logo

Genes within 1Mb (chr12:96476518:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 1.93e-03 -0.153 0.0486 0.269 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 8.11e-01 0.0148 0.0617 0.269 B L1
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0994 0.0654 0.269 B L1
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 3.72e-01 0.0724 0.0809 0.269 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0563 0.0596 0.269 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0263 0.0872 0.269 B L1
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0645 0.0403 0.269 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0388 0.0557 0.269 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 2.65e-01 0.0673 0.0602 0.269 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0436 0.0861 0.269 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0452 0.0527 0.269 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 1.77e-01 0.0877 0.0647 0.269 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0582 0.0416 0.269 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 4.23e-01 0.0359 0.0448 0.269 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 1.38e-01 0.1 0.0671 0.269 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0433 0.0767 0.269 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 6.45e-01 0.0255 0.0553 0.269 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 2.48e-01 0.0848 0.0733 0.269 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0799 0.0763 0.273 DC L1
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 9.46e-01 0.00591 0.0871 0.273 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 1.39e-01 -0.105 0.0708 0.273 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0917 0.087 0.273 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 7.27e-01 0.0254 0.0725 0.273 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 4.34e-01 0.0729 0.093 0.273 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0615 0.0839 0.273 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00831 0.0628 0.269 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0479 0.0791 0.269 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 6.07e-01 0.046 0.0893 0.269 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0343 0.06 0.269 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 7.23e-02 0.101 0.0561 0.269 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 6.72e-02 -0.159 0.0862 0.269 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 7.93e-01 0.0221 0.0842 0.269 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0088 0.0461 0.268 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 5.06e-01 -0.052 0.0782 0.268 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 1.13e-01 -0.117 0.0738 0.268 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0577 0.0614 0.268 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 8.78e-02 -0.133 0.0774 0.268 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0528 0.0393 0.269 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 685366 sc-eQTL 3.27e-01 0.0716 0.0728 0.269 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 4.03e-01 0.069 0.0823 0.269 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 2.58e-01 0.0728 0.0641 0.269 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 7.49e-01 0.0192 0.0598 0.269 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 1.69e-01 0.125 0.0906 0.269 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -13053 sc-eQTL 6.30e-01 0.0455 0.0942 0.269 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0556 0.0894 0.273 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 3.39e-01 -0.097 0.101 0.273 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 8.53e-01 0.0199 0.107 0.273 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 5.28e-01 0.0521 0.0823 0.273 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0247 0.101 0.273 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 5.28e-01 0.0668 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 2.03e-02 -0.177 0.0755 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0653 0.074 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 8.05e-01 0.0206 0.0836 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 3.90e-01 0.0847 0.0983 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 7.41e-01 0.0275 0.0832 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 1.80e-01 -0.131 0.0971 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 8.70e-01 -0.012 0.0737 0.272 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 6.61e-02 -0.156 0.0844 0.272 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 2.21e-01 -0.102 0.0834 0.272 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0119 0.0918 0.272 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 2.63e-01 0.0993 0.0884 0.272 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 4.94e-01 0.0671 0.098 0.272 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 2.18e-02 -0.139 0.0602 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 4.79e-01 0.0452 0.0638 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 2.25e-02 -0.171 0.0746 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 1.96e-01 0.123 0.0945 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 1.71e-01 -0.1 0.0731 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0477 0.0941 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 4.03e-02 -0.158 0.0765 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0245 0.0732 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 2.03e-01 -0.11 0.086 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0054 0.0932 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0625 0.0856 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0109 0.102 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 6.13e-02 -0.134 0.071 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 3.89e-01 0.087 0.101 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 2.57e-01 0.116 0.102 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 4.54e-01 0.0611 0.0815 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0813 0.0887 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0932 0.103 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0618 0.0445 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0493 0.0646 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 1.46e-01 0.0939 0.0644 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0444 0.0906 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 8.71e-01 -0.00937 0.0575 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 1.50e-01 0.102 0.0704 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0538 