logo

Genes within 1Mb (chr12:96294452:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 3.87e-01 0.0867 0.1 0.053 B L1
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 2.54e-01 -0.162 0.141 0.053 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0146 0.124 0.053 B L1
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0866 0.132 0.053 B L1
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 4.03e-01 0.137 0.163 0.053 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0327 0.12 0.053 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 9.28e-01 0.0159 0.176 0.053 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0164 0.0834 0.053 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0691 0.116 0.053 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 4.08e-01 0.0949 0.114 0.053 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 9.44e-01 0.00876 0.124 0.053 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 5.46e-01 -0.107 0.177 0.053 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0753 0.108 0.053 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 6.33e-01 0.0639 0.133 0.053 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 1.84e-02 -0.2 0.084 0.053 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 1.26e-01 -0.21 0.137 0.053 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0231 0.0914 0.053 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 4.34e-02 -0.277 0.136 0.053 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 5.42e-01 0.0956 0.156 0.053 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 1.81e-02 -0.265 0.111 0.053 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 5.48e-01 0.0901 0.15 0.053 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 8.04e-02 -0.269 0.153 0.056 DC L1
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 8.60e-01 0.0311 0.175 0.056 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0268 0.193 0.056 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 1.39e-01 0.212 0.143 0.056 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 4.14e-02 0.357 0.174 0.056 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 1.58e-01 -0.206 0.145 0.056 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 3.30e-01 0.183 0.187 0.056 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 4.85e-01 0.118 0.169 0.056 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 9.14e-01 0.0139 0.129 0.053 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 3.75e-01 -0.144 0.162 0.053 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 8.42e-01 -0.028 0.14 0.053 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 7.56e-01 -0.057 0.183 0.053 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 6.95e-01 0.0482 0.123 0.053 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0345 0.116 0.053 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 4.90e-01 0.123 0.178 0.053 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 6.17e-01 0.0864 0.172 0.053 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 1.90e-01 -0.125 0.0948 0.054 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 3.14e-01 -0.142 0.141 0.054 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 8.27e-02 0.28 0.16 0.054 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 8.38e-02 -0.264 0.152 0.054 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 1.69e-03 -0.395 0.124 0.054 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 2.85e-01 -0.172 0.16 0.054 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0566 0.0803 0.053 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 503300 sc-eQTL 2.80e-01 -0.161 0.148 0.053 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 6.49e-01 -0.07 0.153 0.053 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0338 0.168 0.053 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 4.65e-01 -0.096 0.131 0.053 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 1.30e-01 -0.184 0.121 0.053 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 1.82e-02 0.436 0.183 0.053 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -195119 sc-eQTL 6.66e-01 0.0831 0.192 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0667 0.174 0.059 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 2.39e-01 0.258 0.218 0.059 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 1.27e-01 -0.3 0.196 0.059 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 3.91e-01 -0.179 0.208 0.059 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0139 0.16 0.059 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 2.80e-01 0.212 0.196 0.059 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 5.07e-01 0.137 0.205 0.059 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 2.46e-01 0.178 0.153 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 2.46e-01 -0.204 0.175 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0257 0.148 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 1.20e-01 0.26 0.166 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 2.05e-01 0.249 0.196 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0475 0.166 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 9.82e-03 -0.5 0.192 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 8.31e-01 0.0325 0.152 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 4.56e-01 -0.147 0.197 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0194 0.175 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 1.21e-01 -0.267 0.171 0.054 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 1.48e-01 0.274 0.188 0.054 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 3.86e-01 -0.158 0.182 0.054 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 4.78e-01 -0.144 0.202 0.054 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 4.81e-01 0.088 0.125 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 3.31e-01 -0.157 0.161 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 9.89e-01 0.00177 0.131 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 1.31e-01 -0.233 0.154 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0919 0.194 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 5.90e-01 0.081 0.15 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 2.85e-01 0.206 0.192 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 6.99e-01 0.0598 0.154 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 7.63e-01 0.0562 0.186 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0434 0.146 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0847 0.172 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 5.95e-01 0.0992 0.186 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 5.13e-01 -0.112 0.171 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 1.89e-02 0.475 0.201 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 9.43e-01 0.0108 0.151 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 4.41e-01 0.166 0.216 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 2.53e-01 0.243 0.212 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 1.02e-01 -0.351 0.214 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0578 0.172 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 4.43e-01 -0.144 0.187 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 3.91e-01 0.186 0.216 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0165 0.0916 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0917 0.132 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 1.80e-01 0.177 0.132 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0778 0.132 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 6.83e-01 -0.076 0.186 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 3.57e-01 -0.109 0.118 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 5.69e-01 0.0827 0.145 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0755 0.09 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0936 0.153 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 3.18e-01 0.153 0.153 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 1.96e-01 0.194 0.15 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 2.30e-01 -0.249 0.207 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0173 0.123 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 3.67e-01 0.152 0.168 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.109 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 9.68e-01 0.00735 0.182 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 6.01e-01 -0.088 0.168 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0297 0.156 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0418 0.192 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0349 0.164 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 9.47e-01 0.0129 0.194 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 1.12e-01 -0.166 0.104 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 5.91e-02 -0.341 0.18 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 7.40e-01 0.0629 0.189 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0709 0.172 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 7.88e-01 0.0515 0.192 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 4.99e-01 -0.107 0.158 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 7.51e-01 0.0564 0.177 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 7.72e-01 -0.037 0.127 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0777 0.169 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 9.75e-01 0.00481 0.152 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 1.53e-01 -0.23 0.16 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 1.65e-01 0.235 0.168 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 2.06e-02 -0.334 0.143 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 7.59e-01 0.0529 0.172 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0255 0.137 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0363 0.204 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 1.20e-01 0.311 0.2 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0982 0.17 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 6.41e-02 0.34 0.182 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 3.61e-01 -0.179 0.195 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 2.38e-01 -0.226 0.191 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0134 0.166 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 5.32e-01 0.122 0.195 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 9.23e-01 0.0197 0.203 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0262 0.2 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0411 0.17 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 3.97e-01 0.157 0.185 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 1.72e-01 0.275 0.201 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 8.71e-01 0.0187 0.116 0.054 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 503300 sc-eQTL 2.61e-01 -0.175 0.155 0.054 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 7.80e-01 -0.055 0.196 0.054 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0779 0.179 0.054 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 9.33e-02 -0.251 0.149 0.054 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 2.16e-01 -0.215 0.173 0.054 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 3.32e-03 0.568 0.191 0.054 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -195119 sc-eQTL 3.49e-01 0.181 0.193 0.054 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 8.60e-01 0.0213 0.121 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 2.90e-01 0.215 0.203 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 2.36e-02 0.402 0.176 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 2.22e-01 -0.231 0.189 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 1.13e-01 -0.314 0.197 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 3.75e-01 -0.177 0.199 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0733 0.102 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 3.94e-01 -0.152 0.179 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 4.48e-01 0.14 0.184 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 5.86e-02 -0.308 0.162 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 2.08e-01 -0.195 0.155 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 4.74e-01 -0.128 0.179 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 9.13e-01 0.0192 0.175 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 4.74e-01 -0.158 0.221 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0856 0.23 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 5.59e-01 0.125 0.213 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 4.97e-01 -0.151 0.222 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 9.48e-01 0.0137 0.21 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 2.35e-01 -0.135 0.113 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 1.04e-02 -0.479 0.185 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 5.02e-01 0.129 0.191 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0662 0.183 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 1.22e-02 -0.387 0.153 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0527 0.192 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0451 0.126 0.054 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 503300 sc-eQTL 4.11e-02 -0.289 0.141 0.054 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0716 0.168 0.054 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 4.78e-01 0.118 0.167 0.054 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 2.30e-01 -0.242 0.201 0.054 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0655 0.127 0.054 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 3.34e-01 -0.179 0.185 0.054 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -195119 sc-eQTL 7.54e-01 -0.047 0.15 0.054 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0769 0.136 0.053 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 1.03e-01 -0.301 0.184 0.053 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 5.43e-01 -0.105 0.172 0.053 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 3.58e-01 -0.144 0.156 0.053 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0506 0.175 0.053 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 2.00e-01 -0.231 0.18 0.053 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 8.35e-01 0.0421 0.202 0.053 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 3.76e-02 -0.338 0.161 0.059 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 5.50e-01 0.102 0.17 0.059 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000618 0.205 0.059 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 5.92e-01 0.0781 0.145 0.059 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 4.08e-02 0.391 0.19 0.059 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 5.14e-01 -0.105 0.161 0.059 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 1.65e-01 0.272 0.195 0.059 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 2.66e-01 0.183 0.165 0.059 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 1.01e-01 -0.243 0.147 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 3.14e-01 -0.163 0.162 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 7.13e-01 0.0617 0.168 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0602 0.175 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0422 0.135 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0111 0.139 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 2.00e-01 0.245 0.191 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 6.88e-01 0.0717 0.179 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 1.22e-01 0.256 0.165 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0262 0.186 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0944 0.188 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0763 0.186 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 7.89e-01 0.0406 0.151 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 2.28e-01 -0.18 0.149 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 9.17e-01 -0.021 0.202 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 6.14e-01 0.0961 0.19 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 4.23e-02 -0.32 0.156 0.058 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 503300 sc-eQTL 4.99e-02 -0.355 0.179 0.058 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 1.22e-01 -0.35 0.225 0.058 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0507 0.237 0.058 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0788 0.219 0.058 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0419 0.212 0.058 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 2.70e-02 -0.513 0.23 0.058 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -195119 sc-eQTL 2.36e-01 -0.242 0.204 0.058 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 8.39e-01 0.0377 0.186 0.056 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0823 0.188 0.056 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 6.42e-01 -0.099 0.212 0.056 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 7.68e-01 0.0569 0.193 0.056 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 8.76e-02 0.292 0.17 0.056 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 9.35e-01 0.015 0.183 0.056 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0199 0.191 0.056 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 5.44e-01 -0.116 0.191 0.056 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 3.80e-01 0.131 0.148 0.057 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 6.18e-01 0.0829 0.166 0.057 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 5.08e-01 0.133 0.2 0.057 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0496 0.185 0.057 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 6.96e-01 0.0621 0.159 0.057 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 6.24e-01 0.0796 0.162 0.057 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 3.04e-01 0.177 0.172 0.057 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 2.82e-01 0.211 0.196 0.057 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 2.93e-01 -0.197 0.187 0.062 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 9.04e-01 0.0191 0.158 0.062 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 1.02e-01 0.349 0.212 0.062 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 3.03e-01 0.182 0.176 0.062 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 5.33e-01 0.135 0.216 0.062 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 2.34e-01 -0.225 0.188 0.062 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 4.29e-01 0.165 0.208 0.062 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 6.93e-01 0.0707 0.179 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 3.01e-01 0.133 0.129 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 1.55e-01 -0.255 0.179 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0579 0.134 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00786 0.153 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 9.97e-02 0.314 0.19 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0591 0.148 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 2.02e-02 -0.45 0.192 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 5.92e-01 0.0602 0.112 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 6.17e-01 -0.076 0.152 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0458 0.126 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 2.10e-01 -0.179 0.143 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 742976 sc-eQTL 8.76e-01 0.0273 0.175 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 7.28e-01 0.0502 0.144 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 6.12e-02 0.357 0.189 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 4.67e-01 -0.097 0.133 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 3.68e-01 -0.145 0.161 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0644 0.152 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0334 0.177 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0047 0.128 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0449 0.123 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 4.56e-01 0.144 0.193 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 4.97e-01 0.122 0.179 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 3.44e-01 0.129 0.136 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 298087 sc-eQTL 9.06e-01 0.0192 0.161 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 8.22e-01 0.0413 0.183 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0116 0.179 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 2.46e-01 0.154 0.132 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 7.86e-01 0.0372 0.137 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 5.58e-01 0.103 0.175 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 269129 sc-eQTL 4.72e-01 0.134 0.185 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -106028 sc-eQTL 2.62e-01 -0.108 0.0958 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 820932 sc-eQTL 8.90e-02 -0.248 0.145 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 250932 sc-eQTL 9.23e-02 0.281 0.166 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 100077 sc-eQTL 1.42e-01 -0.224 0.152 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 435524 sc-eQTL 8.11e-03 -0.344 0.129 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -612771 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0657 0.163 0.054 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 -106028 eQTL 1.83e-02 0.0573 0.0242 0.00156 0.0 0.0574
ENSG00000258177 AC008149.1 70479 eQTL 0.0329 -0.167 0.0783 0.0 0.0 0.0574

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257715 \N 269129 1.28e-06 1e-06 3.41e-07 1.16e-06 2.43e-07 5.88e-07 1.47e-06 3.5e-07 1.32e-06 4.32e-07 1.73e-06 6.6e-07 2.01e-06 2.81e-07 5.72e-07 7.95e-07 8.25e-07 6.13e-07 7.55e-07 6.33e-07 6.51e-07 1.28e-06 8.96e-07 6.4e-07 2.24e-06 3.91e-07 8.98e-07 6.93e-07 1.15e-06 1.22e-06 6.52e-07 2.39e-07 2.15e-07 6.68e-07 6.24e-07 4.66e-07 6.79e-07 1.69e-07 4.04e-07 3.2e-07 2.98e-07 1.52e-06 1.93e-07 1.24e-08 1.72e-07 1.02e-07 2.35e-07 9.04e-08 8e-08