e-01 0.105 0.0814 0.536 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 1.38e-01 0.125 0.0838 0.536 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 9.27e-01 0.00861 0.094 0.536 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 4.33e-01 0.063 0.0802 0.527 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00956 0.0835 0.527 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 3.35e-02 0.151 0.0707 0.527 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 2.08e-01 -0.119 0.094 0.527 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 4.35e-01 0.0617 0.0789 0.527 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 8.59e-01 0.0171 0.0963 0.527 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0299 0.0812 0.527 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0831 0.068 0.536 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0862 0.0742 0.536 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 2.76e-01 0.0876 0.0802 0.536 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0931 0.0616 0.536 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0478 0.0638 0.536 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0669 0.0879 0.536 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 4.52e-01 0.0619 0.082 0.536 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0595 0.0771 0.536 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 1.44e-01 0.126 0.0862 0.536 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 8.00e-01 0.0219 0.0865 0.536 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 2.48e-01 0.0813 0.0703 0.536 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0296 0.0696 0.536 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 9.37e-01 0.00745 0.094 0.536 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 6.87e-01 0.0358 0.0885 0.536 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 1.70e-01 0.108 0.0779 0.524 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 720729 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0195 0.09 0.524 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 3.49e-01 -0.11 0.117 0.524 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00208 0.109 0.524 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 9.72e-02 0.173 0.104 0.524 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0443 0.116 0.524 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 22310 sc-eQTL 2.71e-01 0.112 0.101 0.524 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 1.77e-01 -0.118 0.0871 0.527 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0182 0.0884 0.527 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 6.93e-01 0.0358 0.0907 0.527 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 5.21e-01 0.0518 0.0807 0.527 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 5.79e-01 -0.048 0.0863 0.527 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0253 0.0897 0.527 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 1.33e-01 0.135 0.0897 0.527 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0236 0.0706 0.52 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0929 0.0786 0.52 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 9.85e-01 0.00162 0.0879 0.52 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 2.59e-01 0.0851 0.0753 0.52 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 7.65e-02 -0.136 0.0765 0.52 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 1.51e-01 0.118 0.0815 0.52 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0977 0.0932 0.52 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 2.38e-01 -0.109 0.0922 0.534 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 7.66e-01 0.0234 0.0782 0.534 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 1.42e-02 0.213 0.0858 0.534 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 7.64e-01 0.0322 0.107 0.534 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 6.53e-01 0.0421 0.0934 0.534 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0863 0.103 0.534 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 8.20e-01 0.0201 0.0884 0.534 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 1.13e-01 0.0971 0.061 0.536 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 3.11e-01 0.0645 0.0635 0.536 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00176 0.0728 0.536 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 3.55e-02 -0.19 0.0898 0.536 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0706 0.0704 0.536 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 1.23e-01 0.142 0.092 0.536 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 2.57e-01 0.0592 0.0521 0.536 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 7.13e-01 0.0216 0.0587 0.536 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 4.65e-01 0.0488 0.0667 0.536 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 960405 sc-eQTL 1.51e-02 -0.197 0.0806 0.536 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 1.09e-01 0.108 0.0669 0.536 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0888 0.0888 0.536 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0796 0.0613 0.536 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00675 0.0745 0.536 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 3.63e-01 0.0745 0.0817 0.536 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0145 0.0591 0.536 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0515 0.0569 0.536 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0543 0.0894 0.536 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 4.04e-01 0.0692 0.0828 0.536 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 2.08e-01 -0.08 0.0634 0.534 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 515516 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0684 0.0751 0.534 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 9.15e-01 0.00896 0.0834 0.534 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 7.42e-01 0.0204 0.0617 0.534 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0778 0.0634 0.534 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 7.33e-01 0.0279 0.0816 0.534 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 486558 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0246 0.0864 0.534 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 111401 sc-eQTL 5.22e-01 0.0287 0.0448 0.539 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 468361 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0131 0.078 0.539 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 317506 sc-eQTL 3.86e-01 0.0619 0.0712 0.539 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 652953 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0148 0.061 0.539 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 sc-eQTL 8.65e-01 0.0129 0.0761 0.539 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 652953 eQTL 0.0224 0.0207 0.00906 0.00129 0.0 0.457
ENSG00000139350 NEDD1 -395342 eQTL 0.0445 -0.0488 0.0243 0.0 0.0 0.457
ENSG00000188596 CFAP54 22306 eQTL 0.00633 -0.0553 0.0202 0.0 0.0 0.457

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000188596 CFAP54 22306 1.51e-05 1.71e-05 3.99e-06 1.13e-05 3.8e-06 8.91e-06 2.5e-05 3.5e-06 1.74e-05 9.01e-06 2.31e-05 8.69e-06 3.35e-05 7.61e-06 5.23e-06 1.09e-05 1.02e-05 1.66e-05 6.32e-06 5.36e-06 9.62e-06 1.84e-05 1.85e-05 7.87e-06 3e-05 5.72e-06 8.05e-06 8.12e-06 2.12e-05 2.4e-05 1.23e-05 1.58e-06 2.48e-06 6.67e-06 8.5e-06 5.31e-06 3.11e-06 2.98e-06 4.54e-06 3.35e-06 1.81e-06 2.31e-05 2.7e-06 4.11e-07 2.13e-06 2.97e-06 3.33e-06 1.49e-06 1.53e-06