0.0433 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0429 0.0737 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 3.79e-02 0.15 0.0719 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0764 0.1 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 8.36e-02 -0.103 0.0591 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0241 0.0814 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 1.74e-02 -0.126 0.0526 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000159 0.0823 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0434 0.0764 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00197 0.0941 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0192 0.08 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 7.87e-01 0.0257 0.0949 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0752 0.0517 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 8.16e-01 0.0219 0.0938 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 3.28e-01 0.0835 0.0852 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 8.66e-01 -0.016 0.0952 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 2.95e-01 0.0822 0.0783 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0585 0.088 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0167 0.0621 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 7.09e-01 0.0278 0.0744 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 4.02e-01 0.0659 0.0786 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0247 0.0826 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 9.43e-01 0.00507 0.0707 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 3.78e-02 0.174 0.0834 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0512 0.0677 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 7.21e-02 -0.179 0.0988 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 7.14e-01 0.031 0.0843 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000178 0.0914 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 4.11e-01 -0.08 0.097 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 6.55e-02 0.175 0.0943 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 1.82e-01 -0.112 0.0834 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 6.32e-01 0.0491 0.103 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 4.21e-01 0.0811 0.101 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0283 0.0859 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 4.84e-01 0.0656 0.0936 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 1.29e-01 0.154 0.101 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0262 0.0557 0.271 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 685366 sc-eQTL 6.51e-01 0.0341 0.0751 0.271 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 5.99e-01 0.0454 0.0861 0.271 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 4.77e-01 0.0515 0.0722 0.271 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 3.51e-01 0.0782 0.0836 0.271 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 3.18e-02 0.201 0.093 0.271 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -13053 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0313 0.0932 0.271 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 5.60e-02 -0.111 0.058 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 8.64e-01 0.0148 0.0866 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 4.53e-01 -0.069 0.0917 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0485 0.096 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0742 0.0968 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0516 0.0496 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0589 0.0898 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 2.02e-01 -0.101 0.0792 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 3.77e-01 0.0669 0.0756 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 5.81e-02 -0.165 0.0865 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 2.20e-01 0.097 0.0789 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 2.85e-01 0.111 0.104 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0265 0.0964 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 5.25e-02 -0.194 0.0995 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0909 0.0948 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 6.14e-01 0.0275 0.0544 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 4.97e-01 0.0625 0.092 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0524 0.0881 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0786 0.0745 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0585 0.0922 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 2.41e-01 -0.116 0.0983 0.27 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0336 0.0872 0.27 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 3.23e-02 -0.237 0.11 0.27 PB L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0914 0.103 0.27 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 6.84e-01 0.0445 0.109 0.27 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 3.02e-01 0.134 0.129 0.27 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 7.48e-01 -0.02 0.0622 0.272 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 685366 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0604 0.0697 0.272 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0133 0.0821 0.272 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 3.27e-01 0.0973 0.0991 0.272 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 7.56e-01 0.0194 0.0626 0.272 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 8.07e-01 0.0223 0.0909 0.272 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -13053 sc-eQTL 6.15e-01 -0.037 0.0735 0.272 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 9.06e-01 0.00787 0.0669 0.269 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0857 0.0845 0.269 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 9.10e-01 0.00864 0.0767 0.269 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0113 0.0861 0.269 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 7.79e-01 -0.025 0.0888 0.269 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 2.91e-01 0.105 0.0989 0.269 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 2.15e-01 -0.102 0.0821 0.276 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 6.09e-01 0.0438 0.0856 0.276 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0716 0.0732 0.276 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 7.30e-01 0.0335 0.0969 0.276 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0281 0.0811 0.276 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0112 0.0988 0.276 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0216 0.0833 0.276 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 8.39e-01 0.0148 0.0727 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 7.03e-01 0.0303 0.0793 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 7.58e-01 0.0264 0.0856 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 7.77e-01 0.0187 0.066 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 2.27e-01 0.0823 0.0678 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 2.02e-01 -0.119 0.0934 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0271 0.0875 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0244 0.0819 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 2.68e-01 -0.102 0.0917 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 4.45e-01 0.0702 0.0918 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0657 0.0747 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 9.56e-01 0.00404 0.074 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0959 0.0996 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0242 0.094 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0741 0.0777 0.273 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 685366 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0239 0.0894 0.273 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 2.25e-02 0.264 0.114 0.273 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 6.33e-01 0.0516 0.108 0.273 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 9.04e-02 -0.176 0.103 0.273 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 1.00e-01 0.189 0.114 0.273 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -13053 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00521 0.101 0.273 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 6.12e-01 0.0477 0.0939 0.273 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 6.32e-01 0.0456 0.0949 0.273 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 9.65e-01 0.00427 0.0974 0.273 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 8.11e-01 0.0208 0.0868 0.273 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 2.35e-01 -0.11 0.0924 0.273 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0621 0.0963 0.273 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 1.72e-01 -0.132 0.0965 0.273 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 5.08e-01 0.0489 0.0737 0.276 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 9.03e-01 -0.01 0.0823 0.276 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 4.49e-01 0.0696 0.0917 0.276 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 1.92e-01 -0.103 0.0785 0.276 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 3.05e-02 0.173 0.0796 0.276 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 1.76e-01 -0.115 0.0851 0.276 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 8.78e-02 0.166 0.0968 0.276 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0638 0.0961 0.271 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0403 0.0812 0.271 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 9.83e-02 -0.15 0.0901 0.271 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 1.92e-01 -0.145 0.111 0.271 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0799 0.0968 0.271 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0332 0.107 0.271 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0222 0.0918 0.271 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 2.46e-02 -0.143 0.0631 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0771 0.0662 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0163 0.0758 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00117 0.0945 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0142 0.0735 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 9.09e-01 0.011 0.0964 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 5.43e-03 -0.15 0.0535 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 6.25e-01 0.0299 0.0612 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 2.68e-02 -0.154 0.0689 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 925042 sc-eQTL 3.71e-01 0.0763 0.0851 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0729 0.07 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0383 0.0929 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00802 0.0656 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0378 0.0794 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 7.31e-01 0.03 0.0872 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0175 0.063 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 1.12e-01 0.0965 0.0604 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 2.43e-01 -0.111 0.095 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00417 0.0883 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 4.33e-01 0.0537 0.0683 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 480153 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00484 0.0809 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 6.78e-01 0.0373 0.0897 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0558 0.0663 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 7.55e-01 0.0214 0.0684 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 1.81e-01 -0.117 0.0874 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 451195 sc-eQTL 5.38e-01 0.0573 0.0928 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 76038 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0118 0.0466 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 432998 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0249 0.081 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 282143 sc-eQTL 9.20e-02 -0.125 0.0737 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 617590 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0441 0.0634 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 sc-eQTL 1.21e-01 -0.123 0.0787 0.267 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000084110 HAL 480153 eQTL 0.00351 -0.0444 0.0152 0.0 0.0 0.25
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 eQTL 1.56e-09 -0.158 0.0259 0.0 0.0 0.25
ENSG00000188596 CFAP54 -13057 eQTL 0.0295 -0.048 0.022 0.0 0.0 0.25

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -430705 1.28e-06 1.07e-06 2.28e-07 1.17e-06 3.51e-07 6.05e-07 1.48e-06 3.49e-07 1.48e-06 5.19e-07 1.74e-06 7.5e-07 2.41e-06 2.95e-07 5.34e-07 9.24e-07 8.3e-07 8.27e-07 8.26e-07 6.87e-07 5.61e-07 1.56e-06 1.05e-06 6.54e-07 2.25e-06 3.91e-07 9.62e-07 7.22e-07 1.45e-06 1.24e-06 7.03e-07 1.85e-07 2.29e-07 6.95e-07 5.6e-07 4.34e-07 4.92e-07 1.61e-07 3.87e-07 2.88e-07 2.76e-07 1.68e-06 3.37e-07 7.3e-08 2.1e-07 2.11e-07 2.22e-07 8.37e-08 1.69e-07