logo

Genes within 1Mb (chr12:96470748:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.35e-01 0.0697 0.0464 0.511 B L1
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00483 0.066 0.511 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 4.90e-01 0.0401 0.0579 0.511 B L1
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 5.76e-01 0.0345 0.0617 0.511 B L1
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 5.17e-03 -0.211 0.0747 0.511 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 4.63e-01 0.0411 0.056 0.511 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0707 0.0817 0.511 B L1
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 7.92e-01 -0.00992 0.0376 0.511 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 4.98e-01 0.0356 0.0525 0.511 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 7.57e-01 0.016 0.0517 0.511 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 4.75e-01 -0.04 0.0559 0.511 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 9.80e-02 0.132 0.0794 0.511 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00152 0.049 0.511 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0222 0.0603 0.511 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0267 0.0386 0.511 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 1.31e-01 0.0939 0.062 0.511 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0247 0.0414 0.511 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0849 0.0621 0.511 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 1.91e-01 0.0927 0.0707 0.511 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 6.40e-01 0.0239 0.0511 0.511 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0603 0.0678 0.511 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0231 0.0733 0.505 DC L1
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0492 0.0834 0.505 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 8.07e-01 0.0225 0.092 0.505 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 8.22e-02 0.118 0.0677 0.505 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0215 0.0836 0.505 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 7.68e-01 0.0205 0.0695 0.505 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.05e-01 -0.113 0.0889 0.505 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0327 0.0805 0.505 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0273 0.0584 0.511 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 9.85e-01 0.00139 0.0736 0.511 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00707 0.0636 0.511 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 4.58e-01 0.0617 0.083 0.511 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 9.71e-01 0.002 0.0558 0.511 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 1.10e-01 -0.084 0.0523 0.511 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 6.48e-01 -0.037 0.0807 0.511 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 6.15e-01 0.0394 0.0782 0.511 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 3.04e-01 0.0448 0.0435 0.511 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0335 0.0645 0.511 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 8.21e-01 0.0167 0.074 0.511 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 3.69e-01 0.0631 0.0701 0.511 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 3.89e-01 0.0502 0.0581 0.511 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 6.59e-01 0.0325 0.0737 0.511 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 3.85e-02 0.0754 0.0362 0.511 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 679596 sc-eQTL 1.15e-01 -0.106 0.0672 0.511 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 4.91e-01 0.0481 0.0697 0.511 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0584 0.0763 0.511 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 2.90e-01 -0.063 0.0594 0.511 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00611 0.0554 0.511 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 5.42e-02 -0.162 0.0836 0.511 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -18823 sc-eQTL 6.91e-01 0.0348 0.0873 0.511 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 5.41e-01 0.0531 0.0867 0.5 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 1.17e-01 0.171 0.108 0.5 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 5.10e-02 0.191 0.0972 0.5 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 5.05e-01 0.0694 0.104 0.5 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 4.68e-01 0.058 0.0798 0.5 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 1.84e-01 0.13 0.0976 0.5 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 3.30e-01 -0.1 0.102 0.5 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 8.06e-02 0.125 0.0713 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 5.95e-01 0.0438 0.0824 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 4.46e-01 0.053 0.0695 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 7.84e-02 -0.138 0.0779 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 2.53e-03 -0.277 0.0905 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0449 0.0781 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 3.24e-01 0.0904 0.0913 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0118 0.0697 0.513 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0151 0.0907 0.513 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 6.81e-01 0.0331 0.0805 0.513 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 6.90e-02 0.144 0.0785 0.513 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 1.38e-01 -0.128 0.0864 0.513 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 1.30e-01 -0.127 0.0834 0.513 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.31e-01 0.111 0.0925 0.513 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 6.02e-01 0.03 0.0575 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 4.99e-01 0.0504 0.0744 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0278 0.0602 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 1.58e-01 0.1 0.0709 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 7.36e-02 -0.16 0.0889 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 5.07e-02 0.135 0.0687 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 3.58e-01 0.0817 0.0887 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 5.60e-02 0.14 0.0726 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0517 0.0884 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 5.40e-01 0.0426 0.0694 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 5.76e-01 0.0458 0.0818 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0318 0.0884 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 3.00e-01 0.0842 0.0811 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 6.02e-02 -0.181 0.0958 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 2.47e-01 0.0775 0.0668 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0957 0.0956 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 1.14e-01 -0.149 0.0939 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0658 0.0955 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 9.93e-01 0.000634 0.0764 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 5.05e-01 0.0555 0.0831 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.88e-01 -0.102 0.0959 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0188 0.0412 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 7.44e-01 0.0194 0.0595 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 8.66e-01 0.0101 0.0597 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0827 0.0594 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 7.84e-02 0.147 0.083 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0294 