logo

Genes within 1Mb (chr12:96323614:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0391 0.0678 0.859 B L1
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 8.67e-01 0.0161 0.096 0.859 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 1.45e-01 0.123 0.0839 0.859 B L1
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 1.36e-02 -0.22 0.0885 0.859 B L1
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 7.77e-01 0.0313 0.111 0.859 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 5.14e-01 0.0532 0.0815 0.859 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 6.63e-01 0.052 0.119 0.859 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0212 0.0554 0.859 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 5.84e-01 0.0423 0.0772 0.859 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0478 0.076 0.859 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0163 0.0824 0.859 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 2.09e-01 -0.148 0.117 0.859 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0199 0.072 0.859 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0747 0.0885 0.859 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0941 0.0573 0.859 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 7.28e-01 0.0325 0.0931 0.859 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 5.50e-01 -0.037 0.0619 0.859 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 1.36e-01 -0.139 0.0928 0.859 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0941 0.106 0.859 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 4.10e-01 0.063 0.0763 0.859 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 9.11e-03 -0.263 0.0999 0.859 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 4.98e-01 0.0712 0.105 0.858 DC L1
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 2.98e-01 0.124 0.119 0.858 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0149 0.132 0.858 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 5.15e-01 0.0637 0.0976 0.858 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 1.88e-01 0.157 0.119 0.858 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 1.65e-01 0.138 0.099 0.858 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 6.28e-01 0.0619 0.128 0.858 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0549 0.115 0.858 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 1.34e-03 -0.269 0.0828 0.859 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 5.68e-02 0.203 0.106 0.859 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 1.39e-01 0.137 0.0919 0.859 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 2.12e-01 0.15 0.12 0.859 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 6.43e-02 -0.149 0.0804 0.859 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0463 0.0763 0.859 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0712 0.117 0.859 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 3.67e-02 0.237 0.113 0.859 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0999 0.0621 0.861 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 3.88e-01 0.0799 0.0923 0.861 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 8.63e-02 -0.181 0.105 0.861 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0963 0.1 0.861 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0334 0.0834 0.861 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 1.69e-01 -0.145 0.105 0.861 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0555 0.0522 0.859 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 532462 sc-eQTL 4.14e-01 0.0791 0.0966 0.859 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 8.33e-01 0.021 0.0999 0.859 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 5.25e-02 -0.211 0.108 0.859 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0291 0.0853 0.859 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0559 0.0792 0.859 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0167 0.121 0.859 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -165957 sc-eQTL 3.09e-01 -0.127 0.125 0.859 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0687 0.12 0.857 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 6.44e-01 0.0701 0.151 0.857 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 5.17e-01 0.0882 0.136 0.857 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 3.54e-01 -0.134 0.144 0.857 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 3.06e-01 -0.113 0.11 0.857 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 1.70e-01 -0.186 0.135 0.857 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 7.04e-01 0.0541 0.142 0.857 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0687 0.104 0.858 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0324 0.119 0.858 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 4.38e-01 0.078 0.1 0.858 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0677 0.113 0.858 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0164 0.134 0.858 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 7.23e-01 0.0401 0.113 0.858 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 7.89e-01 0.0355 0.132 0.858 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 5.84e-01 0.054 0.0983 0.858 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 9.29e-01 0.0114 0.128 0.858 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 9.34e-02 0.19 0.113 0.858 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0449 0.112 0.858 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 2.38e-01 -0.144 0.122 0.858 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 7.93e-01 0.0311 0.118 0.858 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 2.87e-03 -0.387 0.128 0.858 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0591 0.0834 0.859 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 7.04e-01 0.041 0.108 0.859 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 8.70e-02 0.149 0.0868 0.859 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 2.03e-01 -0.131 0.103 0.859 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0966 0.13 0.859 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 1.90e-01 0.132 0.1 0.859 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 6.15e-01 0.0649 0.129 0.859 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0231 0.105 0.858 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0788 0.126 0.858 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 6.14e-01 0.05 0.0992 0.858 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 2.11e-01 -0.146 0.117 0.858 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 3.36e-01 -0.122 0.126 0.858 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 2.56e-01 0.132 0.116 0.858 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 3.60e-01 0.127 0.138 0.858 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0567 0.0961 0.857 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 3.32e-01 -0.134 0.137 0.857 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 1.76e-02 -0.32 0.134 0.857 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 8.98e-01 0.0177 0.137 0.857 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 4.42e-01 0.0843 0.109 0.857 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0168 0.119 0.857 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 5.78e-01 0.0768 0.138 0.857 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00194 0.0611 0.859 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 5.99e-01 0.0464 0.088 0.859 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0324 0.0883 0.859 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0449 0.0883 0.859 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 3.32e-01 -0.12 0.124 0.859 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 8.72e-01 0.0127 0.0785 0.859 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 1.37e-01 -0.144 0.0962 0.859 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0645 0.0592 0.859 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0254 0.101 0.859 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0687 0.101 0.859 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 1.32e-01 -0.149 0.0986 0.859 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0305 0.137 0.859 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00538 0.0813 0.859 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 3.32e-01 0.108 0.111 0.859 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0204 0.0732 0.859 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 2.92e-01 -0.129 0.122 0.859 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 1.78e-01 -0.152 0.113 0.859 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0109 0.105 0.859 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 9.74e-01 0.00418 0.129 0.859 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0763 0.11 0.859 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 2.76e-01 -0.142 0.13 0.859 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 9.77e-03 -0.181 0.0695 0.859 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0736 0.122 0.859 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 1.08e-01 -0.205 0.127 0.859 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 2.53e-01 -0.133 0.116 0.859 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 2.77e-01 0.141 0.129 0.859 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.107 0.859 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 6.47e-01 0.0548 0.12 0.859 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0972 0.0852 0.859 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 1.44e-01 0.166 0.113 0.859 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 4.33e-01 0.0803 0.102 0.859 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 3.25e-01 -0.107 0.108 0.859 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0588 0.114 0.859 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 7.39e-01 0.0325 0.0974 0.859 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 9.65e-03 -0.298 0.114 0.859 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 3.81e-01 0.0793 0.0904 0.852 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 4.08e-01 -0.112 0.135 0.852 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 3.32e-01 0.129 0.133 0.852 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 4.67e-01 0.082 0.113 0.852 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 1.90e-01 0.16 0.122 0.852 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 4.24e-01 -0.104 0.13 0.852 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 4.57e-04 -0.439 0.123 0.852 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0242 0.116 0.863 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0422 0.136 0.863 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 5.01e-01 0.0955 0.142 0.863 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 1.45e-01 -0.203 0.139 0.863 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0183 0.119 0.863 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 9.30e-01 0.0113 0.13 0.863 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 9.37e-02 -0.235 0.14 0.863 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 1.38e-02 -0.188 0.0758 0.861 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 532462 sc-eQTL 1.96e-01 0.134 0.103 0.861 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 4.75e-01 0.0933 0.13 0.861 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 1.68e-01 -0.164 0.118 0.861 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0677 0.0995 0.861 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0799 0.115 0.861 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 2.44e-01 -0.151 0.129 0.861 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -165957 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0324 0.128 0.861 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0802 0.0795 0.856 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 8.94e-02 0.228 0.134 0.856 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0522 0.118 0.856 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 7.08e-01 0.0469 0.125 0.856 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 3.94e-01 0.112 0.131 0.856 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0769 0.132 0.856 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0464 0.0668 0.86 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 5.44e-01 0.0711 0.117 0.86 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 7.77e-02 -0.213 0.12 0.86 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 5.13e-01 -0.07 0.107 0.86 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0526 0.102 0.86 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 6.82e-01 -0.048 0.117 0.86 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 8.43e-02 -0.179 0.103 0.854 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 8.70e-02 0.224 0.13 0.854 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 2.59e-02 -0.302 0.135 0.854 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0297 0.126 0.854 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 3.87e-01 0.114 0.132 0.854 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0817 0.125 0.854 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 8.49e-02 -0.127 0.0732 0.86 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0118 0.122 0.86 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 4.72e-02 -0.247 0.123 0.86 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0654 0.119 0.86 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0134 0.101 0.86 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 1.75e-01 -0.169 0.124 0.86 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 9.53e-01 0.00865 0.147 0.863 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 5.79e-01 0.0957 0.172 0.863 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0576 0.13 0.863 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 7.49e-02 -0.295 0.164 0.863 PB L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 1.19e-01 0.24 0.153 0.863 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 4.25e-01 -0.13 0.162 0.863 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 3.50e-01 0.181 0.192 0.863 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 6.42e-01 0.0383 0.0822 0.857 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 532462 sc-eQTL 2.24e-01 0.112 0.092 0.857 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 2.29e-01 -0.131 0.109 0.857 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 4.06e-02 -0.222 0.108 0.857 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 6.86e-01 0.0531 0.131 0.857 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0427 0.0828 0.857 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 9.08e-01 0.014 0.12 0.857 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -165957 sc-eQTL 9.94e-01 0.000737 0.0973 0.857 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 2.52e-01 -0.106 0.0927 0.859 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 4.13e-02 0.257 0.125 0.859 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00546 0.118 0.859 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 7.36e-01 -0.036 0.107 0.859 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 7.24e-01 0.0423 0.12 0.859 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 3.88e-01 -0.107 0.123 0.859 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0277 0.138 0.859 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0258 0.11 0.854 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0943 0.115 0.854 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0372 0.139 0.854 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 1.92e-01 0.128 0.0979 0.854 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 1.71e-01 0.177 0.129 0.854 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 6.17e-01 0.0544 0.109 0.854 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 1.34e-01 -0.198 0.132 0.854 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 9.77e-01 0.0032 0.112 0.854 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 4.92e-04 -0.337 0.0951 0.859 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 9.22e-02 0.179 0.106 0.859 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 8.77e-01 0.0171 0.111 0.859 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 2.95e-01 0.121 0.115 0.859 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0949 0.0886 0.859 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 2.79e-01 0.0993 0.0914 0.859 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0685 0.126 0.859 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 1.17e-02 0.295 0.116 0.859 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 1.70e-01 -0.152 0.11 0.859 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 3.21e-01 0.123 0.124 0.859 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 8.45e-02 0.216 0.125 0.859 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 2.95e-01 0.13 0.124 0.859 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 6.28e-02 -0.188 0.1 0.859 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 2.17e-01 -0.123 0.0996 0.859 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0206 0.135 0.859 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 7.28e-02 0.227 0.126 0.859 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0853 0.104 0.848 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 532462 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0154 0.12 0.848 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 9.26e-01 0.0139 0.15 0.848 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0297 0.156 0.848 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 9.77e-01 0.00421 0.145 0.848 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00237 0.14 0.848 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0158 0.154 0.848 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -165957 sc-eQTL 2.72e-01 0.148 0.135 0.848 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0485 0.125 0.86 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0657 0.126 0.86 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 8.37e-02 0.247 0.142 0.86 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 3.44e-01 0.123 0.129 0.86 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 3.21e-01 -0.115 0.115 0.86 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 9.53e-01 0.00723 0.123 0.86 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 7.32e-01 -0.044 0.128 0.86 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 1.26e-01 0.197 0.128 0.86 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0473 0.098 0.857 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 8.45e-02 0.188 0.109 0.857 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 4.52e-01 0.0995 0.132 0.857 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 6.30e-02 0.226 0.121 0.857 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 1.63e-01 -0.146 0.104 0.857 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 3.42e-01 -0.102 0.107 0.857 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0412 0.114 0.857 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 2.15e-01 0.161 0.129 0.857 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 6.93e-01 0.0506 0.128 0.842 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 4.46e-03 0.304 0.105 0.842 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 5.07e-01 0.0969 0.146 0.842 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000551 0.121 0.842 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 8.43e-01 0.0294 0.148 0.842 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 7.47e-01 0.0417 0.129 0.842 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 3.16e-02 0.304 0.14 0.842 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 4.07e-01 0.101 0.122 0.842 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0198 0.0872 0.859 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 7.10e-01 0.0452 0.121 0.859 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 4.29e-02 0.183 0.0897 0.859 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 1.78e-01 -0.139 0.103 0.859 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0147 0.129 0.859 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 4.63e-01 0.0737 0.1 0.859 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 6.71e-02 -0.24 0.131 0.859 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0729 0.0748 0.859 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0574 0.101 0.859 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 6.42e-02 0.155 0.0835 0.859 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 4.37e-02 -0.193 0.095 0.859 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 772138 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00721 0.117 0.859 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 4.43e-01 0.0742 0.0964 0.859 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 1.40e-01 0.189 0.127 0.859 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 1.56e-03 -0.277 0.0863 0.859 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 1.25e-01 0.164 0.106 0.859 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 2.77e-01 0.11 0.101 0.859 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 2.37e-01 0.139 0.117 0.859 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 4.42e-02 -0.17 0.0841 0.859 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0205 0.0819 0.859 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0693 0.128 0.859 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 2.38e-02 0.268 0.118 0.859 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0928 0.091 0.862 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 327249 sc-eQTL 1.32e-01 0.162 0.107 0.862 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 1.05e-01 0.198 0.122 0.862 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 4.15e-02 0.243 0.118 0.862 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 1.24e-01 -0.136 0.088 0.862 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00635 0.0912 0.862 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0532 0.117 0.862 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 298291 sc-eQTL 3.10e-01 0.126 0.124 0.862 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -76866 sc-eQTL 1.13e-01 -0.1 0.0628 0.86 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 850094 sc-eQTL 4.47e-01 0.0732 0.096 0.86 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 280094 sc-eQTL 3.42e-02 -0.232 0.109 0.86 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 129239 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0918 0.1 0.86 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 464686 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0394 0.086 0.86 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -583609 sc-eQTL 2.97e-01 -0.112 0.107 0.86 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111145 ELK3 129239 eQTL 0.003 -0.077 0.0259 0.0 0.0 0.12

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000188596 \N -165961 4.7e-06 4.86e-06 7.53e-07 2.79e-06 1.12e-06 1.53e-06 4.6e-06 1.12e-06 4.98e-06 2.41e-06 5.32e-06 3.17e-06 7.22e-06 2.3e-06 1.39e-06 3.83e-06 2.04e-06 3.79e-06 1.42e-06 9.86e-07 2.95e-06 4.5e-06 3.84e-06 1.57e-06 6.54e-06 1.96e-06 2.27e-06 1.85e-06 4.26e-06 3.77e-06 2.68e-06 5.93e-07 7.93e-07 1.85e-06 2.03e-06 9.25e-07 9.55e-07 4.26e-07 1.3e-06 4.28e-07 2.4e-07 5.31e-06 8.75e-07 1.62e-07 3.58e-07 3.94e-07 1.12e-06 5.06e-07 4.54e-07