logo

Genes within 1Mb (chr12:96251008:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 4.94e-01 0.0572 0.0834 0.919 B L1
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 8.23e-01 0.0265 0.118 0.919 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 3.51e-01 0.0968 0.103 0.919 B L1
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 1.10e-03 -0.356 0.108 0.919 B L1
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 5.82e-01 0.075 0.136 0.919 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 6.22e-02 0.186 0.0995 0.919 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 8.56e-01 0.0266 0.146 0.919 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 1.01e-01 0.112 0.0679 0.919 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0497 0.0952 0.919 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 7.22e-01 0.0334 0.0938 0.919 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0411 0.102 0.919 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 4.08e-01 -0.12 0.145 0.919 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 9.13e-01 0.0097 0.0888 0.919 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0728 0.109 0.919 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 9.89e-01 0.000994 0.0701 0.919 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0276 0.113 0.919 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0263 0.0752 0.919 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0351 0.113 0.919 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 6.26e-01 0.0628 0.129 0.919 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 4.61e-01 0.0684 0.0927 0.919 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 1.41e-01 -0.181 0.123 0.919 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 8.70e-01 0.0212 0.129 0.917 DC L1
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 5.54e-01 -0.087 0.147 0.917 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0197 0.162 0.917 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 5.79e-01 0.0667 0.12 0.917 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 3.10e-01 0.15 0.147 0.917 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 6.97e-02 0.222 0.121 0.917 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 3.48e-01 0.148 0.157 0.917 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 2.43e-01 -0.166 0.141 0.917 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 5.94e-02 -0.196 0.103 0.919 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 3.80e-02 0.271 0.13 0.919 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 9.35e-01 0.00929 0.113 0.919 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 2.58e-01 0.168 0.148 0.919 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 4.88e-01 -0.069 0.0993 0.919 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0345 0.0937 0.919 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0534 0.144 0.919 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 3.40e-01 0.133 0.139 0.919 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 9.41e-01 0.00584 0.0783 0.921 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00487 0.116 0.921 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0396 0.133 0.921 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 1.61e-01 0.177 0.126 0.921 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0378 0.105 0.921 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 6.47e-01 0.0607 0.132 0.921 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 9.98e-01 0.000189 0.0655 0.919 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 459856 sc-eQTL 4.37e-01 0.0942 0.121 0.919 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 4.94e-01 0.0857 0.125 0.919 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 4.74e-02 -0.27 0.136 0.919 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 8.31e-01 0.0228 0.107 0.919 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0431 0.0993 0.919 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 6.93e-01 0.0597 0.151 0.919 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -238563 sc-eQTL 7.05e-01 0.0594 0.157 0.919 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 3.22e-01 -0.153 0.154 0.921 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 5.06e-01 -0.13 0.195 0.921 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 5.79e-01 0.0974 0.175 0.921 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 4.66e-01 -0.136 0.185 0.921 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0813 0.142 0.921 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 2.59e-01 -0.198 0.174 0.921 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 2.51e-01 0.21 0.182 0.921 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 2.57e-01 0.146 0.128 0.918 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 8.71e-01 0.024 0.147 0.918 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 7.43e-01 0.0409 0.125 0.918 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0142 0.14 0.918 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 8.63e-01 0.0286 0.166 0.918 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 1.84e-01 0.186 0.139 0.918 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0043 0.164 0.918 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 3.44e-01 0.117 0.123 0.918 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 6.86e-01 -0.065 0.161 0.918 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 9.56e-02 0.237 0.142 0.918 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 2.23e-01 -0.171 0.14 0.918 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 3.56e-01 -0.142 0.154 0.918 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 4.53e-01 0.112 0.148 0.918 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 2.94e-03 -0.484 0.161 0.918 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0419 0.103 0.919 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 9.48e-01 0.00864 0.133 0.919 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 1.47e-01 0.156 0.107 0.919 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 7.80e-03 -0.337 0.125 0.919 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 3.68e-01 -0.144 0.16 0.919 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 5.49e-02 0.237 0.123 0.919 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 8.14e-01 0.0375 0.159 0.919 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 8.00e-01 0.033 0.13 0.918 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0641 0.157 0.918 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0103 0.123 0.918 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 1.25e-01 -0.222 0.144 0.918 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 8.05e-01 0.0388 0.157 0.918 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 2.73e-01 0.158 0.144 0.918 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 7.19e-02 0.308 0.17 0.918 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 8.82e-01 0.0176 0.118 0.918 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 4.44e-01 -0.13 0.169 0.918 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 8.82e-03 -0.434 0.164 0.918 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0609 0.169 0.918 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 5.15e-02 0.262 0.134 0.918 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0314 0.147 0.918 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 3.91e-01 0.146 0.17 0.918 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 1.21e-01 0.116 0.0746 0.919 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0832 0.108 0.919 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 7.38e-01 0.0363 0.108 0.919 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 6.62e-01 0.0474 0.108 0.919 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 3.27e-01 -0.149 0.152 0.919 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 8.19e-01 0.0221 0.0964 0.919 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 3.46e-01 -0.112 0.118 0.919 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 2.62e-01 0.0822 0.0731 0.919 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0462 0.125 0.919 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 5.82e-01 0.0684 0.124 0.919 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 1.17e-01 -0.192 0.122 0.919 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0857 0.169 0.919 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 6.51e-01 0.0455 0.1 0.919 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 3.22e-01 0.136 0.137 0.919 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00647 0.0907 0.919 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 1.98e-01 -0.195 0.151 0.919 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 6.39e-01 0.0658 0.14 0.919 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 6.81e-01 0.0536 0.13 0.919 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 4.45e-01 0.122 0.16 0.919 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 8.93e-01 0.0184 0.136 0.919 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 2.06e-01 -0.204 0.161 0.919 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0856 0.0857 0.919 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 1.73e-01 -0.202 0.148 0.919 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 1.75e-01 -0.21 0.154 0.919 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0715 0.141 0.919 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 3.66e-01 0.142 0.157 0.919 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000434 0.13 0.919 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0418 0.146 0.919 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 2.19e-01 0.129 0.104 0.919 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 4.23e-01 0.112 0.139 0.919 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 3.35e-01 0.121 0.125 0.919 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0309 0.133 0.919 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 7.38e-01 0.0467 0.139 0.919 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 5.67e-01 0.0685 0.119 0.919 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0907 0.142 0.919 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 1.93e-01 0.146 0.112 0.912 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 7.49e-02 -0.297 0.166 0.912 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 6.87e-01 0.0666 0.165 0.912 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 1.38e-01 0.207 0.139 0.912 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 7.96e-01 0.0391 0.151 0.912 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 3.66e-01 -0.145 0.16 0.912 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 1.58e-02 -0.377 0.155 0.912 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 2.25e-01 -0.171 0.14 0.922 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 1.34e-01 -0.248 0.164 0.922 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 6.75e-01 0.0723 0.172 0.922 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 2.75e-01 -0.185 0.169 0.922 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 3.15e-01 0.145 0.144 0.922 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0575 0.157 0.922 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0814 0.171 0.922 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0639 0.095 0.92 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 459856 sc-eQTL 4.84e-01 0.0897 0.128 0.92 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 3.38e-01 0.155 0.161 0.92 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 1.74e-02 -0.347 0.145 0.92 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 8.72e-01 0.0199 0.123 0.92 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 5.36e-01 0.0884 0.143 0.92 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 2.61e-01 -0.18 0.16 0.92 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -238563 sc-eQTL 8.86e-01 0.0227 0.159 0.92 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0606 0.0989 0.918 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 8.39e-02 0.288 0.166 0.918 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 3.50e-01 0.137 0.146 0.918 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 7.68e-02 0.274 0.154 0.918 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 4.42e-02 0.326 0.161 0.918 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 1.30e-01 0.248 0.163 0.918 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 6.00e-01 0.0443 0.0842 0.92 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 3.38e-01 -0.142 0.147 0.92 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0722 0.152 0.92 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 1.91e-01 0.176 0.134 0.92 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 2.24e-01 -0.156 0.128 0.92 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 9.92e-01 0.00143 0.148 0.92 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0781 0.129 0.916 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 1.50e-01 0.233 0.161 0.916 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 3.81e-01 -0.148 0.169 0.916 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0146 0.157 0.916 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 1.29e-01 0.248 0.162 0.916 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 7.84e-01 0.0424 0.154 0.916 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 6.33e-01 0.0443 0.0926 0.92 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0493 0.154 0.92 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 1.73e-01 -0.213 0.156 0.92 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 5.39e-01 0.0922 0.15 0.92 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 9.98e-01 0.000319 0.127 0.92 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0308 0.157 0.92 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 2.88e-01 0.198 0.185 0.926 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0648 0.218 0.926 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0365 0.164 0.926 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 1.30e-01 -0.318 0.208 0.926 PB L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 2.28e-01 0.235 0.194 0.926 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 4.37e-01 0.16 0.205 0.926 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 8.96e-01 0.0321 0.244 0.926 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 3.81e-01 0.0893 0.102 0.917 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 459856 sc-eQTL 1.33e-01 0.172 0.114 0.917 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 2.43e-01 -0.158 0.135 0.917 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 1.26e-01 -0.205 0.134 0.917 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 1.53e-01 -0.232 0.162 0.917 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0426 0.103 0.917 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 9.70e-01 0.00563 0.149 0.917 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -238563 sc-eQTL 7.64e-01 0.0363 0.121 0.917 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 4.17e-01 -0.092 0.113 0.919 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 1.61e-01 0.215 0.153 0.919 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 1.86e-01 -0.19 0.143 0.919 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 9.81e-01 0.00306 0.13 0.919 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 9.42e-01 0.0106 0.146 0.919 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 9.59e-01 0.00774 0.15 0.919 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0407 0.168 0.919 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 7.89e-01 0.0364 0.136 0.915 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 1.74e-02 -0.333 0.139 0.915 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0453 0.17 0.915 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 2.29e-01 0.145 0.12 0.915 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 9.05e-01 -0.019 0.16 0.915 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 4.53e-01 0.1 0.133 0.915 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0759 0.163 0.915 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0624 0.137 0.915 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 4.87e-02 -0.235 0.119 0.919 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 1.54e-01 0.186 0.13 0.919 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 5.90e-01 0.073 0.135 0.919 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 3.83e-01 0.123 0.141 0.919 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0837 0.109 0.919 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 9.69e-01 0.00439 0.112 0.919 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 4.18e-01 -0.125 0.154 0.919 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 3.66e-01 0.13 0.144 0.919 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0752 0.135 0.919 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 3.53e-01 0.141 0.151 0.919 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 3.38e-01 -0.147 0.153 0.919 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 4.64e-01 0.111 0.151 0.919 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 3.36e-01 -0.119 0.123 0.919 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0968 0.122 0.919 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0292 0.165 0.919 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 2.57e-01 0.176 0.154 0.919 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0311 0.125 0.909 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 459856 sc-eQTL 9.26e-01 0.0133 0.143 0.909 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 5.95e-01 0.0952 0.179 0.909 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0561 0.186 0.909 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 5.09e-01 0.114 0.172 0.909 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 4.90e-01 -0.115 0.166 0.909 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 9.59e-01 0.00957 0.184 0.909 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -238563 sc-eQTL 7.26e-01 0.0565 0.161 0.909 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 8.33e-01 0.0322 0.153 0.918 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0468 0.154 0.918 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 2.47e-01 0.202 0.174 0.918 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 4.70e-01 0.115 0.158 0.918 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 4.37e-01 0.11 0.141 0.918 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 8.42e-01 0.0301 0.151 0.918 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 9.93e-01 0.00129 0.157 0.918 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 2.92e-01 0.166 0.157 0.918 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 5.30e-01 0.0764 0.121 0.919 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 1.59e-01 0.19 0.135 0.919 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 4.68e-01 0.119 0.164 0.919 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 1.27e-01 0.23 0.15 0.919 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0519 0.13 0.919 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0339 0.132 0.919 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 5.07e-01 0.0933 0.141 0.919 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0422 0.16 0.919 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0909 0.156 0.91 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 5.85e-02 0.249 0.13 0.91 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 6.18e-01 0.0889 0.178 0.91 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 2.23e-01 -0.18 0.147 0.91 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 5.96e-01 0.0959 0.18 0.91 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 6.17e-01 0.079 0.157 0.91 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 5.09e-02 0.338 0.172 0.91 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 9.22e-01 0.0146 0.149 0.91 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 4.01e-01 0.0908 0.108 0.919 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 7.85e-01 0.041 0.15 0.919 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 9.82e-02 0.185 0.112 0.919 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 1.66e-01 -0.177 0.128 0.919 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 8.82e-01 0.0237 0.16 0.919 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 1.01e-01 0.204 0.124 0.919 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 3.21e-02 -0.348 0.161 0.919 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0114 0.0923 0.919 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0389 0.125 0.919 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 1.68e-01 0.143 0.103 0.919 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 3.68e-03 -0.34 0.116 0.919 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 699532 sc-eQTL 7.17e-01 0.0523 0.144 0.919 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 1.10e-01 0.189 0.118 0.919 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 1.71e-01 0.215 0.157 0.919 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 6.76e-02 -0.197 0.107 0.919 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 1.39e-01 0.193 0.13 0.919 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 9.43e-01 0.00874 0.123 0.919 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 4.09e-01 0.118 0.143 0.919 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 2.97e-01 -0.108 0.103 0.919 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0317 0.1 0.919 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 5.01e-01 -0.106 0.157 0.919 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 4.61e-01 0.107 0.145 0.919 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 7.30e-01 0.0395 0.114 0.92 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 254643 sc-eQTL 2.18e-01 0.166 0.134 0.92 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 3.99e-01 0.129 0.153 0.92 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 9.23e-02 0.251 0.149 0.92 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 8.33e-01 0.0233 0.111 0.92 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0244 0.114 0.92 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00231 0.146 0.92 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 225685 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00678 0.155 0.92 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -149472 sc-eQTL 8.84e-01 0.0116 0.0793 0.92 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 777488 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0662 0.121 0.92 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 207488 sc-eQTL 4.55e-01 -0.103 0.138 0.92 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 56633 sc-eQTL 2.54e-01 0.144 0.126 0.92 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 392080 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0905 0.108 0.92 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -656215 sc-eQTL 8.40e-01 0.0273 0.135 0.92 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000059758 CDK17 -149472 eQTL 4.24e-02 0.0499 0.0246 0.00128 0.0 0.0589

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000059758 CDK17 -149472 9.14e-06 1.18e-05 1.28e-06 7.63e-06 2.35e-06 4.34e-06 1.14e-05 1.22e-06 9.4e-06 4.89e-06 1.19e-05 4.84e-06 2.01e-05 3.63e-06 3.17e-06 6.37e-06 4.13e-06 7.17e-06 2.58e-06 2.83e-06 4.6e-06 9.54e-06 7.13e-06 2.98e-06 1.26e-05 3.36e-06 4.47e-06 4.45e-06 9.97e-06 7.75e-06 4.95e-06 1.01e-06 1.18e-06 3.29e-06 4.56e-06 1.84e-06 1.75e-06 2.07e-06 2.91e-06 1.5e-06 1.01e-06 1.16e-05 1.62e-06 3.63e-07 7.14e-07 1.7e-06 1.28e-06 6.92e-07 4.64e-07
ENSG00000139344 \N 307677 2.14e-06 2.37e-06 2.88e-07 2.06e-06 4.56e-07 7.58e-07 1.59e-06 3.85e-07 1.61e-06 7.72e-07 1.93e-06 1.32e-06 4.11e-06 1.11e-06 5.05e-07 1.06e-06 9.43e-07 1.33e-06 5.76e-07 1.16e-06 8.89e-07 2.57e-06 1.79e-06 6.61e-07 2.35e-06 1.36e-06 1.01e-06 1.17e-06 1.68e-06 1.63e-06 7.6e-07 2.56e-07 4.76e-07 1.31e-06 9.04e-07 4.57e-07 1.03e-06 4.47e-07 9.26e-07 4.17e-07 2.44e-07 2.09e-06 5.43e-07 4.33e-07 2.84e-07 3.28e-07 2.79e-07 9.26e-08 2.89e-07