0.053 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0705 0.0651 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00507 0.0404 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 2.25e-01 0.0834 0.0685 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 9.99e-01 -9.24e-05 0.0685 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0341 0.0673 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 3.24e-01 0.0919 0.0929 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 3.34e-01 0.0534 0.0551 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.34e-01 0.0898 0.0753 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.65e-02 0.118 0.0489 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00814 0.0828 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 7.44e-01 0.025 0.0765 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 4.16e-01 0.0578 0.071 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 6.46e-01 0.0402 0.0874 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0788 0.0742 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0484 0.0882 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.28e-01 0.0734 0.0481 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 8.46e-02 0.144 0.083 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 6.57e-01 0.0388 0.0873 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 6.22e-01 0.0392 0.0795 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 4.70e-01 0.0641 0.0885 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0132 0.0731 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 8.17e-01 -0.019 0.0819 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.61e-01 -0.081 0.0576 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 4.88e-01 0.0533 0.0768 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0127 0.0693 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0742 0.0731 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 2.99e-01 0.0799 0.0768 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 7.58e-01 0.0203 0.0659 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0481 0.0784 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 2.85e-01 0.0672 0.0627 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0939 0.0936 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 7.94e-01 0.0241 0.0924 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 5.74e-01 -0.044 0.0782 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0524 0.0846 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 2.31e-01 0.108 0.0897 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 1.36e-01 -0.131 0.0877 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 9.01e-01 0.01 0.0805 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 7.98e-01 0.0243 0.0945 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00715 0.0986 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0146 0.0969 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0141 0.0825 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00726 0.0901 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.10e-01 -0.123 0.0974 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00143 0.0524 0.509 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 679596 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0865 0.0704 0.509 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 3.37e-01 0.0855 0.0888 0.509 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0569 0.0809 0.509 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0627 0.0678 0.509 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0986 0.0785 0.509 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 1.27e-01 -0.135 0.0879 0.509 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -18823 sc-eQTL 9.99e-01 6.82e-05 0.0876 0.509 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.10e-03 0.18 0.0543 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 7.20e-01 0.0337 0.094 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 8.89e-01 0.0116 0.0824 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 9.98e-01 0.000273 0.0875 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 2.26e-01 0.111 0.0912 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 4.68e-01 0.0671 0.0922 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 2.27e-01 0.057 0.047 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 6.85e-01 0.0335 0.0826 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 7.19e-01 0.0307 0.0852 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 4.14e-01 0.0616 0.0753 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0841 0.0716 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 9.70e-01 0.0031 0.0827 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0648 0.075 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 7.01e-02 -0.171 0.0939 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0858 0.0983 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 9.15e-01 0.00976 0.0914 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 6.64e-02 0.174 0.0944 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 8.30e-01 0.0194 0.0901 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 9.33e-01 0.00439 0.0517 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 8.78e-01 0.0133 0.0859 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0111 0.0875 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 8.65e-01 0.0143 0.0837 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 2.49e-01 0.0818 0.0707 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.01e-01 0.112 0.0874 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00444 0.0994 0.526 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0775 0.116 0.526 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 7.58e-01 0.0271 0.0877 0.526 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 1.09e-01 0.18 0.111 0.526 PB L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 1.84e-01 0.138 0.103 0.526 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0795 0.109 0.526 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 3.35e-01 -0.126 0.13 0.526 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 7.48e-01 0.0186 0.0577 0.507 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 679596 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0332 0.0648 0.507 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 1.46e-01 0.111 0.0762 0.507 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 4.62e-01 0.0561 0.0761 0.507 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0659 0.0921 0.507 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 9.55e-01 0.0033 0.0581 0.507 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 8.04e-01 0.021 0.0844 0.507 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -18823 sc-eQTL 4.65e-01 0.05 0.0682 0.507 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00401 0.0628 0.511 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 1.50e-01 0.123 0.085 0.511 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 7.07e-01 0.03 0.0795 0.511 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0615 0.072 0.511 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 4.70e-01 0.0586 0.0808 0.511 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 1.64e-01 0.116 0.0831 0.511 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 8.48e-01 0.0178 0.0931 0.511 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 3.68e-01 0.0711 0.0788 0.502 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0312 0.0821 0.502 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 2.26e-01 -0.12 0.0987 0.502 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 9.22e-02 0.118 0.0698 0.502 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0905 0.0926 0.502 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 4.33e-01 0.0609 0.0776 0.502 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00826 0.0947 0.502 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0141 0.0799 0.502 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0984 0.0677 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0528 0.0742 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 2.42e-01 -0.09 0.0767 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 2.53e-01 0.0916 0.0799 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0822 0.0615 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 1.08e-01 -0.102 0.0634 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.11e-01 -0.11 0.0875 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 4.99e-01 0.0554 0.0818 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0379 0.0766 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 1.22e-01 0.133 0.0855 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 5.10e-01 0.0574 0.0869 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 8.81e-01 0.0128 0.0859 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 3.32e-01 0.0679 0.0698 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000454 0.0692 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0343 0.0933 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 6.99e-01 0.0341 0.0879 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 7.56e-02 0.135 0.0754 0.497 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 679596 sc-eQTL 7.43e-01 0.0287 0.0875 0.497 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 9.71e-01 0.00394 0.109 0.497 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 1.76e-01 -0.154 0.113 0.497 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0127 0.106 0.497 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 9.34e-02 0.17 0.101 0.497 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0911 0.112 0.497 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -18823 sc-eQTL 3.67e-01 0.089 0.0983 0.497 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.03e-01 -0.142 0.0866 0.502 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00277 0.0881 0.502 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 1.17e-01 0.156 0.0992 0.502 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 4.75e-01 0.0646 0.0903 0.502 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 5.09e-01 0.0532 0.0804 0.502 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0259 0.086 0.502 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00634 0.0894 0.502 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 8.28e-02 0.156 0.0892 0.502 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0162 0.0698 0.495 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0909 0.0776 0.495 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 9.73e-01 0.00317 0.0942 0.495 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0117 0.0869 0.495 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 2.87e-01 0.0794 0.0744 0.495 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 1.59e-01 -0.107 0.0758 0.495 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.51e-01 0.0929 0.0806 0.495 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 1.25e-01 -0.141 0.0918 0.495 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 2.45e-01 -0.105 0.0897 0.508 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 5.25e-01 0.0485 0.076 0.508 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 3.80e-01 0.0903 0.103 0.508 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 7.17e-03 0.227 0.0832 0.508 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 5.58e-01 0.0611 0.104 0.508 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 4.64e-01 0.0667 0.0908 0.508 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0375 0.1 0.508 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 5.54e-01 0.051 0.0859 0.508 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.47e-01 0.088 0.0605 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 4.78e-01 0.0601 0.0845 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 3.31e-01 0.0614 0.063 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 9.78e-01 0.002 0.0722 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 8.47e-03 -0.235 0.0885 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 4.84e-01 -0.049 0.0699 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 1.79e-01 0.123 0.0914 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.96e-01 0.0668 0.0515 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00285 0.0701 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 8.01e-01 0.0147 0.0581 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 3.90e-01 0.0568 0.066 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 919272 sc-eQTL 1.15e-01 -0.127 0.0804 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 1.38e-01 0.0986 0.0663 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0544 0.0881 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0816 0.061 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 8.88e-01 0.0104 0.0742 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0368 0.0698 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 3.27e-01 0.0798 0.0812 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 8.76e-01 -0.00916 0.0588 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0834 0.0565 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0989 0.0888 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 4.78e-01 0.0586 0.0824 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0807 0.063 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 474383 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0541 0.0746 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 4.18e-01 0.0688 0.0847 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 7.44e-01 0.027 0.0828 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 4.92e-01 0.0422 0.0612 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0557 0.0631 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 6.67e-01 0.035 0.0811 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 445425 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0359 0.0858 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 70268 sc-eQTL 6.88e-01 0.0177 0.0441 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 997228 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0176 0.0671 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 427228 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00859 0.0767 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 276373 sc-eQTL 3.71e-01 0.0627 0.07 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 611820 sc-eQTL 8.34e-01 0.0126 0.06 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 sc-eQTL 6.49e-01 0.0341 0.0748 0.513 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 611820 eQTL 0.0138 0.0227 0.0092 0.00168 0.0 0.479
ENSG00000139350 NEDD1 -436475 eQTL 0.0266 -0.0547 0.0246 0.0 0.0 0.479
ENSG00000188596 CFAP54 -18827 eQTL 0.00602 -0.0565 0.0205 0.0 0.0 0.479

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000188596 CFAP54 -18827 1.08e-05 1.18e-05 1.96e-06 6.3e-06 2.52e-06 5.43e-06 1.25e-05 1.8e-06 9.91e-06 5.31e-06 1.33e-05 5.56e-06 1.86e-05 3.95e-06 3.51e-06 6.62e-06 5.49e-06 8e-06 3.2e-06 2.83e-06 5.7e-06 1.04e-05 1.03e-05 3.58e-06 1.78e-05 3.98e-06 4.82e-06 4.45e-06 1.33e-05 1.35e-05 6.24e-06 9.88e-07 1.21e-06 3.63e-06 4.76e-06 2.82e-06 1.85e-06 1.83e-06 1.96e-06 1.15e-06 9.91e-07 1.39e-05 1.35e-06 1.33e-07 8.22e-07 1.8e-06 1.5e-06 7.37e-07 4.15e-07