logo

Genes within 1Mb (chr12:96426431:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 1.76e-02 0.202 0.0844 0.06 B L1
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 1.32e-02 0.298 0.119 0.06 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 7.78e-01 -0.03 0.106 0.06 B L1
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 1.75e-01 0.153 0.113 0.06 B L1
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 2.03e-01 0.177 0.139 0.06 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 6.56e-01 0.0458 0.103 0.06 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0281 0.15 0.06 B L1
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 6.02e-01 0.0367 0.0703 0.06 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 3.39e-01 0.094 0.098 0.06 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 9.50e-01 0.00605 0.0967 0.06 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 4.95e-01 0.0715 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 6.31e-01 0.0719 0.149 0.06 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0954 0.0913 0.06 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 8.96e-01 0.0147 0.113 0.06 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0665 0.0764 0.06 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0236 0.123 0.06 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0528 0.0821 0.06 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 7.14e-01 0.0453 0.124 0.06 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 8.71e-01 0.0229 0.141 0.06 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0136 0.101 0.06 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 6.46e-01 0.062 0.135 0.06 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 7.06e-01 0.052 0.138 0.063 DC L1
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 7.01e-01 0.0603 0.157 0.063 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 7.40e-01 0.0575 0.173 0.063 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 6.16e-01 0.0644 0.128 0.063 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 1.70e-01 0.215 0.156 0.063 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 3.61e-01 0.119 0.13 0.063 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 2.67e-01 -0.186 0.167 0.063 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 5.82e-02 0.286 0.15 0.063 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 1.57e-01 0.155 0.11 0.06 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 7.12e-01 0.0512 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 4.99e-02 0.234 0.119 0.06 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 8.98e-01 0.0201 0.157 0.06 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 7.73e-02 -0.185 0.104 0.06 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 2.63e-01 -0.111 0.0989 0.06 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0257 0.152 0.06 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0158 0.148 0.06 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0888 0.0806 0.06 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00446 0.12 0.06 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0178 0.137 0.06 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0904 0.13 0.06 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 6.18e-01 0.0538 0.108 0.06 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 4.39e-01 0.106 0.136 0.06 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0634 0.0693 0.06 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 635279 sc-eQTL 2.30e-01 0.154 0.128 0.06 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 3.12e-01 0.134 0.132 0.06 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00831 0.145 0.06 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0185 0.113 0.06 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 6.88e-01 0.0424 0.105 0.06 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0202 0.16 0.06 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -63140 sc-eQTL 9.09e-01 -0.019 0.166 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 3.30e-01 -0.156 0.16 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 5.86e-01 0.11 0.201 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0226 0.181 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 5.06e-01 -0.128 0.192 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0823 0.147 0.061 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 5.71e-01 0.103 0.181 0.061 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 1.03e-01 0.308 0.188 0.061 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 1.65e-01 0.182 0.131 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 1.89e-01 0.197 0.15 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 8.59e-01 0.0226 0.127 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 1.02e-01 0.234 0.142 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 4.56e-01 -0.126 0.169 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 4.06e-01 0.119 0.142 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 4.77e-01 -0.119 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00485 0.127 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 6.22e-01 0.0814 0.165 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0213 0.146 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0786 0.144 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 8.56e-02 0.271 0.157 0.06 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 5.60e-01 0.0889 0.152 0.06 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.78e-01 -0.149 0.168 0.06 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 1.93e-02 0.247 0.105 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 2.01e-02 0.318 0.136 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0265 0.111 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 3.75e-01 0.117 0.131 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 3.16e-01 0.166 0.165 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 3.19e-01 -0.128 0.128 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 9.66e-01 0.00711 0.164 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0105 0.134 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 3.27e-01 0.158 0.161 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0383 0.127 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0551 0.149 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 6.42e-01 -0.075 0.161 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 3.02e-01 0.153 0.148 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 2.84e-01 -0.189 0.176 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 4.28e-01 -0.105 0.132 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 3.73e-01 -0.168 0.189 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 6.84e-01 0.0758 0.186 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 8.56e-01 0.0343 0.189 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 1.75e-01 -0.204 0.15 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 4.54e-01 0.123 0.164 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 2.34e-02 0.428 0.187 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 7.47e-01 0.0249 0.0771 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 2.81e-01 0.12 0.111 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 8.81e-01 0.0167 0.112 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 5.86e-01 0.0608 0.112 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 9.52e-01 0.00949 0.156 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0307 0.0991 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 4.27e-01 0.0971 0.122 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 9.02e-01 0.00933 0.076 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0323 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 8.76e-01 0.0201 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0368 0.127 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 3.46e-01 0.165 0.175 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 1.17e-01 -0.163 0.103 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.79e-01 -0.125 0.142 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 4.85e-02 0.183 0.0921 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 2.10e-02 0.357 0.153 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0711 0.143 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 2.43e-01 0.156 0.133 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 5.81e-02 0.31 0.163 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 1.11e-01 -0.222 0.139 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 7.77e-02 -0.291 0.164 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00174 0.0965 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0299 0.167 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 2.19e-01 -0.214 0.174 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 2.55e-01 -0.18 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0968 0.177 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0327 0.146 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 8.19e-01 0.0374 0.164 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 2.23e-01 -0.132 0.108 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 7.09e-01 0.0538 0.144 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0963 0.13 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 8.29e-01 0.0297 0.137 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 3.50e-01 0.135 0.144 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 5.99e-01 -0.065 0.123 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 4.77e-02 -0.29 0.146 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 1.28e-01 -0.181 0.119 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 3.96e-01 0.151 0.178 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 2.67e-01 0.194 0.175 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 8.48e-01 0.0285 0.148 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 2.27e-01 -0.194 0.16 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 3.78e-01 0.151 0.171 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 8.46e-01 0.0325 0.167 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 4.30e-01 0.122 0.154 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0768 0.181 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 2.11e-01 -0.236 0.188 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 1.15e-01 0.292 0.184 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 1.45e-01 0.23 0.157 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 2.32e-01 -0.206 0.172 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 8.58e-01 0.0335 0.187 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 9.10e-01 0.0116 0.103 0.056 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 635279 sc-eQTL 4.12e-01 0.114 0.139 0.056 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 2.38e-01 0.207 0.175 0.056 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 9.88e-01 0.00243 0.159 0.056 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0647 0.134 0.056 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0271 0.155 0.056 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.87e-01 0.151 0.174 0.056 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -63140 sc-eQTL 7.14e-01 0.0632 0.173 0.056 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 9.59e-02 -0.167 0.0998 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0407 0.17 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0349 0.149 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 7.86e-01 0.0429 0.158 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 2.74e-01 0.18 0.165 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.50e-01 -0.156 0.166 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0885 0.0867 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 5.57e-01 0.0895 0.152 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 5.11e-01 -0.103 0.157 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0576 0.139 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 6.18e-01 0.066 0.132 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.64e-01 0.138 0.152 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000965 0.138 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 5.54e-01 -0.103 0.174 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 9.21e-01 0.0179 0.181 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 8.29e-01 0.0364 0.168 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0483 0.175 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.01e-01 -0.171 0.165 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0281 0.0949 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0544 0.158 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 3.84e-01 0.14 0.16 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 2.91e-01 -0.162 0.153 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 8.34e-01 0.0272 0.13 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.98e-01 0.136 0.161 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 9.47e-01 0.0132 0.2 0.056 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 6.42e-01 0.109 0.234 0.056 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 5.46e-01 -0.107 0.176 0.056 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 7.85e-01 0.0619 0.226 0.056 PB L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 1.67e-01 0.289 0.208 0.056 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 5.40e-01 0.136 0.22 0.056 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0974 0.262 0.056 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0688 0.106 0.061 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 635279 sc-eQTL 4.74e-02 -0.236 0.118 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00217 0.141 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 3.89e-01 0.121 0.14 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 1.09e-01 0.271 0.169 0.061 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 2.65e-01 0.119 0.107 0.061 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 8.71e-01 0.0252 0.155 0.061 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -63140 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0109 0.126 0.061 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0481 0.116 0.06 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 9.03e-02 0.266 0.157 0.06 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 4.26e-01 -0.117 0.147 0.06 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 1.96e-01 0.172 0.132 0.06 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 4.84e-01 -0.104 0.149 0.06 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 7.62e-01 0.0466 0.154 0.06 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0692 0.172 0.06 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 7.91e-01 0.0383 0.144 0.063 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 5.24e-01 0.0954 0.15 0.063 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 8.36e-01 0.0375 0.181 0.063 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 7.35e-01 0.0434 0.128 0.063 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 2.18e-01 0.208 0.169 0.063 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 6.71e-01 0.0603 0.142 0.063 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 2.26e-01 -0.209 0.172 0.063 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 1.99e-01 0.187 0.145 0.063 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 1.83e-01 0.167 0.125 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 5.73e-01 0.0772 0.137 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 1.63e-02 0.338 0.14 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 5.98e-01 0.0778 0.147 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 7.04e-02 -0.205 0.113 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 6.33e-01 0.0561 0.117 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0559 0.161 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 3.31e-01 0.146 0.15 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 3.33e-01 0.137 0.142 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 6.91e-01 0.0633 0.159 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 4.20e-01 0.13 0.161 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 7.83e-01 0.0438 0.159 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0818 0.129 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 3.18e-01 -0.128 0.128 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.23e-01 0.171 0.172 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 8.60e-01 0.0287 0.163 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 1.98e-01 -0.175 0.136 0.064 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 635279 sc-eQTL 1.73e-01 -0.213 0.155 0.064 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 4.39e-01 0.152 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 4.10e-01 -0.168 0.204 0.064 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 3.51e-02 -0.396 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0102 0.182 0.064 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.62e-01 -0.184 0.201 0.064 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -63140 sc-eQTL 4.81e-01 -0.124 0.176 0.064 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 3.11e-01 -0.16 0.158 0.062 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 1.29e-01 -0.243 0.159 0.062 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 3.73e-01 0.162 0.181 0.062 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 9.17e-01 0.0171 0.164 0.062 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 6.00e-01 0.0768 0.146 0.062 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 2.70e-01 0.172 0.156 0.062 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 2.57e-01 -0.184 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0829 0.163 0.062 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 4.43e-01 0.0994 0.129 0.063 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 8.19e-01 -0.033 0.144 0.063 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 6.58e-01 0.0775 0.175 0.063 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 4.10e-01 -0.133 0.161 0.063 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 9.30e-01 0.0122 0.138 0.063 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0934 0.141 0.063 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 7.05e-01 0.0569 0.15 0.063 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 8.50e-01 0.0324 0.171 0.063 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 6.87e-01 0.0645 0.16 0.068 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0163 0.135 0.068 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 3.56e-01 0.168 0.182 0.068 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 7.77e-01 0.0429 0.151 0.068 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 7.03e-01 0.0705 0.185 0.068 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 5.08e-01 0.107 0.161 0.068 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 2.36e-01 -0.211 0.177 0.068 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 3.71e-01 0.137 0.152 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 1.60e-01 0.155 0.11 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 1.22e-01 0.238 0.153 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000288 0.115 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 4.80e-01 0.0927 0.131 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 7.16e-01 0.0595 0.164 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 1.86e-01 0.168 0.127 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 5.17e-01 -0.108 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 3.32e-02 0.202 0.094 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 1.81e-02 0.303 0.127 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0196 0.107 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 5.42e-01 0.0741 0.121 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 874955 sc-eQTL 2.88e-01 0.158 0.148 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 9.16e-01 0.013 0.122 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0185 0.162 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 1.12e-01 0.18 0.113 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 5.45e-01 0.0834 0.138 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 1.05e-01 0.21 0.129 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 4.97e-01 0.103 0.151 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 3.01e-02 -0.236 0.108 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0745 0.105 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0102 0.165 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 5.16e-01 0.0995 0.153 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0103 0.117 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 430066 sc-eQTL 4.38e-01 -0.107 0.138 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 2.25e-01 0.19 0.156 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0814 0.153 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 7.97e-01 0.0292 0.113 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 7.21e-01 0.0419 0.117 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 7.42e-01 0.0495 0.15 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 401108 sc-eQTL 4.98e-01 0.108 0.159 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 25951 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0582 0.0819 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 952911 sc-eQTL 9.66e-01 0.0054 0.125 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 382911 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00672 0.143 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 232056 sc-eQTL 4.06e-01 -0.109 0.13 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 567503 sc-eQTL 5.05e-01 0.0746 0.112 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 sc-eQTL 3.74e-01 0.124 0.139 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074527 NTN4 635279 eQTL 0.0499 -0.133 0.0676 0.0 0.0 0.0613
ENSG00000111144 LTA4H 382911 pQTL 0.0201 0.0814 0.035 0.0 0.0 0.0629
ENSG00000111145 ELK3 232056 eQTL 0.0284 0.0762 0.0347 0.0 0.0 0.0613
ENSG00000139343 SNRPF 567503 eQTL 0.0261 -0.0401 0.018 0.00128 0.0 0.0613
ENSG00000139350 NEDD1 -480792 eQTL 0.00338 0.141 0.0481 0.0 0.0 0.0613

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina