logo

Genes within 1Mb (chr12:96253000:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0624 0.08 0.083 B L1
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0288 0.113 0.083 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 3.05e-01 -0.102 0.0993 0.083 B L1
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 1.56e-03 0.332 0.103 0.083 B L1
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 4.72e-01 -0.094 0.131 0.083 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 4.77e-02 -0.19 0.0954 0.083 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0585 0.14 0.083 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0931 0.0655 0.083 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 6.36e-01 0.0434 0.0917 0.083 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0268 0.0903 0.083 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 6.85e-01 0.0397 0.0978 0.083 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 5.71e-01 0.0792 0.139 0.083 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00224 0.0855 0.083 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 4.17e-01 0.0856 0.105 0.083 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 9.51e-01 0.00418 0.0674 0.083 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 8.72e-01 0.0176 0.109 0.083 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 7.66e-01 0.0215 0.0723 0.083 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 6.60e-01 0.0479 0.109 0.083 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0807 0.124 0.083 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0372 0.0891 0.083 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 1.31e-01 0.179 0.118 0.083 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0427 0.124 0.086 DC L1
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 6.92e-01 0.056 0.141 0.086 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0292 0.156 0.086 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 2.93e-01 -0.122 0.115 0.086 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 2.54e-01 -0.161 0.141 0.086 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 1.29e-01 -0.179 0.117 0.086 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 2.23e-01 -0.184 0.151 0.086 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 1.49e-01 0.196 0.136 0.086 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 6.72e-02 0.183 0.0995 0.083 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 5.58e-02 -0.241 0.125 0.083 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00796 0.109 0.083 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 2.61e-01 -0.16 0.142 0.083 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 5.96e-01 0.0509 0.0958 0.083 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 7.03e-01 0.0345 0.0903 0.083 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 6.30e-01 0.0669 0.139 0.083 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 3.62e-01 -0.123 0.134 0.083 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00103 0.0753 0.082 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00655 0.111 0.082 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 6.46e-01 0.0588 0.128 0.082 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 1.73e-01 -0.165 0.121 0.082 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 7.47e-01 0.0325 0.1 0.082 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0811 0.127 0.082 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 8.25e-01 -0.014 0.063 0.083 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 461848 sc-eQTL 3.19e-01 -0.116 0.116 0.083 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0537 0.12 0.083 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 4.01e-02 0.269 0.13 0.083 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0353 0.103 0.083 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 5.86e-01 0.052 0.0954 0.083 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0544 0.145 0.083 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -236571 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0653 0.15 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 4.84e-01 0.104 0.147 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 3.65e-01 0.168 0.185 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0927 0.167 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 5.85e-01 0.0967 0.177 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 6.29e-01 0.0657 0.136 0.082 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 3.18e-01 0.167 0.166 0.082 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 2.81e-01 -0.188 0.174 0.082 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 2.57e-01 -0.14 0.123 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0341 0.142 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0457 0.12 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 8.66e-01 0.0227 0.135 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0147 0.159 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 1.89e-01 -0.176 0.134 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00273 0.158 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 2.78e-01 -0.129 0.119 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 6.98e-01 0.06 0.154 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 9.39e-02 -0.229 0.136 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 2.76e-01 0.147 0.135 0.084 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 5.13e-01 0.0969 0.148 0.084 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 4.37e-01 -0.111 0.143 0.084 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 6.70e-03 0.426 0.155 0.084 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 7.16e-01 0.036 0.0989 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0126 0.128 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.47e-01 -0.15 0.103 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 9.10e-03 0.317 0.121 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 3.46e-01 0.145 0.154 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 4.23e-02 -0.241 0.118 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0672 0.153 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0286 0.125 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 6.89e-01 0.0603 0.151 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00667 0.118 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 1.25e-01 0.214 0.139 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0846 0.151 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 2.34e-01 -0.165 0.138 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 6.33e-02 -0.305 0.163 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0143 0.114 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 4.70e-01 0.118 0.163 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.21e-02 0.401 0.158 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 7.64e-01 0.0488 0.163 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 8.81e-02 -0.221 0.129 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 7.43e-01 0.0464 0.141 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 4.22e-01 -0.131 0.163 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 1.58e-01 -0.102 0.0719 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 3.75e-01 0.0924 0.104 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0311 0.104 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0331 0.104 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 4.94e-01 0.1 0.146 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0171 0.0928 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 2.33e-01 0.136 0.114 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0654 0.0704 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 8.06e-01 0.0295 0.12 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0673 0.12 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 1.43e-01 0.172 0.117 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 6.23e-01 0.0801 0.163 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0226 0.0965 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 3.02e-01 -0.136 0.132 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 7.61e-01 0.0265 0.0872 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 2.50e-01 0.167 0.145 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0554 0.135 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0654 0.125 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 3.55e-01 -0.142 0.154 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 9.94e-01 0.000998 0.131 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 2.06e-01 0.196 0.155 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 2.89e-01 0.0876 0.0825 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 2.57e-01 0.162 0.142 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.82e-01 0.199 0.149 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 5.50e-01 0.0814 0.136 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 3.30e-01 -0.148 0.151 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 9.47e-01 0.00829 0.125 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 7.14e-01 0.0514 0.14 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 2.70e-01 -0.111 0.1 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 4.26e-01 -0.107 0.134 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 3.16e-01 -0.121 0.12 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 6.88e-01 0.0513 0.128 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0612 0.134 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0357 0.115 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 4.99e-01 0.0924 0.136 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 1.42e-01 -0.158 0.107 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 5.77e-02 0.304 0.159 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0692 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 1.40e-01 -0.198 0.133 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0558 0.145 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 3.14e-01 0.155 0.154 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 1.99e-02 0.35 0.149 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 2.41e-01 0.158 0.134 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 1.81e-01 0.212 0.158 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0484 0.165 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 3.60e-01 0.149 0.162 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 2.58e-01 -0.156 0.138 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 6.74e-01 0.0637 0.151 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 7.64e-01 0.0493 0.164 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 6.74e-01 0.0384 0.0912 0.082 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 461848 sc-eQTL 3.89e-01 -0.106 0.123 0.082 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.155 0.082 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.98e-02 0.327 0.139 0.082 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0356 0.118 0.082 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 7.00e-01 -0.053 0.137 0.082 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 3.02e-01 0.159 0.154 0.082 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -236571 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0175 0.153 0.082 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 4.94e-01 0.065 0.0948 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 8.02e-02 -0.279 0.159 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 3.10e-01 -0.143 0.14 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 7.01e-02 -0.269 0.148 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 4.19e-02 -0.316 0.154 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 1.37e-01 -0.233 0.156 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0301 0.0809 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 4.05e-01 0.118 0.142 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 5.39e-01 0.0899 0.146 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 1.61e-01 -0.181 0.129 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 3.04e-01 0.127 0.123 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0132 0.142 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 5.64e-01 0.0714 0.124 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 1.27e-01 -0.238 0.155 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 3.88e-01 0.14 0.162 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 7.16e-01 0.0547 0.15 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 1.64e-01 -0.218 0.156 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 7.16e-01 -0.054 0.148 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 6.29e-01 -0.043 0.0889 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 7.19e-01 0.0531 0.148 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.02e-01 0.246 0.149 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 5.64e-01 -0.083 0.144 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 9.46e-01 0.00832 0.122 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00192 0.151 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 5.86e-01 -0.096 0.176 0.078 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 6.41e-01 0.0962 0.205 0.078 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 7.38e-01 -0.052 0.155 0.078 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 9.56e-02 0.33 0.196 0.078 PB L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 1.75e-01 -0.249 0.183 0.078 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 1.44e-01 -0.283 0.192 0.078 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 6.41e-01 -0.108 0.23 0.078 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0809 0.0986 0.085 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 461848 sc-eQTL 1.12e-01 -0.176 0.11 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 1.46e-01 0.19 0.13 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.13e-01 0.206 0.13 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 1.59e-01 0.222 0.157 0.085 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 9.13e-01 0.0108 0.0994 0.085 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 9.71e-01 0.00522 0.144 0.085 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -236571 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0373 0.117 0.085 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 5.11e-01 0.0717 0.109 0.083 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 6.68e-02 -0.271 0.147 0.083 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 2.03e-01 0.176 0.137 0.083 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 7.03e-01 0.0477 0.125 0.083 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0401 0.14 0.083 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0296 0.145 0.083 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 9.62e-01 0.00768 0.162 0.083 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0548 0.13 0.088 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 3.15e-02 0.29 0.134 0.088 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0185 0.163 0.088 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 7.09e-02 -0.209 0.115 0.088 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 9.91e-01 0.00174 0.153 0.088 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0644 0.128 0.088 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 8.29e-01 0.0338 0.156 0.088 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 5.26e-01 0.0836 0.131 0.088 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 4.57e-02 0.23 0.114 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 2.42e-01 -0.147 0.126 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0847 0.13 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 3.91e-01 -0.117 0.136 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 5.40e-01 0.0643 0.105 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00236 0.108 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 3.18e-01 0.149 0.149 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 3.91e-01 -0.119 0.139 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 5.66e-01 0.0747 0.13 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 3.62e-01 -0.133 0.146 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 3.10e-01 0.15 0.147 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 4.33e-01 -0.114 0.146 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 3.85e-01 0.103 0.119 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 4.41e-01 0.0905 0.117 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 8.74e-01 0.0251 0.158 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 2.47e-01 -0.173 0.149 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 8.55e-01 0.0218 0.119 0.094 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 461848 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0162 0.136 0.094 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0881 0.17 0.094 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 5.63e-01 0.103 0.178 0.094 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0976 0.164 0.094 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 5.31e-01 0.0996 0.159 0.094 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00422 0.175 0.094 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -236571 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0611 0.154 0.094 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0412 0.147 0.084 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 7.73e-01 0.0428 0.148 0.084 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 2.40e-01 -0.197 0.167 0.084 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 4.52e-01 -0.114 0.152 0.084 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 4.11e-01 -0.111 0.135 0.084 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0023 0.145 0.084 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0108 0.15 0.084 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 2.56e-01 -0.172 0.151 0.084 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0912 0.117 0.084 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 8.78e-02 -0.222 0.129 0.084 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 6.25e-01 -0.077 0.157 0.084 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.56e-01 -0.206 0.144 0.084 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 6.12e-01 0.0633 0.125 0.084 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0116 0.127 0.084 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 5.50e-01 -0.081 0.135 0.084 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 7.43e-01 0.0506 0.154 0.084 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 6.85e-01 0.061 0.15 0.093 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 4.77e-02 -0.25 0.125 0.093 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 4.93e-01 -0.117 0.171 0.093 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.92e-01 0.185 0.141 0.093 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 5.39e-01 -0.107 0.173 0.093 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0757 0.151 0.093 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 2.84e-02 -0.364 0.164 0.093 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 8.07e-01 0.035 0.143 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0958 0.104 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0413 0.145 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 8.56e-02 -0.185 0.107 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 1.88e-01 0.162 0.123 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0287 0.154 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 1.05e-01 -0.194 0.119 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 5.15e-02 0.305 0.156 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 8.92e-01 0.0121 0.0887 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 8.00e-01 0.0304 0.12 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.53e-01 -0.142 0.0991 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 3.98e-03 0.324 0.111 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 701524 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0798 0.139 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 9.05e-02 -0.193 0.113 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 1.25e-01 -0.232 0.15 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 6.14e-02 0.194 0.103 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 1.96e-01 -0.163 0.125 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0158 0.119 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 4.03e-01 -0.116 0.138 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 4.02e-01 0.0837 0.0997 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 7.32e-01 0.0331 0.0964 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 4.06e-01 0.126 0.151 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 4.65e-01 -0.102 0.14 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0547 0.11 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 256635 sc-eQTL 1.50e-01 -0.186 0.129 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0887 0.147 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 1.06e-01 -0.232 0.143 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0204 0.106 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 8.48e-01 0.0211 0.11 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 9.96e-01 0.000638 0.141 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 227677 sc-eQTL 9.52e-01 0.00897 0.149 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -147480 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00753 0.0762 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 779480 sc-eQTL 6.76e-01 0.0484 0.116 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 209480 sc-eQTL 3.30e-01 0.129 0.132 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 58625 sc-eQTL 2.81e-01 -0.131 0.121 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 394072 sc-eQTL 4.19e-01 0.0838 0.104 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -654223 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0523 0.129 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 -147480 eQTL 3.48e-02 -0.0511 0.0242 0.00145 0.0 0.0594

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000059758 CDK17 -147480 5.46e-06 5.1e-06 6.71e-07 3.42e-06 1.32e-06 1.62e-06 5.11e-06 9.76e-07 5.2e-06 2.41e-06 5.59e-06 3.45e-06 7.56e-06 1.97e-06 1.39e-06 3.81e-06 1.74e-06 3.49e-06 1.55e-06 1.19e-06 3.15e-06 4.93e-06 4.04e-06 1.52e-06 6.86e-06 1.74e-06 2.32e-06 1.55e-06 4.38e-06 4.36e-06 2.85e-06 5.25e-07 4.63e-07 1.71e-06 2.05e-06 1.17e-06 1e-06 4.24e-07 1.06e-06 4.57e-07 3.05e-07 6.09e-06 6.31e-07 1.63e-07 5.95e-07 6.75e-07 9.78e-07 4.43e-07 3.41e-07
ENSG00000139344 \N 309669 1.57e-06 1.31e-06 3.06e-07 1.2e-06 3.5e-07 6.36e-07 1.5e-06 3.69e-07 1.43e-06 6.14e-07 1.84e-06 7.85e-07 2.55e-06 2.77e-07 5.18e-07 9.54e-07 8.94e-07 7.89e-07 7.04e-07 4.51e-07 8.07e-07 1.69e-06 8.98e-07 6.34e-07 2.26e-06 5.67e-07 1e-06 8.14e-07 1.47e-06 1.21e-06 7.84e-07 2.39e-07 3e-07 6.83e-07 5.93e-07 5.35e-07 7.14e-07 2.78e-07 3.95e-07 2.98e-07 2.91e-07 1.61e-06 3.51e-07 9.66e-08 2.85e-07 1.47e-07 2.57e-07 1.16e-07 1.6e-07