logo

Genes within 1Mb (chr12:96341863:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 4.26e-01 0.0543 0.068 0.122 B L1
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 6.00e-01 0.0506 0.0963 0.122 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 3.72e-01 0.0755 0.0845 0.122 B L1
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 3.20e-01 0.0896 0.0899 0.122 B L1
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 2.55e-01 0.126 0.111 0.122 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 7.04e-01 0.0311 0.0818 0.122 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 1.77e-01 0.161 0.119 0.122 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0216 0.0556 0.122 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0117 0.0776 0.122 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 1.55e-01 0.109 0.076 0.122 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 1.74e-01 0.112 0.0824 0.122 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 5.26e-02 -0.228 0.117 0.122 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 1.04e-01 0.117 0.0719 0.122 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0842 0.0889 0.122 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0794 0.0568 0.122 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0211 0.0921 0.122 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00568 0.0613 0.122 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 5.03e-01 0.0618 0.0921 0.122 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 2.91e-01 -0.111 0.105 0.122 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 6.17e-01 0.0378 0.0755 0.122 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 3.95e-01 0.0854 0.1 0.122 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 4.57e-01 0.0791 0.106 0.126 DC L1
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 6.73e-01 0.0512 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 4.28e-01 0.106 0.133 0.126 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 9.86e-01 0.0018 0.0989 0.126 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 1.93e-01 0.158 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.43e-01 0.118 0.1 0.126 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.129 0.126 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0306 0.117 0.126 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 7.77e-01 0.0252 0.0889 0.122 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0994 0.112 0.122 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.0965 0.122 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 7.20e-01 0.0455 0.126 0.122 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0665 0.0849 0.122 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.77e-01 0.087 0.0799 0.122 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 1.80e-01 0.165 0.122 0.122 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 7.49e-01 0.0381 0.119 0.122 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 5.73e-03 -0.172 0.0616 0.122 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 5.04e-01 0.062 0.0928 0.122 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 1.42e-01 -0.156 0.106 0.122 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 2.66e-01 -0.112 0.101 0.122 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 4.39e-01 0.0649 0.0836 0.122 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 4.59e-02 0.211 0.105 0.122 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 8.15e-01 0.0126 0.0538 0.122 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 550711 sc-eQTL 7.55e-01 0.0311 0.0994 0.122 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 6.21e-01 0.0508 0.103 0.122 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0857 0.112 0.122 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0873 0.0875 0.122 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 8.57e-01 0.0147 0.0815 0.122 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 6.31e-01 0.0597 0.124 0.122 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -147708 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0586 0.128 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 7.49e-01 0.0387 0.121 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 1.02e-01 -0.248 0.151 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 1.02e-01 -0.223 0.136 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0521 0.145 0.125 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 7.91e-01 0.0294 0.111 0.125 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.04e-02 -0.315 0.134 0.125 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 2.90e-02 0.31 0.141 0.125 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0296 0.103 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 4.07e-01 0.0977 0.118 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 7.56e-01 -0.031 0.0994 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 6.40e-02 0.207 0.111 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 2.75e-01 0.144 0.132 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.34e-01 0.133 0.111 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 1.15e-01 0.206 0.13 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 7.10e-01 -0.038 0.102 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00206 0.133 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 6.17e-01 0.0589 0.118 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 6.53e-01 0.0521 0.116 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0777 0.127 0.123 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0893 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0753 0.136 0.123 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 8.88e-02 0.143 0.0838 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 5.69e-01 0.0622 0.109 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 1.73e-02 0.209 0.0872 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 7.77e-01 0.0296 0.104 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0658 0.131 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 5.98e-01 0.0537 0.102 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 1.98e-01 0.168 0.13 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0455 0.105 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0343 0.127 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 5.14e-01 0.0649 0.0992 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 2.91e-01 0.124 0.117 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 4.44e-01 0.0968 0.126 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0461 0.116 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0161 0.138 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0583 0.0987 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 1.93e-01 -0.184 0.141 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0447 0.139 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 3.00e-01 -0.146 0.141 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0153 0.113 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.15e-01 0.152 0.122 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 4.54e-02 0.283 0.14 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0131 0.0612 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 2.92e-01 -0.093 0.0881 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 1.67e-02 0.211 0.0874 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 3.23e-01 0.0876 0.0884 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 8.25e-02 -0.215 0.123 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 1.80e-02 0.185 0.0777 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0437 0.0969 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0158 0.0601 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 3.30e-01 0.0997 0.102 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 2.79e-01 -0.11 0.102 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0823 0.1 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0865 0.139 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 6.21e-01 0.0407 0.0823 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0467 0.112 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0745 0.0732 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0556 0.123 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 2.44e-01 -0.132 0.113 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 4.07e-01 0.0873 0.105 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 5.45e-01 0.0785 0.129 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 4.52e-01 0.0829 0.11 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 2.85e-01 -0.14 0.13 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 7.54e-02 -0.129 0.0722 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 7.89e-01 0.0336 0.126 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 1.78e-01 -0.177 0.131 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0794 0.12 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 2.12e-01 -0.166 0.133 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 5.92e-01 0.0589 0.11 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0492 0.123 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0623 0.0839 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 4.68e-01 0.0811 0.112 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0764 0.101 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 6.30e-01 0.0513 0.106 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 5.41e-01 0.0684 0.112 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 3.28e-01 0.0937 0.0955 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00896 0.114 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 3.24e-02 -0.197 0.0915 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 7.80e-01 0.0387 0.138 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 3.98e-02 0.279 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 1.13e-01 0.182 0.115 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 5.41e-01 0.0764 0.125 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 9.44e-01 0.00927 0.133 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 3.57e-01 -0.12 0.13 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 2.12e-01 -0.153 0.122 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 2.18e-01 -0.178 0.144 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 8.06e-01 0.0371 0.151 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 9.90e-01 0.00181 0.148 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 2.78e-01 -0.137 0.126 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 9.15e-01 0.0148 0.138 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 3.44e-03 0.433 0.146 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 3.87e-01 0.0667 0.0769 0.121 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 550711 sc-eQTL 5.27e-01 0.0658 0.104 0.121 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0266 0.131 0.121 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 3.12e-01 -0.12 0.119 0.121 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0844 0.0998 0.121 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 9.99e-01 0.000203 0.116 0.121 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0407 0.13 0.121 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -147708 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0288 0.129 0.121 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 2.61e-02 -0.177 0.079 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 1.77e-01 0.182 0.134 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 9.32e-01 0.0101 0.118 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 2.11e-01 0.157 0.125 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.93e-01 0.138 0.131 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 5.26e-01 0.0841 0.132 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 1.99e-03 -0.208 0.0665 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 6.05e-01 0.0617 0.119 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 2.44e-01 -0.143 0.123 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 9.32e-01 0.00937 0.109 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.09e-01 0.13 0.103 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 2.97e-02 0.258 0.118 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0865 0.107 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0314 0.136 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0663 0.141 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 2.50e-01 -0.151 0.131 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 1.44e-01 0.199 0.136 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 6.36e-01 0.0612 0.129 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0749 0.0739 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0939 0.123 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 4.93e-02 -0.245 0.124 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 2.99e-01 -0.125 0.12 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 6.35e-01 0.0482 0.101 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 4.09e-01 0.104 0.125 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0268 0.15 0.111 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0741 0.176 0.111 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0323 0.133 0.111 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0137 0.17 0.111 PB L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 2.52e-02 0.349 0.154 0.111 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 6.01e-01 0.0868 0.166 0.111 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0931 0.197 0.111 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 4.51e-01 0.0656 0.0869 0.122 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 550711 sc-eQTL 6.61e-01 0.043 0.0977 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 3.75e-01 -0.102 0.115 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 4.59e-01 0.0851 0.115 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 1.98e-01 0.179 0.138 0.122 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 3.18e-01 0.0875 0.0874 0.122 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 9.57e-01 0.0068 0.127 0.122 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -147708 sc-eQTL 1.63e-01 0.144 0.102 0.122 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 8.24e-01 0.021 0.0943 0.122 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 5.62e-02 0.244 0.127 0.122 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 8.15e-01 0.028 0.119 0.122 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 2.44e-01 0.126 0.108 0.122 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 1.90e-01 -0.159 0.121 0.122 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 6.50e-03 -0.339 0.123 0.122 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.14 0.122 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 8.98e-01 0.0142 0.111 0.127 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 5.14e-01 0.075 0.115 0.127 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 7.14e-01 0.051 0.139 0.127 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0802 0.0983 0.127 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 4.06e-01 0.108 0.13 0.127 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 8.66e-01 0.0183 0.109 0.127 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 1.53e-01 -0.189 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0738 0.112 0.127 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 2.97e-01 0.105 0.1 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0606 0.11 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 7.16e-01 0.0414 0.114 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 4.04e-01 0.099 0.118 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00183 0.0914 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 1.27e-01 0.144 0.0937 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 2.87e-01 0.138 0.129 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 6.81e-01 0.0498 0.121 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 9.31e-01 0.00974 0.113 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 1.08e-01 -0.203 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0567 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 2.93e-01 0.133 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 1.37e-02 -0.252 0.102 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.66e-01 0.113 0.101 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 1.43e-01 0.201 0.137 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 2.98e-01 0.134 0.129 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 1.40e-01 -0.163 0.11 0.121 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 550711 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0916 0.127 0.121 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 4.42e-01 0.123 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 1.56e-01 -0.235 0.165 0.121 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 3.46e-02 -0.323 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 9.46e-02 -0.247 0.147 0.121 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 3.05e-01 0.168 0.163 0.121 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -147708 sc-eQTL 9.61e-01 0.0071 0.144 0.121 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 8.75e-01 0.0199 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 6.94e-02 -0.231 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 1.40e-01 0.213 0.144 0.124 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 2.00e-01 -0.167 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 9.84e-01 0.00229 0.116 0.124 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.78e-02 0.273 0.123 0.124 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0835 0.129 0.124 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 4.81e-01 0.0916 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0667 0.105 0.12 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 2.53e-01 0.134 0.117 0.12 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 5.12e-02 0.275 0.14 0.12 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 8.20e-01 0.0298 0.13 0.12 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0844 0.112 0.12 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 9.65e-01 0.00501 0.114 0.12 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 8.22e-01 0.0274 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 9.99e-01 0.00019 0.139 0.12 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 7.03e-01 0.05 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 2.39e-01 -0.13 0.11 0.116 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 6.86e-01 0.0603 0.149 0.116 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 6.72e-01 0.0524 0.124 0.116 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 5.10e-01 0.0998 0.151 0.116 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 1.86e-01 0.174 0.131 0.116 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0077 0.146 0.116 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0596 0.125 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00818 0.0876 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000417 0.122 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 9.42e-01 0.00669 0.091 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 2.03e-01 0.132 0.104 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 3.96e-01 0.11 0.129 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 8.13e-01 0.0239 0.101 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 2.48e-01 0.153 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 2.12e-01 0.0942 0.0753 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00894 0.102 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 1.18e-01 0.132 0.0843 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 1.88e-01 0.127 0.0962 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 790387 sc-eQTL 8.84e-01 0.0172 0.118 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 8.46e-01 0.0189 0.0973 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 2.25e-01 0.156 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 2.24e-01 0.111 0.0911 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0765 0.111 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00389 0.104 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 6.41e-01 0.0567 0.122 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 2.43e-01 -0.103 0.0876 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 4.21e-01 0.0683 0.0846 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 1.19e-01 0.207 0.132 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 7.16e-01 0.0448 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0507 0.0947 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 345498 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0214 0.112 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 5.82e-02 0.24 0.126 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 6.98e-01 0.0482 0.124 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 6.13e-01 0.0465 0.0918 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.32e-01 0.113 0.0944 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 3.85e-01 0.106 0.121 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 316540 sc-eQTL 6.17e-01 0.0644 0.129 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -58617 sc-eQTL 2.52e-02 -0.142 0.0631 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 868343 sc-eQTL 6.87e-01 0.0391 0.0971 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 298343 sc-eQTL 8.69e-02 -0.19 0.11 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 147488 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0762 0.101 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 482935 sc-eQTL 2.67e-01 0.0964 0.0867 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 sc-eQTL 3.93e-02 0.223 0.107 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111145 ELK3 147488 eQTL 1.23e-05 0.109 0.0249 0.00126 0.0 0.124
ENSG00000139350 NEDD1 -565360 eQTL 1.07e-05 0.153 0.0346 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111145 ELK3 147488 4.12e-06 4.79e-06 8.29e-07 2.46e-06 1.27e-06 1.33e-06 2.96e-06 9.27e-07 3.17e-06 1.83e-06 4.16e-06 3.32e-06 6.49e-06 1.54e-06 1.44e-06 2.43e-06 2.06e-06 2.72e-06 1.34e-06 9.5e-07 2.41e-06 4.56e-06 3.31e-06 1.71e-06 4.87e-06 1.28e-06 2e-06 1.51e-06 3.81e-06 4e-06 1.96e-06 4.91e-07 8.12e-07 1.76e-06 1.99e-06 9.43e-07 9.05e-07 4.42e-07 1.23e-06 3.42e-07 2.8e-07 5.19e-06 3.76e-07 1.69e-07 3.44e-07 3.22e-07 8.86e-07 4.11e-07 3.24e-07