logo

Genes within 1Mb (chr12:96471206:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.35e-01 0.0697 0.0464 0.511 B L1
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00483 0.066 0.511 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 4.90e-01 0.0401 0.0579 0.511 B L1
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 5.76e-01 0.0345 0.0617 0.511 B L1
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 5.17e-03 -0.211 0.0747 0.511 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 4.63e-01 0.0411 0.056 0.511 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0707 0.0817 0.511 B L1
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 7.92e-01 -0.00992 0.0376 0.511 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 4.98e-01 0.0356 0.0525 0.511 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 7.57e-01 0.016 0.0517 0.511 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 4.75e-01 -0.04 0.0559 0.511 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 9.80e-02 0.132 0.0794 0.511 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00152 0.049 0.511 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0222 0.0603 0.511 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0267 0.0386 0.511 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 1.31e-01 0.0939 0.062 0.511 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0247 0.0414 0.511 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0849 0.0621 0.511 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 1.91e-01 0.0927 0.0707 0.511 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 6.40e-01 0.0239 0.0511 0.511 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0603 0.0678 0.511 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0231 0.0733 0.505 DC L1
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0492 0.0834 0.505 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 8.07e-01 0.0225 0.092 0.505 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 8.22e-02 0.118 0.0677 0.505 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0215 0.0836 0.505 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 7.68e-01 0.0205 0.0695 0.505 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.05e-01 -0.113 0.0889 0.505 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0327 0.0805 0.505 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0273 0.0584 0.511 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 9.85e-01 0.00139 0.0736 0.511 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00707 0.0636 0.511 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 4.58e-01 0.0617 0.083 0.511 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 9.71e-01 0.002 0.0558 0.511 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 1.10e-01 -0.084 0.0523 0.511 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 6.48e-01 -0.037 0.0807 0.511 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 6.15e-01 0.0394 0.0782 0.511 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 3.04e-01 0.0448 0.0435 0.511 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0335 0.0645 0.511 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 8.21e-01 0.0167 0.074 0.511 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 3.69e-01 0.0631 0.0701 0.511 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 3.89e-01 0.0502 0.0581 0.511 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 6.59e-01 0.0325 0.0737 0.511 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 3.85e-02 0.0754 0.0362 0.511 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 680054 sc-eQTL 1.15e-01 -0.106 0.0672 0.511 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 4.91e-01 0.0481 0.0697 0.511 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0584 0.0763 0.511 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 2.90e-01 -0.063 0.0594 0.511 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00611 0.0554 0.511 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 5.42e-02 -0.162 0.0836 0.511 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -18365 sc-eQTL 6.91e-01 0.0348 0.0873 0.511 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 5.41e-01 0.0531 0.0867 0.5 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 1.17e-01 0.171 0.108 0.5 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 5.10e-02 0.191 0.0972 0.5 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 5.05e-01 0.0694 0.104 0.5 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 4.68e-01 0.058 0.0798 0.5 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 1.84e-01 0.13 0.0976 0.5 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 3.30e-01 -0.1 0.102 0.5 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 8.06e-02 0.125 0.0713 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 5.95e-01 0.0438 0.0824 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 4.46e-01 0.053 0.0695 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 7.84e-02 -0.138 0.0779 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 2.53e-03 -0.277 0.0905 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0449 0.0781 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 3.24e-01 0.0904 0.0913 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0118 0.0697 0.513 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0151 0.0907 0.513 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 6.81e-01 0.0331 0.0805 0.513 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 6.90e-02 0.144 0.0785 0.513 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 1.38e-01 -0.128 0.0864 0.513 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 1.30e-01 -0.127 0.0834 0.513 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.31e-01 0.111 0.0925 0.513 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 6.02e-01 0.03 0.0575 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 4.99e-01 0.0504 0.0744 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0278 0.0602 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 1.58e-01 0.1 0.0709 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 7.36e-02 -0.16 0.0889 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 5.07e-02 0.135 0.0687 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 3.58e-01 0.0817 0.0887 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 5.60e-02 0.14 0.0726 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0517 0.0884 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 5.40e-01 0.0426 0.0694 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 5.76e-01 0.0458 0.0818 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0318 0.0884 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 3.00e-01 0.0842 0.0811 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 6.02e-02 -0.181 0.0958 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 2.47e-01 0.0775 0.0668 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0957 0.0956 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 1.14e-01 -0.149 0.0939 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0658 0.0955 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 9.93e-01 0.000634 0.0764 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 5.05e-01 0.0555 0.0831 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.88e-01 -0.102 0.0959 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0188 0.0412 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 7.44e-01 0.0194 0.0595 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 8.66e-01 0.0101 0.0597 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0827 0.0594 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 7.84e-02 0.147 0.083 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0294 0.053 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0705 0.0651 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00507 0.0404 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 2.25e-01 0.0834 0.0685 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 9.99e-01 -9.24e-05 0.0685 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0341 0.0673 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 3.24e-01 0.0919 0.0929 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 3.34e-01 0.0534 0.0551 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.34e-01 0.0898 0.0753 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.65e-02 0.118 0.0489 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00814 0.0828 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 7.44e-01 0.025 0.0765 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 4.16e-01 0.0578 0.071 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 6.46e-01 0.0402 0.0874 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0788 0.0742 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0484 0.0882 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.28e-01 0.0734 0.0481 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 8.46e-02 0.144 0.083 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 6.57e-01 0.0388 0.0873 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 6.22e-01 0.0392 0.0795 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 4.70e-01 0.0641 0.0885 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0132 0.0731 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 8.17e-01 -0.019 0.0819 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.61e-01 -0.081 0.0576 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 4.88e-01 0.0533 0.0768 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0127 0.0693 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0742 0.0731 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 2.99e-01 0.0799 0.0768 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 7.58e-01 0.0203 0.0659 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0481 0.0784 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 2.85e-01 0.0672 0.0627 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0939 0.0936 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 7.94e-01 0.0241 0.0924 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 5.74e-01 -0.044 0.0782 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0524 0.0846 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 2.31e-01 0.108 0.0897 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 1.36e-01 -0.131 0.0877 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 9.01e-01 0.01 0.0805 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 7.98e-01 0.0243 0.0945 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00715 0.0986 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0146 0.0969 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0141 0.0825 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00726 0.0901 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.10e-01 -0.123 0.0974 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00143 0.0524 0.509 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 680054 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0865 0.0704 0.509 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 3.37e-01 0.0855 0.0888 0.509 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0569 0.0809 0.509 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0627 0.0678 0.509 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0986 0.0785 0.509 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 1.27e-01 -0.135 0.0879 0.509 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -18365 sc-eQTL 9.99e-01 6.82e-05 0.0876 0.509 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.10e-03 0.18 0.0543 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 7.20e-01 0.0337 0.094 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 8.89e-01 0.0116 0.0824 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 9.98e-01 0.000273 0.0875 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 2.26e-01 0.111 0.0912 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 4.68e-01 0.0671 0.0922 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 2.27e-01 0.057 0.047 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 6.85e-01 0.0335 0.0826 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 7.19e-01 0.0307 0.0852 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 4.14e-01 0.0616 0.0753 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0841 0.0716 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 9.70e-01 0.0031 0.0827 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0648 0.075 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 7.01e-02 -0.171 0.0939 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0858 0.0983 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 9.15e-01 0.00976 0.0914 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 6.64e-02 0.174 0.0944 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 8.30e-01 0.0194 0.0901 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 9.33e-01 0.00439 0.0517 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 8.78e-01 0.0133 0.0859 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0111 0.0875 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 8.65e-01 0.0143 0.0837 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 2.49e-01 0.0818 0.0707 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.01e-01 0.112 0.0874 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00444 0.0994 0.526 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0775 0.116 0.526 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 7.58e-01 0.0271 0.0877 0.526 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 1.09e-01 0.18 0.111 0.526 PB L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 1.84e-01 0.138 0.103 0.526 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0795 0.109 0.526 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 3.35e-01 -0.126 0.13 0.526 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 7.48e-01 0.0186 0.0577 0.507 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 680054 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0332 0.0648 0.507 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 1.46e-01 0.111 0.0762 0.507 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 4.62e-01 0.0561 0.0761 0.507 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0659 0.0921 0.507 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 9.55e-01 0.0033 0.0581 0.507 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 8.04e-01 0.021 0.0844 0.507 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -18365 sc-eQTL 4.65e-01 0.05 0.0682 0.507 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00401 0.0628 0.511 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 1.50e-01 0.123 0.085 0.511 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 7.07e-01 0.03 0.0795 0.511 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0615 0.072 0.511 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 4.70e-01 0.0586 0.0808 0.511 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 1.64e-01 0.116 0.0831 0.511 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 8.48e-01 0.0178 0.0931 0.511 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 3.68e-01 0.0711 0.0788 0.502 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0312 0.0821 0.502 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 2.26e-01 -0.12 0.0987 0.502 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 9.22e-02 0.118 0.0698 0.502 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0905 0.0926 0.502 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 4.33e-01 0.0609 0.0776 0.502 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00826 0.0947 0.502 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0141 0.0799 0.502 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0984 0.0677 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0528 0.0742 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 2.42e-01 -0.09 0.0767 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 2.53e-01 0.0916 0.0799 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0822 0.0615 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 1.08e-01 -0.102 0.0634 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.11e-01 -0.11 0.0875 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 4.99e-01 0.0554 0.0818 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0379 0.0766 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 1.22e-01 0.133 0.0855 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 5.10e-01 0.0574 0.0869 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 8.81e-01 0.0128 0.0859 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 3.32e-01 0.0679 0.0698 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000454 0.0692 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0343 0.0933 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 6.99e-01 0.0341 0.0879 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 7.56e-02 0.135 0.0754 0.497 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 680054 sc-eQTL 7.43e-01 0.0287 0.0875 0.497 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 9.71e-01 0.00394 0.109 0.497 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 1.76e-01 -0.154 0.113 0.497 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0127 0.106 0.497 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 9.34e-02 0.17 0.101 0.497 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0911 0.112 0.497 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -18365 sc-eQTL 3.67e-01 0.089 0.0983 0.497 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.03e-01 -0.142 0.0866 0.502 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00277 0.0881 0.502 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 1.17e-01 0.156 0.0992 0.502 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 4.75e-01 0.0646 0.0903 0.502 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 5.09e-01 0.0532 0.0804 0.502 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0259 0.086 0.502 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00634 0.0894 0.502 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 8.28e-02 0.156 0.0892 0.502 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0162 0.0698 0.495 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0909 0.0776 0.495 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 9.73e-01 0.00317 0.0942 0.495 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0117 0.0869 0.495 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 2.87e-01 0.0794 0.0744 0.495 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 1.59e-01 -0.107 0.0758 0.495 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.51e-01 0.0929 0.0806 0.495 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 1.25e-01 -0.141 0.0918 0.495 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 2.45e-01 -0.105 0.0897 0.508 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 5.25e-01 0.0485 0.076 0.508 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 3.80e-01 0.0903 0.103 0.508 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 7.17e-03 0.227 0.0832 0.508 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 5.58e-01 0.0611 0.104 0.508 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 4.64e-01 0.0667 0.0908 0.508 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0375 0.1 0.508 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 5.54e-01 0.051 0.0859 0.508 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.47e-01 0.088 0.0605 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 4.78e-01 0.0601 0.0845 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 3.31e-01 0.0614 0.063 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 9.78e-01 0.002 0.0722 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 8.47e-03 -0.235 0.0885 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 4.84e-01 -0.049 0.0699 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 1.79e-01 0.123 0.0914 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.96e-01 0.0668 0.0515 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00285 0.0701 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 8.01e-01 0.0147 0.0581 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 3.90e-01 0.0568 0.066 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 919730 sc-eQTL 1.15e-01 -0.127 0.0804 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 1.38e-01 0.0986 0.0663 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0544 0.0881 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0816 0.061 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 8.88e-01 0.0104 0.0742 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0368 0.0698 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 3.27e-01 0.0798 0.0812 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 8.76e-01 -0.00916 0.0588 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0834 0.0565 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0989 0.0888 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 4.78e-01 0.0586 0.0824 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0807 0.063 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 474841 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0541 0.0746 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 4.18e-01 0.0688 0.0847 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 7.44e-01 0.027 0.0828 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 4.92e-01 0.0422 0.0612 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0557 0.0631 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 6.67e-01 0.035 0.0811 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 445883 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0359 0.0858 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 70726 sc-eQTL 6.88e-01 0.0177 0.0441 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997686 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0176 0.0671 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427686 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00859 0.0767 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276831 sc-eQTL 3.71e-01 0.0627 0.07 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 612278 sc-eQTL 8.34e-01 0.0126 0.06 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 sc-eQTL 6.49e-01 0.0341 0.0748 0.513 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 612278 eQTL 0.0156 0.0223 0.00918 0.00157 0.0 0.48
ENSG00000139350 NEDD1 -436017 eQTL 0.029 -0.0538 0.0246 0.0 0.0 0.48
ENSG00000188596 CFAP54 -18369 eQTL 0.0062 -0.0562 0.0205 0.0 0.0 0.48

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000188596 CFAP54 -18369 1.33e-05 1.93e-05 2.57e-06 9.17e-06 2.32e-06 6.82e-06 2.14e-05 2.18e-06 1.51e-05 7.13e-06 1.99e-05 6.86e-06 3.11e-05 5.8e-06 4.38e-06 8.56e-06 8.2e-06 1.09e-05 4.54e-06 3.13e-06 6.47e-06 1.39e-05 1.37e-05 4.25e-06 2.59e-05 4.47e-06 7.27e-06 5.79e-06 1.66e-05 1.6e-05 1.15e-05 9.67e-07 1.25e-06 3.63e-06 6.28e-06 3.58e-06 1.75e-06 2.12e-06 2.2e-06 1.96e-06 9.87e-07 2e-05 1.61e-06 2.03e-07 7.68e-07 2.02e-06 1.75e-06 7.04e-07 4.43e-07