logo

Genes within 1Mb (chr12:96459224:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 1.05e-01 0.0754 0.0464 0.513 B L1
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000757 0.066 0.513 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 4.51e-01 0.0438 0.0579 0.513 B L1
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 6.11e-01 0.0314 0.0617 0.513 B L1
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 1.10e-02 -0.192 0.0749 0.513 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 4.86e-01 0.0391 0.056 0.513 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0808 0.0817 0.513 B L1
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00322 0.0376 0.513 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 4.93e-01 0.036 0.0524 0.513 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 7.48e-01 0.0166 0.0516 0.513 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0312 0.0559 0.513 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 7.10e-02 0.144 0.0791 0.513 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00492 0.0489 0.513 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0284 0.0602 0.513 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0248 0.0385 0.513 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 9.47e-02 0.104 0.0618 0.513 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0215 0.0414 0.513 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0782 0.0621 0.513 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 2.11e-01 0.0887 0.0706 0.513 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 6.36e-01 0.0242 0.051 0.513 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0538 0.0678 0.513 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0281 0.0729 0.507 DC L1
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0447 0.083 0.507 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 9.55e-01 0.00512 0.0915 0.507 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 9.90e-02 0.112 0.0675 0.507 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0172 0.0832 0.507 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 8.25e-01 0.0154 0.0692 0.507 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.19e-01 -0.109 0.0885 0.507 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0419 0.0801 0.507 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0284 0.0582 0.513 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 9.55e-01 0.00414 0.0733 0.513 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0105 0.0633 0.513 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 5.10e-01 0.0546 0.0827 0.513 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00138 0.0556 0.513 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 1.07e-01 -0.0844 0.0521 0.513 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0399 0.0804 0.513 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 7.35e-01 0.0264 0.078 0.513 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 3.05e-01 0.0446 0.0434 0.513 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 6.08e-01 -0.033 0.0644 0.513 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 8.13e-01 0.0175 0.0738 0.513 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 2.88e-01 0.0745 0.0699 0.513 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 4.65e-01 0.0424 0.058 0.513 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 6.22e-01 0.0362 0.0735 0.513 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 2.96e-02 0.0789 0.036 0.513 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 668072 sc-eQTL 1.06e-01 -0.109 0.0669 0.513 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 4.19e-01 0.0563 0.0694 0.513 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0366 0.0761 0.513 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0571 0.0593 0.513 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00276 0.0552 0.513 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.76e-02 -0.184 0.0831 0.513 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -30347 sc-eQTL 4.92e-01 0.0598 0.087 0.513 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 4.87e-01 0.06 0.0861 0.503 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 1.75e-01 0.147 0.108 0.503 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 6.77e-02 0.178 0.0967 0.503 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 4.22e-01 0.0831 0.103 0.503 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 4.65e-01 0.058 0.0793 0.503 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 1.90e-01 0.128 0.097 0.503 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.67e-01 -0.113 0.102 0.503 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 6.68e-02 0.131 0.071 0.511 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 5.31e-01 0.0515 0.082 0.511 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 4.44e-01 0.0531 0.0693 0.511 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 6.22e-02 -0.145 0.0776 0.511 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 6.15e-03 -0.251 0.0906 0.511 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0302 0.0779 0.511 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 4.31e-01 0.0719 0.0911 0.511 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0106 0.0696 0.515 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 9.35e-01 0.00739 0.0905 0.515 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 6.18e-01 0.0401 0.0803 0.515 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 7.80e-02 0.139 0.0784 0.515 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 1.22e-01 -0.134 0.0862 0.515 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 7.83e-02 -0.147 0.0831 0.515 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.70e-01 0.102 0.0923 0.515 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 5.47e-01 0.0345 0.0573 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 5.88e-01 0.0402 0.0742 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0272 0.0601 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 2.16e-01 0.0878 0.0708 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 1.02e-01 -0.146 0.0888 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 4.97e-02 0.135 0.0685 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 3.71e-01 0.0794 0.0885 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 5.24e-02 0.141 0.0723 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0398 0.088 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 4.92e-01 0.0476 0.069 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 6.02e-01 0.0426 0.0815 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0116 0.088 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 3.70e-01 0.0726 0.0808 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 7.01e-02 -0.174 0.0955 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 2.15e-01 0.0828 0.0666 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0958 0.0954 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 1.37e-01 -0.14 0.0937 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0492 0.0953 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 9.14e-01 0.00821 0.0761 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 6.17e-01 0.0415 0.0829 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 3.12e-01 -0.097 0.0956 0.516 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0133 0.0412 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 6.85e-01 0.0241 0.0593 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 8.90e-01 0.00823 0.0595 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0737 0.0593 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 5.83e-02 0.158 0.0827 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0293 0.0529 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0769 0.0649 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 9.85e-01 0.000781 0.0403 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 2.30e-01 0.0824 0.0685 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 9.53e-01 0.00405 0.0684 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0207 0.0673 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 2.80e-01 0.101 0.0928 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 3.59e-01 0.0506 0.0551 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 3.44e-01 0.0715 0.0753 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 1.97e-02 0.115 0.0488 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0224 0.0826 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 7.83e-01 0.0211 0.0763 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 2.99e-01 0.0736 0.0707 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 7.91e-01 0.0231 0.0872 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0654 0.0741 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0481 0.088 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 1.25e-01 0.0739 0.048 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 7.35e-02 0.149 0.0828 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 6.30e-01 0.042 0.0871 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 4.56e-01 0.0592 0.0792 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 5.52e-01 0.0526 0.0883 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0185 0.0729 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0243 0.0818 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0753 0.0575 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 5.28e-01 0.0485 0.0767 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 1.00e+00 -1.9e-05 0.0692 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0763 0.073 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 4.24e-01 0.0615 0.0768 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 6.40e-01 0.0308 0.0658 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0402 0.0783 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 2.85e-01 0.0672 0.0627 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0939 0.0936 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 7.94e-01 0.0241 0.0924 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 5.74e-01 -0.044 0.0782 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0524 0.0846 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 2.31e-01 0.108 0.0897 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 1.36e-01 -0.131 0.0877 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 9.06e-01 0.00955 0.0804 0.505 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 6.47e-01 0.0432 0.0943 0.505 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000561 0.0984 0.505 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0109 0.0967 0.505 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00276 0.0823 0.505 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0138 0.0899 0.505 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.88e-01 -0.104 0.0973 0.505 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 8.01e-01 0.0132 0.0523 0.511 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 668072 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0849 0.0703 0.511 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 3.88e-01 0.0767 0.0887 0.511 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0614 0.0808 0.511 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0423 0.0678 0.511 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0959 0.0784 0.511 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 8.63e-02 -0.151 0.0877 0.511 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -30347 sc-eQTL 8.27e-01 0.0192 0.0875 0.511 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 9.22e-04 0.182 0.054 0.511 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 9.43e-01 0.00668 0.0937 0.511 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 8.13e-01 0.0195 0.0822 0.511 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0132 0.0872 0.511 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 3.14e-01 0.0919 0.091 0.511 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 4.25e-01 0.0734 0.0919 0.511 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 2.36e-01 0.0557 0.0469 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 6.74e-01 0.0346 0.0823 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 7.43e-01 0.0278 0.0849 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 3.29e-01 0.0735 0.075 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0949 0.0713 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 9.34e-01 0.00684 0.0824 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0691 0.0747 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 6.20e-02 -0.175 0.0935 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 4.21e-01 -0.079 0.098 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 8.39e-01 0.0185 0.091 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 8.12e-02 0.165 0.0942 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 7.77e-01 0.0255 0.0898 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 8.69e-01 0.00851 0.0515 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 8.81e-01 0.0128 0.0855 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0111 0.0871 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 7.49e-01 0.0267 0.0834 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 2.27e-01 0.0854 0.0704 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.45e-01 0.102 0.087 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 9.43e-01 0.00708 0.0991 0.53 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 3.70e-01 -0.104 0.115 0.53 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 6.77e-01 0.0365 0.0874 0.53 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 8.58e-02 0.192 0.111 0.53 PB L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 2.15e-01 0.128 0.103 0.53 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0873 0.109 0.53 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 3.79e-01 -0.114 0.129 0.53 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 7.31e-01 0.0199 0.0577 0.509 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 668072 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0329 0.0647 0.509 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 1.23e-01 0.118 0.076 0.509 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 3.22e-01 0.0754 0.076 0.509 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0753 0.092 0.509 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00134 0.0581 0.509 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 8.85e-01 0.0122 0.0844 0.509 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -30347 sc-eQTL 3.72e-01 0.0609 0.0681 0.509 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00651 0.0627 0.513 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 1.14e-01 0.135 0.0847 0.513 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 6.67e-01 0.0342 0.0793 0.513 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0596 0.0718 0.513 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 4.94e-01 0.0552 0.0806 0.513 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 1.52e-01 0.119 0.0829 0.513 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 7.53e-01 0.0292 0.0929 0.513 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 3.84e-01 0.0683 0.0784 0.505 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0255 0.0816 0.505 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 1.87e-01 -0.13 0.0981 0.505 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 1.06e-01 0.113 0.0695 0.505 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0878 0.0921 0.505 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 4.53e-01 0.058 0.0772 0.505 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00849 0.0942 0.505 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0175 0.0794 0.505 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0986 0.0675 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0494 0.0739 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0893 0.0765 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 2.82e-01 0.086 0.0797 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0833 0.0613 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0987 0.0631 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.15e-01 -0.108 0.0871 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 5.92e-01 0.0438 0.0816 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0375 0.0763 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 1.19e-01 0.133 0.0852 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 5.70e-01 0.0492 0.0866 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 9.36e-01 0.00684 0.0856 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 3.23e-01 0.0688 0.0695 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00414 0.0689 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0399 0.0929 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 8.05e-01 0.0217 0.0875 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 7.56e-02 0.135 0.0754 0.497 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 668072 sc-eQTL 7.43e-01 0.0287 0.0875 0.497 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 9.71e-01 0.00394 0.109 0.497 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 1.76e-01 -0.154 0.113 0.497 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0127 0.106 0.497 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 9.34e-02 0.17 0.101 0.497 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0911 0.112 0.497 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -30347 sc-eQTL 3.67e-01 0.089 0.0983 0.497 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 8.78e-02 -0.148 0.0861 0.504 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00254 0.0877 0.504 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 1.26e-01 0.152 0.0987 0.504 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 5.52e-01 0.0536 0.0899 0.504 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 5.53e-01 0.0476 0.0801 0.504 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0337 0.0856 0.504 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00938 0.089 0.504 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 9.15e-02 0.151 0.0889 0.504 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 8.18e-01 -0.016 0.0695 0.498 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0828 0.0773 0.498 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 9.44e-01 0.0066 0.0938 0.498 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0178 0.0864 0.498 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 3.09e-01 0.0755 0.074 0.498 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 1.32e-01 -0.114 0.0754 0.498 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.72e-01 0.0884 0.0803 0.498 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 9.69e-02 -0.152 0.0912 0.498 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 2.27e-01 -0.108 0.0889 0.511 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 4.94e-01 0.0516 0.0753 0.511 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 4.52e-01 0.0765 0.102 0.511 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 1.16e-02 0.211 0.0826 0.511 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 5.84e-01 0.0566 0.103 0.511 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 5.46e-01 0.0544 0.09 0.511 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0297 0.0993 0.511 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 6.59e-01 0.0376 0.0852 0.511 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 1.41e-01 0.0892 0.0604 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 3.87e-01 0.073 0.0842 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 3.46e-01 0.0594 0.0629 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 9.87e-01 0.00116 0.072 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 1.47e-02 -0.218 0.0885 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0505 0.0697 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.61e-01 0.103 0.0913 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 1.64e-01 0.0718 0.0514 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 1.00e+00 4.02e-05 0.0699 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 7.76e-01 0.0165 0.0579 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 4.73e-01 0.0473 0.0659 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 907748 sc-eQTL 1.85e-01 -0.107 0.0803 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 1.61e-01 0.093 0.0661 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0571 0.0878 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0822 0.0608 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 8.70e-01 0.0121 0.0739 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0391 0.0695 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 3.62e-01 0.074 0.081 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 8.68e-01 -0.00973 0.0586 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0823 0.0563 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 2.59e-01 -0.1 0.0884 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 5.76e-01 0.046 0.0821 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0812 0.0627 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 462859 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0486 0.0743 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 4.08e-01 0.0699 0.0843 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 8.46e-01 0.016 0.0825 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 5.64e-01 0.0353 0.061 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 3.09e-01 -0.064 0.0628 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 7.19e-01 0.0291 0.0807 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 433901 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0452 0.0854 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 58744 sc-eQTL 7.07e-01 0.0165 0.0439 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 985704 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0161 0.0669 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 415704 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00761 0.0765 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 264849 sc-eQTL 2.83e-01 0.075 0.0698 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 600296 sc-eQTL 9.19e-01 0.00608 0.0599 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 sc-eQTL 6.28e-01 0.0362 0.0746 0.515 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 600296 eQTL 0.0133 0.0228 0.0092 0.00173 0.0 0.481
ENSG00000139350 NEDD1 -447999 eQTL 0.0413 -0.0504 0.0247 0.0 0.0 0.481
ENSG00000188596 CFAP54 -30351 eQTL 0.00813 -0.0545 0.0206 0.0 0.0 0.481

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina