logo

Genes within 1Mb (chr12:96258183:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 5.74e-02 -0.153 0.08 0.085 B L1
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 8.39e-01 0.0232 0.114 0.085 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0051 0.1 0.085 B L1
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 1.78e-01 -0.144 0.106 0.085 B L1
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 3.84e-01 -0.115 0.131 0.085 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0518 0.0969 0.085 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0858 0.141 0.085 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 8.57e-01 0.0121 0.0669 0.085 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 8.02e-01 0.0234 0.0933 0.085 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0914 0.085 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00492 0.0995 0.085 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 1.33e-01 0.213 0.141 0.085 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 2.03e-01 -0.111 0.0866 0.085 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0354 0.107 0.085 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0631 0.0688 0.085 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0109 0.111 0.085 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 6.70e-01 0.0315 0.074 0.085 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 2.79e-01 -0.121 0.111 0.085 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 4.88e-01 0.0878 0.127 0.085 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0532 0.0912 0.085 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 2.86e-01 -0.129 0.121 0.085 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0121 0.127 0.086 DC L1
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 3.88e-01 -0.125 0.144 0.086 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 2.77e-01 -0.173 0.159 0.086 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 5.92e-01 0.0633 0.118 0.086 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 9.75e-02 -0.239 0.144 0.086 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 9.61e-01 0.00586 0.12 0.086 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0969 0.154 0.086 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 3.88e-01 0.12 0.139 0.086 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 1.71e-01 -0.141 0.103 0.085 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 7.15e-01 0.0476 0.13 0.085 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0973 0.112 0.085 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 1.73e-01 0.2 0.146 0.085 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 2.67e-01 -0.11 0.0983 0.085 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 8.48e-01 0.0179 0.093 0.085 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0621 0.143 0.085 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 2.10e-01 0.173 0.138 0.085 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 7.29e-02 -0.135 0.0751 0.086 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 4.21e-01 0.0902 0.112 0.086 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0196 0.129 0.086 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 2.39e-01 -0.143 0.122 0.086 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 6.69e-01 0.0433 0.101 0.086 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0421 0.128 0.086 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 9.97e-01 0.000217 0.0637 0.085 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 467031 sc-eQTL 2.60e-01 0.132 0.117 0.085 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 3.12e-02 -0.261 0.12 0.085 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 4.31e-01 -0.105 0.133 0.085 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 3.32e-01 0.101 0.104 0.085 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 1.24e-01 -0.148 0.096 0.085 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0995 0.147 0.085 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -231388 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0894 0.152 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 2.24e-01 -0.183 0.15 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 3.17e-01 -0.19 0.189 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.12e-02 0.366 0.169 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 4.17e-02 -0.367 0.179 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 4.67e-01 -0.101 0.139 0.082 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 4.82e-01 0.12 0.17 0.082 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 3.93e-01 -0.153 0.178 0.082 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0557 0.125 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 8.89e-01 -0.02 0.143 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.02e-01 0.125 0.12 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 9.08e-01 0.0158 0.136 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00918 0.161 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 4.17e-01 -0.11 0.135 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 8.96e-01 0.0208 0.159 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 7.04e-01 0.0462 0.121 0.086 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 3.21e-01 -0.157 0.157 0.086 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 5.06e-01 0.0932 0.14 0.086 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 4.62e-01 0.101 0.137 0.086 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 9.82e-02 -0.249 0.15 0.086 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 1.90e-01 -0.191 0.145 0.086 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 9.41e-01 0.0119 0.161 0.086 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0631 0.102 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 8.73e-01 0.0212 0.132 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0323 0.107 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 2.00e-01 -0.162 0.126 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0549 0.159 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0494 0.123 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0456 0.158 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 6.89e-01 -0.051 0.128 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 2.80e-01 -0.167 0.154 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0499 0.121 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 2.74e-01 -0.156 0.142 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0819 0.154 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 1.33e-01 -0.213 0.141 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 1.53e-01 -0.24 0.167 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00623 0.12 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 1.31e-01 -0.26 0.171 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 9.99e-01 0.000145 0.17 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 5.14e-01 0.112 0.172 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0174 0.137 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 2.56e-01 -0.17 0.149 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 4.16e-01 0.141 0.173 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0664 0.0734 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 7.38e-01 0.0355 0.106 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 1.53e-01 0.152 0.106 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0635 0.106 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 8.60e-02 0.255 0.148 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 5.75e-02 -0.179 0.0936 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0181 0.116 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 5.43e-01 0.0435 0.0715 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00365 0.122 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0224 0.121 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 5.56e-01 0.0704 0.119 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 4.12e-01 0.136 0.165 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0572 0.0979 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0223 0.134 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 1.49e-01 -0.127 0.0879 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 1.66e-01 -0.205 0.147 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.54e-01 0.126 0.136 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0147 0.127 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0446 0.156 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 5.08e-01 0.088 0.133 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 3.16e-01 -0.158 0.157 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 1.33e-02 -0.208 0.0832 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0292 0.146 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0433 0.152 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 1.75e-02 -0.328 0.137 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 5.38e-02 0.297 0.153 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0169 0.128 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 3.37e-01 0.137 0.143 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00612 0.103 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 9.04e-02 -0.232 0.136 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 7.03e-01 0.0472 0.124 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 1.58e-01 -0.185 0.13 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 5.80e-01 0.0762 0.137 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0725 0.118 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0089 0.14 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 9.86e-02 0.187 0.112 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 4.04e-01 -0.141 0.169 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.02e-01 -0.172 0.166 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 8.28e-01 0.0306 0.141 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0458 0.153 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 1.63e-01 -0.226 0.162 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 2.26e-02 -0.36 0.157 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0752 0.141 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 6.45e-01 0.0765 0.166 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.74e-01 0.154 0.173 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 4.29e-01 0.134 0.17 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 1.75e-01 -0.196 0.144 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00743 0.158 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 5.20e-02 -0.332 0.17 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0496 0.0912 0.087 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 467031 sc-eQTL 4.52e-01 0.0925 0.123 0.087 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 1.25e-01 -0.237 0.154 0.087 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0962 0.141 0.087 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 2.97e-01 0.123 0.118 0.087 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0892 0.137 0.087 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00701 0.154 0.087 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -231388 sc-eQTL 6.56e-01 -0.068 0.152 0.087 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 8.24e-01 0.0218 0.0979 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0451 0.165 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0558 0.145 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 4.41e-01 -0.118 0.153 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 7.62e-01 0.0488 0.161 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 3.93e-01 -0.139 0.162 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0872 0.0816 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 3.30e-01 0.14 0.143 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 6.97e-01 0.0575 0.148 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 9.61e-01 0.00641 0.131 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0017 0.124 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 8.14e-01 0.0337 0.143 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0552 0.131 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 7.46e-01 0.0536 0.165 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 8.22e-01 0.0386 0.172 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 4.50e-01 -0.121 0.159 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 3.23e-01 -0.164 0.166 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0569 0.157 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 5.05e-02 -0.178 0.0903 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 9.35e-01 0.0124 0.151 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.27e-01 -0.151 0.154 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 3.83e-01 -0.129 0.147 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 1.64e-01 0.174 0.124 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 7.06e-01 0.0584 0.154 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 7.14e-02 -0.284 0.156 0.1 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0516 0.185 0.1 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 2.65e-01 0.155 0.139 0.1 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 3.20e-02 -0.38 0.175 0.1 PB L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 2.06e-01 0.209 0.164 0.1 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0203 0.174 0.1 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 2.92e-01 0.218 0.206 0.1 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0134 0.103 0.085 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 467031 sc-eQTL 8.46e-01 0.0225 0.116 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 2.89e-01 -0.145 0.137 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 1.58e-01 -0.193 0.136 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 3.64e-01 0.15 0.165 0.085 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 1.04e-01 -0.169 0.104 0.085 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0231 0.151 0.085 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -231388 sc-eQTL 8.40e-01 0.0247 0.122 0.085 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 9.56e-01 0.00618 0.113 0.085 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 6.71e-01 0.0652 0.153 0.085 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 6.35e-01 0.0679 0.143 0.085 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0503 0.129 0.085 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0173 0.145 0.085 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 2.32e-01 -0.179 0.149 0.085 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 6.77e-01 0.0698 0.167 0.085 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 2.43e-01 -0.156 0.133 0.09 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 3.17e-01 -0.139 0.139 0.09 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 1.32e-01 -0.253 0.167 0.09 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.83e-01 0.104 0.119 0.09 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 3.51e-01 -0.147 0.157 0.09 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 3.11e-01 0.133 0.131 0.09 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0881 0.16 0.09 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 4.56e-01 0.101 0.135 0.09 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0266 0.117 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 6.96e-01 0.0501 0.128 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 7.90e-02 -0.233 0.132 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 2.45e-01 0.161 0.138 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0257 0.106 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 1.67e-01 -0.152 0.109 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 1.88e-01 -0.199 0.151 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 8.18e-01 0.0325 0.141 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 9.05e-01 0.0159 0.133 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 3.75e-01 0.133 0.149 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0378 0.151 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.45e-01 0.141 0.149 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0536 0.122 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 3.00e-01 0.125 0.12 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 8.98e-01 0.0209 0.162 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 2.22e-01 0.187 0.152 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 8.69e-01 0.0218 0.132 0.076 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 467031 sc-eQTL 1.74e-01 0.206 0.151 0.076 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0347 0.19 0.076 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 7.20e-01 -0.071 0.198 0.076 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 9.73e-01 0.00619 0.183 0.076 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 7.33e-02 -0.315 0.175 0.076 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 4.16e-01 0.159 0.194 0.076 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -231388 sc-eQTL 4.86e-01 0.119 0.171 0.076 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 2.13e-01 -0.188 0.15 0.089 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 6.45e-01 0.0705 0.153 0.089 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 6.18e-01 0.0863 0.173 0.089 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.42e-01 0.149 0.156 0.089 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 4.17e-01 -0.113 0.139 0.089 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 5.06e-01 0.0991 0.149 0.089 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 4.95e-01 0.106 0.155 0.089 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0963 0.156 0.089 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 1.24e-01 -0.184 0.119 0.088 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 1.66e-01 0.185 0.133 0.088 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 1.48e-01 -0.234 0.161 0.088 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 1.95e-01 0.193 0.148 0.088 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 3.41e-01 -0.122 0.128 0.088 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 8.28e-02 0.226 0.13 0.088 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 3.60e-01 -0.127 0.139 0.088 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 3.75e-01 0.141 0.158 0.088 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 8.49e-01 0.0291 0.153 0.085 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0263 0.129 0.085 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0218 0.175 0.085 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 9.02e-01 0.0178 0.145 0.085 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 1.89e-01 -0.232 0.176 0.085 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 4.46e-01 -0.118 0.154 0.085 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 9.59e-01 0.00871 0.17 0.085 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 8.51e-01 0.0274 0.146 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0992 0.104 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00812 0.146 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 2.06e-01 0.137 0.108 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 9.12e-01 0.0137 0.124 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 3.38e-01 -0.148 0.154 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 2.13e-01 -0.15 0.12 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 9.52e-01 0.0095 0.158 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0362 0.0908 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 6.67e-01 -0.053 0.123 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0274 0.102 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 1.63e-01 -0.162 0.116 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 706707 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0944 0.142 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 1.72e-01 -0.159 0.116 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 2.11e-01 -0.194 0.154 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0472 0.107 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 5.97e-01 0.0687 0.13 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 3.93e-01 -0.105 0.122 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 3.71e-01 0.127 0.142 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0638 0.103 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 8.17e-01 0.023 0.0994 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 4.99e-01 -0.105 0.156 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 3.84e-01 0.126 0.144 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 1.68e-01 -0.151 0.109 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 261818 sc-eQTL 1.62e-01 0.181 0.129 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0857 0.147 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 1.11e-01 0.228 0.143 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0885 0.106 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 3.13e-01 0.11 0.109 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0593 0.14 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 232860 sc-eQTL 9.04e-01 0.018 0.149 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -142297 sc-eQTL 7.60e-02 -0.136 0.0765 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 784663 sc-eQTL 4.69e-01 0.085 0.117 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 214663 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0867 0.134 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 63808 sc-eQTL 3.72e-01 -0.11 0.122 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 399255 sc-eQTL 4.85e-01 0.0734 0.105 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0165 0.131 0.084 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -649040 eQTL 0.00143 -0.129 0.0403 0.0 0.0 0.0898

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139343 \N 399255 1.31e-06 2.09e-06 3.58e-07 1.56e-06 2.53e-07 6.36e-07 1.25e-06 4.18e-07 1.74e-06 4.7e-07 1.86e-06 7.5e-07 3.25e-06 8.7e-07 5.65e-07 7.13e-07 9.36e-07 9.53e-07 7.22e-07 4.81e-07 7.68e-07 1.74e-06 8.66e-07 6.51e-07 2.41e-06 2.9e-07 7.73e-07 9.31e-07 1.53e-06 1.32e-06 8.55e-07 2.09e-07 2.65e-07 5.6e-07 8.33e-07 4.53e-07 7.3e-07 2.97e-07 4.63e-07 2.99e-07 2.58e-07 1.73e-06 2.19e-07 2.06e-07 1.8e-07 1.23e-07 1.85e-07 8.51e-08 5.4e-08