logo

Genes within 1Mb (chr12:96454904:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 1.52e-02 -0.215 0.088 0.071 B L1
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 2.78e-01 -0.137 0.126 0.071 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00459 0.111 0.071 B L1
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 3.84e-01 -0.103 0.118 0.071 B L1
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 4.49e-02 0.291 0.144 0.071 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 1.55e-01 -0.152 0.107 0.071 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 4.34e-01 0.122 0.156 0.071 B L1
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 5.64e-02 -0.141 0.0737 0.071 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 1.91e-01 -0.136 0.103 0.071 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 4.81e-01 0.0719 0.102 0.071 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 1.24e-01 0.17 0.11 0.071 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 4.83e-01 -0.111 0.158 0.071 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0278 0.0967 0.071 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 1.51e-02 0.288 0.117 0.071 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 4.57e-03 -0.212 0.0738 0.071 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 4.05e-01 -0.101 0.121 0.071 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 4.89e-01 0.056 0.0807 0.071 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 4.49e-01 0.0921 0.121 0.071 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0295 0.138 0.071 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 2.64e-01 -0.111 0.0994 0.071 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 8.36e-02 0.229 0.132 0.071 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 3.60e-02 -0.285 0.135 0.072 DC L1
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 9.29e-01 0.0139 0.156 0.072 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 5.06e-01 -0.114 0.171 0.072 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 1.21e-01 -0.197 0.127 0.072 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 5.58e-01 0.0914 0.156 0.072 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.67e-01 -0.117 0.129 0.072 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 9.30e-01 0.0147 0.166 0.072 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 2.32e-01 -0.179 0.15 0.072 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 7.85e-01 0.0307 0.112 0.071 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 1.61e-01 -0.198 0.141 0.071 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0954 0.122 0.071 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 5.18e-01 -0.103 0.16 0.071 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 7.03e-01 0.041 0.107 0.071 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.43e-01 0.0961 0.101 0.071 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 1.52e-01 -0.222 0.155 0.071 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 3.63e-01 -0.137 0.15 0.071 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 5.36e-03 -0.234 0.0832 0.069 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 6.79e-01 0.052 0.125 0.069 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 3.03e-01 0.148 0.144 0.069 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 3.97e-01 -0.116 0.136 0.069 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 1.97e-01 -0.146 0.113 0.069 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 2.58e-01 -0.162 0.143 0.069 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0918 0.0697 0.071 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 663752 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00808 0.129 0.071 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0438 0.134 0.071 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 3.94e-01 0.125 0.146 0.071 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00791 0.114 0.071 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0506 0.106 0.071 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 6.32e-01 0.0774 0.161 0.071 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -34667 sc-eQTL 7.62e-01 0.0508 0.167 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 2.55e-01 -0.205 0.179 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 4.80e-01 -0.16 0.226 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 4.55e-01 -0.153 0.204 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0718 0.216 0.064 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0245 0.166 0.064 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 9.76e-01 0.0061 0.204 0.064 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 4.05e-01 0.177 0.213 0.064 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 1.38e-03 -0.431 0.133 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 1.49e-01 -0.225 0.155 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 3.71e-02 -0.274 0.131 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0015 0.149 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 1.92e-01 0.228 0.175 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 6.74e-01 0.0623 0.148 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 1.83e-01 -0.231 0.173 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0916 0.135 0.071 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 4.76e-01 0.125 0.175 0.071 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 7.63e-02 -0.276 0.155 0.071 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 4.53e-01 0.115 0.153 0.071 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 2.68e-01 0.186 0.168 0.071 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0946 0.162 0.071 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 8.96e-01 0.0235 0.18 0.071 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 3.24e-02 -0.233 0.108 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 1.67e-01 -0.195 0.141 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0872 0.114 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 2.00e-02 -0.313 0.134 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 1.99e-03 0.521 0.166 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 6.59e-03 -0.355 0.129 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 1.01e-01 0.277 0.168 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0137 0.141 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 3.53e-01 -0.158 0.17 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 7.23e-01 0.0473 0.133 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0503 0.157 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0452 0.17 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0761 0.156 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 7.80e-01 0.0519 0.186 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 1.29e-01 -0.2 0.131 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 5.63e-01 -0.109 0.189 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 4.09e-02 0.38 0.184 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0887 0.189 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 5.07e-01 0.0999 0.15 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0563 0.164 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 3.85e-01 -0.165 0.189 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 1.87e-01 -0.108 0.0812 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 3.33e-01 -0.114 0.117 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 5.01e-01 0.0794 0.118 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 1.37e-01 0.175 0.117 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 2.79e-01 -0.179 0.165 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0889 0.105 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 5.14e-02 0.25 0.128 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 3.73e-02 -0.168 0.0802 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 2.06e-01 -0.174 0.137 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 2.72e-01 0.151 0.137 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 6.18e-02 0.252 0.134 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 6.46e-01 0.086 0.187 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.03e-01 0.114 0.111 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 6.68e-01 0.0651 0.151 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 1.54e-01 -0.139 0.0971 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 4.88e-01 -0.113 0.163 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0253 0.151 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 4.43e-01 0.107 0.14 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0554 0.172 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 2.87e-01 -0.156 0.146 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 5.95e-01 0.0925 0.174 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 1.13e-02 -0.235 0.0919 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0855 0.161 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 5.94e-01 0.0898 0.168 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 1.20e-01 0.238 0.152 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0435 0.171 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 8.71e-01 0.0229 0.141 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 5.09e-02 0.308 0.157 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 1.03e-01 -0.184 0.112 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0831 0.15 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 2.55e-01 0.154 0.135 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 6.00e-01 0.0752 0.143 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0541 0.151 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.38e-02 -0.272 0.128 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 7.73e-02 0.27 0.152 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0499 0.123 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 1.08e-02 0.466 0.181 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0313 0.181 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 5.14e-01 -0.1 0.153 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 4.70e-01 0.12 0.166 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 9.10e-01 -0.02 0.177 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 6.02e-01 0.0903 0.173 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 7.35e-02 -0.277 0.154 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0627 0.182 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 8.91e-01 0.026 0.19 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 1.78e-01 0.251 0.186 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 4.51e-01 -0.12 0.159 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 2.02e-01 0.221 0.173 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 5.12e-01 0.124 0.188 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0139 0.103 0.069 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 663752 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0796 0.139 0.069 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 1.38e-01 0.259 0.174 0.069 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 1.40e-01 0.235 0.159 0.069 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0823 0.134 0.069 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0238 0.155 0.069 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 1.35e-01 0.26 0.173 0.069 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -34667 sc-eQTL 4.22e-01 -0.139 0.172 0.069 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 1.58e-01 -0.15 0.106 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 8.98e-02 0.304 0.178 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 3.13e-01 0.159 0.157 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0541 0.167 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 4.62e-03 -0.49 0.171 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 3.21e-02 -0.376 0.174 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 2.35e-02 -0.208 0.0912 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 9.70e-01 0.00607 0.162 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 9.13e-01 0.0182 0.167 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 9.48e-02 -0.246 0.147 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.04e-01 0.144 0.14 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 1.84e-01 -0.215 0.161 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0988 0.142 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 3.15e-01 0.18 0.179 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 5.74e-01 0.105 0.187 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 5.18e-01 0.112 0.173 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.09e-01 -0.183 0.18 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0472 0.171 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 3.68e-02 -0.206 0.0981 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 3.32e-01 -0.16 0.164 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 7.13e-02 0.301 0.166 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 3.48e-01 0.151 0.16 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.31e-02 -0.288 0.134 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 5.78e-01 0.0934 0.168 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 8.24e-01 -0.04 0.179 0.07 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 8.24e-01 0.0468 0.21 0.07 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 4.58e-01 0.117 0.158 0.07 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 3.12e-01 -0.205 0.202 0.07 PB L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 7.52e-01 0.0593 0.187 0.07 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 6.53e-01 0.0891 0.197 0.07 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 5.37e-01 0.145 0.235 0.07 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0664 0.11 0.072 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 663752 sc-eQTL 9.09e-01 0.0141 0.124 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 9.03e-02 -0.247 0.145 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0135 0.146 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 3.62e-01 0.161 0.176 0.072 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 4.42e-01 0.0853 0.111 0.072 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 7.83e-01 0.0444 0.161 0.072 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -34667 sc-eQTL 6.58e-01 0.0577 0.13 0.072 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0608 0.123 0.071 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 4.97e-01 -0.114 0.167 0.071 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 6.46e-01 0.0715 0.156 0.071 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 3.57e-02 -0.295 0.14 0.071 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 6.72e-01 0.0671 0.158 0.071 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 4.35e-01 -0.128 0.163 0.071 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 1.69e-01 0.251 0.181 0.071 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 4.53e-02 -0.29 0.144 0.076 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 2.78e-01 0.164 0.15 0.076 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 1.85e-01 0.241 0.181 0.076 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 1.75e-01 -0.175 0.129 0.076 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 1.96e-01 0.22 0.17 0.076 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 4.45e-01 -0.109 0.143 0.076 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 4.83e-01 0.122 0.174 0.076 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 3.36e-01 -0.141 0.146 0.076 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 8.69e-01 0.0214 0.13 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0452 0.142 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0386 0.147 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 3.58e-01 -0.141 0.153 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 2.40e-01 0.138 0.117 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 8.89e-01 0.017 0.122 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 5.40e-01 -0.103 0.167 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 8.13e-02 -0.272 0.155 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 9.43e-01 0.0106 0.147 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 1.06e-01 -0.266 0.163 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0183 0.166 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0496 0.164 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0946 0.134 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 1.88e-01 0.174 0.132 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 9.71e-02 -0.296 0.177 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0451 0.168 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0825 0.139 0.073 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 663752 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00857 0.159 0.073 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 1.66e-01 -0.276 0.198 0.073 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 2.60e-01 0.234 0.207 0.073 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 2.54e-01 0.219 0.191 0.073 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 1.27e-01 -0.283 0.184 0.073 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 5.48e-01 0.123 0.205 0.073 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -34667 sc-eQTL 3.55e-01 -0.166 0.179 0.073 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 9.31e-01 0.0142 0.164 0.071 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 1.28e-01 -0.253 0.165 0.071 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 4.56e-03 -0.529 0.185 0.071 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0123 0.171 0.071 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 6.63e-01 0.0662 0.152 0.071 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.32e-02 -0.344 0.161 0.071 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 9.10e-01 0.0191 0.169 0.071 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 5.19e-01 -0.11 0.17 0.071 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 9.59e-01 0.00669 0.13 0.072 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0153 0.145 0.072 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0781 0.175 0.072 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 8.63e-01 0.028 0.162 0.072 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 1.10e-01 -0.222 0.138 0.072 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 2.63e-01 0.159 0.141 0.072 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 8.35e-01 0.0315 0.151 0.072 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 5.40e-01 -0.105 0.172 0.072 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 2.26e-01 -0.2 0.165 0.076 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0199 0.14 0.076 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 7.23e-02 -0.338 0.187 0.076 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0251 0.157 0.076 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 9.21e-01 0.019 0.192 0.076 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 5.26e-01 -0.106 0.167 0.076 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0718 0.184 0.076 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0595 0.158 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 9.78e-04 -0.374 0.112 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 8.93e-02 -0.271 0.159 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 8.23e-02 -0.207 0.118 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 2.54e-01 0.156 0.136 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 2.84e-01 0.182 0.169 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 3.70e-01 -0.118 0.132 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00841 0.173 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 6.46e-02 -0.18 0.0971 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 1.70e-01 -0.182 0.132 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0721 0.11 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 5.64e-02 -0.238 0.124 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 903428 sc-eQTL 6.26e-02 0.284 0.152 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 6.28e-02 -0.234 0.125 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 2.38e-01 0.197 0.166 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 9.33e-01 0.0099 0.117 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 2.43e-01 -0.165 0.141 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0169 0.133 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0792 0.155 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 6.53e-01 0.0506 0.112 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 2.85e-01 0.116 0.108 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 1.78e-01 -0.229 0.169 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 4.26e-01 -0.126 0.157 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 5.84e-01 0.0665 0.121 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 458539 sc-eQTL 4.34e-01 -0.112 0.143 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 4.67e-02 -0.323 0.161 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00813 0.159 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0727 0.118 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0773 0.121 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 8.02e-01 0.0391 0.156 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 429581 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0422 0.165 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54424 sc-eQTL 3.14e-03 -0.252 0.0843 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981384 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00617 0.131 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411384 sc-eQTL 3.06e-01 0.153 0.149 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260529 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0949 0.137 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595976 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0823 0.117 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452319 sc-eQTL 4.50e-01 -0.11 0.146 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 54424 eQTL 1.07e-02 0.061 0.0238 0.00174 0.0 0.0628
ENSG00000084110 HAL 458539 eQTL 0.0227 -0.0634 0.0278 0.0 0.0 0.0628
ENSG00000111144 LTA4H 411384 pQTL 0.0314 0.077 0.0357 0.0 0.0 0.06
ENSG00000188596 CFAP54 -34671 eQTL 0.0145 -0.0985 0.0402 0.0 0.0 0.0628

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina