logo

Genes within 1Mb (chr12:96361758:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 9.16e-03 0.136 0.0517 0.237 B L1
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0691 0.0742 0.237 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 4.48e-01 0.0495 0.0652 0.237 B L1
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0831 0.0693 0.237 B L1
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 9.41e-01 0.00639 0.0857 0.237 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0913 0.0628 0.237 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0521 0.0921 0.237 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 2.57e-01 0.0508 0.0447 0.237 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 3.09e-01 0.0636 0.0624 0.237 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0285 0.0616 0.237 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 8.32e-01 0.0142 0.0667 0.237 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0432 0.0951 0.237 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0679 0.0581 0.237 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 9.39e-01 0.00549 0.0718 0.237 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 5.37e-02 0.0881 0.0454 0.237 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 7.15e-01 0.027 0.0739 0.237 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 7.47e-01 0.0159 0.0492 0.237 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0458 0.0739 0.237 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0276 0.0841 0.237 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0342 0.0606 0.237 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 9.26e-01 0.00752 0.0806 0.237 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 2.17e-02 0.195 0.0841 0.234 DC L1
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0402 0.097 0.234 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 3.22e-02 -0.228 0.106 0.234 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 1.44e-01 -0.116 0.0789 0.234 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0214 0.0972 0.234 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 8.39e-02 -0.139 0.0802 0.234 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0854 0.104 0.234 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 1.46e-01 -0.136 0.0932 0.234 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 3.62e-01 0.0627 0.0687 0.237 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 9.20e-02 0.146 0.0861 0.237 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 2.29e-01 0.0901 0.0746 0.237 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 1.48e-01 -0.141 0.0974 0.237 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 8.38e-01 0.0135 0.0657 0.237 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0363 0.0619 0.237 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 3.57e-01 0.0877 0.0949 0.237 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 1.46e-01 -0.134 0.0917 0.237 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.26e-01 0.076 0.0495 0.238 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 9.10e-01 0.00834 0.0737 0.238 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 6.41e-01 0.0395 0.0845 0.238 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 9.52e-01 0.00486 0.0802 0.238 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 7.15e-02 -0.119 0.066 0.238 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 7.02e-01 0.0323 0.0841 0.238 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.56e-01 0.0616 0.0432 0.237 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 570606 sc-eQTL 3.83e-01 0.07 0.0802 0.237 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 6.37e-01 0.0391 0.0829 0.237 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 2.30e-01 0.109 0.0905 0.237 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 2.30e-01 0.0851 0.0706 0.237 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0311 0.0658 0.237 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 1.54e-02 -0.242 0.0989 0.237 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -127813 sc-eQTL 2.98e-01 -0.108 0.104 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0318 0.102 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0209 0.128 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 2.31e-01 0.138 0.115 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 2.57e-01 0.139 0.122 0.219 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 3.32e-02 0.199 0.0926 0.219 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0352 0.115 0.219 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 6.90e-02 -0.218 0.119 0.219 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 5.55e-01 0.0499 0.0846 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0912 0.0969 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 6.58e-01 0.0363 0.0819 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 5.70e-02 -0.175 0.0916 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00253 0.109 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 1.92e-01 -0.12 0.0917 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 3.20e-01 0.107 0.108 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.27e-02 0.206 0.082 0.233 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 7.42e-01 0.0357 0.108 0.233 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 2.62e-01 0.108 0.0958 0.233 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0396 0.0944 0.233 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 6.04e-01 0.0538 0.104 0.233 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 3.47e-01 0.0941 0.0999 0.233 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0712 0.111 0.233 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 4.90e-01 0.0459 0.0664 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0906 0.0857 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0305 0.0696 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 8.45e-01 0.0161 0.0823 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0791 0.103 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0608 0.0799 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 3.29e-01 -0.1 0.102 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.57e-03 0.272 0.0848 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 9.03e-01 0.0128 0.105 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 1.20e-01 0.128 0.0818 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 8.84e-01 0.0142 0.097 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 8.35e-01 0.0219 0.105 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 7.50e-01 0.0308 0.0963 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 7.88e-01 0.0309 0.115 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 3.07e-02 0.167 0.0767 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 6.45e-01 0.0512 0.111 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 1.48e-02 -0.265 0.108 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 1.06e-01 0.179 0.11 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 8.59e-01 0.0157 0.0884 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 4.90e-01 0.0665 0.0962 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 9.82e-01 0.00249 0.111 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.17e-01 0.0767 0.0488 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 1.71e-01 0.0966 0.0704 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0804 0.0707 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 7.38e-01 0.0237 0.0709 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0626 0.0993 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0344 0.063 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 7.99e-01 0.0198 0.0776 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 7.47e-01 0.0155 0.0479 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 6.08e-01 0.0419 0.0816 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 3.61e-01 0.0743 0.0811 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0395 0.0799 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 4.15e-01 0.0901 0.11 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0332 0.0656 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 7.18e-01 0.0324 0.0896 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 9.94e-01 0.000442 0.0578 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 7.35e-01 0.0327 0.0966 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 5.93e-01 0.0477 0.0892 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 5.55e-01 -0.049 0.0828 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0168 0.102 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0955 0.0866 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00321 0.103 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.87e-02 0.13 0.0549 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 2.34e-01 -0.114 0.0958 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 4.86e-01 0.07 0.1 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0652 0.0913 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0442 0.102 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0916 0.0838 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0966 0.094 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 5.49e-01 0.04 0.0666 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 3.93e-02 0.182 0.0877 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0419 0.0798 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0178 0.0845 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0477 0.0886 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0845 0.0757 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 3.91e-01 0.0775 0.0903 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 3.44e-01 0.0699 0.0737 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 8.31e-01 0.0235 0.11 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 6.75e-01 0.0456 0.108 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 9.51e-01 0.00565 0.0919 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 7.51e-01 0.0316 0.0995 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 3.50e-01 -0.099 0.106 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 9.30e-01 0.0091 0.104 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 5.61e-01 0.0532 0.0914 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 9.14e-01 0.0117 0.107 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0302 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 2.26e-02 -0.25 0.109 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 5.34e-01 0.0583 0.0936 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0181 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0695 0.111 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0206 0.0623 0.236 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 570606 sc-eQTL 9.86e-01 0.00148 0.084 0.236 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 2.56e-01 0.12 0.105 0.236 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 5.53e-01 0.0571 0.0962 0.236 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 7.65e-02 0.143 0.0802 0.236 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0315 0.0936 0.236 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 2.40e-02 -0.236 0.104 0.236 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -127813 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0677 0.104 0.236 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00679 0.0639 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0162 0.108 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0356 0.0946 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0398 0.1 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 1.54e-01 -0.149 0.104 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 2.51e-03 0.317 0.104 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 5.47e-01 0.0325 0.054 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0588 0.0946 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 6.62e-01 0.0427 0.0975 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0973 0.0861 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 8.85e-02 -0.14 0.0816 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0672 0.0946 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 6.77e-01 -0.035 0.0838 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0522 0.106 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0693 0.11 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0238 0.102 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 8.39e-02 -0.183 0.105 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 7.43e-01 0.033 0.101 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 2.22e-01 0.072 0.0587 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 4.81e-01 0.069 0.0978 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 8.05e-01 0.0247 0.0997 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 4.80e-01 0.0674 0.0953 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 1.20e-02 -0.202 0.0796 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 9.52e-01 0.00605 0.0999 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.52e-01 0.166 0.115 0.211 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 8.53e-01 0.0252 0.136 0.211 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 2.35e-01 0.121 0.102 0.211 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 4.10e-01 -0.108 0.131 0.211 PB L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0449 0.121 0.211 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00876 0.128 0.211 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0678 0.152 0.211 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 8.32e-01 0.014 0.0662 0.239 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 570606 sc-eQTL 9.86e-01 0.00132 0.0744 0.239 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 2.32e-01 0.105 0.0875 0.239 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 3.97e-01 0.0741 0.0873 0.239 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 1.90e-01 -0.138 0.105 0.239 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0423 0.0666 0.239 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 4.49e-01 0.0734 0.0967 0.239 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -127813 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00143 0.0784 0.239 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00159 0.0729 0.237 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 5.46e-01 0.0599 0.0991 0.237 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0824 0.0921 0.237 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0008 0.0836 0.237 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 9.31e-02 0.157 0.0933 0.237 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 1.60e-01 -0.136 0.0964 0.237 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 5.99e-01 -0.057 0.108 0.237 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.97e-03 0.283 0.09 0.22 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 2.41e-01 -0.113 0.0957 0.22 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 7.71e-02 -0.204 0.115 0.22 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0954 0.082 0.22 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 2.60e-02 -0.241 0.107 0.22 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 5.90e-01 0.049 0.0909 0.22 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 1.36e-01 -0.165 0.11 0.22 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0563 0.0934 0.22 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 4.86e-01 0.056 0.0802 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 4.13e-01 0.0718 0.0874 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 5.71e-01 0.0515 0.0907 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 1.56e-01 -0.134 0.0941 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 9.95e-01 0.000437 0.0729 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 6.32e-01 0.036 0.0751 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 2.73e-02 0.228 0.102 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0185 0.0966 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 7.86e-01 0.0246 0.0903 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 5.71e-01 0.0574 0.101 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 4.98e-01 0.0695 0.102 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 2.28e-01 -0.122 0.101 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 6.88e-01 0.0331 0.0824 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 4.70e-01 -0.059 0.0814 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0799 0.11 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 1.42e-01 -0.152 0.103 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 4.24e-01 0.0696 0.0867 0.236 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 570606 sc-eQTL 5.07e-01 0.0663 0.0996 0.236 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 3.97e-01 -0.106 0.124 0.236 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0607 0.13 0.236 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 4.60e-01 0.0889 0.12 0.236 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0518 0.116 0.236 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 3.28e-01 -0.125 0.128 0.236 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -127813 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0535 0.112 0.236 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 6.36e-01 0.0476 0.1 0.236 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 9.52e-01 0.00609 0.102 0.236 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 3.98e-01 0.0973 0.115 0.236 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 2.26e-01 -0.126 0.104 0.236 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0356 0.0928 0.236 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 7.46e-01 0.0322 0.0992 0.236 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0627 0.103 0.236 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 2.68e-01 -0.115 0.103 0.236 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.43e-01 0.116 0.0787 0.242 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 4.73e-01 0.0634 0.0882 0.242 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00898 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 2.12e-02 -0.226 0.0972 0.242 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0408 0.0845 0.242 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 8.01e-02 -0.151 0.0857 0.242 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 9.39e-02 0.153 0.0911 0.242 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 1.86e-05 -0.438 0.0999 0.242 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 2.86e-01 0.11 0.102 0.243 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 5.74e-01 0.0489 0.0867 0.243 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 2.84e-01 -0.126 0.117 0.243 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0744 0.0969 0.243 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 4.05e-01 0.0989 0.119 0.243 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 1.49e-01 -0.149 0.103 0.243 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 1.78e-01 0.154 0.114 0.243 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 1.26e-01 -0.15 0.0973 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.42e-01 0.103 0.0697 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0158 0.0974 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 4.16e-01 0.0592 0.0726 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 6.92e-02 -0.151 0.0825 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 6.53e-01 0.0466 0.104 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 9.08e-01 0.00934 0.0806 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 7.29e-01 0.0366 0.106 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 1.11e-01 0.0947 0.0591 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0422 0.0805 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 8.94e-01 0.00894 0.0668 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 7.92e-01 -0.02 0.076 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 810282 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0337 0.0929 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0643 0.0764 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0295 0.101 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 2.83e-01 0.0777 0.0722 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 2.23e-01 0.107 0.0874 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 4.18e-01 0.067 0.0824 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 1.69e-01 -0.132 0.0958 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 9.35e-01 0.00566 0.0695 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0248 0.0671 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 3.08e-01 0.107 0.105 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0872 0.0973 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 2.32e-01 0.0871 0.0726 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 365393 sc-eQTL 5.78e-01 0.0479 0.086 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 5.77e-01 0.0544 0.0976 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 1.25e-02 -0.237 0.094 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 8.19e-02 -0.123 0.0701 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 6.91e-01 -0.029 0.0728 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 7.85e-01 0.0255 0.0934 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 sc-eQTL 9.35e-04 -0.323 0.0963 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -38722 sc-eQTL 3.48e-01 0.0476 0.0506 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 888238 sc-eQTL 8.49e-01 0.0147 0.0771 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 318238 sc-eQTL 5.30e-01 0.0554 0.088 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 167383 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00255 0.0807 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 502830 sc-eQTL 1.45e-02 -0.168 0.068 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0205 0.086 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111145 ELK3 167383 eQTL 0.00891 -0.061 0.0233 0.0 0.0 0.187
ENSG00000139350 NEDD1 -545465 eQTL 0.00199 0.1 0.0323 0.0 0.0 0.187
ENSG00000257715 AC007298.1 336435 eQTL 0.0311 -0.0559 0.0259 0.0 0.0 0.187

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina