logo

Genes within 1Mb (chr12:96357529:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 4.26e-01 0.0543 0.068 0.122 B L1
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 6.00e-01 0.0506 0.0963 0.122 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 3.72e-01 0.0755 0.0845 0.122 B L1
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 3.20e-01 0.0896 0.0899 0.122 B L1
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 2.55e-01 0.126 0.111 0.122 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 7.04e-01 0.0311 0.0818 0.122 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 1.77e-01 0.161 0.119 0.122 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0216 0.0556 0.122 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0117 0.0776 0.122 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 1.55e-01 0.109 0.076 0.122 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 1.74e-01 0.112 0.0824 0.122 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 5.26e-02 -0.228 0.117 0.122 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 1.04e-01 0.117 0.0719 0.122 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0842 0.0889 0.122 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0794 0.0568 0.122 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0211 0.0921 0.122 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00568 0.0613 0.122 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 5.03e-01 0.0618 0.0921 0.122 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 2.91e-01 -0.111 0.105 0.122 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 6.17e-01 0.0378 0.0755 0.122 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 3.95e-01 0.0854 0.1 0.122 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 4.57e-01 0.0791 0.106 0.126 DC L1
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 6.73e-01 0.0512 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 4.28e-01 0.106 0.133 0.126 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 9.86e-01 0.0018 0.0989 0.126 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 1.93e-01 0.158 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.43e-01 0.118 0.1 0.126 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.129 0.126 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0306 0.117 0.126 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 7.77e-01 0.0252 0.0889 0.122 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0994 0.112 0.122 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.0965 0.122 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 7.20e-01 0.0455 0.126 0.122 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0665 0.0849 0.122 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.77e-01 0.087 0.0799 0.122 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 1.80e-01 0.165 0.122 0.122 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 7.49e-01 0.0381 0.119 0.122 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 5.73e-03 -0.172 0.0616 0.122 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 5.04e-01 0.062 0.0928 0.122 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 1.42e-01 -0.156 0.106 0.122 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 2.66e-01 -0.112 0.101 0.122 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 4.39e-01 0.0649 0.0836 0.122 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 4.59e-02 0.211 0.105 0.122 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 8.15e-01 0.0126 0.0538 0.122 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 566377 sc-eQTL 7.55e-01 0.0311 0.0994 0.122 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 6.21e-01 0.0508 0.103 0.122 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0857 0.112 0.122 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0873 0.0875 0.122 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 8.57e-01 0.0147 0.0815 0.122 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 6.31e-01 0.0597 0.124 0.122 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -132042 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0586 0.128 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 7.49e-01 0.0387 0.121 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 1.02e-01 -0.248 0.151 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 1.02e-01 -0.223 0.136 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0521 0.145 0.125 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 7.91e-01 0.0294 0.111 0.125 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.04e-02 -0.315 0.134 0.125 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 2.90e-02 0.31 0.141 0.125 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0296 0.103 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 4.07e-01 0.0977 0.118 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 7.56e-01 -0.031 0.0994 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 6.40e-02 0.207 0.111 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 2.75e-01 0.144 0.132 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.34e-01 0.133 0.111 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 1.15e-01 0.206 0.13 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 7.10e-01 -0.038 0.102 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00206 0.133 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 6.17e-01 0.0589 0.118 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 6.53e-01 0.0521 0.116 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0777 0.127 0.123 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0893 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0753 0.136 0.123 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 8.88e-02 0.143 0.0838 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 5.69e-01 0.0622 0.109 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 1.73e-02 0.209 0.0872 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 7.77e-01 0.0296 0.104 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0658 0.131 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 5.98e-01 0.0537 0.102 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 1.98e-01 0.168 0.13 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0455 0.105 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0343 0.127 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 5.14e-01 0.0649 0.0992 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 2.91e-01 0.124 0.117 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 4.44e-01 0.0968 0.126 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0461 0.116 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0161 0.138 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0583 0.0987 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 1.93e-01 -0.184 0.141 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0447 0.139 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 3.00e-01 -0.146 0.141 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0153 0.113 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.15e-01 0.152 0.122 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 4.54e-02 0.283 0.14 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0131 0.0612 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 2.92e-01 -0.093 0.0881 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 1.67e-02 0.211 0.0874 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 3.23e-01 0.0876 0.0884 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 8.25e-02 -0.215 0.123 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 1.80e-02 0.185 0.0777 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0437 0.0969 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0158 0.0601 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 3.30e-01 0.0997 0.102 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 2.79e-01 -0.11 0.102 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0823 0.1 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0865 0.139 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 6.21e-01 0.0407 0.0823 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0467 0.112 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0745 0.0732 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0556 0.123 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 2.44e-01 -0.132 0.113 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 4.07e-01 0.0873 0.105 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 5.45e-01 0.0785 0.129 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 4.52e-01 0.0829 0.11 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 2.85e-01 -0.14 0.13 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 7.54e-02 -0.129 0.0722 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 7.89e-01 0.0336 0.126 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 1.78e-01 -0.177 0.131 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0794 0.12 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 2.12e-01 -0.166 0.133 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 5.92e-01 0.0589 0.11 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0492 0.123 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0623 0.0839 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 4.68e-01 0.0811 0.112 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0764 0.101 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 6.30e-01 0.0513 0.106 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 5.41e-01 0.0684 0.112 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 3.28e-01 0.0937 0.0955 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00896 0.114 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 3.24e-02 -0.197 0.0915 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 7.80e-01 0.0387 0.138 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 3.98e-02 0.279 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 1.13e-01 0.182 0.115 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 5.41e-01 0.0764 0.125 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 9.44e-01 0.00927 0.133 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 3.57e-01 -0.12 0.13 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 2.12e-01 -0.153 0.122 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 2.18e-01 -0.178 0.144 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 8.06e-01 0.0371 0.151 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 9.90e-01 0.00181 0.148 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 2.78e-01 -0.137 0.126 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 9.15e-01 0.0148 0.138 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 3.44e-03 0.433 0.146 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 3.87e-01 0.0667 0.0769 0.121 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 566377 sc-eQTL 5.27e-01 0.0658 0.104 0.121 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0266 0.131 0.121 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 3.12e-01 -0.12 0.119 0.121 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0844 0.0998 0.121 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 9.99e-01 0.000203 0.116 0.121 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0407 0.13 0.121 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -132042 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0288 0.129 0.121 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 2.61e-02 -0.177 0.079 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 1.77e-01 0.182 0.134 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 9.32e-01 0.0101 0.118 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 2.11e-01 0.157 0.125 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.93e-01 0.138 0.131 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 5.26e-01 0.0841 0.132 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 1.99e-03 -0.208 0.0665 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 6.05e-01 0.0617 0.119 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 2.44e-01 -0.143 0.123 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 9.32e-01 0.00937 0.109 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.09e-01 0.13 0.103 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 2.97e-02 0.258 0.118 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0865 0.107 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0314 0.136 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0663 0.141 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 2.50e-01 -0.151 0.131 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 1.44e-01 0.199 0.136 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 6.36e-01 0.0612 0.129 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0749 0.0739 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0939 0.123 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 4.93e-02 -0.245 0.124 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 2.99e-01 -0.125 0.12 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 6.35e-01 0.0482 0.101 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 4.09e-01 0.104 0.125 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0268 0.15 0.111 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0741 0.176 0.111 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0323 0.133 0.111 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0137 0.17 0.111 PB L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 2.52e-02 0.349 0.154 0.111 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 6.01e-01 0.0868 0.166 0.111 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0931 0.197 0.111 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 4.51e-01 0.0656 0.0869 0.122 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 566377 sc-eQTL 6.61e-01 0.043 0.0977 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 3.75e-01 -0.102 0.115 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 4.59e-01 0.0851 0.115 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 1.98e-01 0.179 0.138 0.122 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 3.18e-01 0.0875 0.0874 0.122 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 9.57e-01 0.0068 0.127 0.122 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -132042 sc-eQTL 1.63e-01 0.144 0.102 0.122 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 8.24e-01 0.021 0.0943 0.122 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 5.62e-02 0.244 0.127 0.122 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 8.15e-01 0.028 0.119 0.122 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 2.44e-01 0.126 0.108 0.122 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 1.90e-01 -0.159 0.121 0.122 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 6.50e-03 -0.339 0.123 0.122 