logo

Genes within 1Mb (chr12:96404901:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 6.83e-01 -0.023 0.0562 0.194 B L1
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00551 0.0796 0.194 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 7.33e-01 0.0238 0.0698 0.194 B L1
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0358 0.0743 0.194 B L1
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 3.63e-01 0.0835 0.0915 0.194 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 1.00e+00 -2e-05 0.0676 0.194 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0186 0.0986 0.194 B L1
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0102 0.0455 0.194 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 9.07e-01 0.0074 0.0635 0.194 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 1.60e-02 0.15 0.0616 0.194 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 5.22e-01 0.0433 0.0676 0.194 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0734 0.0964 0.194 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 7.78e-01 0.0167 0.0591 0.194 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0575 0.0727 0.194 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 7.27e-02 -0.0842 0.0467 0.194 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0506 0.0758 0.194 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 9.55e-01 0.00284 0.0505 0.194 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0478 0.076 0.194 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0714 0.0863 0.194 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0204 0.0623 0.194 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00175 0.0828 0.194 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 4.83e-01 0.0603 0.0858 0.2 DC L1
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0299 0.0977 0.2 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0508 0.108 0.2 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 6.78e-01 0.0332 0.0799 0.2 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 2.96e-01 -0.102 0.0977 0.2 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 2.25e-01 0.0988 0.0811 0.2 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0201 0.105 0.2 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 3.67e-01 0.0852 0.0942 0.2 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 9.78e-01 0.002 0.0735 0.194 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0129 0.0926 0.194 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0221 0.08 0.194 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 4.60e-01 0.0773 0.104 0.194 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 2.85e-02 -0.153 0.0694 0.194 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 1.95e-01 0.0858 0.0659 0.194 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 5.34e-01 0.0633 0.102 0.194 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 6.18e-01 0.0492 0.0985 0.194 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 3.31e-05 -0.209 0.0493 0.195 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 3.06e-01 0.0778 0.0758 0.195 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 2.01e-01 -0.111 0.0868 0.195 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 7.94e-02 -0.145 0.0821 0.195 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 6.31e-01 0.0329 0.0685 0.195 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 2.79e-01 0.094 0.0866 0.195 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 4.85e-01 0.0302 0.0432 0.194 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 613749 sc-eQTL 4.17e-01 0.065 0.0798 0.194 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0569 0.0824 0.194 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0794 0.0902 0.194 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0232 0.0705 0.194 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0461 0.0655 0.194 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 8.14e-01 0.0235 0.0998 0.194 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -84670 sc-eQTL 2.84e-01 -0.111 0.103 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0151 0.1 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 6.91e-02 -0.228 0.125 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 8.26e-01 0.0249 0.113 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 2.24e-02 -0.272 0.118 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 6.33e-01 -0.044 0.092 0.196 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 2.58e-01 -0.128 0.113 0.196 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 3.78e-01 0.104 0.118 0.196 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0262 0.0846 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 9.95e-01 0.000555 0.097 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00421 0.0819 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 4.59e-01 0.0685 0.0923 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 3.38e-01 0.104 0.109 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 6.74e-01 0.0388 0.092 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 1.97e-01 0.139 0.107 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 7.06e-01 0.0319 0.0843 0.196 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 5.18e-01 -0.071 0.11 0.196 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 4.35e-01 0.0761 0.0972 0.196 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 5.54e-01 0.0567 0.0957 0.196 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 1.91e-01 -0.137 0.105 0.196 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 7.12e-02 -0.183 0.101 0.196 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0568 0.112 0.196 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 4.31e-01 0.0547 0.0694 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 6.82e-01 0.0369 0.0898 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 1.73e-01 0.0991 0.0724 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0318 0.086 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 9.63e-01 0.00501 0.108 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00893 0.0837 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 9.59e-01 0.00558 0.107 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0778 0.0857 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 1.81e-01 -0.139 0.103 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00799 0.0814 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0637 0.0959 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 7.34e-01 0.0353 0.104 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0904 0.0951 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0892 0.113 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0153 0.0806 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 7.04e-02 -0.208 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0145 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0271 0.115 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0344 0.0918 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0248 0.1 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 1.23e-01 0.178 0.115 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0298 0.0504 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0111 0.0727 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 8.90e-04 0.239 0.071 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 9.73e-01 0.00246 0.0729 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0459 0.102 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 5.69e-01 0.0369 0.0647 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00633 0.0798 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0119 0.0487 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 6.78e-01 0.0345 0.083 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0994 0.0824 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0209 0.0813 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0314 0.112 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00854 0.0667 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0523 0.0911 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 8.55e-02 -0.102 0.0592 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 8.01e-02 -0.174 0.0989 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 7.62e-01 -0.028 0.092 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 7.15e-01 0.0313 0.0855 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0027 0.105 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 2.18e-01 0.11 0.0892 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 4.28e-02 -0.214 0.105 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 1.04e-03 -0.191 0.0573 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 8.04e-01 0.0253 0.102 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0849 0.106 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 5.00e-03 -0.269 0.0949 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 7.39e-01 0.0359 0.108 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 8.48e-01 0.017 0.0889 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 8.05e-01 0.0247 0.0997 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0358 0.0707 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 3.72e-01 -0.084 0.0938 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 6.71e-01 -0.036 0.0847 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0651 0.0895 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 7.52e-01 0.0297 0.0941 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 6.72e-01 0.0341 0.0806 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0161 0.096 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0323 0.0772 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0616 0.115 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 7.85e-01 0.031 0.114 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 1.66e-01 0.133 0.0957 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 9.36e-01 0.00836 0.104 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 3.29e-01 -0.108 0.11 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 1.41e-01 -0.159 0.108 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 2.64e-02 -0.214 0.0957 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 3.50e-01 -0.106 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 6.55e-01 0.0531 0.119 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 5.35e-01 0.0725 0.117 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0961 0.0991 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00014 0.108 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 2.00e-01 0.151 0.117 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 6.41e-01 0.0292 0.0626 0.195 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 613749 sc-eQTL 4.10e-01 0.0696 0.0843 0.195 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 2.76e-01 -0.116 0.106 0.195 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 2.20e-01 -0.119 0.0964 0.195 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00832 0.0812 0.195 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0315 0.0941 0.195 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0131 0.106 0.195 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -84670 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0784 0.105 0.195 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 1.44e-02 -0.16 0.0648 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 4.51e-01 0.0837 0.111 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0326 0.0972 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 9.94e-01 0.000727 0.103 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 3.69e-01 0.097 0.108 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0504 0.109 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 1.06e-04 -0.215 0.0544 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 5.89e-01 0.0534 0.0988 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0602 0.102 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 8.38e-01 0.0185 0.0902 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 4.38e-01 0.0666 0.0858 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 5.63e-02 0.188 0.0981 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0504 0.0907 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 5.22e-01 0.0733 0.114 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0908 0.119 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 8.47e-02 -0.19 0.11 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 3.56e-01 0.106 0.115 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 7.43e-01 0.0357 0.109 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 1.42e-02 -0.153 0.0618 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 9.48e-01 0.0068 0.104 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 4.59e-02 -0.211 0.105 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 1.86e-01 -0.134 0.101 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 5.55e-01 0.0507 0.0859 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 6.36e-01 0.0503 0.106 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0876 0.113 0.196 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0316 0.133 0.196 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 3.73e-01 0.0891 0.0997 0.196 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 9.12e-02 -0.216 0.127 0.196 PB L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 3.99e-03 0.336 0.114 0.196 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 7.21e-01 0.0447 0.125 0.196 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 7.38e-01 0.0498 0.149 0.196 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 5.37e-01 0.0449 0.0725 0.193 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 613749 sc-eQTL 9.27e-01 0.00743 0.0815 0.193 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 2.50e-01 -0.111 0.096 0.193 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0463 0.0958 0.193 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 8.77e-02 0.198 0.115 0.193 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0173 0.0731 0.193 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 9.06e-01 0.0126 0.106 0.193 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -84670 sc-eQTL 4.54e-01 0.0644 0.0858 0.193 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 7.80e-01 0.0214 0.0764 0.194 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 1.30e-01 0.157 0.103 0.194 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 5.25e-01 0.0615 0.0967 0.194 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 6.35e-01 0.0417 0.0877 0.194 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0557 0.0984 0.194 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 1.20e-03 -0.325 0.0991 0.194 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0108 0.113 0.194 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0597 0.0914 0.205 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0648 0.095 0.205 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0998 0.115 0.205 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0486 0.0814 0.205 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 3.47e-01 -0.101 0.107 0.205 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 2.10e-01 0.113 0.0897 0.205 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 2.30e-01 -0.132 0.109 0.205 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00168 0.0925 0.205 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 2.44e-01 0.0949 0.0812 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 7.81e-01 0.0248 0.0888 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 9.12e-02 -0.155 0.0915 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 3.66e-01 0.0868 0.0958 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0688 0.0738 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 5.60e-01 0.0444 0.0762 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0192 0.105 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00764 0.098 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 2.48e-01 0.106 0.0914 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0673 0.103 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0676 0.104 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 3.55e-01 0.095 0.103 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 7.13e-03 -0.224 0.0823 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 1.40e-01 0.122 0.0823 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 2.77e-01 0.121 0.111 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 3.42e-01 0.1 0.105 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0943 0.0904 0.185 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 613749 sc-eQTL 6.66e-01 0.045 0.104 0.185 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 6.27e-01 0.0634 0.13 0.185 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 2.46e-01 -0.157 0.135 0.185 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 3.81e-02 -0.259 0.124 0.185 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 5.18e-03 -0.335 0.118 0.185 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 2.89e-01 0.142 0.133 0.185 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -84670 sc-eQTL 9.33e-01 0.00986 0.117 0.185 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 1.68e-01 -0.146 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 1.21e-01 -0.166 0.107 0.2 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 1.63e-01 0.169 0.121 0.2 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 3.24e-01 -0.109 0.11 0.2 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 3.02e-01 -0.101 0.0977 0.2 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 1.34e-03 0.332 0.102 0.2 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 9.00e-01 0.0137 0.109 0.2 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 9.61e-01 0.0053 0.109 0.2 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0883 0.0837 0.195 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 6.31e-02 0.174 0.0929 0.195 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 7.68e-01 0.0335 0.113 0.195 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 6.53e-01 0.047 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0873 0.0895 0.195 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 2.46e-01 0.106 0.0914 0.195 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0315 0.0973 0.195 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.111 0.195 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 5.37e-01 0.0649 0.105 0.184 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0586 0.0886 0.184 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0408 0.12 0.184 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 3.86e-01 0.0862 0.0991 0.184 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 4.45e-01 -0.093 0.121 0.184 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 5.68e-01 0.0606 0.106 0.184 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 8.23e-01 0.0263 0.117 0.184 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 6.44e-01 0.0464 0.1 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0189 0.0724 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0719 0.101 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 6.50e-01 0.0342 0.0752 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 5.38e-01 0.0529 0.0859 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 8.48e-01 0.0206 0.107 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0671 0.0832 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 5.94e-01 0.0583 0.109 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 5.73e-01 0.0351 0.0623 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 5.23e-01 -0.054 0.0843 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 5.10e-01 0.0461 0.0699 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0083 0.0797 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 853425 sc-eQTL 7.69e-01 0.0287 0.0974 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0433 0.0802 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0488 0.106 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 1.63e-01 0.104 0.0743 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 9.14e-01 0.00974 0.0904 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 2.07e-01 -0.107 0.0848 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 6.68e-01 0.0427 0.0992 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 3.37e-02 -0.152 0.071 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 3.09e-01 0.0704 0.069 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 6.07e-01 0.0559 0.108 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 9.19e-01 0.0103 0.101 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0771 0.0766 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 408536 sc-eQTL 3.80e-01 0.0797 0.0906 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 4.81e-01 0.0727 0.103 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 3.90e-01 0.0864 0.1 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0198 0.0744 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 4.80e-02 0.151 0.076 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 5.46e-01 0.0594 0.0983 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 379578 sc-eQTL 4.98e-01 0.0707 0.104 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 4421 sc-eQTL 2.35e-04 -0.19 0.0507 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 931381 sc-eQTL 4.83e-01 0.056 0.0796 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 361381 sc-eQTL 7.80e-02 -0.16 0.0904 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 210526 sc-eQTL 2.12e-01 -0.104 0.0831 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 545973 sc-eQTL 4.06e-01 0.0593 0.0712 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -502322 sc-eQTL 1.67e-01 0.123 0.0886 0.194 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 4421 eQTL 3.46e-02 -0.0311 0.0147 0.0 0.0 0.204
ENSG00000111145 ELK3 210526 eQTL 0.00246 0.0647 0.0213 0.0 0.0 0.204

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111145 ELK3 210526 3.24e-06 2.35e-06 2.97e-07 1.32e-06 1.16e-07 7.96e-07 1.31e-06 9.69e-08 1.73e-06 3.82e-07 1.35e-06 6.02e-07 3.49e-06 9.52e-07 8.32e-07 1.1e-06 7.97e-07 7.89e-07 6.4e-07 3.93e-07 6.51e-07 1.96e-06 1.05e-06 5.36e-07 2.24e-06 3.91e-07 8.75e-07 7.81e-07 1.5e-06 1.22e-06 8e-07 5.35e-08 1.27e-07 5.72e-07 5.39e-07 4.75e-07 2.36e-07 1.32e-07 4.74e-07 2.09e-07 4.49e-08 5.59e-06 6.51e-07 1.79e-08 1.49e-07 1.27e-07 1.62e-07 3.3e-09 4.82e-08
ENSG00000139343 \N 545973 1.26e-06 3.23e-07 8.9e-08 3.61e-07 9.79e-08 2.46e-07 5.54e-07 5.19e-08 3.03e-07 1.05e-07 1.69e-07 1.62e-07 1.21e-06 1.48e-07 1.9e-07 2.05e-07 4.18e-08 2.93e-07 7.39e-08 5.04e-08 1.23e-07 2.51e-07 2.2e-07 2.87e-08 3.7e-07 1.65e-07 1.31e-07 1.1e-07 1.98e-07 1.29e-07 1.86e-07 3.1e-08 3.68e-08 1.75e-07 2.35e-07 5.32e-08 4.43e-08 8.76e-08 4.78e-08 8.72e-09 4.41e-08 1.19e-06 5.29e-08 1.11e-08 4.67e-08 8.07e-09 1e-07 3.86e-09 4.73e-08