logo

Genes within 1Mb (chr12:96401505:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 6.43e-01 0.0335 0.0722 0.1 B L1
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00797 0.102 0.1 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 3.78e-01 0.0792 0.0895 0.1 B L1
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 2.66e-01 0.106 0.0952 0.1 B L1
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 1.48e-01 0.17 0.117 0.1 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 5.63e-01 0.0502 0.0867 0.1 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.95e-01 0.164 0.126 0.1 B L1
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0232 0.0591 0.1 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00436 0.0824 0.1 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 1.23e-01 0.125 0.0807 0.1 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 3.40e-01 0.0839 0.0877 0.1 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 7.01e-02 -0.226 0.124 0.1 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 1.07e-01 0.124 0.0764 0.1 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0771 0.0945 0.1 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0572 0.0602 0.1 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0268 0.0973 0.1 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0143 0.0647 0.1 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 9.74e-01 0.00312 0.0975 0.1 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0897 0.111 0.1 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 7.86e-01 0.0217 0.0798 0.1 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.97e-01 0.137 0.106 0.1 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 4.53e-01 0.0852 0.113 0.104 DC L1
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00653 0.129 0.104 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 8.21e-01 0.0324 0.143 0.104 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 7.78e-01 0.0298 0.106 0.104 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 9.91e-01 0.00139 0.13 0.104 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 1.25e-01 0.165 0.107 0.104 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 9.22e-01 0.0135 0.138 0.104 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0375 0.125 0.104 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 3.94e-01 0.0797 0.0933 0.1 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 3.58e-01 -0.108 0.117 0.1 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 3.07e-01 0.104 0.101 0.1 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00205 0.133 0.1 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 2.32e-01 -0.107 0.0889 0.1 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 1.94e-02 0.196 0.0831 0.1 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.56e-01 0.183 0.129 0.1 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0204 0.125 0.1 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 2.66e-03 -0.199 0.0656 0.101 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 4.50e-01 0.075 0.099 0.101 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 1.50e-01 -0.163 0.113 0.101 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0656 0.108 0.101 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 5.50e-01 0.0535 0.0894 0.101 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.41e-01 0.166 0.113 0.101 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 4.79e-01 0.0405 0.0571 0.1 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 610353 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00863 0.106 0.1 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000642 0.109 0.1 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 2.65e-01 -0.133 0.119 0.1 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0832 0.0931 0.1 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 9.31e-01 0.00751 0.0867 0.1 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.96e-01 0.17 0.131 0.1 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -88066 sc-eQTL 6.45e-01 -0.063 0.137 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 3.33e-01 0.125 0.129 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 8.26e-02 -0.282 0.161 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 3.28e-01 -0.143 0.146 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 2.32e-01 -0.185 0.155 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 5.42e-01 0.0728 0.119 0.105 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 1.79e-02 -0.344 0.144 0.105 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.19e-01 0.238 0.152 0.105 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 2.79e-01 -0.118 0.109 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0212 0.125 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0418 0.106 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 9.48e-02 0.199 0.119 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 2.42e-01 0.165 0.14 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 4.16e-01 0.0968 0.119 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 6.92e-02 0.253 0.138 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0133 0.109 0.101 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0321 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 5.16e-01 0.0815 0.125 0.101 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 6.42e-01 0.0574 0.123 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0106 0.135 0.101 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 4.25e-01 -0.104 0.131 0.101 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0718 0.145 0.101 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 2.94e-01 0.0939 0.0893 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 5.81e-01 0.064 0.116 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 2.69e-02 0.207 0.0927 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 3.85e-01 0.0963 0.111 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 9.52e-01 0.00834 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 6.80e-01 0.0446 0.108 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 3.22e-01 0.137 0.138 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0417 0.111 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 4.20e-01 -0.108 0.134 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 3.90e-01 0.0905 0.105 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 5.84e-01 0.068 0.124 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 4.36e-01 0.105 0.134 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 5.35e-01 0.0765 0.123 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 5.10e-01 0.0967 0.146 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0247 0.106 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0994 0.152 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 4.63e-01 -0.11 0.15 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 4.05e-01 -0.127 0.152 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 5.28e-01 0.0765 0.121 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 3.03e-01 0.136 0.132 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 3.77e-01 0.135 0.152 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00581 0.0651 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0516 0.0939 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 1.29e-02 0.233 0.0928 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 2.76e-01 0.103 0.094 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 5.14e-02 -0.256 0.131 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 1.53e-02 0.202 0.0826 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 8.57e-01 0.0186 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0469 0.0634 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 3.78e-01 0.0955 0.108 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 2.59e-01 -0.122 0.107 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 3.07e-01 -0.108 0.106 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 7.08e-01 -0.055 0.146 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 4.82e-01 0.0612 0.0868 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0563 0.119 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0474 0.0783 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 2.72e-01 -0.144 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 2.54e-01 -0.138 0.121 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 4.57e-01 0.0838 0.112 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 5.70e-01 0.0787 0.138 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 2.59e-01 0.133 0.117 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.46e-01 -0.203 0.139 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 3.32e-02 -0.164 0.0768 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 6.56e-01 0.0597 0.134 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 4.51e-01 -0.106 0.14 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 3.21e-01 -0.127 0.127 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 5.13e-01 -0.093 0.142 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 4.79e-01 0.083 0.117 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0141 0.131 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 7.10e-01 0.0334 0.0897 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 7.43e-01 0.0391 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0701 0.107 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 8.43e-01 0.0225 0.114 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 4.69e-01 0.0864 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 4.12e-01 0.0839 0.102 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 9.84e-01 0.00243 0.122 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 1.45e-01 -0.144 0.0982 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0389 0.147 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 2.43e-01 0.169 0.145 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 7.04e-02 0.222 0.122 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000519 0.133 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0941 0.141 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0314 0.138 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 1.10e-01 -0.209 0.13 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 1.02e-01 -0.251 0.153 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 5.45e-01 0.0973 0.16 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 9.31e-01 0.0137 0.158 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 4.39e-01 -0.104 0.134 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 5.97e-01 0.0777 0.147 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 3.14e-04 0.565 0.154 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 3.11e-01 0.0827 0.0814 0.1 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 610353 sc-eQTL 7.33e-01 0.0376 0.11 0.1 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0882 0.138 0.1 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 1.56e-01 -0.179 0.126 0.1 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0498 0.106 0.1 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 6.79e-01 0.0508 0.123 0.1 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 8.14e-01 0.0324 0.138 0.1 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -88066 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0184 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 1.64e-02 -0.204 0.0843 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 9.94e-02 0.237 0.143 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 8.32e-01 0.0268 0.127 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 2.88e-01 0.143 0.134 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 2.48e-01 0.162 0.14 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 7.47e-01 0.0457 0.142 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 9.43e-04 -0.238 0.0709 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 6.86e-01 0.0516 0.128 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0903 0.131 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 5.69e-01 0.0664 0.116 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 2.29e-01 0.133 0.11 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.06e-01 0.206 0.127 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 9.59e-01 0.0059 0.116 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 5.11e-01 0.0961 0.146 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 2.79e-01 -0.165 0.151 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 4.00e-01 -0.119 0.141 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 2.76e-01 0.16 0.146 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 7.59e-01 0.0427 0.139 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0851 0.0795 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 4.28e-01 -0.105 0.132 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 1.45e-01 -0.196 0.134 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0357 0.129 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00592 0.109 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 5.20e-01 0.0871 0.135 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 7.27e-01 0.0556 0.159 0.096 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0313 0.186 0.096 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0449 0.14 0.096 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0559 0.18 0.096 PB L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 1.01e-02 0.423 0.162 0.096 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 4.95e-01 0.12 0.175 0.096 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 2.72e-01 -0.229 0.207 0.096 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 4.79e-01 0.0672 0.0947 0.1 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 610353 sc-eQTL 6.87e-01 0.0429 0.106 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0485 0.126 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 5.91e-01 0.0673 0.125 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 3.35e-01 0.146 0.151 0.1 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 6.35e-01 0.0453 0.0954 0.1 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00138 0.139 0.1 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -88066 sc-eQTL 1.70e-01 0.154 0.112 0.1 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 3.96e-01 0.0862 0.101 0.1 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 1.81e-01 0.184 0.137 0.1 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 8.05e-01 0.0318 0.128 0.1 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 1.96e-01 0.15 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0597 0.131 0.1 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 1.79e-03 -0.416 0.132 0.1 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 3.42e-01 -0.143 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0323 0.119 0.102 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0213 0.123 0.102 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 4.43e-01 0.114 0.149 0.102 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 2.19e-01 -0.13 0.105 0.102 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0802 0.139 0.102 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 2.68e-01 0.13 0.116 0.102 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 3.22e-01 -0.141 0.142 0.102 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 1.79e-01 -0.161 0.119 0.102 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 1.61e-01 0.148 0.105 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 7.95e-01 -0.03 0.115 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0158 0.119 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 7.96e-01 0.0321 0.124 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0425 0.0958 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 1.49e-02 0.239 0.0975 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 4.34e-01 0.107 0.136 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0207 0.127 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 4.40e-01 0.0922 0.119 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 6.26e-02 -0.249 0.133 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0593 0.136 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 5.70e-01 0.0761 0.134 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 5.60e-03 -0.3 0.107 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 1.05e-01 0.174 0.107 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.27e-01 0.222 0.145 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 4.74e-01 0.0982 0.137 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 1.30e-01 -0.18 0.118 0.094 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 610353 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0273 0.136 0.094 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 4.78e-01 0.121 0.17 0.094 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 5.14e-01 -0.116 0.178 0.094 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 2.92e-02 -0.357 0.162 0.094 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 7.48e-02 -0.282 0.157 0.094 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 4.08e-01 0.145 0.175 0.094 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -88066 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0697 0.154 0.094 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00378 0.133 0.102 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 7.34e-02 -0.241 0.134 0.102 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 1.90e-01 0.2 0.152 0.102 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 1.95e-01 -0.179 0.138 0.102 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0415 0.123 0.102 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 9.03e-03 0.342 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0359 0.137 0.102 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 4.09e-01 0.114 0.138 0.102 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0597 0.111 0.097 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 4.00e-01 0.104 0.124 0.097 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 3.94e-02 0.308 0.148 0.097 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 7.42e-01 0.0456 0.138 0.097 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0591 0.119 0.097 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 4.60e-01 0.0898 0.121 0.097 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 5.23e-01 0.0823 0.129 0.097 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 9.01e-01 0.0184 0.147 0.097 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 6.21e-01 0.0704 0.142 0.093 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 1.57e-01 -0.17 0.119 0.093 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0791 0.162 0.093 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 4.19e-01 0.109 0.134 0.093 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 7.89e-01 0.044 0.164 0.093 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 2.60e-01 0.162 0.143 0.093 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 7.79e-01 0.0446 0.158 0.093 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 7.40e-01 0.0451 0.136 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0389 0.0941 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 3.45e-01 -0.124 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 9.21e-01 0.00967 0.0977 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 2.32e-01 0.133 0.111 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 2.57e-01 0.158 0.139 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0354 0.108 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 2.86e-01 0.151 0.142 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 4.18e-01 0.0649 0.08 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0136 0.108 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 1.61e-01 0.126 0.0895 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 1.70e-01 0.14 0.102 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 850029 sc-eQTL 6.71e-01 0.0532 0.125 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 4.42e-01 0.0793 0.103 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.67e-01 0.188 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 9.06e-02 0.162 0.0954 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0783 0.116 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0345 0.11 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00353 0.128 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 1.09e-01 -0.148 0.0917 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 6.44e-02 0.164 0.0883 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.56e-01 0.198 0.139 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0312 0.129 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0327 0.1 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 405140 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0367 0.119 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 6.70e-02 0.246 0.134 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 6.50e-01 0.0597 0.131 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 5.82e-01 0.0536 0.0973 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 5.50e-02 0.192 0.0995 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.75e-01 0.174 0.128 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 376182 sc-eQTL 7.01e-01 0.0524 0.136 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 1025 sc-eQTL 9.43e-03 -0.175 0.0668 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 927985 sc-eQTL 7.94e-01 0.027 0.103 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 357985 sc-eQTL 1.54e-01 -0.168 0.118 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 207130 sc-eQTL 8.32e-01 -0.023 0.108 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 542577 sc-eQTL 5.14e-01 0.0604 0.0924 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 sc-eQTL 1.09e-01 0.184 0.115 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111145 ELK3 207130 eQTL 0.000255 0.0981 0.0267 0.0 0.0 0.109
ENSG00000139350 NEDD1 -505718 eQTL 0.000163 0.141 0.0371 0.0 0.0 0.109

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111145 ELK3 207130 1.6e-06 2.3e-06 2.29e-07 1.97e-06 1.96e-07 8.24e-07 1.88e-06 5.68e-08 1.73e-06 5.15e-07 1.79e-06 5.75e-07 3.54e-06 2.89e-07 9.2e-08 1.06e-06 5.56e-07 7.78e-07 8.13e-07 1.73e-07 6.18e-07 1.97e-06 1.87e-06 6.33e-07 2.51e-06 7.53e-07 1.04e-06 5.31e-07 2.07e-06 1.62e-06 7.47e-07 2.9e-08 3.46e-08 2.35e-07 8.75e-07 1.36e-07 1.1e-07 5.25e-08 4.74e-08 1.17e-07 5.53e-08 3.32e-06 5.53e-08 1.41e-07 2.64e-08 1.48e-07 1.23e-07 1.88e-09 4.83e-08