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.14 0.122 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 8.98e-01 0.0142 0.111 0.127 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 5.14e-01 0.075 0.115 0.127 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 7.14e-01 0.051 0.139 0.127 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0802 0.0983 0.127 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 4.06e-01 0.108 0.13 0.127 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 8.66e-01 0.0183 0.109 0.127 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 1.53e-01 -0.189 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0738 0.112 0.127 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 2.97e-01 0.105 0.1 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0606 0.11 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 7.16e-01 0.0414 0.114 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 4.04e-01 0.099 0.118 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00183 0.0914 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 1.27e-01 0.144 0.0937 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 2.87e-01 0.138 0.129 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 6.81e-01 0.0498 0.121 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 9.31e-01 0.00974 0.113 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 1.08e-01 -0.203 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0567 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 2.93e-01 0.133 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 1.37e-02 -0.252 0.102 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.66e-01 0.113 0.101 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 1.43e-01 0.201 0.137 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 2.98e-01 0.134 0.129 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 1.40e-01 -0.163 0.11 0.121 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 566377 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0916 0.127 0.121 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 4.42e-01 0.123 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 1.56e-01 -0.235 0.165 0.121 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 3.46e-02 -0.323 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 9.46e-02 -0.247 0.147 0.121 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 3.05e-01 0.168 0.163 0.121 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -132042 sc-eQTL 9.61e-01 0.0071 0.144 0.121 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 8.75e-01 0.0199 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 6.94e-02 -0.231 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 1.40e-01 0.213 0.144 0.124 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 2.00e-01 -0.167 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 9.84e-01 0.00229 0.116 0.124 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.78e-02 0.273 0.123 0.124 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0835 0.129 0.124 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 4.81e-01 0.0916 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0667 0.105 0.12 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 2.53e-01 0.134 0.117 0.12 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 5.12e-02 0.275 0.14 0.12 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 8.20e-01 0.0298 0.13 0.12 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0844 0.112 0.12 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 9.65e-01 0.00501 0.114 0.12 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 8.22e-01 0.0274 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 9.99e-01 0.00019 0.139 0.12 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 7.03e-01 0.05 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 2.39e-01 -0.13 0.11 0.116 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 6.86e-01 0.0603 0.149 0.116 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 6.72e-01 0.0524 0.124 0.116 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 5.10e-01 0.0998 0.151 0.116 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 1.86e-01 0.174 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0077 0.146 0.116 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0596 0.125 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00818 0.0876 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000417 0.122 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 9.42e-01 0.00669 0.091 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 2.03e-01 0.132 0.104 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 3.96e-01 0.11 0.129 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 8.13e-01 0.0239 0.101 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 2.48e-01 0.153 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 2.12e-01 0.0942 0.0753 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00894 0.102 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 1.18e-01 0.132 0.0843 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 1.88e-01 0.127 0.0962 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 806053 sc-eQTL 8.84e-01 0.0172 0.118 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 8.46e-01 0.0189 0.0973 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 2.25e-01 0.156 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 2.24e-01 0.111 0.0911 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0765 0.111 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00389 0.104 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 6.41e-01 0.0567 0.122 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 2.43e-01 -0.103 0.0876 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 4.21e-01 0.0683 0.0846 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 1.19e-01 0.207 0.132 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 7.16e-01 0.0448 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0507 0.0947 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 361164 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0214 0.112 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 5.82e-02 0.24 0.126 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 6.98e-01 0.0482 0.124 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 6.13e-01 0.0465 0.0918 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.32e-01 0.113 0.0944 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 3.85e-01 0.106 0.121 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 332206 sc-eQTL 6.17e-01 0.0644 0.129 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -42951 sc-eQTL 2.52e-02 -0.142 0.0631 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 884009 sc-eQTL 6.87e-01 0.0391 0.0971 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 314009 sc-eQTL 8.69e-02 -0.19 0.11 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 163154 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0762 0.101 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 498601 sc-eQTL 2.67e-01 0.0964 0.0867 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 sc-eQTL 3.93e-02 0.223 0.107 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111145 ELK3 163154 eQTL 1.88e-05 0.105 0.0245 0.00116 0.0 0.125
ENSG00000139350 NEDD1 -549694 eQTL 1.74e-05 0.147 0.034 0.0 0.0 0.125

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina