logo

Genes within 1Mb (chr12:96358699:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 4.26e-01 0.0543 0.068 0.122 B L1
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 6.00e-01 0.0506 0.0963 0.122 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 3.72e-01 0.0755 0.0845 0.122 B L1
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 3.20e-01 0.0896 0.0899 0.122 B L1
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 2.55e-01 0.126 0.111 0.122 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 7.04e-01 0.0311 0.0818 0.122 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 1.77e-01 0.161 0.119 0.122 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0216 0.0556 0.122 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0117 0.0776 0.122 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 1.55e-01 0.109 0.076 0.122 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 1.74e-01 0.112 0.0824 0.122 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 5.26e-02 -0.228 0.117 0.122 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 1.04e-01 0.117 0.0719 0.122 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0842 0.0889 0.122 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0794 0.0568 0.122 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0211 0.0921 0.122 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00568 0.0613 0.122 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 5.03e-01 0.0618 0.0921 0.122 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 2.91e-01 -0.111 0.105 0.122 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 6.17e-01 0.0378 0.0755 0.122 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 3.95e-01 0.0854 0.1 0.122 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 4.57e-01 0.0791 0.106 0.126 DC L1
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 6.73e-01 0.0512 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 4.28e-01 0.106 0.133 0.126 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 9.86e-01 0.0018 0.0989 0.126 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 1.93e-01 0.158 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.43e-01 0.118 0.1 0.126 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.129 0.126 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0306 0.117 0.126 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 7.77e-01 0.0252 0.0889 0.122 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0994 0.112 0.122 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.0965 0.122 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 7.20e-01 0.0455 0.126 0.122 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0665 0.0849 0.122 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.77e-01 0.087 0.0799 0.122 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 1.80e-01 0.165 0.122 0.122 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 7.49e-01 0.0381 0.119 0.122 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 5.73e-03 -0.172 0.0616 0.122 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 5.04e-01 0.062 0.0928 0.122 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 1.42e-01 -0.156 0.106 0.122 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 2.66e-01 -0.112 0.101 0.122 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 4.39e-01 0.0649 0.0836 0.122 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 4.59e-02 0.211 0.105 0.122 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 8.15e-01 0.0126 0.0538 0.122 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 567547 sc-eQTL 7.55e-01 0.0311 0.0994 0.122 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 6.21e-01 0.0508 0.103 0.122 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0857 0.112 0.122 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0873 0.0875 0.122 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 8.57e-01 0.0147 0.0815 0.122 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 6.31e-01 0.0597 0.124 0.122 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -130872 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0586 0.128 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 7.49e-01 0.0387 0.121 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 1.02e-01 -0.248 0.151 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 1.02e-01 -0.223 0.136 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0521 0.145 0.125 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 7.91e-01 0.0294 0.111 0.125 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.04e-02 -0.315 0.134 0.125 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 2.90e-02 0.31 0.141 0.125 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0296 0.103 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 4.07e-01 0.0977 0.118 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 7.56e-01 -0.031 0.0994 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 6.40e-02 0.207 0.111 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 2.75e-01 0.144 0.132 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.34e-01 0.133 0.111 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 1.15e-01 0.206 0.13 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 7.10e-01 -0.038 0.102 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00206 0.133 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 6.17e-01 0.0589 0.118 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 6.53e-01 0.0521 0.116 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0777 0.127 0.123 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0893 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0753 0.136 0.123 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 8.88e-02 0.143 0.0838 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 5.69e-01 0.0622 0.109 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 1.73e-02 0.209 0.0872 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 7.77e-01 0.0296 0.104 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0658 0.131 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 5.98e-01 0.0537 0.102 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 1.98e-01 0.168 0.13 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0455 0.105 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0343 0.127 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 5.14e-01 0.0649 0.0992 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 2.91e-01 0.124 0.117 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 4.44e-01 0.0968 0.126 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0461 0.116 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0161 0.138 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0583 0.0987 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 1.93e-01 -0.184 0.141 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0447 0.139 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 3.00e-01 -0.146 0.141 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0153 0.113 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.15e-01 0.152 0.122 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 4.54e-02 0.283 0.14 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0131 0.0612 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 2.92e-01 -0.093 0.0881 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 1.67e-02 0.211 0.0874 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 3.23e-01 0.0876 0.0884 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 8.25e-02 -0.215 0.123 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 1.80e-02 0.185 0.0777 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0437 0.0969 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0158 0.0601 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 3.30e-01 0.0997 0.102 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 2.79e-01 -0.11 0.102 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0823 0.1 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0865 0.139 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 6.21e-01 0.0407 0.0823 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0467 0.112 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0745 0.0732 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0556 0.123 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 2.44e-01 -0.132 0.113 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 4.07e-01 0.0873 0.105 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 5.45e-01 0.0785 0.129 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 4.52e-01 0.0829 0.11 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 2.85e-01 -0.14 0.13 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 7.54e-02 -0.129 0.0722 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 7.89e-01 0.0336 0.126 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 1.78e-01 -0.177 0.131 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0794 0.12 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 2.12e-01 -0.166 0.133 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 5.92e-01 0.0589 0.11 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0492 0.123 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0623 0.0839 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 4.68e-01 0.0811 0.112 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0764 0.101 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 6.30e-01 0.0513 0.106 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 5.41e-01 0.0684 0.112 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 3.28e-01 0.0937 0.0955 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00896 0.114 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 3.24e-02 -0.197 0.0915 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 7.80e-01 0.0387 0.138 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 3.98e-02 0.279 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 1.13e-01 0.182 0.115 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 5.41e-01 0.0764 0.125 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 9.44e-01 0.00927 0.133 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 3.57e-01 -0.12 0.13 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 2.12e-01 -0.153 0.122 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 2.18e-01 -0.178 0.144 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 8.06e-01 0.0371 0.151 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 9.90e-01 0.00181 0.148 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 2.78e-01 -0.137 0.126 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 9.15e-01 0.0148 0.138 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 3.44e-03 0.433 0.146 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 3.87e-01 0.0667 0.0769 0.121 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 567547 sc-eQTL 5.27e-01 0.0658 0.104 0.121 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0266 0.131 0.121 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 3.12e-01 -0.12 0.119 0.121 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0844 0.0998 0.121 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 9.99e-01 0.000203 0.116 0.121 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0407 0.13 0.121 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -130872 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0288 0.129 0.121 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 2.61e-02 -0.177 0.079 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 1.77e-01 0.182 0.134 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 9.32e-01 0.0101 0.118 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 2.11e-01 0.157 0.125 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.93e-01 0.138 0.131 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 5.26e-01 0.0841 0.132 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 1.99e-03 -0.208 0.0665 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 6.05e-01 0.0617 0.119 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 2.44e-01 -0.143 0.123 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 9.32e-01 0.00937 0.109 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.09e-01 0.13 0.103 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 2.97e-02 0.258 0.118 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0865 0.107 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0314 0.136 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0663 0.141 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 2.50e-01 -0.151 0.131 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 1.44e-01 0.199 0.136 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 6.36e-01 0.0612 0.129 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0749 0.0739 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0939 0.123 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 4.93e-02 -0.245 0.124 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 2.99e-01 -0.125 0.12 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 6.35e-01 0.0482 0.101 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 4.09e-01 0.104 0.125 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0268 0.15 0.111 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0741 0.176 0.111 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0323 0.133 0.111 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0137 0.17 0.111 PB L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 2.52e-02 0.349 0.154 0.111 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 6.01e-01 0.0868 0.166 0.111 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0931 0.197 0.111 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 4.51e-01 0.0656 0.0869 0.122 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 567547 sc-eQTL 6.61e-01 0.043 0.0977 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 3.75e-01 -0.102 0.115 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 4.59e-01 0.0851 0.115 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 1.98e-01 0.179 0.138 0.122 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 3.18e-01 0.0875 0.0874 0.122 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 9.57e-01 0.0068 0.127 0.122 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -130872 sc-eQTL 1.63e-01 0.144 0.102 0.122 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 8.24e-01 0.021 0.0943 0.122 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 5.62e-02 0.244 0.127 0.122 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 8.15e-01 0.028 0.119 0.122 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 2.44e-01 0.126 0.108 0.122 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 1.90e-01 -0.159 0.121 0.122 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 6.50e-03 -0.339 0.123 0.122 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.14 0.122 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 8.98e-01 0.0142 0.111 0.127 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 5.14e-01 0.075 0.115 0.127 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 7.14e-01 0.051 0.139 0.127 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0802 0.0983 0.127 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 4.06e-01 0.108 0.13 0.127 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 8.66e-01 0.0183 0.109 0.127 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 1.53e-01 -0.189 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0738 0.112 0.127 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 2.97e-01 0.105 0.1 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0606 0.11 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 7.16e-01 0.0414 0.114 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 4.04e-01 0.099 0.118 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00183 0.0914 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 1.27e-01 0.144 0.0937 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 2.87e-01 0.138 0.129 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 6.81e-01 0.0498 0.121 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 9.31e-01 0.00974 0.113 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 1.08e-01 -0.203 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0567 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 2.93e-01 0.133 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 1.37e-02 -0.252 0.102 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.66e-01 0.113 0.101 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 1.43e-01 0.201 0.137 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 2.98e-01 0.134 0.129 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 1.40e-01 -0.163 0.11 0.121 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 567547 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0916 0.127 0.121 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 4.42e-01 0.123 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 1.56e-01 -0.235 0.165 0.121 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 3.46e-02 -0.323 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 9.46e-02 -0.247 0.147 0.121 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 3.05e-01 0.168 0.163 0.121 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -130872 sc-eQTL 9.61e-01 0.0071 0.144 0.121 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 8.75e-01 0.0199 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 6.94e-02 -0.231 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 1.40e-01 0.213 0.144 0.124 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 2.00e-01 -0.167 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 9.84e-01 0.00229 0.116 0.124 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.78e-02 0.273 0.123 0.124 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0835 0.129 0.124 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 4.81e-01 0.0916 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0667 0.105 0.12 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 2.53e-01 0.134 0.117 0.12 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 5.12e-02 0.275 0.14 0.12 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 8.20e-01 0.0298 0.13 0.12 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0844 0.112 0.12 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 9.65e-01 0.00501 0.114 0.12 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 8.22e-01 0.0274 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 9.99e-01 0.00019 0.139 0.12 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 7.03e-01 0.05 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 2.39e-01 -0.13 0.11 0.116 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 6.86e-01 0.0603 0.149 0.116 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 6.72e-01 0.0524 0.124 0.116 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 5.10e-01 0.0998 0.151 0.116 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 1.86e-01 0.174 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0077 0.146 0.116 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0596 0.125 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00818 0.0876 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000417 0.122 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 9.42e-01 0.00669 0.091 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 2.03e-01 0.132 0.104 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 3.96e-01 0.11 0.129 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 8.13e-01 0.0239 0.101 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 2.48e-01 0.153 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 2.12e-01 0.0942 0.0753 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00894 0.102 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 1.18e-01 0.132 0.0843 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 1.88e-01 0.127 0.0962 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 807223 sc-eQTL 8.84e-01 0.0172 0.118 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 8.46e-01 0.0189 0.0973 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 2.25e-01 0.156 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 2.24e-01 0.111 0.0911 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0765 0.111 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00389 0.104 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 6.41e-01 0.0567 0.122 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 2.43e-01 -0.103 0.0876 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 4.21e-01 0.0683 0.0846 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 1.19e-01 0.207 0.132 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 7.16e-01 0.0448 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0507 0.0947 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 362334 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0214 0.112 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 5.82e-02 0.24 0.126 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 6.98e-01 0.0482 0.124 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 6.13e-01 0.0465 0.0918 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.32e-01 0.113 0.0944 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 3.85e-01 0.106 0.121 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 333376 sc-eQTL 6.17e-01 0.0644 0.129 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -41781 sc-eQTL 2.52e-02 -0.142 0.0631 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 885179 sc-eQTL 6.87e-01 0.0391 0.0971 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 315179 sc-eQTL 8.69e-02 -0.19 0.11 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 164324 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0762 0.101 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 499771 sc-eQTL 2.67e-01 0.0964 0.0867 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 sc-eQTL 3.93e-02 0.223 0.107 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111145 ELK3 164324 eQTL 1.74e-05 0.106 0.0245 0.00118 0.0 0.124
ENSG00000139350 NEDD1 -548524 eQTL 9.25e-06 0.152 0.0341 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111145 ELK3 164324 7.77e-06 9.03e-06 1.31e-06 5.03e-06 1.47e-06 3.88e-06 9.61e-06 1.1e-06 6.39e-06 4.26e-06 8.9e-06 3.41e-06 1.31e-05 3.8e-06 1.86e-06 4.63e-06 3.72e-06 5.52e-06 2.64e-06 2.59e-06 4.54e-06 7.77e-06 5.82e-06 1.97e-06 1.04e-05 2.11e-06 3.16e-06 2.73e-06 8.33e-06 7.59e-06 4.35e-06 1.05e-06 1.1e-06 2.79e-06 2.8e-06 2.14e-06 1.41e-06 1.74e-06 1.76e-06 8.57e-07 7.14e-07 9.93e-06 1.13e-06 1.66e-07 7.12e-07 1.48e-06 1.17e-06 7.11e-07 4.39e-07