logo

Genes within 1Mb (chr12:96454570:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 1.35e-01 0.0697 0.0465 0.506 B L1
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 9.64e-01 0.00297 0.0661 0.506 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 4.72e-01 0.0417 0.058 0.506 B L1
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 5.60e-01 0.036 0.0617 0.506 B L1
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 2.95e-03 -0.224 0.0746 0.506 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 3.32e-01 0.0544 0.056 0.506 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0643 0.0818 0.506 B L1
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 8.43e-01 -0.00748 0.0376 0.506 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 4.17e-01 0.0426 0.0524 0.506 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 7.45e-01 0.0169 0.0517 0.506 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0301 0.0559 0.506 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 8.23e-02 0.138 0.0793 0.506 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00306 0.0489 0.506 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0257 0.0602 0.506 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0188 0.0386 0.506 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 1.04e-01 0.101 0.0619 0.506 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 6.47e-01 -0.019 0.0414 0.506 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0742 0.0622 0.506 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 2.24e-01 0.0861 0.0707 0.506 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 4.92e-01 0.0352 0.051 0.506 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0667 0.0678 0.506 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00506 0.0736 0.5 DC L1
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0539 0.0837 0.5 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 5.84e-01 0.0506 0.0923 0.5 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 1.21e-01 0.106 0.0681 0.5 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0135 0.0839 0.5 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 7.06e-01 0.0264 0.0698 0.5 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 2.29e-01 -0.108 0.0893 0.5 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0323 0.0809 0.5 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0246 0.0583 0.506 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 8.81e-01 0.011 0.0735 0.506 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 7.63e-01 0.0192 0.0635 0.506 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 5.11e-01 0.0546 0.0829 0.506 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 8.58e-01 0.00996 0.0557 0.506 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 8.53e-02 -0.0902 0.0522 0.506 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0452 0.0806 0.506 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 6.68e-01 0.0335 0.0782 0.506 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 2.72e-01 0.0479 0.0435 0.506 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 6.42e-01 -0.03 0.0646 0.506 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 9.80e-01 0.00186 0.0741 0.506 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 4.62e-01 0.0517 0.0702 0.506 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 3.29e-01 0.0569 0.0581 0.506 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 5.69e-01 0.042 0.0737 0.506 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 8.33e-02 0.0633 0.0364 0.506 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 663418 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0996 0.0674 0.506 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 4.95e-01 0.0478 0.0699 0.506 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 5.40e-01 -0.047 0.0765 0.506 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0671 0.0596 0.506 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0113 0.0555 0.506 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 3.24e-02 -0.18 0.0837 0.506 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -35001 sc-eQTL 5.42e-01 0.0535 0.0875 0.506 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 6.34e-01 0.0413 0.0867 0.495 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 1.19e-01 0.17 0.108 0.495 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 1.24e-01 0.151 0.0975 0.495 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 3.12e-01 0.105 0.104 0.495 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 4.20e-01 0.0645 0.0797 0.495 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 2.63e-01 0.11 0.0977 0.495 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0996 0.102 0.495 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 1.01e-01 0.118 0.0715 0.504 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 5.12e-01 0.0542 0.0824 0.504 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 3.73e-01 0.0621 0.0696 0.504 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 9.35e-02 -0.132 0.0781 0.504 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 2.93e-03 -0.273 0.0907 0.504 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0308 0.0782 0.504 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 3.00e-01 0.0951 0.0915 0.504 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0231 0.0698 0.509 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 9.86e-01 0.00165 0.0908 0.509 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 7.25e-01 0.0284 0.0806 0.509 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 9.89e-02 0.13 0.0787 0.509 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 9.75e-02 -0.144 0.0864 0.509 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.77e-01 -0.113 0.0836 0.509 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 1.71e-01 0.127 0.0925 0.509 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 6.87e-01 0.0232 0.0575 0.506 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 4.97e-01 0.0505 0.0743 0.506 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0262 0.0602 0.506 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 1.62e-01 0.0996 0.0709 0.506 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 7.40e-02 -0.16 0.0889 0.506 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 3.65e-02 0.144 0.0686 0.506 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 4.60e-01 0.0657 0.0887 0.506 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 7.68e-02 0.129 0.0726 0.506 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0364 0.0882 0.506 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 5.51e-01 0.0413 0.0692 0.506 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 6.06e-01 0.0421 0.0816 0.506 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0566 0.0881 0.506 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 3.43e-01 0.0769 0.0809 0.506 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 6.31e-02 -0.179 0.0956 0.506 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 3.73e-01 0.0598 0.0669 0.509 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 1.55e-01 -0.136 0.0955 0.509 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 6.59e-02 -0.173 0.0938 0.509 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 3.11e-01 -0.097 0.0955 0.509 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 7.86e-01 0.0208 0.0764 0.509 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 7.76e-01 0.0237 0.0832 0.509 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 2.61e-01 -0.108 0.0959 0.509 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0134 0.0412 0.506 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 6.07e-01 0.0306 0.0594 0.506 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 7.52e-01 0.0188 0.0596 0.506 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0634 0.0595 0.506 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 7.40e-02 0.149 0.0829 0.506 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0273 0.0529 0.506 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0772 0.065 0.506 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 9.64e-01 0.00181 0.0404 0.506 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 2.56e-01 0.0782 0.0686 0.506 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0136 0.0685 0.506 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0264 0.0674 0.506 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 2.98e-01 0.0969 0.0929 0.506 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 4.41e-01 0.0426 0.0552 0.506 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 2.09e-01 0.0949 0.0753 0.506 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 2.99e-02 0.107 0.049 0.506 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 9.91e-01 0.000886 0.0829 0.506 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 8.50e-01 0.0145 0.0765 0.506 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 4.17e-01 0.0577 0.071 0.506 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 5.78e-01 0.0488 0.0874 0.506 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0667 0.0743 0.506 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 5.19e-01 -0.057 0.0882 0.506 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 1.28e-01 0.0734 0.0481 0.506 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 6.95e-02 0.151 0.0829 0.506 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 8.57e-01 0.0157 0.0873 0.506 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 6.51e-01 0.036 0.0795 0.506 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 3.28e-01 0.0866 0.0884 0.506 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0247 0.073 0.506 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00228 0.082 0.506 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0818 0.0575 0.506 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 4.42e-01 0.059 0.0767 0.506 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00516 0.0693 0.506 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0586 0.0732 0.506 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 3.75e-01 0.0683 0.0768 0.506 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 5.36e-01 0.0408 0.0658 0.506 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0505 0.0784 0.506 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 3.03e-01 0.0649 0.0628 0.498 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0871 0.0937 0.498 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 9.34e-01 0.00769 0.0925 0.498 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0433 0.0783 0.498 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0649 0.0847 0.498 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.78e-01 0.121 0.0898 0.498 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 9.57e-02 -0.147 0.0877 0.498 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00604 0.0811 0.495 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 8.43e-01 0.0188 0.0952 0.495 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00423 0.0993 0.495 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 9.02e-01 0.0121 0.0976 0.495 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00413 0.0831 0.495 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 9.04e-01 -0.011 0.0907 0.495 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 1.82e-01 -0.131 0.098 0.495 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0112 0.0525 0.504 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 663418 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0735 0.0706 0.504 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 2.47e-01 0.103 0.0889 0.504 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0332 0.0811 0.504 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0626 0.068 0.504 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0934 0.0787 0.504 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 7.20e-02 -0.159 0.088 0.504 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -35001 sc-eQTL 9.08e-01 0.0102 0.0878 0.504 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 2.03e-03 0.171 0.0545 0.504 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 7.01e-01 0.0362 0.0942 0.504 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 9.58e-01 0.00433 0.0826 0.504 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 9.82e-01 0.00193 0.0877 0.504 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.43e-01 0.134 0.0912 0.504 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 4.56e-01 0.069 0.0924 0.504 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 1.67e-01 0.0652 0.047 0.509 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 6.32e-01 0.0396 0.0827 0.509 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 7.04e-01 0.0324 0.0852 0.509 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 4.89e-01 0.0523 0.0754 0.509 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0752 0.0717 0.509 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 7.42e-01 0.0273 0.0827 0.509 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0703 0.0749 0.511 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 1.10e-01 -0.151 0.094 0.511 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0979 0.0982 0.511 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 8.61e-01 0.016 0.0913 0.511 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.19e-01 0.148 0.0946 0.511 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 6.87e-01 0.0363 0.09 0.511 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 8.60e-01 0.00916 0.0518 0.509 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 8.44e-01 0.017 0.086 0.509 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0454 0.0875 0.509 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 9.86e-01 0.00151 0.0838 0.509 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.51e-01 0.102 0.0706 0.509 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 2.67e-01 0.0974 0.0875 0.509 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 7.51e-01 0.032 0.101 0.526 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0692 0.117 0.526 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 8.40e-01 0.0179 0.0887 0.526 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 1.39e-01 0.168 0.113 0.526 PB L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 1.98e-01 0.135 0.105 0.526 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0757 0.111 0.526 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 3.68e-01 -0.119 0.131 0.526 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 9.89e-01 0.000781 0.0579 0.502 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 663418 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0229 0.0649 0.502 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 1.61e-01 0.107 0.0764 0.502 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 6.74e-01 0.0321 0.0764 0.502 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 3.64e-01 -0.084 0.0922 0.502 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 9.02e-01 0.00719 0.0583 0.502 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 9.67e-01 0.00349 0.0846 0.502 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -35001 sc-eQTL 3.84e-01 0.0596 0.0683 0.502 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 9.88e-01 0.000961 0.0629 0.506 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 9.68e-02 0.142 0.085 0.506 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 8.02e-01 0.02 0.0796 0.506 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0427 0.0721 0.506 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 5.69e-01 0.0461 0.081 0.506 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.80e-01 0.112 0.0832 0.506 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 8.65e-01 0.0159 0.0932 0.506 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 2.56e-01 0.0901 0.0791 0.498 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0477 0.0824 0.498 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0844 0.0994 0.498 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 1.05e-01 0.114 0.0702 0.498 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 2.89e-01 -0.099 0.0931 0.498 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 4.34e-01 0.0611 0.078 0.498 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00599 0.0952 0.498 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 9.63e-01 0.00373 0.0803 0.498 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 1.50e-01 -0.098 0.0678 0.506 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0428 0.0743 0.506 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0792 0.0769 0.506 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 2.66e-01 0.0893 0.0801 0.506 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0649 0.0617 0.506 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 9.42e-02 -0.107 0.0634 0.506 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 1.86e-01 -0.116 0.0875 0.506 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 4.08e-01 0.0679 0.0819 0.506 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0428 0.0766 0.506 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 7.87e-02 0.151 0.0854 0.506 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 3.86e-01 0.0754 0.0869 0.506 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 8.82e-01 0.0127 0.086 0.506 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 3.72e-01 0.0625 0.0699 0.506 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0101 0.0692 0.506 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0359 0.0934 0.506 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 7.90e-01 0.0235 0.0879 0.506 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 7.24e-02 0.137 0.0759 0.488 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 663418 sc-eQTL 7.40e-01 0.0293 0.0881 0.488 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 7.23e-01 0.0392 0.11 0.488 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 1.60e-01 -0.161 0.114 0.488 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0324 0.106 0.488 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.61e-01 0.144 0.102 0.488 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0355 0.113 0.488 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -35001 sc-eQTL 2.36e-01 0.118 0.0988 0.488 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 1.78e-01 -0.118 0.0872 0.498 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 9.93e-01 0.000832 0.0886 0.498 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 7.98e-02 0.175 0.0996 0.498 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 5.08e-01 0.0602 0.0908 0.498 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 5.62e-01 0.047 0.0809 0.498 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 5.87e-01 -0.047 0.0865 0.498 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0166 0.0899 0.498 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 8.25e-02 0.157 0.0898 0.498 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00542 0.0699 0.491 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 1.65e-01 -0.108 0.0777 0.491 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 8.66e-01 0.0159 0.0944 0.491 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0189 0.087 0.491 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 3.23e-01 0.0739 0.0746 0.491 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0993 0.076 0.491 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 2.39e-01 0.0954 0.0808 0.491 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 1.61e-01 -0.13 0.0921 0.491 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0889 0.0902 0.503 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 5.02e-01 0.0514 0.0763 0.503 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 4.37e-01 0.0803 0.103 0.503 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 1.79e-02 0.201 0.084 0.503 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 4.84e-01 0.0733 0.104 0.503 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 4.46e-01 0.0696 0.0911 0.503 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0305 0.101 0.503 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 6.74e-01 0.0364 0.0863 0.503 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 1.98e-01 0.0782 0.0606 0.506 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 3.71e-01 0.0757 0.0844 0.506 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 3.35e-01 0.0609 0.063 0.506 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 9.34e-01 0.00594 0.0722 0.506 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 7.21e-03 -0.24 0.0885 0.506 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0368 0.0699 0.506 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 1.49e-01 0.132 0.0913 0.506 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 2.35e-01 0.0614 0.0515 0.506 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000617 0.07 0.506 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 7.87e-01 0.0157 0.058 0.506 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 3.94e-01 0.0564 0.066 0.506 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 903094 sc-eQTL 7.84e-02 -0.142 0.0802 0.506 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.05e-01 0.108 0.0661 0.506 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0632 0.088 0.506 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0817 0.061 0.506 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 7.63e-01 0.0224 0.0742 0.506 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0126 0.0699 0.506 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 3.42e-01 0.0774 0.0813 0.506 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 9.82e-01 0.00131 0.0589 0.506 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0892 0.0565 0.506 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 2.49e-01 -0.103 0.0888 0.506 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 4.98e-01 0.056 0.0824 0.506 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0619 0.0631 0.506 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 458205 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0692 0.0746 0.506 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 2.65e-01 0.0945 0.0845 0.506 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 7.82e-01 0.023 0.0828 0.506 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 6.53e-01 0.0276 0.0613 0.506 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 3.84e-01 -0.055 0.0631 0.506 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 7.04e-01 0.0308 0.081 0.506 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 429247 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0278 0.0858 0.506 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 54090 sc-eQTL 6.28e-01 0.0214 0.0441 0.509 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 981050 sc-eQTL 8.70e-01 -0.011 0.0671 0.509 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 411050 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0213 0.0767 0.509 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 260195 sc-eQTL 4.48e-01 0.0533 0.0701 0.509 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 595642 sc-eQTL 7.68e-01 0.0177 0.0601 0.509 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 sc-eQTL 5.42e-01 0.0457 0.0748 0.509 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 595642 eQTL 0.0165 0.0221 0.0092 0.00154 0.0 0.485
ENSG00000139350 NEDD1 -452653 eQTL 0.00634 -0.0673 0.0246 0.0 0.0 0.485
ENSG00000188596 CFAP54 -35005 eQTL 0.011 -0.0524 0.0205 0.0 0.0 0.485

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000188596 CFAP54 -35005 2.39e-05 2.74e-05 2.64e-06 1.27e-05 2.75e-06 8.49e-06 2.75e-05 2.93e-06 1.87e-05 8.91e-06 2.23e-05 9.59e-06 3.59e-05 1.07e-05 5.84e-06 1.15e-05 9.24e-06 1.69e-05 4.19e-06 4.13e-06 8.43e-06 2.09e-05 1.8e-05 4.96e-06 2.89e-05 5.31e-06 7.99e-06 8.09e-06 1.9e-05 1.48e-05 1.25e-05 1.11e-06 1.55e-06 4.07e-06 7.28e-06 3.41e-06 1.78e-06 2.39e-06 2.99e-06 2.38e-06 1.01e-06 3.4e-05 2.67e-06 1.53e-07 1.02e-06 2.44e-06 3.24e-06 6.16e-07 5.8e-07