logo

Genes within 1Mb (chr12:96454736:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 3.04e-03 -0.164 0.0546 0.199 B L1
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 9.74e-02 -0.13 0.0783 0.199 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0309 0.0692 0.199 B L1
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0997 0.0733 0.199 B L1
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 1.62e-01 0.127 0.0904 0.199 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0428 0.0668 0.199 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0642 0.0976 0.199 B L1
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 3.08e-02 -0.0975 0.0449 0.199 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0489 0.0632 0.199 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0198 0.0623 0.199 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 3.88e-01 0.0583 0.0674 0.199 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0576 0.0962 0.199 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0503 0.0589 0.199 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 3.28e-02 0.154 0.0719 0.199 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 3.15e-02 -0.0997 0.0461 0.199 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0335 0.0751 0.199 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 5.72e-01 0.0283 0.05 0.199 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 5.44e-02 0.144 0.0746 0.199 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0461 0.0855 0.199 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.21e-01 -0.022 0.0616 0.199 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 1.52e-01 0.117 0.0816 0.199 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 1.34e-01 -0.127 0.0843 0.2 DC L1
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 2.59e-01 -0.109 0.0962 0.2 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00218 0.106 0.2 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 7.03e-02 -0.142 0.0782 0.2 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 2.57e-01 -0.109 0.0963 0.2 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00558 0.0804 0.2 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 2.46e-01 0.12 0.103 0.2 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0653 0.093 0.2 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 5.06e-01 0.0464 0.0697 0.199 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 7.52e-02 -0.156 0.0872 0.199 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 4.41e-02 -0.152 0.0752 0.199 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 1.78e-01 -0.133 0.0988 0.199 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0204 0.0666 0.199 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.96e-02 0.11 0.0623 0.199 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0988 0.0962 0.199 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 1.82e-01 -0.125 0.0931 0.199 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 6.84e-01 -0.021 0.0515 0.197 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 5.28e-01 0.0481 0.0762 0.197 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0337 0.0874 0.197 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 1.47e-01 -0.12 0.0825 0.197 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 3.08e-02 -0.148 0.068 0.197 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 1.56e-01 -0.123 0.0867 0.197 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0259 0.0439 0.199 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 663584 sc-eQTL 6.27e-01 0.0395 0.0812 0.199 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0605 0.0837 0.199 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 7.34e-01 0.0312 0.0917 0.199 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 6.38e-01 0.0337 0.0716 0.199 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 9.98e-01 0.000128 0.0666 0.199 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 6.16e-02 0.189 0.101 0.199 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -34835 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0347 0.105 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0989 0.1 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0532 0.126 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0999 0.113 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 8.37e-01 0.0248 0.12 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 4.64e-01 0.0678 0.0923 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000953 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 5.67e-01 0.0681 0.119 0.202 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 4.20e-03 -0.239 0.0827 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0782 0.0966 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 3.03e-02 -0.176 0.0808 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0323 0.0921 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 1.56e-01 0.154 0.108 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0347 0.0917 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 5.82e-02 -0.203 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 8.32e-01 0.0174 0.0818 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 5.69e-01 0.0606 0.106 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 8.77e-02 -0.161 0.0938 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0687 0.0928 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 5.20e-01 0.0657 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.74e-01 0.0283 0.0984 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 6.57e-01 0.0484 0.109 0.2 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 2.61e-02 -0.151 0.0675 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 1.13e-01 -0.14 0.0879 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0303 0.0715 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 1.05e-01 -0.137 0.0841 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 1.29e-01 0.161 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0761 0.0821 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 7.96e-01 0.0273 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 7.18e-02 -0.154 0.0853 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 2.09e-01 -0.13 0.103 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0763 0.0813 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 4.52e-02 -0.192 0.0951 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 9.81e-01 0.00241 0.104 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 9.12e-01 0.0105 0.0953 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0618 0.113 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 1.12e-01 -0.126 0.0787 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0482 0.113 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 8.10e-01 0.0269 0.112 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 3.95e-01 0.0961 0.113 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 7.83e-01 0.0249 0.0902 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 1.80e-01 -0.132 0.0978 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 9.91e-01 0.00122 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 8.10e-02 -0.0875 0.0499 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 9.94e-01 0.000506 0.0725 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 2.71e-01 -0.08 0.0725 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 2.57e-01 0.0824 0.0725 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0518 0.102 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0142 0.0646 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 5.91e-02 0.15 0.0789 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 2.66e-02 -0.108 0.0482 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 1.96e-01 -0.107 0.0827 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00202 0.0827 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 1.00e-01 0.133 0.0808 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 5.58e-01 -0.066 0.112 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 3.01e-01 -0.069 0.0665 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0237 0.0911 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 4.64e-02 -0.118 0.0591 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 2.74e-01 -0.109 0.0995 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 4.61e-01 0.068 0.092 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0128 0.0856 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 7.21e-01 0.0377 0.105 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0951 0.0894 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 1.58e-01 0.15 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0648 0.0578 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 4.48e-01 -0.076 0.1 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 3.76e-01 0.0926 0.104 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 1.27e-01 0.145 0.0947 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0619 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 4.88e-01 0.0608 0.0874 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0201 0.0982 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 6.05e-01 -0.036 0.0694 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0431 0.0923 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 8.06e-01 0.0205 0.0832 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 5.28e-01 0.0556 0.088 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0718 0.0924 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0645 0.0791 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 1.90e-02 0.22 0.093 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0695 0.0748 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 1.26e-02 0.277 0.11 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 2.82e-02 -0.24 0.109 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 1.37e-01 0.138 0.0927 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 4.51e-01 0.0761 0.101 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0293 0.107 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 2.04e-01 0.134 0.105 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 6.43e-02 -0.172 0.0923 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 5.17e-01 0.0708 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 9.14e-01 0.0123 0.114 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 3.52e-01 0.104 0.112 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0545 0.0953 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.82e-01 0.0289 0.104 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 1.20e-01 0.176 0.112 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00926 0.0623 0.199 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 663584 sc-eQTL 7.29e-01 0.0291 0.0839 0.199 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 7.49e-01 0.0338 0.106 0.199 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0274 0.0962 0.199 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 7.48e-01 0.026 0.0807 0.199 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.49e-01 -0.03 0.0935 0.199 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 3.20e-03 0.307 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -34835 sc-eQTL 1.08e-01 -0.167 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 3.03e-02 -0.141 0.0648 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0495 0.111 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0203 0.097 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0997 0.103 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 8.98e-02 -0.182 0.107 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0552 0.109 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0472 0.0556 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000988 0.0976 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 9.29e-01 0.00901 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 2.51e-01 -0.102 0.0888 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0228 0.0848 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 1.65e-01 -0.135 0.0972 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 3.65e-01 0.0795 0.0875 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 4.85e-01 0.0772 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 6.28e-01 0.0557 0.115 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0741 0.107 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 1.45e-01 -0.162 0.111 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0774 0.105 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 5.42e-01 0.037 0.0607 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00881 0.101 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 3.82e-01 0.0897 0.102 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 7.87e-01 0.0266 0.0983 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 2.56e-02 -0.185 0.0823 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 8.46e-01 -0.02 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00812 0.116 0.189 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00506 0.135 0.189 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 1.59e-01 -0.144 0.101 0.189 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 1.14e-02 -0.327 0.127 0.189 PB L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 7.87e-01 0.0328 0.121 0.189 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0439 0.128 0.189 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 1.56e-01 0.215 0.15 0.189 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 9.45e-01 0.00473 0.068 0.2 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 663584 sc-eQTL 1.14e-01 -0.12 0.0759 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0962 0.09 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0507 0.0898 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 5.17e-01 0.0704 0.109 0.2 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 8.84e-01 0.01 0.0685 0.2 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 3.57e-01 0.0916 0.0993 0.2 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -34835 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0266 0.0805 0.2 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0245 0.0744 0.199 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 5.61e-01 -0.059 0.101 0.199 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 9.95e-01 0.000637 0.0943 0.199 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0759 0.0852 0.199 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 6.52e-01 0.0433 0.0958 0.199 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0241 0.0989 0.199 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 1.10e-01 0.176 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 1.88e-01 -0.12 0.0911 0.205 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 9.09e-01 0.0109 0.0952 0.205 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 4.92e-01 0.079 0.115 0.205 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0917 0.0813 0.205 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0409 0.108 0.205 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000735 0.0901 0.205 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 5.53e-01 0.0652 0.11 0.205 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 6.66e-01 -0.04 0.0925 0.205 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 2.47e-01 0.0932 0.0803 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0545 0.0878 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0229 0.0911 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 1.01e-01 -0.155 0.0943 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00543 0.0731 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 2.23e-01 0.0918 0.0752 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0838 0.104 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 4.32e-02 -0.195 0.096 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000331 0.0909 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 1.81e-02 -0.24 0.101 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 4.39e-03 -0.292 0.101 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0726 0.102 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0362 0.083 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 3.80e-01 0.0721 0.0819 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0358 0.111 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 3.32e-01 -0.101 0.104 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 2.24e-01 -0.105 0.0857 0.206 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 663584 sc-eQTL 9.95e-01 0.000579 0.0989 0.206 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 7.44e-02 -0.22 0.122 0.206 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 4.21e-02 0.26 0.127 0.206 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 6.05e-01 0.0618 0.119 0.206 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 6.38e-03 -0.31 0.112 0.206 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 9.57e-01 0.00681 0.127 0.206 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -34835 sc-eQTL 7.67e-01 -0.033 0.111 0.206 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 6.60e-01 0.0458 0.104 0.2 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0445 0.105 0.2 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 2.12e-02 -0.273 0.117 0.2 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 1.76e-01 -0.146 0.107 0.2 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 3.27e-01 0.0941 0.0958 0.2 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 1.54e-01 -0.146 0.102 0.2 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000363 0.107 0.2 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 9.88e-02 -0.177 0.107 0.2 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 4.38e-01 0.063 0.0812 0.206 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0218 0.0907 0.206 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 2.15e-01 -0.136 0.109 0.206 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0907 0.101 0.206 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0266 0.0868 0.206 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 2.52e-01 0.102 0.0884 0.206 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0965 0.094 0.206 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 7.39e-01 0.0358 0.107 0.206 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0663 0.108 0.206 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 1.01e-01 -0.149 0.0902 0.206 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0945 0.123 0.206 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 1.61e-01 -0.142 0.101 0.206 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 1.45e-01 -0.181 0.124 0.206 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 1.43e-01 -0.159 0.108 0.206 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0448 0.12 0.206 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0317 0.103 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 1.15e-02 -0.178 0.0699 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 2.81e-01 -0.106 0.0985 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 3.25e-02 -0.157 0.0729 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0314 0.0842 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 4.96e-01 0.0715 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0668 0.0815 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0542 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 7.36e-03 -0.162 0.06 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0962 0.0823 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0499 0.0684 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 2.18e-02 -0.178 0.077 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 903260 sc-eQTL 3.88e-01 0.0824 0.0952 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0397 0.0785 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0197 0.104 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 3.73e-01 0.0647 0.0725 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 9.81e-02 -0.145 0.0874 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 8.30e-02 -0.143 0.0823 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 1.46e-01 -0.14 0.0961 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0179 0.0698 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 7.06e-02 0.121 0.0668 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0737 0.105 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 1.27e-01 -0.149 0.0973 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 4.72e-01 0.0539 0.0748 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 458371 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0326 0.0885 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 2.95e-02 -0.218 0.0994 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 1.87e-01 -0.129 0.0978 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 8.95e-01 0.0096 0.0727 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0448 0.0749 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 5.96e-01 -0.051 0.096 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 429413 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0296 0.102 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54256 sc-eQTL 7.45e-01 -0.017 0.052 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981216 sc-eQTL 9.89e-01 0.00105 0.0792 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411216 sc-eQTL 7.83e-01 0.025 0.0904 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260361 sc-eQTL 1.85e-01 -0.11 0.0825 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595808 sc-eQTL 6.77e-02 -0.129 0.0703 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 sc-eQTL 2.62e-01 -0.099 0.0881 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000084110 HAL 458371 eQTL 0.000291 -0.0639 0.0176 0.0 0.0 0.184
ENSG00000111144 LTA4H 411216 eQTL 0.00942 -0.0677 0.026 0.0 0.0 0.184
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 eQTL 0.000224 -0.113 0.0305 0.0 0.0 0.184
ENSG00000188596 CFAP54 -34839 eQTL 0.0251 -0.0573 0.0255 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -452487 6.97e-07 5.74e-07 8.02e-08 3.58e-07 9.93e-08 1.71e-07 5.01e-07 8.17e-08 3.32e-07 1.89e-07 6.28e-07 3.08e-07 6e-07 1.07e-07 1.18e-07 1.53e-07 2.11e-07 3.04e-07 1.62e-07 8.25e-08 1.61e-07 3.1e-07 3.11e-07 1.06e-07 6.59e-07 2.46e-07 1.78e-07 1.88e-07 2.66e-07 5.56e-07 2.31e-07 5.38e-08 5.41e-08 1.18e-07 1.95e-07 5.41e-08 7.97e-08 6.2e-08 5.89e-08 7.53e-08 3.17e-08 4.68e-07 3.19e-08 1.1e-08 6.59e-08 8.59e-09 9.73e-08 0.0 4.54e-08