logo

Genes within 1Mb (chr12:96459710:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 1.22e-01 -0.101 0.0653 0.124 B L1
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 2.58e-01 -0.105 0.0926 0.124 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 9.95e-01 0.000488 0.0816 0.124 B L1
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0963 0.0866 0.124 B L1
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 8.12e-01 0.0254 0.107 0.124 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 6.90e-01 0.0314 0.0788 0.124 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 1.75e-01 -0.156 0.115 0.124 B L1
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0545 0.0539 0.124 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 6.83e-01 0.0308 0.0753 0.124 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0887 0.0739 0.124 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 9.47e-01 0.00539 0.0803 0.124 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0161 0.115 0.124 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0392 0.0702 0.124 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 4.49e-01 0.0654 0.0864 0.124 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00614 0.0553 0.124 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 9.93e-01 0.000781 0.0893 0.124 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00151 0.0594 0.124 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 1.11e-01 0.142 0.0889 0.124 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0538 0.102 0.124 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 4.85e-01 0.0512 0.0732 0.124 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 6.27e-01 0.0474 0.0973 0.124 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 9.38e-01 0.00792 0.101 0.124 DC L1
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 1.75e-01 -0.157 0.115 0.124 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 3.43e-01 0.121 0.127 0.124 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0801 0.0943 0.124 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 7.56e-02 -0.205 0.115 0.124 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 5.67e-01 0.055 0.0961 0.124 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 3.41e-01 0.117 0.123 0.124 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 8.90e-01 0.0154 0.111 0.124 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 7.13e-01 0.0308 0.0836 0.124 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0876 0.105 0.124 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 7.09e-02 -0.164 0.0904 0.124 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.40e-01 -0.113 0.119 0.124 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0289 0.0799 0.124 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 3.28e-01 0.0736 0.0752 0.124 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 9.58e-01 0.00614 0.116 0.124 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0861 0.112 0.124 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 7.98e-02 0.108 0.0615 0.124 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 4.90e-01 0.0634 0.0916 0.124 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 1.21e-01 -0.163 0.105 0.124 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 2.68e-01 -0.111 0.0995 0.124 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 1.04e-01 -0.134 0.0822 0.124 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0953 0.105 0.124 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 9.09e-01 0.00602 0.0524 0.124 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 668558 sc-eQTL 4.38e-01 0.0751 0.0967 0.124 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0338 0.1 0.124 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0175 0.109 0.124 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 7.77e-01 0.0243 0.0854 0.124 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 6.03e-01 0.0413 0.0794 0.124 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 7.48e-02 0.215 0.12 0.124 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -29861 sc-eQTL 4.19e-01 -0.101 0.125 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0569 0.114 0.133 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 8.25e-01 0.0319 0.144 0.133 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.78e-01 -0.114 0.129 0.133 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 6.09e-01 0.0701 0.137 0.133 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 3.39e-01 0.101 0.105 0.133 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00404 0.129 0.133 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00572 0.135 0.133 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0932 0.101 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 7.90e-01 0.0309 0.116 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0502 0.0981 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0166 0.111 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 2.75e-01 0.142 0.13 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0873 0.11 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 2.58e-01 -0.146 0.129 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 6.33e-01 0.0467 0.0977 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 5.91e-01 0.0684 0.127 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 4.26e-01 -0.09 0.113 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 9.09e-02 -0.187 0.11 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 9.54e-01 0.00697 0.122 0.125 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 2.46e-01 0.136 0.117 0.125 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 6.90e-01 0.0519 0.13 0.125 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 3.27e-01 -0.08 0.0813 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0988 0.105 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 7.03e-01 0.0326 0.0853 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0352 0.101 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0769 0.127 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 3.45e-01 0.0927 0.098 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 3.30e-01 -0.123 0.126 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 6.10e-02 -0.192 0.102 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0812 0.124 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0983 0.0969 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 3.58e-02 -0.24 0.113 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 9.70e-01 0.00467 0.124 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 6.12e-01 0.0577 0.114 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 3.47e-01 -0.127 0.135 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0893 0.0933 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0267 0.134 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 1.47e-01 -0.191 0.131 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 2.78e-01 0.145 0.133 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000415 0.107 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 1.48e-01 -0.168 0.115 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 8.54e-01 0.0247 0.134 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0548 0.0595 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 3.25e-01 0.0845 0.0857 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 5.22e-02 -0.167 0.0854 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 4.74e-01 0.0617 0.0861 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 7.87e-01 0.0326 0.121 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 5.02e-01 0.0515 0.0765 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 4.44e-01 0.0723 0.0942 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0455 0.0576 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0358 0.0983 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 2.19e-01 -0.12 0.0976 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 6.57e-01 0.0428 0.0963 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0868 0.133 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 1.98e-02 -0.183 0.078 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0624 0.108 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 1.23e-01 -0.11 0.0708 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 3.72e-01 -0.106 0.119 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.34e-01 0.106 0.11 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 5.13e-01 -0.067 0.102 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 4.61e-01 0.0928 0.126 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0644 0.107 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 1.97e-01 0.164 0.126 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 5.48e-01 0.0413 0.0687 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0217 0.119 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 7.30e-01 0.0429 0.124 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 5.51e-01 0.0675 0.113 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0526 0.126 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 4.88e-01 0.0721 0.104 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 1.44e-01 -0.17 0.116 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 5.11e-01 0.0545 0.0828 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0441 0.11 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0594 0.0993 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 8.68e-01 0.0174 0.105 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0881 0.11 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 3.02e-01 0.0975 0.0943 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 1.59e-01 0.158 0.112 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0654 0.0895 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 3.14e-01 0.135 0.133 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.88e-03 -0.377 0.129 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 3.85e-02 0.23 0.11 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 5.89e-01 0.0654 0.121 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00645 0.128 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 4.17e-01 0.102 0.126 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 3.32e-01 -0.106 0.109 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 4.07e-01 0.107 0.128 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 8.98e-01 0.0172 0.134 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 8.12e-01 0.0315 0.132 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0148 0.112 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0575 0.123 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 1.56e-01 0.189 0.132 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0123 0.0736 0.126 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 668558 sc-eQTL 2.70e-01 0.109 0.099 0.126 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0456 0.125 0.126 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 2.23e-01 -0.138 0.113 0.126 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 4.96e-01 0.0651 0.0954 0.126 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00127 0.111 0.126 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 1.89e-02 0.29 0.123 0.126 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -29861 sc-eQTL 1.09e-01 -0.197 0.122 0.126 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 1.91e-01 -0.103 0.0784 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 1.74e-01 -0.181 0.132 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.91e-01 -0.1 0.116 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0888 0.123 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 6.97e-01 0.0505 0.129 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 2.43e-01 0.152 0.13 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 4.71e-01 0.0478 0.0662 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 8.76e-01 0.0182 0.116 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00871 0.12 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0187 0.106 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0845 0.101 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0801 0.116 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 6.66e-02 0.192 0.104 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 6.72e-01 0.056 0.132 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0261 0.137 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 2.64e-01 -0.142 0.127 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 3.99e-01 -0.112 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0287 0.126 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 1.45e-02 0.178 0.0724 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 5.48e-01 0.0734 0.122 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0949 0.124 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0525 0.119 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 2.81e-01 -0.109 0.1 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 3.00e-01 -0.129 0.124 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0448 0.14 0.119 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0824 0.164 0.119 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 6.61e-02 -0.226 0.122 0.119 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 1.76e-02 -0.372 0.155 0.119 PB L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0363 0.147 0.119 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0212 0.155 0.119 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 4.04e-01 0.153 0.183 0.119 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0147 0.0807 0.124 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 668558 sc-eQTL 7.01e-02 -0.164 0.0899 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 9.16e-01 0.0113 0.107 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.43e-01 -0.101 0.106 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0381 0.129 0.124 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0406 0.0813 0.124 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 4.16e-01 0.0962 0.118 0.124 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -29861 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0506 0.0955 0.124 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0233 0.0881 0.124 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 9.78e-01 0.00335 0.12 0.124 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0584 0.111 0.124 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 6.86e-01 0.041 0.101 0.124 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 8.83e-01 0.0167 0.113 0.124 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 8.93e-01 0.0157 0.117 0.124 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 2.38e-01 0.154 0.13 0.124 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 7.30e-01 0.0384 0.111 0.124 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 3.97e-01 -0.098 0.115 0.124 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 9.60e-01 0.00705 0.14 0.124 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0281 0.0991 0.124 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 1.32e-01 -0.197 0.13 0.124 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 7.20e-01 0.0393 0.109 0.124 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0155 0.133 0.124 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 6.48e-01 0.0515 0.112 0.124 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 4.52e-01 0.0725 0.0962 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0354 0.105 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0275 0.109 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 2.69e-01 -0.125 0.113 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 6.73e-01 -0.037 0.0874 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 2.28e-01 0.109 0.0899 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0326 0.124 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0722 0.116 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0076 0.109 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 2.94e-01 -0.128 0.122 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 7.89e-04 -0.409 0.12 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0494 0.122 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00305 0.0992 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0417 0.098 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 3.38e-01 0.127 0.132 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 3.22e-01 -0.123 0.124 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0978 0.103 0.127 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 668558 sc-eQTL 9.69e-01 0.00455 0.118 0.127 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 3.53e-01 -0.137 0.147 0.127 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 1.44e-01 0.225 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0836 0.143 0.127 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 3.19e-02 -0.294 0.135 0.127 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0201 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -29861 sc-eQTL 5.49e-01 0.0799 0.133 0.127 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 6.79e-01 0.0524 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 3.76e-01 0.113 0.127 0.124 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0852 0.144 0.124 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 1.31e-01 -0.197 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 3.04e-01 0.12 0.116 0.124 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 3.48e-01 -0.117 0.124 0.124 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0311 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 1.55e-01 -0.185 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 2.14e-01 0.12 0.0959 0.129 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0228 0.107 0.129 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 3.88e-01 -0.112 0.13 0.129 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.45e-01 -0.113 0.12 0.129 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 7.97e-01 0.0265 0.103 0.129 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 6.66e-01 0.0454 0.105 0.129 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0984 0.111 0.129 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 2.66e-01 0.142 0.127 0.129 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 8.44e-01 0.0256 0.13 0.124 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 1.20e-01 -0.17 0.109 0.124 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 5.63e-01 0.0857 0.148 0.124 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 2.14e-01 -0.152 0.122 0.124 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 1.38e-01 -0.222 0.149 0.124 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 1.78e-01 -0.176 0.13 0.124 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0432 0.144 0.124 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00809 0.124 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0602 0.0853 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 8.03e-01 0.0297 0.119 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0825 0.0886 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 2.04e-01 -0.129 0.101 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 7.03e-01 0.0483 0.126 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0113 0.0983 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0773 0.129 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 1.01e-01 -0.119 0.0722 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0389 0.0983 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 9.13e-01 0.00894 0.0816 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 1.61e-01 -0.13 0.0924 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 908234 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0523 0.113 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 3.61e-01 0.0854 0.0933 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 2.32e-01 -0.148 0.123 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 5.27e-01 0.0551 0.0869 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0796 0.105 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 4.01e-02 -0.203 0.0983 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 2.46e-01 -0.134 0.115 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0159 0.0836 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 3.18e-01 0.0806 0.0805 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 6.48e-01 0.0578 0.126 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 2.87e-01 -0.125 0.117 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 3.96e-01 0.0762 0.0897 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 463345 sc-eQTL 8.81e-01 0.0159 0.106 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0895 0.12 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 2.31e-01 -0.141 0.117 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 9.86e-01 0.00155 0.0871 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0724 0.0897 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0739 0.115 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 434387 sc-eQTL 9.19e-01 0.0124 0.122 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 59230 sc-eQTL 5.94e-02 0.118 0.062 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 986190 sc-eQTL 8.44e-01 0.0187 0.0952 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 416190 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0922 0.109 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 265335 sc-eQTL 2.75e-01 -0.109 0.0993 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600782 sc-eQTL 9.08e-02 -0.144 0.0846 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0949 0.106 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000084110 HAL 463345 eQTL 0.0214 -0.0489 0.0212 0.0 0.0 0.114
ENSG00000139350 NEDD1 -447513 eQTL 0.00652 -0.1 0.0368 0.0 0.0 0.114

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina