logo

Genes within 1Mb (chr12:96421291:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 5.82e-01 0.0279 0.0506 0.246 B L1
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0572 0.0715 0.246 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 6.21e-01 0.0311 0.0628 0.246 B L1
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 7.49e-01 0.0215 0.0669 0.246 B L1
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 7.09e-03 0.221 0.0811 0.246 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0571 0.0607 0.246 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 3.86e-01 0.077 0.0886 0.246 B L1
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 2.75e-01 0.0457 0.0417 0.246 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 8.47e-01 0.0113 0.0584 0.246 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0682 0.0573 0.246 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 4.35e-01 0.0486 0.0622 0.246 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0688 0.0887 0.246 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 2.12e-01 0.0678 0.0542 0.246 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 5.99e-02 -0.126 0.0665 0.246 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 1.19e-01 0.0664 0.0424 0.246 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0243 0.0688 0.246 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 2.21e-01 0.056 0.0456 0.246 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 3.30e-01 0.0671 0.0688 0.246 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0401 0.0783 0.246 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 1.10e-01 -0.09 0.0561 0.246 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0545 0.075 0.246 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 2.36e-01 0.096 0.0807 0.245 DC L1
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 4.48e-01 0.07 0.0921 0.245 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 1.84e-01 -0.135 0.101 0.245 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 7.67e-01 0.0224 0.0754 0.245 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 4.56e-01 0.0689 0.0922 0.245 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0999 0.0765 0.245 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 3.54e-01 0.0913 0.0984 0.245 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0523 0.0889 0.245 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 4.79e-01 0.0457 0.0644 0.246 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0129 0.0813 0.246 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 7.09e-01 0.0263 0.0702 0.246 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0324 0.0917 0.246 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 5.71e-02 0.117 0.0611 0.246 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 8.49e-01 0.0111 0.0581 0.246 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 6.84e-02 0.162 0.0885 0.246 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0335 0.0864 0.246 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0326 0.0476 0.247 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 8.76e-01 -0.011 0.0705 0.247 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0687 0.0807 0.247 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 4.03e-01 0.0642 0.0766 0.247 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0273 0.0636 0.247 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 8.43e-01 -0.016 0.0805 0.247 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0165 0.0399 0.246 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 630139 sc-eQTL 8.60e-01 0.013 0.0737 0.246 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0691 0.076 0.246 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 1.11e-01 -0.132 0.0828 0.246 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 7.33e-01 0.0222 0.065 0.246 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 9.37e-01 0.00475 0.0604 0.246 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 2.25e-01 0.112 0.0917 0.246 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -68280 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000319 0.0953 0.246 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 7.01e-01 0.0346 0.0898 0.26 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0605 0.113 0.26 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 1.45e-01 -0.148 0.101 0.26 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0857 0.108 0.26 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0466 0.0827 0.26 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0281 0.102 0.26 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0358 0.106 0.26 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 3.41e-01 0.0746 0.0782 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0284 0.0898 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 8.08e-01 0.0185 0.0758 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 4.14e-02 0.174 0.0847 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 4.78e-04 0.348 0.0979 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 7.18e-02 -0.153 0.0845 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 2.67e-01 0.111 0.0995 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 4.11e-01 0.0624 0.0757 0.244 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0103 0.0986 0.244 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 8.90e-01 0.0122 0.0876 0.244 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 3.34e-02 -0.182 0.0852 0.244 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 2.46e-01 0.11 0.0942 0.244 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0991 0.091 0.244 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 1.82e-01 -0.134 0.101 0.244 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 3.25e-01 -0.062 0.0628 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 1.24e-01 -0.125 0.081 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 2.19e-01 0.081 0.0657 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0563 0.0778 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 2.05e-01 0.124 0.0976 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0306 0.0758 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 7.69e-01 0.0286 0.0972 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 3.01e-01 0.0816 0.0787 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0947 0.0951 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 8.86e-01 0.0108 0.0748 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 4.71e-01 0.0636 0.0881 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 5.08e-01 0.0631 0.0952 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 1.27e-01 -0.133 0.0871 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 7.65e-03 0.276 0.102 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 2.97e-01 0.0787 0.0753 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 1.64e-01 0.15 0.107 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 7.47e-01 0.0344 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 2.38e-01 -0.127 0.107 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 2.33e-01 0.103 0.0857 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 4.84e-01 0.0656 0.0936 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 5.66e-01 0.0622 0.108 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 1.57e-01 0.0652 0.046 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0529 0.0665 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0261 0.0668 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 7.83e-01 0.0184 0.0668 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0726 0.0935 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 6.67e-01 0.0256 0.0593 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0961 0.0728 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 8.37e-01 0.00915 0.0444 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 1.89e-01 0.0992 0.0753 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0571 0.0752 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 1.43e-01 0.108 0.0737 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 1.19e-01 -0.159 0.102 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 5.46e-01 0.0367 0.0607 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0936 0.0828 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 3.03e-02 -0.119 0.0544 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 7.72e-01 0.0267 0.0919 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0696 0.0848 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 2.85e-01 0.0843 0.0787 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0659 0.097 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 3.98e-02 0.169 0.0818 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0292 0.0979 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0437 0.0535 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 5.83e-01 -0.051 0.0926 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 5.12e-01 0.0635 0.0967 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 9.50e-01 0.0055 0.0882 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 3.01e-01 0.102 0.098 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 2.05e-01 -0.103 0.0807 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 2.79e-01 0.0983 0.0906 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 4.27e-02 0.13 0.0636 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00842 0.0854 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 7.01e-01 0.0296 0.077 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 1.79e-01 0.109 0.0811 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0665 0.0854 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0701 0.0731 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 1.87e-01 -0.115 0.0868 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 6.39e-01 0.0321 0.0685 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 4.79e-01 0.0724 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 3.20e-01 0.1 0.1 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 2.47e-01 0.0986 0.085 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 9.70e-01 0.0035 0.0923 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00909 0.0982 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0386 0.0961 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 8.49e-01 0.0165 0.0869 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0493 0.102 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 7.09e-01 0.0397 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 2.06e-01 -0.132 0.104 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 4.33e-01 0.0699 0.0889 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 9.59e-02 0.161 0.0965 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 9.06e-01 0.0125 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 3.56e-01 0.0536 0.058 0.249 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 630139 sc-eQTL 8.51e-01 0.0147 0.0783 0.249 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 1.96e-02 -0.229 0.0973 0.249 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 2.65e-01 -0.1 0.0895 0.249 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 5.94e-01 0.0402 0.0753 0.249 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 5.45e-01 0.0528 0.0872 0.249 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0427 0.098 0.249 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -68280 sc-eQTL 6.54e-01 0.0436 0.0971 0.249 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0813 0.061 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 3.37e-01 0.0992 0.103 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 4.78e-02 0.179 0.0897 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 9.20e-02 0.162 0.0955 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0752 0.1 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 1.63e-01 -0.141 0.101 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0605 0.0512 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 1.20e-01 -0.14 0.0896 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 1.58e-01 -0.131 0.0924 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 1.31e-01 0.124 0.0818 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 4.17e-01 0.0635 0.0781 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 7.76e-01 0.0257 0.0901 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 3.31e-01 0.079 0.0811 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 2.48e-01 0.118 0.102 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 5.79e-02 -0.201 0.106 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 8.54e-01 0.0182 0.0989 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 4.50e-01 -0.078 0.103 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 4.75e-01 0.0697 0.0974 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 6.64e-01 0.0246 0.0565 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0464 0.0939 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0616 0.0955 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 2.20e-01 -0.112 0.0912 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0657 0.0774 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 2.87e-01 -0.102 0.0956 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 2.42e-01 0.129 0.109 0.233 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 5.34e-02 -0.247 0.126 0.233 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0286 0.097 0.233 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 1.87e-01 -0.164 0.123 0.233 PB L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0189 0.115 0.233 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 8.90e-01 0.0168 0.121 0.233 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 7.31e-01 0.0497 0.144 0.233 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 6.75e-01 0.0264 0.0628 0.25 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 630139 sc-eQTL 3.23e-01 0.0698 0.0704 0.25 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000871 0.0834 0.25 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 9.47e-01 0.00556 0.083 0.25 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 2.67e-01 -0.111 0.1 0.25 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 7.19e-01 0.0228 0.0633 0.25 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0798 0.0918 0.25 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -68280 sc-eQTL 4.81e-01 0.0524 0.0743 0.25 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 4.93e-01 0.0471 0.0685 0.246 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 7.74e-02 -0.164 0.0927 0.246 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 8.90e-01 -0.012 0.0869 0.246 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0083 0.0787 0.246 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00635 0.0884 0.246 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0827 0.091 0.246 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0602 0.102 0.246 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0548 0.0842 0.254 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00995 0.0877 0.254 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 1.23e-01 -0.163 0.105 0.254 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0373 0.0751 0.254 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 6.26e-01 0.0484 0.0991 0.254 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0309 0.083 0.254 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 7.12e-01 0.0374 0.101 0.254 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 2.19e-01 -0.105 0.0849 0.254 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 5.43e-01 0.045 0.0738 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0504 0.0806 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00408 0.0836 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0148 0.0871 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 9.42e-03 0.173 0.066 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 6.95e-01 0.0271 0.0692 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 5.06e-02 0.186 0.0945 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0259 0.0889 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 6.97e-01 0.0331 0.0848 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0279 0.0952 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0267 0.0963 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0261 0.0951 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0232 0.0775 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0191 0.0766 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 9.19e-02 0.174 0.103 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0475 0.0972 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0297 0.0835 0.252 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 630139 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0436 0.0958 0.252 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0558 0.12 0.252 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 1.98e-01 -0.161 0.124 0.252 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0468 0.116 0.252 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0517 0.111 0.252 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 6.58e-01 0.0545 0.123 0.252 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -68280 sc-eQTL 1.62e-01 -0.151 0.107 0.252 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 2.12e-01 0.117 0.0932 0.247 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0297 0.0946 0.247 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 8.49e-01 0.0204 0.107 0.247 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0665 0.0969 0.247 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 2.29e-01 -0.104 0.0861 0.247 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0332 0.0923 0.247 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0231 0.096 0.247 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0461 0.0965 0.247 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00489 0.0764 0.247 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 1.06e-02 0.216 0.0839 0.247 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 2.02e-01 0.132 0.103 0.247 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 6.19e-01 0.0473 0.0951 0.247 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0443 0.0816 0.247 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 9.64e-01 0.00376 0.0834 0.247 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0176 0.0886 0.247 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 2.64e-01 0.113 0.101 0.247 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 1.33e-01 0.15 0.0994 0.243 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 3.19e-01 0.0843 0.0843 0.243 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 6.32e-01 0.0547 0.114 0.243 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 4.79e-01 -0.067 0.0945 0.243 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0682 0.116 0.243 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0034 0.101 0.243 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 1.97e-01 0.144 0.111 0.243 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0413 0.0955 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 2.87e-01 0.07 0.0657 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0218 0.0916 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0114 0.0684 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00163 0.0782 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 8.41e-04 0.321 0.0949 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 1.16e-01 -0.119 0.0753 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 5.66e-01 -0.057 0.0993 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0437 0.0567 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 6.98e-02 -0.139 0.0763 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 7.52e-01 0.0202 0.0637 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 7.44e-01 0.0237 0.0726 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 869815 sc-eQTL 2.69e-01 0.0981 0.0885 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0656 0.0729 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 2.41e-01 0.113 0.0964 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 6.15e-01 0.0339 0.0672 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0504 0.0814 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 9.60e-01 0.00389 0.0767 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0241 0.0894 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 8.04e-02 0.113 0.0641 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 7.42e-01 0.0206 0.0623 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 2.25e-02 0.222 0.0966 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0303 0.0905 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 4.11e-01 0.0566 0.0688 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 424926 sc-eQTL 1.18e-01 0.127 0.081 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 8.53e-01 0.0171 0.0924 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 9.53e-01 0.00537 0.0903 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0445 0.0668 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0235 0.0689 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00426 0.0884 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 395968 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00516 0.0936 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 20811 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00592 0.0483 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 947771 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0499 0.0734 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 377771 sc-eQTL 2.08e-01 -0.106 0.0836 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 226916 sc-eQTL 4.65e-01 0.0562 0.0767 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 562363 sc-eQTL 8.49e-01 0.0126 0.0657 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -485932 sc-eQTL 9.99e-01 5.59e-05 0.082 0.248 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257878 \N 424770 8.21e-07 3.55e-07 8.99e-08 2.53e-07 1.1e-07 1.25e-07 3.44e-07 5.82e-08 1.96e-07 1.05e-07 2.47e-07 1.23e-07 3.48e-07 8.85e-08 5.97e-08 1.14e-07 5.73e-08 2.66e-07 1.93e-07 6.03e-08 1.57e-07 2.3e-07 2.26e-07 3.27e-08 4.27e-07 1.76e-07 1.48e-07 1.52e-07 1.6e-07 2.89e-07 1.43e-07 3.59e-08 3.8e-08 9.58e-08 3.07e-08 6.23e-08 5.67e-08 9.17e-08 6.21e-08 6.19e-08 5.14e-08 6.11e-07 2.84e-08 1.77e-08 7.26e-08 6.98e-09 8.98e-08 1.88e-09 4.68e-08