logo

Genes within 1Mb (chr12:96472725:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0923 0.0917 0.071 B L1
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 7.56e-01 0.0404 0.13 0.071 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 4.13e-01 0.0936 0.114 0.071 B L1
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 5.05e-01 -0.081 0.121 0.071 B L1
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 4.27e-01 -0.119 0.15 0.071 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 2.56e-01 -0.125 0.11 0.071 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 7.27e-01 0.0563 0.161 0.071 B L1
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 4.94e-01 0.0511 0.0746 0.071 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0884 0.104 0.071 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0602 0.102 0.071 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 7.01e-01 0.0427 0.111 0.071 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 9.65e-01 0.00693 0.158 0.071 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0204 0.0971 0.071 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 2.84e-01 -0.128 0.119 0.071 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 4.06e-01 0.0639 0.0767 0.071 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0764 0.124 0.071 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 6.48e-01 0.0377 0.0825 0.071 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 5.96e-01 -0.066 0.124 0.071 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 9.47e-01 0.00946 0.141 0.071 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 2.98e-01 0.106 0.101 0.071 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0411 0.135 0.071 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 6.60e-01 0.0627 0.142 0.072 DC L1
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 4.08e-02 0.33 0.16 0.072 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00116 0.178 0.072 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 7.53e-01 0.0417 0.132 0.072 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0242 0.162 0.072 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 4.15e-01 0.11 0.135 0.072 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0861 0.173 0.072 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0533 0.156 0.072 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 1.73e-01 -0.158 0.116 0.071 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 9.72e-02 0.242 0.145 0.071 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0646 0.126 0.071 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 2.29e-03 0.499 0.162 0.071 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0909 0.111 0.071 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 4.57e-01 0.0778 0.104 0.071 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 7.35e-02 -0.287 0.159 0.071 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 6.06e-03 0.424 0.153 0.071 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 9.90e-01 0.0011 0.0864 0.071 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 3.39e-01 0.122 0.128 0.071 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0289 0.147 0.071 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0584 0.139 0.071 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 7.93e-02 0.202 0.115 0.071 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 3.57e-01 -0.135 0.146 0.071 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0835 0.0726 0.071 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 681573 sc-eQTL 3.76e-01 0.119 0.134 0.071 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0391 0.139 0.071 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 4.33e-01 0.119 0.152 0.071 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 1.57e-01 0.168 0.118 0.071 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 6.78e-01 0.0459 0.11 0.071 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 8.40e-01 -0.034 0.168 0.071 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -16846 sc-eQTL 1.75e-01 0.236 0.173 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 7.70e-01 0.0471 0.161 0.071 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 2.46e-01 -0.235 0.202 0.071 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 8.08e-01 0.0444 0.182 0.071 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0237 0.193 0.071 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0704 0.148 0.071 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0509 0.182 0.071 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 5.80e-01 0.106 0.19 0.071 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 6.35e-01 0.0668 0.141 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000341 0.162 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 1.13e-01 0.216 0.136 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 4.79e-01 0.109 0.154 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 3.22e-01 -0.18 0.181 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 2.16e-01 0.189 0.153 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 4.68e-01 0.13 0.179 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0478 0.137 0.071 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 8.64e-01 0.0305 0.178 0.071 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0819 0.158 0.071 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 3.80e-01 -0.136 0.155 0.071 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 2.11e-01 -0.213 0.17 0.071 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 1.47e-01 0.238 0.164 0.071 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 6.74e-01 0.0766 0.182 0.071 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0662 0.115 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0325 0.149 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 7.73e-02 0.212 0.12 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 1.20e-01 -0.221 0.142 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0128 0.179 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 1.71e-01 -0.189 0.138 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 1.53e-01 -0.254 0.177 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 3.21e-01 -0.144 0.144 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 7.42e-01 0.0576 0.175 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 4.76e-01 0.0978 0.137 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 3.93e-01 0.138 0.161 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0594 0.175 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 8.85e-02 -0.273 0.159 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 5.65e-01 0.11 0.191 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0875 0.135 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0244 0.193 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 9.99e-02 0.312 0.189 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 3.58e-01 0.177 0.192 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 4.94e-01 0.105 0.154 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 4.06e-01 0.139 0.167 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 1.68e-01 -0.267 0.193 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 7.41e-01 0.0272 0.082 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0475 0.118 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 7.68e-01 0.035 0.119 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 7.16e-01 0.0432 0.119 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0138 0.166 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00286 0.105 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0524 