logo

Genes within 1Mb (chr12:96432833:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.74e-01 0.07 0.0513 0.222 B L1
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0682 0.0728 0.222 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0518 0.064 0.222 B L1
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 9.57e-01 0.0037 0.0682 0.222 B L1
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 9.91e-03 0.215 0.0828 0.222 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0129 0.0619 0.222 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 5.66e-01 0.0519 0.0904 0.222 B L1
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 8.08e-01 0.0104 0.0426 0.222 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 9.11e-01 0.00665 0.0594 0.222 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 1.00e+00 -3.57e-05 0.0585 0.222 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 7.21e-01 0.0227 0.0634 0.222 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 4.32e-01 -0.071 0.0903 0.222 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 1.25e-01 0.0847 0.0551 0.222 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 1.23e-01 -0.105 0.0678 0.222 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 2.81e-01 0.0468 0.0433 0.222 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0653 0.07 0.222 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 1.92e-01 0.0608 0.0464 0.222 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 1.04e-01 0.114 0.0698 0.222 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00772 0.0798 0.222 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 6.64e-02 -0.105 0.0571 0.222 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0555 0.0764 0.222 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 3.28e-01 0.0812 0.0827 0.223 DC L1
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 9.43e-01 0.00677 0.0944 0.223 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 1.63e-01 -0.145 0.104 0.223 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 9.97e-01 0.000311 0.0772 0.223 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 7.78e-01 0.0267 0.0945 0.223 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0793 0.0784 0.223 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 1.04e-01 0.164 0.1 0.223 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0374 0.0911 0.223 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 5.32e-01 0.0413 0.0659 0.222 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 8.57e-01 -0.015 0.0831 0.222 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00955 0.0718 0.222 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 1.71e-01 -0.128 0.0935 0.222 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 1.29e-01 0.0956 0.0627 0.222 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 5.23e-01 0.038 0.0594 0.222 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 8.42e-03 0.239 0.0898 0.222 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0717 0.0883 0.222 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.38e-01 -0.072 0.0483 0.223 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0373 0.0719 0.223 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00128 0.0825 0.223 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 6.00e-01 0.041 0.0782 0.223 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0598 0.0647 0.223 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00574 0.0821 0.223 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0322 0.0407 0.222 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 641681 sc-eQTL 5.19e-01 0.0487 0.0754 0.222 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0217 0.0779 0.222 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0849 0.0851 0.222 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 8.89e-01 0.00932 0.0665 0.222 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 9.94e-01 0.000493 0.0618 0.222 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 8.05e-01 0.0232 0.0941 0.222 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -56738 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0479 0.0974 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 7.53e-01 0.0291 0.0923 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0706 0.116 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 3.02e-02 -0.225 0.103 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0404 0.111 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0147 0.085 0.23 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 8.03e-01 -0.026 0.104 0.23 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0685 0.109 0.23 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.47e-01 0.116 0.0795 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 9.77e-01 0.00264 0.0916 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0498 0.0773 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 6.93e-02 0.158 0.0866 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 4.58e-04 0.356 0.0999 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 6.66e-02 -0.159 0.0862 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 6.11e-01 0.0519 0.102 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.78e-01 0.104 0.077 0.22 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 8.68e-01 0.0167 0.101 0.22 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0352 0.0892 0.22 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 3.05e-01 -0.09 0.0876 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 8.46e-01 0.0188 0.0963 0.22 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0353 0.093 0.22 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0977 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 9.05e-01 0.00763 0.0641 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 8.48e-02 -0.143 0.0824 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 9.11e-01 0.00752 0.0672 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0538 0.0793 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 4.66e-01 0.0729 0.0997 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0178 0.0772 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0254 0.0991 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 8.66e-01 0.0136 0.0805 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0294 0.0972 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0904 0.0761 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0679 0.0899 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 2.72e-01 0.107 0.0969 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0627 0.0893 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.12e-03 0.323 0.104 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 3.80e-01 0.0679 0.0771 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 3.06e-01 0.113 0.11 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 6.41e-01 0.0508 0.109 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 9.78e-02 -0.182 0.11 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 2.05e-01 0.111 0.0877 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 6.97e-01 0.0373 0.0958 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 7.30e-01 0.0382 0.111 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 5.59e-01 0.0274 0.0469 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 3.99e-01 -0.057 0.0675 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 4.90e-01 0.0469 0.0677 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 6.25e-01 0.0331 0.0678 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0837 0.0949 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 5.59e-01 0.0352 0.0602 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0875 0.074 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0254 0.0453 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 2.06e-01 0.0975 0.0769 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0349 0.0769 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 3.32e-01 0.0734 0.0755 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0665 0.105 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 5.19e-01 0.04 0.062 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.00e-01 -0.109 0.0845 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.67e-02 -0.134 0.0556 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 7.50e-01 0.03 0.0941 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 7.39e-01 -0.029 0.087 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 7.32e-01 0.0277 0.0808 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0304 0.0994 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 3.53e-02 0.177 0.0837 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 4.41e-01 0.0774 0.1 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0439 0.0547 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 1.64e-01 -0.132 0.0943 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 5.95e-01 0.0527 0.0989 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00482 0.0901 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 1.58e-01 0.142 0.0999 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0723 0.0826 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 5.81e-01 0.0514 0.0928 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.79e-01 0.0874 0.0648 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 9.47e-01 0.00574 0.0865 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 6.81e-01 0.0321 0.078 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 1.17e-01 0.129 0.082 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0465 0.0866 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 1.65e-01 -0.103 0.0738 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0666 0.0882 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 7.34e-01 0.024 0.0705 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0265 0.105 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 5.01e-01 0.0698 0.103 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 1.95e-01 0.113 0.0873 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 6.10e-01 0.0485 0.0949 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0186 0.101 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00456 0.0989 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00259 0.0892 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0681 0.105 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 6.41e-01 -0.051 0.109 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0747 0.107 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 4.53e-01 0.0686 0.0912 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 4.06e-01 0.083 0.0996 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0103 0.108 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 6.21e-01 0.0292 0.0591 0.225 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 641681 sc-eQTL 5.44e-01 0.0483 0.0796 0.225 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 1.40e-01 -0.148 0.0998 0.225 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0831 0.0911 0.225 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 7.74e-01 0.022 0.0766 0.225 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 5.87e-01 0.0483 0.0887 0.225 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.42e-01 -0.117 0.0993 0.225 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -56738 sc-eQTL 8.12e-01 0.0236 0.0988 0.225 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 6.07e-02 -0.119 0.0629 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 3.18e-01 0.107 0.107 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 2.73e-01 0.103 0.0935 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 4.34e-01 0.0779 0.0994 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 2.21e-01 -0.127 0.104 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 9.09e-01 0.0121 0.105 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0856 0.0521 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 7.21e-02 -0.165 0.0912 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 7.44e-01 -0.031 0.0947 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 3.25e-01 0.0826 0.0837 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 5.43e-01 0.0486 0.0798 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00262 0.0919 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 2.63e-01 0.0945 0.0843 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 3.33e-01 0.103 0.106 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.11 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 5.59e-01 0.0601 0.103 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0484 0.107 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.60e-01 0.114 0.101 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0112 0.0579 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 2.92e-01 -0.101 0.0959 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0515 0.0978 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0975 0.0935 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0826 0.0792 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0719 0.098 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.33e-01 0.166 0.109 0.222 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 1.56e-01 -0.183 0.128 0.222 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0314 0.0974 0.222 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 3.04e-01 -0.128 0.124 0.222 PB L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 6.76e-01 0.0484 0.116 0.222 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 8.37e-01 0.0251 0.122 0.222 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0194 0.145 0.222 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 4.84e-01 0.045 0.0642 0.224 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 641681 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00566 0.0722 0.224 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0112 0.0852 0.224 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 9.59e-01 0.00438 0.0849 0.224 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 1.97e-01 -0.132 0.102 0.224 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 9.89e-01 0.000916 0.0647 0.224 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0165 0.094 0.224 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -56738 sc-eQTL 7.49e-01 0.0243 0.076 0.224 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 7.47e-01 0.0226 0.0701 0.222 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 7.87e-02 -0.167 0.0947 0.222 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0397 0.0887 0.222 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0197 0.0804 0.222 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0695 0.0902 0.222 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0619 0.093 0.222 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0207 0.104 0.222 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 5.24e-01 -0.055 0.0861 0.232 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0581 0.0895 0.232 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 3.72e-02 -0.224 0.107 0.232 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 9.95e-01 0.000497 0.0768 0.232 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0431 0.101 0.232 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 9.42e-01 0.00621 0.0849 0.232 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.74e-01 0.113 0.103 0.232 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0764 0.087 0.232 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 5.63e-01 0.044 0.0758 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0643 0.0827 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0168 0.0858 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0985 0.0891 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 7.86e-02 0.121 0.0684 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 5.17e-01 0.046 0.071 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.61e-02 0.217 0.0967 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0303 0.0913 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 6.41e-01 0.0408 0.0873 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0299 0.0979 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0889 0.0989 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 1.90e-01 -0.128 0.0975 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 9.95e-01 0.00053 0.0797 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 8.26e-01 0.0174 0.0788 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 3.71e-02 0.221 0.105 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 1.63e-01 -0.14 0.0996 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.30e-01 -0.13 0.0854 0.224 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 641681 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0277 0.0988 0.224 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 2.23e-01 -0.151 0.123 0.224 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0255 0.129 0.224 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0803 0.119 0.224 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0852 0.115 0.224 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 8.45e-02 -0.218 0.126 0.224 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -56738 sc-eQTL 1.59e-01 -0.157 0.111 0.224 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 2.03e-01 0.122 0.0957 0.224 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 2.16e-01 -0.12 0.0968 0.224 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 7.03e-01 0.042 0.11 0.224 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 1.21e-01 -0.154 0.0991 0.224 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0674 0.0886 0.224 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00796 0.0949 0.224 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 3.78e-01 0.0869 0.0984 0.224 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 4.62e-01 -0.073 0.099 0.224 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 8.04e-01 0.0197 0.079 0.224 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 1.58e-01 0.124 0.0877 0.224 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 4.12e-01 0.0876 0.106 0.224 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0561 0.0982 0.224 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0076 0.0844 0.224 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 8.08e-01 0.021 0.0862 0.224 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 4.40e-01 0.0707 0.0914 0.224 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 5.48e-01 0.0629 0.104 0.224 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 1.33e-01 0.15 0.0993 0.22 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 3.94e-01 0.0721 0.0842 0.22 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 7.79e-01 0.0321 0.114 0.22 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 2.75e-01 -0.103 0.0941 0.22 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0369 0.116 0.22 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00739 0.101 0.22 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.62e-01 0.125 0.111 0.22 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0584 0.0953 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 7.36e-02 0.12 0.0666 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 9.03e-01 0.0114 0.0933 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0679 0.0695 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 5.95e-01 0.0423 0.0796 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 3.20e-03 0.29 0.0972 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0822 0.077 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0989 0.101 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 8.22e-01 -0.013 0.0578 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 1.06e-01 -0.126 0.0777 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0562 0.0647 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0207 0.0738 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 881357 sc-eQTL 2.80e-01 0.0975 0.09 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0217 0.0744 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.83e-01 0.106 0.0981 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 6.32e-01 0.033 0.0686 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0313 0.0831 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0426 0.0783 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 1.67e-01 -0.126 0.0909 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 2.36e-01 0.0782 0.0657 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 5.47e-01 0.0384 0.0636 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 1.24e-02 0.248 0.0983 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0831 0.0923 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 2.98e-01 0.0738 0.0707 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 436468 sc-eQTL 7.68e-01 0.0247 0.0838 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 6.45e-01 0.0439 0.0951 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0702 0.0928 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 9.84e-01 0.00138 0.0688 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0162 0.0709 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 2.13e-01 0.113 0.0906 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 407510 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0276 0.0963 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 32353 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0378 0.0492 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 959313 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0928 0.0747 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 389313 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00714 0.0857 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 238458 sc-eQTL 7.56e-01 0.0244 0.0784 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 573905 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0142 0.0671 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00447 0.0837 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 32353 eQTL 3.54e-02 0.0279 0.0132 0.0 0.0 0.229
ENSG00000111144 LTA4H 389313 eQTL 0.0498 -0.0447 0.0228 0.0 0.0 0.229
ENSG00000139350 NEDD1 -474390 eQTL 0.0283 0.0587 0.0267 0.0 0.0 0.229
ENSG00000188596 CFAP54 -56742 eQTL 0.0141 0.0548 0.0223 0.0 0.0 0.229

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina