logo

Genes within 1Mb (chr12:96469926:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.35e-01 0.0697 0.0464 0.511 B L1
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00483 0.066 0.511 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 4.90e-01 0.0401 0.0579 0.511 B L1
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 5.76e-01 0.0345 0.0617 0.511 B L1
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 5.17e-03 -0.211 0.0747 0.511 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 4.63e-01 0.0411 0.056 0.511 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0707 0.0817 0.511 B L1
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 7.92e-01 -0.00992 0.0376 0.511 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 4.98e-01 0.0356 0.0525 0.511 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 7.57e-01 0.016 0.0517 0.511 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 4.75e-01 -0.04 0.0559 0.511 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 9.80e-02 0.132 0.0794 0.511 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00152 0.049 0.511 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0222 0.0603 0.511 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0267 0.0386 0.511 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 1.31e-01 0.0939 0.062 0.511 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0247 0.0414 0.511 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0849 0.0621 0.511 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 1.91e-01 0.0927 0.0707 0.511 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 6.40e-01 0.0239 0.0511 0.511 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0603 0.0678 0.511 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0231 0.0733 0.505 DC L1
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0492 0.0834 0.505 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 8.07e-01 0.0225 0.092 0.505 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 8.22e-02 0.118 0.0677 0.505 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0215 0.0836 0.505 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 7.68e-01 0.0205 0.0695 0.505 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.05e-01 -0.113 0.0889 0.505 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0327 0.0805 0.505 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0273 0.0584 0.511 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 9.85e-01 0.00139 0.0736 0.511 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00707 0.0636 0.511 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 4.58e-01 0.0617 0.083 0.511 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 9.71e-01 0.002 0.0558 0.511 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 1.10e-01 -0.084 0.0523 0.511 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 6.48e-01 -0.037 0.0807 0.511 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 6.15e-01 0.0394 0.0782 0.511 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 3.04e-01 0.0448 0.0435 0.511 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0335 0.0645 0.511 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 8.21e-01 0.0167 0.074 0.511 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 3.69e-01 0.0631 0.0701 0.511 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 3.89e-01 0.0502 0.0581 0.511 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 6.59e-01 0.0325 0.0737 0.511 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 3.85e-02 0.0754 0.0362 0.511 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 678774 sc-eQTL 1.15e-01 -0.106 0.0672 0.511 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 4.91e-01 0.0481 0.0697 0.511 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0584 0.0763 0.511 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 2.90e-01 -0.063 0.0594 0.511 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00611 0.0554 0.511 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 5.42e-02 -0.162 0.0836 0.511 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -19645 sc-eQTL 6.91e-01 0.0348 0.0873 0.511 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 5.41e-01 0.0531 0.0867 0.5 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 1.17e-01 0.171 0.108 0.5 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 5.10e-02 0.191 0.0972 0.5 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 5.05e-01 0.0694 0.104 0.5 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 4.68e-01 0.058 0.0798 0.5 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 1.84e-01 0.13 0.0976 0.5 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 3.30e-01 -0.1 0.102 0.5 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 8.06e-02 0.125 0.0713 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 5.95e-01 0.0438 0.0824 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 4.46e-01 0.053 0.0695 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 7.84e-02 -0.138 0.0779 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 2.53e-03 -0.277 0.0905 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0449 0.0781 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 3.24e-01 0.0904 0.0913 0.509 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0118 0.0697 0.513 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0151 0.0907 0.513 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 6.81e-01 0.0331 0.0805 0.513 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 6.90e-02 0.144 0.0785 0.513 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 1.38e-01 -0.128 0.0864 0.513 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 1.30e-01 -0.127 0.0834 0.513 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.31e-01 0.111 0.0925 0.513 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 6.02e-01 0.03 0.0575 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 4.99e-01 0.0504 0.0744 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0278 0.0602 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 1.58e-01 0.1 0.0709 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 7.36e-02 -0.16 0.0889 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 5.07e-02 0.135 0.0687 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 3.58e-01 0.0817 0.0887 0.511 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 5.60e-02 0.14 0.0726 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0517 0.0884 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 5.40e-01 0.0426 0.0694 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 5.76e-01 0.0458 0.0818 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0318 0.0884 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 3.00e-01 0.0842 0.0811 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 6.02e-02 -0.181 0.0958 0.511 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 2.47e-01 0.0775 0.0668 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0957 0.0956 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 1.14e-01 -0.149 0.0939 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0658 0.0955 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 9.93e-01 0.000634 0.0764 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 5.05e-01 0.0555 0.0831 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.88e-01 -0.102 0.0959 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0188 0.0412 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 7.44e-01 0.0194 0.0595 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 8.66e-01 0.0101 0.0597 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0827 0.0594 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 7.84e-02 0.147 0.083 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0294 0.053 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0705 0.0651 0.511 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00507 0.0404 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 2.25e-01 0.0834 0.0685 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 9.99e-01 -9.24e-05 0.0685 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0341 0.0673 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 3.24e-01 0.0919 0.0929 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 3.34e-01 0.0534 0.0551 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.34e-01 0.0898 0.0753 0.511 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.65e-02 0.118 0.0489 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00814 0.0828 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 7.44e-01 0.025 0.0765 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 4.16e-01 0.0578 0.071 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 6.46e-01 0.0402 0.0874 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0788 0.0742 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0484 0.0882 0.511 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.28e-01 0.0734 0.0481 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 8.46e-02 0.144 0.083 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 6.57e-01 0.0388 0.0873 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 6.22e-01 0.0392 0.0795 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 4.70e-01 0.0641 0.0885 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0132 0.0731 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 8.17e-01 -0.019 0.0819 0.511 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.61e-01 -0.081 0.0576 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 4.88e-01 0.0533 0.0768 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0127 0.0693 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0742 0.0731 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 2.99e-01 0.0799 0.0768 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 7.58e-01 0.0203 0.0659 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0481 0.0784 0.511 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 2.85e-01 0.0672 0.0627 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0939 0.0936 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 7.94e-01 0.0241 0.0924 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 5.74e-01 -0.044 0.0782 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0524 0.0846 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 2.31e-01 0.108 0.0897 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 1.36e-01 -0.131 0.0877 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 9.01e-01 0.01 0.0805 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 7.98e-01 0.0243 0.0945 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00715 0.0986 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0146 0.0969 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0141 0.0825 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00726 0.0901 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.10e-01 -0.123 0.0974 0.502 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00143 0.0524 0.509 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 678774 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0865 0.0704 0.509 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 3.37e-01 0.0855 0.0888 0.509 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0569 0.0809 0.509 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0627 0.0678 0.509 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0986 0.0785 0.509 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 1.27e-01 -0.135 0.0879 0.509 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -19645 sc-eQTL 9.99e-01 6.82e-05 0.0876 0.509 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.10e-03 0.18 0.0543 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 7.20e-01 0.0337 0.094 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 8.89e-01 0.0116 0.0824 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 9.98e-01 0.000273 0.0875 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 2.26e-01 0.111 0.0912 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 4.68e-01 0.0671 0.0922 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 2.27e-01 0.057 0.047 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 6.85e-01 0.0335 0.0826 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 7.19e-01 0.0307 0.0852 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 4.14e-01 0.0616 0.0753 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0841 0.0716 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 9.70e-01 0.0031 0.0827 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0648 0.075 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 7.01e-02 -0.171 0.0939 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0858 0.0983 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 9.15e-01 0.00976 0.0914 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 6.64e-02 0.174 0.0944 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 8.30e-01 0.0194 0.0901 0.516 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 9.33e-01 0.00439 0.0517 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 8.78e-01 0.0133 0.0859 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0111 0.0875 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 8.65e-01 0.0143 0.0837 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 2.49e-01 0.0818 0.0707 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.01e-01 0.112 0.0874 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00444 0.0994 0.526 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0775 0.116 0.526 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 7.58e-01 0.0271 0.0877 0.526 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 1.09e-01 0.18 0.111 0.526 PB L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 1.84e-01 0.138 0.103 0.526 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0795 0.109 0.526 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 3.35e-01 -0.126 0.13 0.526 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 7.48e-01 0.0186 0.0577 0.507 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 678774 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0332 0.0648 0.507 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 1.46e-01 0.111 0.0762 0.507 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 4.62e-01 0.0561 0.0761 0.507 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0659 0.0921 0.507 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 9.55e-01 0.0033 0.0581 0.507 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 8.04e-01 0.021 0.0844 0.507 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -19645 sc-eQTL 4.65e-01 0.05 0.0682 0.507 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00401 0.0628 0.511 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 1.50e-01 0.123 0.085 0.511 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 7.07e-01 0.03 0.0795 0.511 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0615 0.072 0.511 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 4.70e-01 0.0586 0.0808 0.511 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 1.64e-01 0.116 0.0831 0.511 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 8.48e-01 0.0178 0.0931 0.511 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 3.68e-01 0.0711 0.0788 0.502 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0312 0.0821 0.502 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 2.26e-01 -0.12 0.0987 0.502 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 9.22e-02 0.118 0.0698 0.502 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0905 0.0926 0.502 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 4.33e-01 0.0609 0.0776 0.502 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00826 0.0947 0.502 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0141 0.0799 0.502 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0984 0.0677 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0528 0.0742 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 2.42e-01 -0.09 0.0767 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 2.53e-01 0.0916 0.0799 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0822 0.0615 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 1.08e-01 -0.102 0.0634 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.11e-01 -0.11 0.0875 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 4.99e-01 0.0554 0.0818 0.511 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0379 0.0766 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 1.22e-01 0.133 0.0855 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 5.10e-01 0.0574 0.0869 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 8.81e-01 0.0128 0.0859 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 3.32e-01 0.0679 0.0698 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000454 0.0692 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0343 0.0933 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 6.99e-01 0.0341 0.0879 0.511 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 7.56e-02 0.135 0.0754 0.497 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 678774 sc-eQTL 7.43e-01 0.0287 0.0875 0.497 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 9.71e-01 0.00394 0.109 0.497 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 1.76e-01 -0.154 0.113 0.497 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0127 0.106 0.497 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 9.34e-02 0.17 0.101 0.497 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0911 0.112 0.497 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -19645 sc-eQTL 3.67e-01 0.089 0.0983 0.497 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.03e-01 -0.142 0.0866 0.502 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00277 0.0881 0.502 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 1.17e-01 0.156 0.0992 0.502 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 4.75e-01 0.0646 0.0903 0.502 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 5.09e-01 0.0532 0.0804 0.502 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0259 0.086 0.502 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00634 0.0894 0.502 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 8.28e-02 0.156 0.0892 0.502 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0162 0.0698 0.495 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0909 0.0776 0.495 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 9.73e-01 0.00317 0.0942 0.495 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0117 0.0869 0.495 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 2.87e-01 0.0794 0.0744 0.495 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 1.59e-01 -0.107 0.0758 0.495 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.51e-01 0.0929 0.0806 0.495 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 1.25e-01 -0.141 0.0918 0.495 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 2.45e-01 -0.105 0.0897 0.508 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 5.25e-01 0.0485 0.076 0.508 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 3.80e-01 0.0903 0.103 0.508 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 7.17e-03 0.227 0.0832 0.508 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 5.58e-01 0.0611 0.104 0.508 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 4.64e-01 0.0667 0.0908 0.508 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0375 0.1 0.508 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 5.54e-01 0.051 0.0859 0.508 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.47e-01 0.088 0.0605 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 4.78e-01 0.0601 0.0845 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 3.31e-01 0.0614 0.063 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 9.78e-01 0.002 0.0722 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 8.47e-03 -0.235 0.0885 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 4.84e-01 -0.049 0.0699 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 1.79e-01 0.123 0.0914 0.511 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.96e-01 0.0668 0.0515 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00285 0.0701 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 8.01e-01 0.0147 0.0581 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 3.90e-01 0.0568 0.066 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 918450 sc-eQTL 1.15e-01 -0.127 0.0804 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 1.38e-01 0.0986 0.0663 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0544 0.0881 0.511 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0816 0.061 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 8.88e-01 0.0104 0.0742 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0368 0.0698 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 3.27e-01 0.0798 0.0812 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 8.76e-01 -0.00916 0.0588 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0834 0.0565 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0989 0.0888 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 4.78e-01 0.0586 0.0824 0.511 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0807 0.063 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 473561 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0541 0.0746 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 4.18e-01 0.0688 0.0847 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 7.44e-01 0.027 0.0828 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 4.92e-01 0.0422 0.0612 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0557 0.0631 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 6.67e-01 0.035 0.0811 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 444603 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0359 0.0858 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 69446 sc-eQTL 6.88e-01 0.0177 0.0441 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 996406 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0176 0.0671 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 426406 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00859 0.0767 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 275551 sc-eQTL 3.71e-01 0.0627 0.07 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 610998 sc-eQTL 8.34e-01 0.0126 0.06 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 sc-eQTL 6.49e-01 0.0341 0.0748 0.513 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 610998 eQTL 0.0163 0.0221 0.00918 0.00154 0.0 0.481
ENSG00000139350 NEDD1 -437297 eQTL 0.0268 -0.0545 0.0246 0.0 0.0 0.481
ENSG00000188596 CFAP54 -19649 eQTL 0.00459 -0.0582 0.0205 0.0 0.0 0.481

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000188596 CFAP54 -19649 1.45e-05 1.46e-05 3.39e-06 9.74e-06 3.33e-06 8.25e-06 2.26e-05 3.41e-06 1.62e-05 7.84e-06 1.99e-05 7.68e-06 2.97e-05 6.24e-06 5.1e-06 1.01e-05 8.8e-06 1.52e-05 5.89e-06 5.22e-06 8.72e-06 1.55e-05 1.72e-05 7.65e-06 2.73e-05 5.4e-06 7.98e-06 7.35e-06 1.86e-05 2.45e-05 1.05e-05 1.61e-06 2.43e-06 6.71e-06 7.28e-06 5.04e-06 3.17e-06 2.9e-06 4.54e-06 3.3e-06 1.78e-06 2.01e-05 2.52e-06 4.31e-07 2.13e-06 2.68e-06 3.46e-06 1.42e-06 1.41e-06