0.13 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 2.85e-01 0.0863 0.0804 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 3.41e-01 -0.131 0.137 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 4.27e-01 -0.109 0.137 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 2.66e-01 0.15 0.134 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 5.09e-01 -0.123 0.186 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 2.92e-01 -0.116 0.11 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0354 0.151 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0865 0.0986 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 7.02e-01 0.0633 0.165 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0961 0.152 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 4.32e-01 -0.111 0.142 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 4.77e-01 -0.124 0.174 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 3.08e-01 0.151 0.148 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 5.77e-02 -0.333 0.175 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0697 0.0964 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 8.48e-01 -0.032 0.167 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 3.76e-01 -0.154 0.174 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 4.45e-01 -0.121 0.159 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 6.04e-01 0.0919 0.177 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 5.23e-01 0.0933 0.146 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 3.09e-01 -0.166 0.163 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 5.66e-01 0.0661 0.115 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0907 0.153 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 7.95e-01 0.0359 0.138 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 6.57e-01 0.0649 0.146 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 2.98e-01 0.159 0.153 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 2.97e-01 0.137 0.131 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00312 0.156 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 6.84e-01 0.0514 0.126 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 6.31e-03 -0.51 0.185 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 6.42e-01 0.0863 0.185 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 6.21e-02 -0.292 0.156 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 1.31e-01 -0.256 0.169 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 2.17e-01 -0.223 0.18 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 1.72e-01 0.241 0.176 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 5.63e-01 0.0888 0.153 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 8.83e-01 0.0264 0.18 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 5.27e-01 0.119 0.187 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0106 0.184 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 7.38e-01 0.0526 0.157 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 4.67e-01 0.125 0.171 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 7.83e-01 0.0513 0.186 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0472 0.105 0.071 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 681573 sc-eQTL 9.38e-01 0.0109 0.141 0.071 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 4.73e-01 -0.128 0.178 0.071 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 2.34e-01 0.193 0.162 0.071 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 3.53e-01 0.126 0.136 0.071 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 3.75e-02 0.327 0.156 0.071 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 5.70e-01 -0.101 0.177 0.071 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -16846 sc-eQTL 4.55e-02 0.35 0.174 0.071 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 9.72e-01 0.00376 0.108 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0838 0.183 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 4.74e-01 0.115 0.16 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 8.04e-01 0.0422 0.17 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 1.09e-01 0.284 0.177 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 4.93e-01 -0.123 0.179 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 5.30e-01 -0.058 0.0922 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 2.49e-01 0.187 0.161 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 2.64e-01 -0.186 0.166 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0799 0.148 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 6.67e-02 0.257 0.139 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 1.34e-01 -0.242 0.161 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 5.45e-01 0.0907 0.149 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 1.08e-01 0.302 0.187 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 1.17e-01 0.306 0.195 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 4.98e-01 0.123 0.182 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 3.27e-01 -0.186 0.189 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 5.29e-01 -0.113 0.179 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0517 0.102 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 2.64e-01 0.19 0.169 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 7.04e-01 0.0658 0.173 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 1.62e-01 -0.231 0.165 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 1.19e-01 0.218 0.139 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 5.49e-01 -0.104 0.173 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 4.67e-02 -0.359 0.178 0.078 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 4.82e-01 0.15 0.212 0.078 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 1.44e-01 0.233 0.159 0.078 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 8.60e-01 0.0363 0.205 0.078 PB L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 7.23e-02 -0.34 0.187 0.078 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 5.79e-01 0.111 0.2 0.078 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 8.81e-01 0.0357 0.238 0.078 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0137 0.117 0.072 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 681573 sc-eQTL 3.26e-01 0.129 0.131 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 1.80e-01 -0.207 0.154 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 3.26e-01 0.151 0.154 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 4.57e-01 0.139 0.186 0.072 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 8.77e-01 0.0182 0.117 0.072 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 4.22e-01 -0.137 0.17 0.072 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -16846 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0525 0.138 0.072 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 3.49e-01 0.116 0.124 0.071 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 5.52e-01 -0.1 0.169 0.071 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 7.84e-02 -0.276 0.156 0.071 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 9.00e-02 0.241 0.141 0.071 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 5.28e-01 -0.101 0.16 0.071 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00998 0.165 0.071 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 3.92e-01 -0.157 0.184 0.071 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0499 0.153 0.071 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 3.23e-01 0.157 0.159 0.071 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 1.83e-01 0.256 0.191 0.071 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0106 0.136 0.071 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 1.40e-01 0.265 0.179 0.071 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0943 0.151 0.071 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 3.07e-01 -0.188 0.183 0.071 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 8.25e-01 0.0342 0.155 0.071 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 2.22e-01 -0.164 0.134 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 9.87e-02 0.241 0.145 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 3.00e-01 -0.157 0.151 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 2.03e-03 0.483 0.155 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 9.70e-01 0.00456 0.122 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 7.39e-01 0.0419 0.126 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 1.93e-01 -0.225 0.172 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 1.76e-02 0.381 0.159 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0984 0.152 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 2.35e-01 0.202 0.17 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 1.40e-01 0.255 0.172 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 1.48e-02 0.413 0.168 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 4.70e-01 -0.1 0.139 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 4.21e-01 -0.111 0.137 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 2.08e-01 -0.233 0.185 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 1.61e-01 0.244 0.174 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 8.85e-01 0.0217 0.15 0.07 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 681573 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0167 0.172 0.07 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 9.69e-03 0.551 0.21 0.07 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 2.82e-01 0.242 0.224 0.07 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 7.31e-01 0.0715 0.208 0.07 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 1.67e-01 0.276 0.199 0.07 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 5.22e-03 0.611 0.215 0.07 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -16846 sc-eQTL 7.86e-01 0.0528 0.194 0.07 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0119 0.169 0.073 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 1.78e-01 0.23 0.17 0.073 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 1.16e-01 -0.304 0.192 0.073 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 3.13e-02 0.376 0.173 0.073 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 2.51e-01 -0.179 0.156 0.073 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 4.02e-01 0.14 0.167 0.073 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 4.19e-01 -0.14 0.173 0.073 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 9.72e-01 0.00622 0.175 0.073 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0562 0.137 0.07 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 6.55e-01 0.0682 0.153 0.07 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 4.68e-02 0.366 0.183 0.07 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 4.27e-03 0.482 0.167 0.07 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 7.91e-02 -0.256 0.145 0.07 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 7.38e-02 0.266 0.148 0.07 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 3.48e-01 -0.149 0.158 0.07 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 1.30e-02 0.447 0.178 0.07 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0294 0.182 0.065 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 8.25e-02 0.266 0.152 0.065 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00364 0.207 0.065 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0934 0.172 0.065 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0792 0.21 0.065 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 2.29e-01 0.22 0.183 0.065 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0379 0.202 0.065 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0279 0.174 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 9.20e-01 0.0118 0.118 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00735 0.164 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 2.32e-01 0.146 0.122 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 9.59e-01 0.00726 0.14 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 1.88e-01 -0.23 0.174 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 3.32e-01 0.132 0.136 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 2.69e-01 0.197 0.178 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0829 0.103 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0595 0.14 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 6.13e-02 0.217 0.115 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0501 0.132 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 921249 sc-eQTL 8.95e-01 0.0214 0.162 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 1.13e-01 -0.211 0.133 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 5.51e-01 -0.105 0.176 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 1.42e-01 -0.178 0.12 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 1.32e-01 0.22 0.146 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 9.71e-01 0.00504 0.138 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 4.74e-03 0.451 0.158 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 6.13e-01 -0.059 0.116 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 7.84e-01 0.0308 0.112 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 2.13e-01 -0.219 0.175 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 1.57e-02 0.392 0.161 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0293 0.126 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 476360 sc-eQTL 3.84e-01 0.13 0.149 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 8.90e-01 0.0234 0.169 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 4.73e-03 0.463 0.162 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 1.84e-01 -0.162 0.122 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 1.03e-01 0.205 0.125 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 1.32e-01 -0.243 0.161 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 447402 sc-eQTL 1.41e-01 0.252 0.17 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 72245 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0171 0.0871 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 999205 sc-eQTL 9.01e-02 0.224 0.132 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 429205 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0931 0.151 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 278350 sc-eQTL 3.72e-01 -0.124 0.138 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 613797 sc-eQTL 9.09e-02 0.2 0.118 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 sc-eQTL 2.58e-01 -0.167 0.148 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 72245 eQTL 1.05e-03 -0.0745 0.0227 0.00514 0.00395 0.0658
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 eQTL 8.49e-07 -0.225 0.0455 0.0 0.0 0.0658

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -434498 1.28e-06 1.01e-06 3.31e-07 1.11e-06 2.71e-07 5.92e-07 1.52e-06 3.43e-07 1.41e-06 4.24e-07 1.67e-06 6.63e-07 2.31e-06 2.83e-07 5.31e-07 8.25e-07 8.06e-07 6.58e-07 7.4e-07 6.99e-07 5.47e-07 1.38e-06 9.01e-07 5.86e-07 2.24e-06 4.11e-07 7.97e-07 7.27e-07 1.25e-06 1.29e-06 6.68e-07 2.24e-07 1.99e-07 6.8e-07 5.82e-07 4.4e-07 7.14e-07 1.9e-07 4.04e-07 1.3e-07 2.57e-07 1.68e-06 9.48e-08 4.19e-08 1.7e-07 1.24e-07 2.45e-07 7.69e-08 9.59e-08