logo

Genes within 1Mb (chr12:96359643:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0572 0.0834 0.081 B L1
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0265 0.118 0.081 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0968 0.103 0.081 B L1
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 1.10e-03 0.356 0.108 0.081 B L1
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 5.82e-01 -0.075 0.136 0.081 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 6.22e-02 -0.186 0.0995 0.081 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0266 0.146 0.081 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 1.01e-01 -0.112 0.0679 0.081 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 6.03e-01 0.0497 0.0952 0.081 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0334 0.0938 0.081 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 6.86e-01 0.0411 0.102 0.081 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 4.08e-01 0.12 0.145 0.081 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0097 0.0888 0.081 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 5.06e-01 0.0728 0.109 0.081 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000994 0.0701 0.081 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 8.08e-01 0.0276 0.113 0.081 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 7.27e-01 0.0263 0.0752 0.081 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 7.57e-01 0.0351 0.113 0.081 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0628 0.129 0.081 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0684 0.0927 0.081 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 1.41e-01 0.181 0.123 0.081 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0212 0.129 0.083 DC L1
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 5.54e-01 0.087 0.147 0.083 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 9.03e-01 0.0197 0.162 0.083 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0667 0.12 0.083 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 3.10e-01 -0.15 0.147 0.083 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 6.97e-02 -0.222 0.121 0.083 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 3.48e-01 -0.148 0.157 0.083 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 2.43e-01 0.166 0.141 0.083 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 5.94e-02 0.196 0.103 0.081 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 3.80e-02 -0.271 0.13 0.081 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00929 0.113 0.081 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 2.58e-01 -0.168 0.148 0.081 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 4.88e-01 0.069 0.0993 0.081 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 7.13e-01 0.0345 0.0937 0.081 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 7.11e-01 0.0534 0.144 0.081 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 3.40e-01 -0.133 0.139 0.081 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00584 0.0783 0.079 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 9.67e-01 0.00487 0.116 0.079 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 7.66e-01 0.0396 0.133 0.079 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 1.61e-01 -0.177 0.126 0.079 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 7.18e-01 0.0378 0.105 0.079 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0607 0.132 0.079 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000189 0.0655 0.081 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 568491 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0942 0.121 0.081 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0857 0.125 0.081 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 4.74e-02 0.27 0.136 0.081 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0228 0.107 0.081 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 6.64e-01 0.0431 0.0993 0.081 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0597 0.151 0.081 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -129928 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0594 0.157 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 3.22e-01 0.153 0.154 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 5.06e-01 0.13 0.195 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0974 0.175 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 4.66e-01 0.136 0.185 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 5.69e-01 0.0813 0.142 0.079 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 2.59e-01 0.198 0.174 0.079 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 2.51e-01 -0.21 0.182 0.079 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 2.57e-01 -0.146 0.128 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 8.71e-01 -0.024 0.147 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0409 0.125 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 9.20e-01 0.0142 0.14 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0286 0.166 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 1.84e-01 -0.186 0.139 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 9.79e-01 0.0043 0.164 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 3.44e-01 -0.117 0.123 0.082 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 6.86e-01 0.065 0.161 0.082 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 9.56e-02 -0.237 0.142 0.082 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 2.23e-01 0.171 0.14 0.082 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 3.56e-01 0.142 0.154 0.082 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 4.53e-01 -0.112 0.148 0.082 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 2.94e-03 0.484 0.161 0.082 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 6.84e-01 0.0419 0.103 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00864 0.133 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 1.47e-01 -0.156 0.107 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 7.80e-03 0.337 0.125 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 3.68e-01 0.144 0.16 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 5.49e-02 -0.237 0.123 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0375 0.159 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 8.00e-01 -0.033 0.13 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 6.83e-01 0.0641 0.157 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 9.33e-01 0.0103 0.123 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 1.25e-01 0.222 0.144 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0388 0.157 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 2.73e-01 -0.158 0.144 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 7.19e-02 -0.308 0.17 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0176 0.118 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 4.44e-01 0.13 0.169 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 8.82e-03 0.434 0.164 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 7.19e-01 0.0609 0.169 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 5.15e-02 -0.262 0.134 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 8.31e-01 0.0314 0.147 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 3.91e-01 -0.146 0.17 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 1.21e-01 -0.116 0.0746 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 4.42e-01 0.0832 0.108 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0363 0.108 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0474 0.108 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 3.27e-01 0.149 0.152 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0221 0.0964 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 3.46e-01 0.112 0.118 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0822 0.0731 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 7.11e-01 0.0462 0.125 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0684 0.124 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 1.17e-01 0.192 0.122 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 6.13e-01 0.0857 0.169 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0455 0.1 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 3.22e-01 -0.136 0.137 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 9.43e-01 0.00647 0.0907 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 1.98e-01 0.195 0.151 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0658 0.14 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0536 0.13 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 4.45e-01 -0.122 0.16 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0184 0.136 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 2.06e-01 0.204 0.161 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 3.19e-01 0.0856 0.0857 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 1.73e-01 0.202 0.148 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 1.75e-01 0.21 0.154 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 6.13e-01 0.0715 0.141 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 3.66e-01 -0.142 0.157 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 9.97e-01 0.000434 0.13 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 7.74e-01 0.0418 0.146 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 2.19e-01 -0.129 0.104 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 4.23e-01 -0.112 0.139 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 3.35e-01 -0.121 0.125 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 8.16e-01 0.0309 0.133 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0467 0.139 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0685 0.119 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 5.24e-01 0.0907 0.142 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 1.93e-01 -0.146 0.112 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 7.49e-02 0.297 0.166 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0666 0.165 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 1.38e-01 -0.207 0.139 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0391 0.151 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 3.66e-01 0.145 0.16 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 1.58e-02 0.377 0.155 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 2.25e-01 0.171 0.14 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 1.34e-01 0.248 0.164 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0723 0.172 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 2.75e-01 0.185 0.169 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 3.15e-01 -0.145 0.144 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 7.15e-01 0.0575 0.157 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 6.34e-01 0.0814 0.171 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 5.02e-01 0.0639 0.095 0.08 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 568491 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0897 0.128 0.08 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 3.38e-01 -0.155 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 1.74e-02 0.347 0.145 0.08 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0199 0.123 0.08 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0884 0.143 0.08 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 2.61e-01 0.18 0.16 0.08 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -129928 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0227 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 5.41e-01 0.0606 0.0989 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 8.39e-02 -0.288 0.166 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 3.50e-01 -0.137 0.146 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 7.68e-02 -0.274 0.154 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 4.42e-02 -0.326 0.161 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 1.30e-01 -0.248 0.163 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0443 0.0842 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 3.38e-01 0.142 0.147 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 6.36e-01 0.0722 0.152 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 1.91e-01 -0.176 0.134 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 2.24e-01 0.156 0.128 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00143 0.148 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 5.45e-01 0.0781 0.129 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 1.50e-01 -0.233 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 3.81e-01 0.148 0.169 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 9.26e-01 0.0146 0.157 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 1.29e-01 -0.248 0.162 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0424 0.154 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0443 0.0926 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 7.49e-01 0.0493 0.154 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 1.73e-01 0.213 0.156 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0922 0.15 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000319 0.127 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 8.45e-01 0.0308 0.157 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 2.88e-01 -0.198 0.185 0.074 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 7.66e-01 0.0648 0.218 0.074 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 8.24e-01 0.0365 0.164 0.074 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 1.30e-01 0.318 0.208 0.074 PB L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 2.28e-01 -0.235 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 4.37e-01 -0.16 0.205 0.074 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0321 0.244 0.074 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0893 0.102 0.083 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 568491 sc-eQTL 1.33e-01 -0.172 0.114 0.083 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 2.43e-01 0.158 0.135 0.083 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 1.26e-01 0.205 0.134 0.083 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 1.53e-01 0.232 0.162 0.083 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 6.79e-01 0.0426 0.103 0.083 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00563 0.149 0.083 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -129928 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0363 0.121 0.083 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 4.17e-01 0.092 0.113 0.081 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 1.61e-01 -0.215 0.153 0.081 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 1.86e-01 0.19 0.143 0.081 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00306 0.13 0.081 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0106 0.146 0.081 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00774 0.15 0.081 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 8.09e-01 0.0407 0.168 0.081 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0364 0.136 0.085 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 1.74e-02 0.333 0.139 0.085 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 7.91e-01 0.0453 0.17 0.085 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 2.29e-01 -0.145 0.12 0.085 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 9.05e-01 0.019 0.16 0.085 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 4.53e-01 -0.1 0.133 0.085 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 6.41e-01 0.0759 0.163 0.085 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 6.50e-01 0.0624 0.137 0.085 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 4.87e-02 0.235 0.119 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 1.54e-01 -0.186 0.13 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 5.90e-01 -0.073 0.135 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 3.83e-01 -0.123 0.141 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 4.42e-01 0.0837 0.109 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00439 0.112 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 4.18e-01 0.125 0.154 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 3.66e-01 -0.13 0.144 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 5.78e-01 0.0752 0.135 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 3.53e-01 -0.141 0.151 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 3.38e-01 0.147 0.153 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 4.64e-01 -0.111 0.151 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 3.36e-01 0.119 0.123 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 4.27e-01 0.0968 0.122 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 8.59e-01 0.0292 0.165 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 2.57e-01 -0.176 0.154 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 8.03e-01 0.0311 0.125 0.091 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 568491 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0133 0.143 0.091 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0952 0.179 0.091 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 7.64e-01 0.0561 0.186 0.091 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 5.09e-01 -0.114 0.172 0.091 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 4.90e-01 0.115 0.166 0.091 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00957 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -129928 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0565 0.161 0.091 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0322 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 7.62e-01 0.0468 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 2.47e-01 -0.202 0.174 0.082 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 4.70e-01 -0.115 0.158 0.082 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 4.37e-01 -0.11 0.141 0.082 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0301 0.151 0.082 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00129 0.157 0.082 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 2.92e-01 -0.166 0.157 0.082 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0764 0.121 0.081 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 1.59e-01 -0.19 0.135 0.081 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 4.68e-01 -0.119 0.164 0.081 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 1.27e-01 -0.23 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 6.89e-01 0.0519 0.13 0.081 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 7.98e-01 0.0339 0.132 0.081 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0933 0.141 0.081 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 7.93e-01 0.0422 0.16 0.081 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 5.61e-01 0.0909 0.156 0.09 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 5.85e-02 -0.249 0.13 0.09 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0889 0.178 0.09 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 2.23e-01 0.18 0.147 0.09 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0959 0.18 0.09 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 6.17e-01 -0.079 0.157 0.09 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 5.09e-02 -0.338 0.172 0.09 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0146 0.149 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0908 0.108 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 7.85e-01 -0.041 0.15 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 9.82e-02 -0.185 0.112 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 1.66e-01 0.177 0.128 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0237 0.16 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 1.01e-01 -0.204 0.124 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 3.21e-02 0.348 0.161 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 9.02e-01 0.0114 0.0923 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 7.56e-01 0.0389 0.125 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 1.68e-01 -0.143 0.103 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 3.68e-03 0.34 0.116 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 808167 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0523 0.144 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 1.10e-01 -0.189 0.118 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 1.71e-01 -0.215 0.157 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 6.76e-02 0.197 0.107 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 1.39e-01 -0.193 0.13 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00874 0.123 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 4.09e-01 -0.118 0.143 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 2.97e-01 0.108 0.103 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 7.51e-01 0.0317 0.1 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 5.01e-01 0.106 0.157 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 4.61e-01 -0.107 0.145 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0395 0.114 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 363278 sc-eQTL 2.18e-01 -0.166 0.134 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 3.99e-01 -0.129 0.153 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 9.23e-02 -0.251 0.149 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0233 0.111 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 8.31e-01 0.0244 0.114 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 9.87e-01 0.00231 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 334320 sc-eQTL 9.65e-01 0.00678 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -40837 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0116 0.0793 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 886123 sc-eQTL 5.83e-01 0.0662 0.121 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 316123 sc-eQTL 4.55e-01 0.103 0.138 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 165268 sc-eQTL 2.54e-01 -0.144 0.126 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 500715 sc-eQTL 4.02e-01 0.0905 0.108 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -547580 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0273 0.135 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 -40837 eQTL 3.69e-02 -0.0509 0.0244 0.00142 0.0 0.0589

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000059758 CDK17 -40837 9.72e-06 1.04e-05 1.61e-06 6.41e-06 2.45e-06 4.92e-06 1.14e-05 2.14e-06 9.26e-06 5.39e-06 1.27e-05 6.11e-06 1.58e-05 3.66e-06 2.94e-06 6.33e-06 4.99e-06 9.07e-06 2.53e-06 2.82e-06 5.1e-06 9.52e-06 9.05e-06 3.3e-06 1.5e-05 4.36e-06 4.73e-06 4.18e-06 1.09e-05 1e-05 5.67e-06 8.91e-07 1.27e-06 3.5e-06 4.88e-06 2.7e-06 1.75e-06 1.94e-06 2.19e-06 9.35e-07 9.94e-07 1.3e-05 1.57e-06 1.49e-07 7.57e-07 1.72e-06 1.68e-06 7.25e-07 4.14e-07
ENSG00000139344 \N 416312 1.27e-06 1.19e-06 3.18e-07 1.3e-06 3.37e-07 6.17e-07 1.48e-06 3.99e-07 1.52e-06 5.06e-07 1.85e-06 9.21e-07 2.25e-06 2.79e-07 5.4e-07 9.19e-07 9.05e-07 8.82e-07 8.13e-07 5.97e-07 6.61e-07 1.63e-06 8.94e-07 5.61e-07 2.23e-06 6.17e-07 9.28e-07 7.45e-07 1.48e-06 1.22e-06 7.26e-07 1.88e-07 2e-07 6.68e-07 5.34e-07 4.56e-07 5.76e-07 2.34e-07 4.1e-07 3.1e-07 2.92e-07 1.6e-06 3.55e-07 9.69e-08 2.98e-07 1.11e-07 2.19e-07 6.05e-08 1.68e-07